MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_011989	GCC	2	6	2450127	2450132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48502	NC_011989	GCC	2	6	2450263	2450268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
48503	NC_011989	CCG	2	6	2450373	2450378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
48504	NC_011989	CGC	2	6	2450451	2450456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
48505	NC_011989	CCG	2	6	2450471	2450476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
48506	NC_011989	TTG	2	6	2450523	2450528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149165
48507	NC_011989	ATG	2	6	2450576	2450581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149165
48508	NC_011989	CGC	2	6	2450696	2450701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
48509	NC_011989	TGGC	2	8	2450743	2450750	0 %	25 %	50 %	25 %	222149165
48510	NC_011989	CCG	2	6	2450762	2450767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
48511	NC_011989	GTC	2	6	2450842	2450847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149165
48512	NC_011989	GGA	2	6	2450872	2450877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149165
48513	NC_011989	CCG	2	6	2450891	2450896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
48514	NC_011989	ATG	2	6	2450926	2450931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149165
48515	NC_011989	TC	3	6	2450933	2450938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48516	NC_011989	GCGGA	2	10	2451056	2451065	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48517	NC_011989	CAC	2	6	2451169	2451174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149166
48518	NC_011989	ATCA	2	8	2451208	2451215	50 %	25 %	0 %	25 %	222149166
48519	NC_011989	CGC	2	6	2451235	2451240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149166
48520	NC_011989	CGC	2	6	2451244	2451249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149166
48521	NC_011989	GCC	2	6	2451253	2451258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149166
48522	NC_011989	CCCAGG	2	12	2451317	2451328	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222149166
48523	NC_011989	CTG	2	6	2451436	2451441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149166
48524	NC_011989	GGGC	2	8	2451456	2451463	0 %	0 %	75 %	25 %	222149166
48525	NC_011989	CAA	2	6	2451534	2451539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149166
48526	NC_011989	CTG	2	6	2451613	2451618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149166
48527	NC_011989	TTTG	2	8	2451672	2451679	0 %	75 %	25 %	0 %	222149166
48528	NC_011989	ACG	2	6	2451692	2451697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149166
48529	NC_011989	TGGA	2	8	2451760	2451767	25 %	25 %	50 %	0 %	222149166
48530	NC_011989	CGG	3	9	2451846	2451854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149166
48531	NC_011989	CCA	2	6	2451866	2451871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149166
48532	NC_011989	GGT	2	6	2451874	2451879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149166
48533	NC_011989	CG	3	6	2451889	2451894	0 %	0 %	50 %	50 %	222149166
48534	NC_011989	ATC	2	6	2451899	2451904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149166
48535	NC_011989	CTGA	2	8	2451922	2451929	25 %	25 %	25 %	25 %	222149166
48536	NC_011989	GGC	2	6	2451999	2452004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149166
48537	NC_011989	ATG	2	6	2452097	2452102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149167
48538	NC_011989	AGAC	2	8	2452111	2452118	50 %	0 %	25 %	25 %	222149167
48539	NC_011989	TCCAC	2	10	2452145	2452154	20 %	20 %	0 %	60 %	222149167
48540	NC_011989	ATG	2	6	2452220	2452225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149167
48541	NC_011989	CGC	2	6	2452245	2452250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149167
48542	NC_011989	TGG	2	6	2452251	2452256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149167
48543	NC_011989	CTG	2	6	2452290	2452295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149167
48544	NC_011989	TTTC	2	8	2452318	2452325	0 %	75 %	0 %	25 %	222149167
48545	NC_011989	ATA	2	6	2452352	2452357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149167
48546	NC_011989	CGC	2	6	2452358	2452363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149167
48547	NC_011989	TCG	2	6	2452494	2452499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149167
48548	NC_011989	ATC	2	6	2452505	2452510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149167
48549	NC_011989	CAT	2	6	2452528	2452533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149167
48550	NC_011989	A	6	6	2452542	2452547	100 %	0 %	0 %	0 %	222149167
48551	NC_011989	TGG	2	6	2452599	2452604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149167
48552	NC_011989	GCT	2	6	2452740	2452745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149167
48553	NC_011989	CAT	2	6	2452765	2452770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149167
48554	NC_011989	GCC	2	6	2452865	2452870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149167
48555	NC_011989	CGG	2	6	2452873	2452878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149167
48556	NC_011989	GT	3	6	2452887	2452892	0 %	50 %	50 %	0 %	222149167
48557	NC_011989	GCA	2	6	2452904	2452909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149167
48558	NC_011989	CGC	2	6	2452926	2452931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149167
48559	NC_011989	TGGC	2	8	2452966	2452973	0 %	25 %	50 %	25 %	222149167
48560	NC_011989	CAT	3	9	2453020	2453028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149167
48561	NC_011989	CAT	2	6	2453044	2453049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149167
48562	NC_011989	CAG	2	6	2453089	2453094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149167
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48565	NC_011989	CGT	2	6	2453272	2453277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149168
48566	NC_011989	GCC	2	6	2453280	2453285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149168
48567	NC_011989	GGC	2	6	2453291	2453296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149168
48568	NC_011989	GCG	2	6	2453297	2453302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149168
48569	NC_011989	ATG	2	6	2453303	2453308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149168
48570	NC_011989	CG	3	6	2453358	2453363	0 %	0 %	50 %	50 %	222149168
48571	NC_011989	CCA	2	6	2453373	2453378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149168
48572	NC_011989	CGG	2	6	2453385	2453390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149168
48573	NC_011989	GAT	2	6	2453422	2453427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149168
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48576	NC_011989	GTG	2	6	2453606	2453611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149168
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48578	NC_011989	CGCC	2	8	2453659	2453666	0 %	0 %	25 %	75 %	222149168
48579	NC_011989	CGG	2	6	2453758	2453763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149168
48580	NC_011989	GCT	2	6	2453832	2453837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149168
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48582	NC_011989	ATC	2	6	2453862	2453867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149168
48583	NC_011989	TCGGCA	2	12	2453892	2453903	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222149168
48584	NC_011989	CGC	2	6	2454112	2454117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149168
48585	NC_011989	ACA	2	6	2454345	2454350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149168
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48587	NC_011989	CGC	2	6	2454394	2454399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149168
48588	NC_011989	GCT	2	6	2454456	2454461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149168
48589	NC_011989	ATG	2	6	2454464	2454469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149168
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48591	NC_011989	CCG	2	6	2454489	2454494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149168
48592	NC_011989	ATC	2	6	2454512	2454517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149168
48593	NC_011989	AAC	2	6	2454530	2454535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149168
48594	NC_011989	GCAT	2	8	2454555	2454562	25 %	25 %	25 %	25 %	222149168
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48596	NC_011989	CGG	2	6	2454681	2454686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149168
48597	NC_011989	GC	3	6	2454694	2454699	0 %	0 %	50 %	50 %	222149168
48598	NC_011989	ATC	2	6	2454722	2454727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149168
48599	NC_011989	GAAGC	2	10	2454827	2454836	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48600	NC_011989	TC	3	6	2454847	2454852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48601	NC_011989	CAT	2	6	2454855	2454860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149169
48602	NC_011989	GCA	2	6	2454876	2454881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149169
48603	NC_011989	CCAG	2	8	2454889	2454896	25 %	0 %	25 %	50 %	222149169
48604	NC_011989	TCA	2	6	2454912	2454917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149169
48605	NC_011989	GGC	2	6	2454982	2454987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149169
48606	NC_011989	GTT	2	6	2455012	2455017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149169
48607	NC_011989	CGA	2	6	2455078	2455083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149169
48608	NC_011989	CAG	2	6	2455106	2455111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149169
48609	NC_011989	GC	3	6	2455118	2455123	0 %	0 %	50 %	50 %	222149169
48610	NC_011989	CAGC	2	8	2455153	2455160	25 %	0 %	25 %	50 %	222149169
48611	NC_011989	GCA	2	6	2455249	2455254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149169
48612	NC_011989	ATCC	2	8	2455267	2455274	25 %	25 %	0 %	50 %	222149169
48613	NC_011989	GCCT	2	8	2455292	2455299	0 %	25 %	25 %	50 %	222149169
48614	NC_011989	CAGG	2	8	2455300	2455307	25 %	0 %	50 %	25 %	222149169
48615	NC_011989	ATA	2	6	2455366	2455371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48616	NC_011989	GCG	2	6	2455459	2455464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149170
48617	NC_011989	CG	3	6	2455599	2455604	0 %	0 %	50 %	50 %	222149170
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48733	NC_011989	GAT	2	6	2461965	2461970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149177
48734	NC_011989	AGA	2	6	2461999	2462004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149177
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48740	NC_011989	AGA	2	6	2462519	2462524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149177
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48745	NC_011989	GA	3	6	2462803	2462808	50 %	0 %	50 %	0 %	222149177
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48751	NC_011989	GCCGAT	2	12	2463159	2463170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222149177
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48760	NC_011989	CGT	2	6	2463652	2463657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48761	NC_011989	AAC	2	6	2463658	2463663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48762	NC_011989	GCACAG	2	12	2463704	2463715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48764	NC_011989	T	6	6	2463802	2463807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48765	NC_011989	T	6	6	2463868	2463873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48766	NC_011989	GTC	2	6	2463906	2463911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48769	NC_011989	CACC	2	8	2464119	2464126	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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48845	NC_011989	TGAAT	2	10	2468364	2468373	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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48852	NC_011989	TCG	2	6	2468970	2468975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149182
48853	NC_011989	CAT	2	6	2468981	2468986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149182
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48912	NC_011989	CAAT	2	8	2472331	2472338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48913	NC_011989	CAT	2	6	2472395	2472400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48916	NC_011989	TA	3	6	2472544	2472549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48917	NC_011989	A	6	6	2472583	2472588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48918	NC_011989	GACAT	2	10	2472609	2472618	40 %	20 %	20 %	20 %	222149185
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48932	NC_011989	A	6	6	2473456	2473461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48933	NC_011989	A	6	6	2473514	2473519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48934	NC_011989	TC	3	6	2473573	2473578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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48936	NC_011989	A	7	7	2473670	2473676	100 %	0 %	0 %	0 %	222149186
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48944	NC_011989	AATT	2	8	2474320	2474327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48945	NC_011989	GATTT	2	10	2474452	2474461	20 %	60 %	20 %	0 %	222149187
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48965	NC_011989	GAT	2	6	2475851	2475856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149188
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