MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011991	A	6	6	523	528	100 %	0 %	0 %	0 %	222109118
2	NC_011991	G	8	8	3767	3774	0 %	0 %	100 %	0 %	222109120
3	NC_011991	T	6	6	4738	4743	0 %	100 %	0 %	0 %	222109121
4	NC_011991	C	6	6	9599	9604	0 %	0 %	0 %	100 %	222109128
5	NC_011991	G	6	6	10322	10327	0 %	0 %	100 %	0 %	222109128
6	NC_011991	G	7	7	11008	11014	0 %	0 %	100 %	0 %	222109130
7	NC_011991	A	6	6	12378	12383	100 %	0 %	0 %	0 %	222109131
8	NC_011991	A	6	6	16624	16629	100 %	0 %	0 %	0 %	222109132
9	NC_011991	T	6	6	20960	20965	0 %	100 %	0 %	0 %	222109137
10	NC_011991	A	6	6	21295	21300	100 %	0 %	0 %	0 %	222109137
11	NC_011991	A	6	6	21423	21428	100 %	0 %	0 %	0 %	222109137
12	NC_011991	A	6	6	22307	22312	100 %	0 %	0 %	0 %	222109137
13	NC_011991	G	7	7	24926	24932	0 %	0 %	100 %	0 %	222109139
14	NC_011991	T	6	6	25382	25387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011991	A	6	6	26313	26318	100 %	0 %	0 %	0 %	222109140
16	NC_011991	A	6	6	28944	28949	100 %	0 %	0 %	0 %	222109142
17	NC_011991	T	6	6	30637	30642	0 %	100 %	0 %	0 %	222109143
18	NC_011991	T	7	7	30841	30847	0 %	100 %	0 %	0 %	222109143
19	NC_011991	T	6	6	32535	32540	0 %	100 %	0 %	0 %	222109143
20	NC_011991	A	6	6	32767	32772	100 %	0 %	0 %	0 %	222109143
21	NC_011991	T	6	6	33508	33513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011991	C	7	7	35433	35439	0 %	0 %	0 %	100 %	222109144
23	NC_011991	A	6	6	35589	35594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011991	A	6	6	36701	36706	100 %	0 %	0 %	0 %	222109147
25	NC_011991	T	6	6	36850	36855	0 %	100 %	0 %	0 %	222109147
26	NC_011991	T	6	6	42983	42988	0 %	100 %	0 %	0 %	222109151
27	NC_011991	A	6	6	46969	46974	100 %	0 %	0 %	0 %	222109157
28	NC_011991	A	6	6	47152	47157	100 %	0 %	0 %	0 %	222109157
29	NC_011991	C	6	6	50545	50550	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_011991	G	6	6	54827	54832	0 %	0 %	100 %	0 %	222109166
31	NC_011991	T	6	6	56769	56774	0 %	100 %	0 %	0 %	222109169
32	NC_011991	C	6	6	62053	62058	0 %	0 %	0 %	100 %	222109175
33	NC_011991	A	6	6	64451	64456	100 %	0 %	0 %	0 %	222109177
34	NC_011991	C	6	6	64470	64475	0 %	0 %	0 %	100 %	222109177
35	NC_011991	C	6	6	65387	65392	0 %	0 %	0 %	100 %	222109180
36	NC_011991	A	6	6	67651	67656	100 %	0 %	0 %	0 %	222109180
37	NC_011991	T	6	6	71550	71555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011991	A	6	6	75071	75076	100 %	0 %	0 %	0 %	222109187
39	NC_011991	T	6	6	75085	75090	0 %	100 %	0 %	0 %	222109187
40	NC_011991	T	6	6	75496	75501	0 %	100 %	0 %	0 %	222109188
41	NC_011991	A	6	6	76473	76478	100 %	0 %	0 %	0 %	222109189
42	NC_011991	T	6	6	76857	76862	0 %	100 %	0 %	0 %	222109189
43	NC_011991	A	6	6	77072	77077	100 %	0 %	0 %	0 %	222109189
44	NC_011991	A	6	6	77096	77101	100 %	0 %	0 %	0 %	222109189
45	NC_011991	A	7	7	78704	78710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011991	T	6	6	79736	79741	0 %	100 %	0 %	0 %	222109191
47	NC_011991	A	7	7	79810	79816	100 %	0 %	0 %	0 %	222109191
48	NC_011991	A	8	8	80084	80091	100 %	0 %	0 %	0 %	222109191
49	NC_011991	T	6	6	80667	80672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011991	A	6	6	81875	81880	100 %	0 %	0 %	0 %	222109193
51	NC_011991	T	9	9	82166	82174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011991	A	7	7	82828	82834	100 %	0 %	0 %	0 %	222109194
53	NC_011991	T	7	7	85656	85662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011991	G	6	6	87162	87167	0 %	0 %	100 %	0 %	222109200
55	NC_011991	A	6	6	87478	87483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011991	A	7	7	88738	88744	100 %	0 %	0 %	0 %	222109201
57	NC_011991	T	6	6	91087	91092	0 %	100 %	0 %	0 %	222109203
58	NC_011991	T	7	7	91176	91182	0 %	100 %	0 %	0 %	222109203
59	NC_011991	G	7	7	92520	92526	0 %	0 %	100 %	0 %	222109204
60	NC_011991	A	7	7	95100	95106	100 %	0 %	0 %	0 %	222109206
61	NC_011991	A	6	6	95177	95182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011991	A	6	6	97826	97831	100 %	0 %	0 %	0 %	222109208
63	NC_011991	A	6	6	99899	99904	100 %	0 %	0 %	0 %	222109208
64	NC_011991	A	6	6	102374	102379	100 %	0 %	0 %	0 %	222109208
65	NC_011991	G	6	6	103422	103427	0 %	0 %	100 %	0 %	222109208
66	NC_011991	T	6	6	107771	107776	0 %	100 %	0 %	0 %	222109208
67	NC_011991	T	8	8	108462	108469	0 %	100 %	0 %	0 %	222109209
68	NC_011991	G	6	6	111028	111033	0 %	0 %	100 %	0 %	222109209
69	NC_011991	G	6	6	114199	114204	0 %	0 %	100 %	0 %	222109209
70	NC_011991	A	7	7	114421	114427	100 %	0 %	0 %	0 %	222109209
71	NC_011991	A	7	7	114675	114681	100 %	0 %	0 %	0 %	222109209
72	NC_011991	A	6	6	114758	114763	100 %	0 %	0 %	0 %	222109209
73	NC_011991	G	6	6	117170	117175	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011991	G	6	6	122556	122561	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011991	T	6	6	122565	122570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011991	A	8	8	127770	127777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011991	A	6	6	127806	127811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011991	C	6	6	128251	128256	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_011991	A	6	6	130030	130035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.