MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 chromosome

Total Repeats: 47764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012913	TTAA	2	8	46596	46603	50 %	50 %	0 %	0 %	251791860
1002	NC_012913	CGTT	2	8	46629	46636	0 %	50 %	25 %	25 %	251791860
1003	NC_012913	CA	3	6	46676	46681	50 %	0 %	0 %	50 %	251791860
1004	NC_012913	A	6	6	46681	46686	100 %	0 %	0 %	0 %	251791860
1005	NC_012913	ATAA	2	8	46752	46759	75 %	25 %	0 %	0 %	251791860
1006	NC_012913	ACC	2	6	46783	46788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251791860
1007	NC_012913	GTT	2	6	46829	46834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791860
1008	NC_012913	AGTA	2	8	46914	46921	50 %	25 %	25 %	0 %	251791860
1009	NC_012913	GAC	2	6	47045	47050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251791860
1010	NC_012913	AAT	2	6	47054	47059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791860
1011	NC_012913	AAT	2	6	47189	47194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791860
1012	NC_012913	CATG	2	8	47319	47326	25 %	25 %	25 %	25 %	251791860
1013	NC_012913	CTG	2	6	47363	47368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791860
1014	NC_012913	GTA	2	6	47388	47393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791860
1015	NC_012913	AGA	2	6	47396	47401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251791860
1016	NC_012913	AAT	2	6	47404	47409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791860
1017	NC_012913	CTT	2	6	47503	47508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791860
1018	NC_012913	TCAT	2	8	47511	47518	25 %	50 %	0 %	25 %	251791860
1019	NC_012913	CTG	2	6	47541	47546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791860
1020	NC_012913	CAA	2	6	47558	47563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791860
1021	NC_012913	TGC	2	6	47620	47625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791860
1022	NC_012913	TC	3	6	47774	47779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_012913	A	6	6	47784	47789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_012913	A	6	6	47825	47830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012913	ATG	2	6	47841	47846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012913	ATGG	2	8	47848	47855	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_012913	AAT	2	6	47882	47887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012913	ATT	2	6	47905	47910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012913	TTA	2	6	47916	47921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_012913	A	6	6	47935	47940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012913	ATT	2	6	47946	47951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_012913	TG	3	6	47970	47975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012913	AAT	2	6	48057	48062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012913	GGA	2	6	48085	48090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012913	GTG	2	6	48121	48126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012913	ACA	2	6	48243	48248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791861
1037	NC_012913	TGCCGT	2	12	48330	48341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791861
1038	NC_012913	CAA	2	6	48356	48361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791861
1039	NC_012913	ATT	2	6	48387	48392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791861
1040	NC_012913	ACA	2	6	48414	48419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791861
1041	NC_012913	TTGT	2	8	48437	48444	0 %	75 %	25 %	0 %	251791861
1042	NC_012913	A	6	6	48674	48679	100 %	0 %	0 %	0 %	251791861
1043	NC_012913	TGGTGA	2	12	48742	48753	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	251791861
1044	NC_012913	A	6	6	48759	48764	100 %	0 %	0 %	0 %	251791861
1045	NC_012913	ACC	2	6	48770	48775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251791861
1046	NC_012913	TGGCG	2	10	48934	48943	0 %	20 %	60 %	20 %	251791861
1047	NC_012913	CTG	2	6	49014	49019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791861
1048	NC_012913	A	6	6	49046	49051	100 %	0 %	0 %	0 %	251791861
1049	NC_012913	AAGATA	2	12	49059	49070	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	251791861
1050	NC_012913	TGGG	2	8	49115	49122	0 %	25 %	75 %	0 %	251791861
1051	NC_012913	CACG	2	8	49130	49137	25 %	0 %	25 %	50 %	251791861
1052	NC_012913	CAA	2	6	49177	49182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791861
1053	NC_012913	GTGG	2	8	49205	49212	0 %	25 %	75 %	0 %	251791861
1054	NC_012913	TGC	2	6	49313	49318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791862
1055	NC_012913	ATTT	2	8	49353	49360	25 %	75 %	0 %	0 %	251791862
1056	NC_012913	ATT	2	6	49408	49413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791862
1057	NC_012913	ATT	2	6	49431	49436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791862
1058	NC_012913	ATT	2	6	49488	49493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791862
1059	NC_012913	GCA	2	6	49495	49500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251791862
1060	NC_012913	A	6	6	49619	49624	100 %	0 %	0 %	0 %	251791863
1061	NC_012913	A	6	6	49627	49632	100 %	0 %	0 %	0 %	251791863
1062	NC_012913	TTTG	2	8	49656	49663	0 %	75 %	25 %	0 %	251791863
1063	NC_012913	AGAAA	2	10	49704	49713	80 %	0 %	20 %	0 %	251791863
1064	NC_012913	TGAAAG	2	12	49721	49732	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	251791863
1065	NC_012913	TGG	2	6	49835	49840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791863
1066	NC_012913	TGA	2	6	49857	49862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791863
1067	NC_012913	CGG	2	6	49898	49903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251791863
1068	NC_012913	GTG	2	6	49906	49911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791863
1069	NC_012913	T	6	6	49956	49961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_012913	T	6	6	49970	49975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_012913	CACAC	2	10	50001	50010	40 %	0 %	0 %	60 %	251791864
1072	NC_012913	CACCGC	2	12	50021	50032	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	251791864
1073	NC_012913	GGT	2	6	50045	50050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791864
1074	NC_012913	CCA	2	6	50065	50070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251791864
1075	NC_012913	ATG	2	6	50080	50085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791864
1076	NC_012913	TCA	2	6	50101	50106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791864
1077	NC_012913	GTG	2	6	50120	50125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791864
1078	NC_012913	TGG	2	6	50138	50143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791864
1079	NC_012913	CAT	2	6	50192	50197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791864
1080	NC_012913	T	6	6	50217	50222	0 %	100 %	0 %	0 %	251791864
1081	NC_012913	TTTC	2	8	50225	50232	0 %	75 %	0 %	25 %	251791864
1082	NC_012913	CCG	2	6	50245	50250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251791864
1083	NC_012913	TCTTTT	2	12	50278	50289	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	251791864
1084	NC_012913	TGG	2	6	50308	50313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791864
1085	NC_012913	TTA	2	6	50410	50415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791864
1086	NC_012913	GTT	2	6	50432	50437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791864
1087	NC_012913	GCA	2	6	50512	50517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251791864
1088	NC_012913	CACTGA	2	12	50525	50536	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	251791864
1089	NC_012913	AG	3	6	50543	50548	50 %	0 %	50 %	0 %	251791864
1090	NC_012913	A	7	7	50582	50588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012913	CCT	2	6	50589	50594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_012913	TTA	2	6	50639	50644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_012913	T	6	6	50664	50669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012913	ATA	2	6	50690	50695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_012913	TTTA	2	8	50696	50703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_012913	TTA	2	6	50724	50729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_012913	AGA	2	6	50750	50755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251791865
1098	NC_012913	T	6	6	50768	50773	0 %	100 %	0 %	0 %	251791865
1099	NC_012913	A	6	6	50859	50864	100 %	0 %	0 %	0 %	251791865
1100	NC_012913	ATA	2	6	51052	51057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791865
1101	NC_012913	TGC	2	6	51094	51099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791865
1102	NC_012913	GATGT	2	10	51174	51183	20 %	40 %	40 %	0 %	251791865
1103	NC_012913	AGT	2	6	51288	51293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791865
1104	NC_012913	GTC	2	6	51710	51715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791866
1105	NC_012913	TTG	2	6	51743	51748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791866
1106	NC_012913	TAA	2	6	51788	51793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791866
1107	NC_012913	AAT	2	6	51918	51923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791866
1108	NC_012913	TGA	2	6	51954	51959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791866
1109	NC_012913	TTG	2	6	52100	52105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791866
1110	NC_012913	GTT	2	6	52138	52143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791866
1111	NC_012913	TGA	3	9	52188	52196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791866
1112	NC_012913	CGA	2	6	52221	52226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251791866
1113	NC_012913	GCC	2	6	52235	52240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251791866
1114	NC_012913	TAA	2	6	52267	52272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791866
1115	NC_012913	AAT	2	6	52436	52441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791866
1116	NC_012913	CAA	2	6	52499	52504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791866
1117	NC_012913	GTT	2	6	52523	52528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791866
1118	NC_012913	CCAA	2	8	52530	52537	50 %	0 %	0 %	50 %	251791866
1119	NC_012913	AGC	2	6	52681	52686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251791867
1120	NC_012913	TTC	2	6	52781	52786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791867
1121	NC_012913	TTC	2	6	52811	52816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791867
1122	NC_012913	CGTT	2	8	52893	52900	0 %	50 %	25 %	25 %	251791867
1123	NC_012913	AC	3	6	52981	52986	50 %	0 %	0 %	50 %	251791867
1124	NC_012913	GC	3	6	53267	53272	0 %	0 %	50 %	50 %	251791867
1125	NC_012913	TCAA	2	8	53304	53311	50 %	25 %	0 %	25 %	251791867
1126	NC_012913	ACG	2	6	53312	53317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251791867
1127	NC_012913	CCG	2	6	53383	53388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251791867
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1129	NC_012913	TCT	2	6	53439	53444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791867
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1256	NC_012913	TAC	2	6	59449	59454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1257	NC_012913	AAAATA	2	12	59499	59510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_012913	GA	3	6	59515	59520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_012913	T	7	7	59534	59540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_012913	TA	3	6	59544	59549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1261	NC_012913	AGC	2	6	59861	59866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251791874
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