MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAgK84

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011994	TC	3	6	109	114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011994	TC	3	6	1172	1177	0 %	50 %	0 %	50 %	222112729
3	NC_011994	GA	3	6	3216	3221	50 %	0 %	50 %	0 %	222112730
4	NC_011994	CT	3	6	4135	4140	0 %	50 %	0 %	50 %	222112731
5	NC_011994	GA	3	6	4465	4470	50 %	0 %	50 %	0 %	222112731
6	NC_011994	CA	4	8	4927	4934	50 %	0 %	0 %	50 %	222112732
7	NC_011994	AG	3	6	4967	4972	50 %	0 %	50 %	0 %	222112732
8	NC_011994	AG	3	6	7342	7347	50 %	0 %	50 %	0 %	222112733
9	NC_011994	GT	3	6	7359	7364	0 %	50 %	50 %	0 %	222112733
10	NC_011994	TA	3	6	8182	8187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011994	TA	3	6	9164	9169	50 %	50 %	0 %	0 %	222112740
12	NC_011994	GC	3	6	9441	9446	0 %	0 %	50 %	50 %	222112734
13	NC_011994	GC	3	6	9490	9495	0 %	0 %	50 %	50 %	222112734
14	NC_011994	TC	3	6	9907	9912	0 %	50 %	0 %	50 %	222112734
15	NC_011994	AC	3	6	10185	10190	50 %	0 %	0 %	50 %	222112734
16	NC_011994	GT	3	6	10771	10776	0 %	50 %	50 %	0 %	222112735
17	NC_011994	GT	3	6	11573	11578	0 %	50 %	50 %	0 %	222112736
18	NC_011994	GC	3	6	11730	11735	0 %	0 %	50 %	50 %	222112736
19	NC_011994	CG	3	6	12140	12145	0 %	0 %	50 %	50 %	222112736
20	NC_011994	CT	3	6	12172	12177	0 %	50 %	0 %	50 %	222112736
21	NC_011994	GA	3	6	12553	12558	50 %	0 %	50 %	0 %	222112737
22	NC_011994	GC	3	6	12694	12699	0 %	0 %	50 %	50 %	222112737
23	NC_011994	GA	3	6	13264	13269	50 %	0 %	50 %	0 %	222112738
24	NC_011994	AT	3	6	13492	13497	50 %	50 %	0 %	0 %	222112738
25	NC_011994	CT	3	6	14182	14187	0 %	50 %	0 %	50 %	222112739
26	NC_011994	CT	3	6	14457	14462	0 %	50 %	0 %	50 %	222112739
27	NC_011994	CG	3	6	14640	14645	0 %	0 %	50 %	50 %	222112739
28	NC_011994	GT	3	6	15562	15567	0 %	50 %	50 %	0 %	222112706
29	NC_011994	CT	3	6	15602	15607	0 %	50 %	0 %	50 %	222112706
30	NC_011994	GA	3	6	15760	15765	50 %	0 %	50 %	0 %	222112706
31	NC_011994	AC	3	6	16000	16005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011994	TC	3	6	16827	16832	0 %	50 %	0 %	50 %	222112707
33	NC_011994	GA	3	6	17068	17073	50 %	0 %	50 %	0 %	222112707
34	NC_011994	AT	3	6	17228	17233	50 %	50 %	0 %	0 %	222112707
35	NC_011994	GA	3	6	17544	17549	50 %	0 %	50 %	0 %	222112707
36	NC_011994	GA	3	6	17603	17608	50 %	0 %	50 %	0 %	222112707
37	NC_011994	CT	4	8	17850	17857	0 %	50 %	0 %	50 %	222112707
38	NC_011994	TG	3	6	18007	18012	0 %	50 %	50 %	0 %	222112707
39	NC_011994	AT	3	6	18884	18889	50 %	50 %	0 %	0 %	222112708
40	NC_011994	AT	3	6	18914	18919	50 %	50 %	0 %	0 %	222112708
41	NC_011994	GC	3	6	19358	19363	0 %	0 %	50 %	50 %	222112708
42	NC_011994	GA	3	6	20159	20164	50 %	0 %	50 %	0 %	222112709
43	NC_011994	AT	3	6	20953	20958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011994	CG	3	6	21454	21459	0 %	0 %	50 %	50 %	222112710
45	NC_011994	GC	3	6	22485	22490	0 %	0 %	50 %	50 %	222112711
46	NC_011994	AT	3	6	22950	22955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011994	CG	3	6	24049	24054	0 %	0 %	50 %	50 %	222112713
48	NC_011994	GT	3	6	25283	25288	0 %	50 %	50 %	0 %	222112713
49	NC_011994	GC	3	6	28614	28619	0 %	0 %	50 %	50 %	222112716
50	NC_011994	CG	3	6	29941	29946	0 %	0 %	50 %	50 %	222112717
51	NC_011994	TG	3	6	30010	30015	0 %	50 %	50 %	0 %	222112717
52	NC_011994	GC	3	6	30540	30545	0 %	0 %	50 %	50 %	222112718
53	NC_011994	TC	3	6	31320	31325	0 %	50 %	0 %	50 %	222112719
54	NC_011994	GC	3	6	32748	32753	0 %	0 %	50 %	50 %	222112719
55	NC_011994	GA	3	6	33169	33174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011994	CG	4	8	33187	33194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011994	GC	4	8	34006	34013	0 %	0 %	50 %	50 %	222112720
58	NC_011994	GA	3	6	36003	36008	50 %	0 %	50 %	0 %	222112722
59	NC_011994	CG	3	6	36736	36741	0 %	0 %	50 %	50 %	222112723
60	NC_011994	GC	4	8	36981	36988	0 %	0 %	50 %	50 %	222112723
61	NC_011994	GA	3	6	37260	37265	50 %	0 %	50 %	0 %	222112723
62	NC_011994	GC	3	6	37298	37303	0 %	0 %	50 %	50 %	222112723
63	NC_011994	GT	3	6	37521	37526	0 %	50 %	50 %	0 %	222112724
64	NC_011994	GT	3	6	37902	37907	0 %	50 %	50 %	0 %	222112725
65	NC_011994	GC	3	6	38088	38093	0 %	0 %	50 %	50 %	222112725
66	NC_011994	GT	3	6	38758	38763	0 %	50 %	50 %	0 %	222112725
67	NC_011994	GC	3	6	39600	39605	0 %	0 %	50 %	50 %	222112726
68	NC_011994	GA	3	6	40505	40510	50 %	0 %	50 %	0 %	222112727
69	NC_011994	CG	3	6	41899	41904	0 %	0 %	50 %	50 %	222112728
70	NC_011994	GC	3	6	42386	42391	0 %	0 %	50 %	50 %	222112728
71	NC_011994	GC	3	6	43165	43170	0 %	0 %	50 %	50 %	222112728
72	NC_011994	GC	3	6	43239	43244	0 %	0 %	50 %	50 %	222112728
73	NC_011994	CG	3	6	43505	43510	0 %	0 %	50 %	50 %	222112728
74	NC_011994	GC	3	6	43512	43517	0 %	0 %	50 %	50 %	222112728
75	NC_011994	GA	3	6	44392	44397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.