MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_011989	GCCAGA	2	12	2401675	2401686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149128
47502	NC_011989	TCG	2	6	2401723	2401728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149128
47503	NC_011989	GAC	2	6	2401752	2401757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149128
47504	NC_011989	GTC	2	6	2401761	2401766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149128
47505	NC_011989	CAC	2	6	2401776	2401781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149128
47506	NC_011989	GCCAG	2	10	2401807	2401816	20 %	0 %	40 %	40 %	222149128
47507	NC_011989	GC	3	6	2401861	2401866	0 %	0 %	50 %	50 %	222149128
47508	NC_011989	GGC	2	6	2401916	2401921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149128
47509	NC_011989	AATCGA	2	12	2401934	2401945	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222149128
47510	NC_011989	TCA	2	6	2402021	2402026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149128
47511	NC_011989	GCG	2	6	2402037	2402042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149128
47512	NC_011989	CGG	2	6	2402093	2402098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149128
47513	NC_011989	ACC	2	6	2402140	2402145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149128
47514	NC_011989	GCC	2	6	2402173	2402178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149128
47515	NC_011989	GGCA	2	8	2402331	2402338	25 %	0 %	50 %	25 %	222149128
47516	NC_011989	GTC	2	6	2402407	2402412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47517	NC_011989	CAA	2	6	2402421	2402426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47518	NC_011989	CATTCA	2	12	2402436	2402447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47519	NC_011989	ATCCG	2	10	2402464	2402473	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47520	NC_011989	CCG	2	6	2402527	2402532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47521	NC_011989	TCG	2	6	2402537	2402542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47522	NC_011989	CAA	2	6	2402617	2402622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47523	NC_011989	TTTC	2	8	2402635	2402642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47524	NC_011989	A	6	6	2402668	2402673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47525	NC_011989	CAA	2	6	2402706	2402711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47526	NC_011989	GA	3	6	2402791	2402796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47527	NC_011989	GGC	2	6	2402908	2402913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149129
47528	NC_011989	AAG	2	6	2402916	2402921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149129
47529	NC_011989	GTC	2	6	2402939	2402944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47530	NC_011989	GCT	2	6	2402959	2402964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47531	NC_011989	ACG	2	6	2402999	2403004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47532	NC_011989	GGCT	2	8	2403016	2403023	0 %	25 %	50 %	25 %	222149129
47533	NC_011989	GCT	2	6	2403043	2403048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47534	NC_011989	GGC	3	9	2403053	2403061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149129
47535	NC_011989	GCT	2	6	2403066	2403071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47536	NC_011989	CGAG	2	8	2403109	2403116	25 %	0 %	50 %	25 %	222149129
47537	NC_011989	GCG	2	6	2403125	2403130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149129
47538	NC_011989	CAG	2	6	2403131	2403136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47539	NC_011989	CTG	2	6	2403164	2403169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47540	NC_011989	CTGG	2	8	2403250	2403257	0 %	25 %	50 %	25 %	222149129
47541	NC_011989	GCA	3	9	2403330	2403338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47542	NC_011989	CGGA	2	8	2403419	2403426	25 %	0 %	50 %	25 %	222149129
47543	NC_011989	CAG	2	6	2403433	2403438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47544	NC_011989	GCA	2	6	2403447	2403452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47545	NC_011989	GCT	2	6	2403454	2403459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47546	NC_011989	GCAT	2	8	2403474	2403481	25 %	25 %	25 %	25 %	222149129
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47551	NC_011989	GGC	2	6	2403743	2403748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149129
47552	NC_011989	CGAC	2	8	2403769	2403776	25 %	0 %	25 %	50 %	222149129
47553	NC_011989	GAT	2	6	2403821	2403826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149129
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47555	NC_011989	TCG	2	6	2403870	2403875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47556	NC_011989	ACC	2	6	2403899	2403904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149129
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47558	NC_011989	GC	3	6	2403928	2403933	0 %	0 %	50 %	50 %	222149129
47559	NC_011989	TCG	2	6	2403948	2403953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149129
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47564	NC_011989	GTC	2	6	2404170	2404175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47565	NC_011989	GCG	2	6	2404274	2404279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149129
47566	NC_011989	CG	3	6	2404278	2404283	0 %	0 %	50 %	50 %	222149129
47567	NC_011989	GAC	2	6	2404307	2404312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149129
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47569	NC_011989	ACCGGT	2	12	2404367	2404378	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222149129
47570	NC_011989	GCC	3	9	2404379	2404387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149129
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47572	NC_011989	TCA	2	6	2404440	2404445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149129
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47575	NC_011989	GAT	2	6	2404526	2404531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149129
47576	NC_011989	TGGTCA	2	12	2404543	2404554	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222149129
47577	NC_011989	CAA	2	6	2404576	2404581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149129
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47579	NC_011989	CTT	2	6	2404723	2404728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149129
47580	NC_011989	TGTCT	2	10	2404756	2404765	0 %	60 %	20 %	20 %	222149129
47581	NC_011989	CG	3	6	2404772	2404777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47582	NC_011989	CT	3	6	2404821	2404826	0 %	50 %	0 %	50 %	222149130
47583	NC_011989	CAT	2	6	2404847	2404852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149130
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47587	NC_011989	GGC	2	6	2404999	2405004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149130
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47589	NC_011989	ATC	2	6	2405136	2405141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149130
47590	NC_011989	ATC	2	6	2405216	2405221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149130
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47602	NC_011989	GCA	3	9	2405683	2405691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149130
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47604	NC_011989	GCA	2	6	2405721	2405726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149130
47605	NC_011989	TGG	2	6	2405779	2405784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149130
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47609	NC_011989	CCGGC	2	10	2405981	2405990	0 %	0 %	40 %	60 %	222149130
47610	NC_011989	GCG	2	6	2406010	2406015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149130
47611	NC_011989	GCCG	2	8	2406019	2406026	0 %	0 %	50 %	50 %	222149130
47612	NC_011989	GA	3	6	2406090	2406095	50 %	0 %	50 %	0 %	222149130
47613	NC_011989	CAG	2	6	2406255	2406260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149131
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47615	NC_011989	GCG	2	6	2406522	2406527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149131
47616	NC_011989	GAT	2	6	2406529	2406534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149131
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47700	NC_011989	CGTTT	2	10	2410555	2410564	0 %	60 %	20 %	20 %	222149134
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47730	NC_011989	GGC	2	6	2412094	2412099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149135
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47963	NC_011989	CAT	2	6	2422498	2422503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149142
47964	NC_011989	GAAA	2	8	2422508	2422515	75 %	0 %	25 %	0 %	222149142
47965	NC_011989	TCA	2	6	2422518	2422523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149142
47966	NC_011989	GCC	2	6	2422624	2422629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149143
47967	NC_011989	CAA	2	6	2422767	2422772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149143
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47978	NC_011989	C	7	7	2423244	2423250	0 %	0 %	0 %	100 %	222149144
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47980	NC_011989	GGAT	2	8	2423347	2423354	25 %	25 %	50 %	0 %	222149144
47981	NC_011989	CG	3	6	2423405	2423410	0 %	0 %	50 %	50 %	222149144
47982	NC_011989	GAT	2	6	2423423	2423428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149144
47983	NC_011989	TGA	2	6	2423501	2423506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149144
47984	NC_011989	GAC	2	6	2423529	2423534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149144
47985	NC_011989	CGG	2	6	2423537	2423542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149144
47986	NC_011989	AC	3	6	2423546	2423551	50 %	0 %	0 %	50 %	222149144
47987	NC_011989	GGAA	2	8	2423591	2423598	50 %	0 %	50 %	0 %	222149144
47988	NC_011989	GGA	2	6	2423628	2423633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149144
47989	NC_011989	ATG	2	6	2423706	2423711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149144
47990	NC_011989	GAC	2	6	2423720	2423725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149144
47991	NC_011989	GCG	2	6	2423734	2423739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149144
47992	NC_011989	GAA	2	6	2423900	2423905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149144
47993	NC_011989	CAT	2	6	2424026	2424031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47994	NC_011989	CGGA	2	8	2424048	2424055	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47995	NC_011989	GCC	3	9	2424126	2424134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149145
47996	NC_011989	CGAC	2	8	2424183	2424190	25 %	0 %	25 %	50 %	222149145
47997	NC_011989	GCC	2	6	2424247	2424252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149145
47998	NC_011989	CGC	3	9	2424277	2424285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149145
47999	NC_011989	CGA	2	6	2424317	2424322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149145
48000	NC_011989	CAG	2	6	2424362	2424367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149145

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