MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011989	GCC	2	6	26268	26273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147043
502	NC_011989	CGA	2	6	26320	26325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147043
503	NC_011989	TCA	2	6	26326	26331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147043
504	NC_011989	TCGA	2	8	26414	26421	25 %	25 %	25 %	25 %	222147043
505	NC_011989	GACGA	2	10	26432	26441	40 %	0 %	40 %	20 %	222147043
506	NC_011989	GGC	2	6	26449	26454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147043
507	NC_011989	T	6	6	26546	26551	0 %	100 %	0 %	0 %	222147043
508	NC_011989	TAA	2	6	26608	26613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147043
509	NC_011989	CAT	2	6	26615	26620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147043
510	NC_011989	ATT	2	6	26765	26770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147044
511	NC_011989	CCA	2	6	26799	26804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147044
512	NC_011989	CCG	2	6	26883	26888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147044
513	NC_011989	TGC	2	6	26898	26903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147044
514	NC_011989	GCAT	2	8	26955	26962	25 %	25 %	25 %	25 %	222147044
515	NC_011989	GCCC	2	8	26993	27000	0 %	0 %	25 %	75 %	222147044
516	NC_011989	GTC	2	6	27034	27039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147044
517	NC_011989	TGG	2	6	27093	27098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147044
518	NC_011989	GGC	2	6	27241	27246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147044
519	NC_011989	CGAC	2	8	27273	27280	25 %	0 %	25 %	50 %	222147044
520	NC_011989	GGC	2	6	27284	27289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147044
521	NC_011989	GC	3	6	27327	27332	0 %	0 %	50 %	50 %	222147044
522	NC_011989	GAT	2	6	27427	27432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147045
523	NC_011989	GC	3	6	27525	27530	0 %	0 %	50 %	50 %	222147045
524	NC_011989	TGT	2	6	27571	27576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147045
525	NC_011989	CGA	2	6	27642	27647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147045
526	NC_011989	GCG	2	6	27666	27671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147045
527	NC_011989	CG	3	6	27720	27725	0 %	0 %	50 %	50 %	222147045
528	NC_011989	CGTG	2	8	27745	27752	0 %	25 %	50 %	25 %	222147045
529	NC_011989	AAG	2	6	27884	27889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147045
530	NC_011989	ATC	2	6	27914	27919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147045
531	NC_011989	CGGG	2	8	28014	28021	0 %	0 %	75 %	25 %	222147045
532	NC_011989	CCG	2	6	28042	28047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147045
533	NC_011989	GC	3	6	28064	28069	0 %	0 %	50 %	50 %	222147045
534	NC_011989	ATG	2	6	28104	28109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147045
535	NC_011989	GATC	2	8	28114	28121	25 %	25 %	25 %	25 %	222147045
536	NC_011989	CGG	2	6	28122	28127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147045
537	NC_011989	ATT	2	6	28194	28199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147046
538	NC_011989	CGT	2	6	28226	28231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147046
539	NC_011989	GTC	2	6	28371	28376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147046
540	NC_011989	CCGCA	2	10	28379	28388	20 %	0 %	20 %	60 %	222147046
541	NC_011989	G	6	6	28415	28420	0 %	0 %	100 %	0 %	222147046
542	NC_011989	GCGG	2	8	28427	28434	0 %	0 %	75 %	25 %	222147046
543	NC_011989	GCT	3	9	28451	28459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147046
544	NC_011989	TCAA	2	8	28479	28486	50 %	25 %	0 %	25 %	222147046
545	NC_011989	GCC	2	6	28524	28529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147046
546	NC_011989	CAAT	2	8	28541	28548	50 %	25 %	0 %	25 %	222147046
547	NC_011989	GCCAG	2	10	28585	28594	20 %	0 %	40 %	40 %	222147046
548	NC_011989	GCG	2	6	28693	28698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147046
549	NC_011989	TGG	2	6	28834	28839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147046
550	NC_011989	GGC	2	6	28874	28879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147046
551	NC_011989	TTG	2	6	29017	29022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147047
552	NC_011989	GCC	2	6	29091	29096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147047
553	NC_011989	AAG	2	6	29097	29102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147047
554	NC_011989	GAC	2	6	29305	29310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147048
555	NC_011989	CAGG	2	8	29317	29324	25 %	0 %	50 %	25 %	222147048
556	NC_011989	GGA	2	6	29332	29337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147048
557	NC_011989	TCG	2	6	29387	29392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147048
558	NC_011989	CGC	2	6	29421	29426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147048
559	NC_011989	CGG	2	6	29495	29500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147048
560	NC_011989	ATCT	2	8	29501	29508	25 %	50 %	0 %	25 %	222147048
561	NC_011989	AGC	2	6	29562	29567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147048
562	NC_011989	TAT	2	6	29608	29613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147048
563	NC_011989	CGGTGG	2	12	29628	29639	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222147048
564	NC_011989	CCA	2	6	29646	29651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147048
565	NC_011989	GC	3	6	29654	29659	0 %	0 %	50 %	50 %	222147048
566	NC_011989	CAC	2	6	29713	29718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147048
567	NC_011989	AACGC	2	10	29738	29747	40 %	0 %	20 %	40 %	222147048
568	NC_011989	ACA	2	6	29757	29762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147048
569	NC_011989	CGG	2	6	29799	29804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147048
570	NC_011989	CTG	2	6	29807	29812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147048
571	NC_011989	TGC	2	6	29886	29891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147048
572	NC_011989	CAT	2	6	29905	29910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147048
573	NC_011989	TGC	2	6	29949	29954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147048
574	NC_011989	CG	3	6	29958	29963	0 %	0 %	50 %	50 %	222147048
575	NC_011989	TTC	2	6	30005	30010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147048
576	NC_011989	CGA	2	6	30129	30134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147048
577	NC_011989	ATC	2	6	30258	30263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147048
578	NC_011989	TAT	3	9	30311	30319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011989	GAG	2	6	30352	30357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011989	CATT	2	8	30366	30373	25 %	50 %	0 %	25 %	222147049
581	NC_011989	CAA	2	6	30379	30384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147049
582	NC_011989	GT	3	6	30408	30413	0 %	50 %	50 %	0 %	222147049
583	NC_011989	CAGCGA	2	12	30426	30437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147049
584	NC_011989	CCG	2	6	30447	30452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147049
585	NC_011989	CGG	3	9	30487	30495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147049
586	NC_011989	ATC	2	6	30608	30613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147049
587	NC_011989	CGG	2	6	30622	30627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147049
588	NC_011989	TGC	2	6	30687	30692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147049
589	NC_011989	CAA	2	6	30763	30768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147049
590	NC_011989	CGT	2	6	30863	30868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147049
591	NC_011989	CGC	2	6	31015	31020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147050
592	NC_011989	TGG	2	6	31060	31065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147050
593	NC_011989	CGGCG	2	10	31077	31086	0 %	0 %	60 %	40 %	222147050
594	NC_011989	GGT	2	6	31092	31097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147050
595	NC_011989	GCT	2	6	31101	31106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147050
596	NC_011989	AGC	2	6	31110	31115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147050
597	NC_011989	CAA	2	6	31184	31189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147050
598	NC_011989	CTT	2	6	31195	31200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147050
599	NC_011989	GAA	2	6	31277	31282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147050
600	NC_011989	CGG	2	6	31291	31296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147050
601	NC_011989	TTG	2	6	31305	31310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147050
602	NC_011989	GCCC	2	8	31318	31325	0 %	0 %	25 %	75 %	222147050
603	NC_011989	ACC	2	6	31328	31333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147050
604	NC_011989	TCGC	2	8	31401	31408	0 %	25 %	25 %	50 %	222147050
605	NC_011989	CT	3	6	31475	31480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_011989	GAT	2	6	31544	31549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011989	GCA	2	6	31595	31600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147051
608	NC_011989	AGTC	2	8	31707	31714	25 %	25 %	25 %	25 %	222147051
609	NC_011989	CTT	2	6	31816	31821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147051
610	NC_011989	GA	3	6	31832	31837	50 %	0 %	50 %	0 %	222147051
611	NC_011989	GCC	2	6	31838	31843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147051
612	NC_011989	CAG	2	6	31846	31851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147051
613	NC_011989	CCG	2	6	31898	31903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147051
614	NC_011989	CCAG	2	8	31906	31913	25 %	0 %	25 %	50 %	222147051
615	NC_011989	CCAG	2	8	31920	31927	25 %	0 %	25 %	50 %	222147051
616	NC_011989	CGC	2	6	32043	32048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147051
617	NC_011989	GCCA	2	8	32056	32063	25 %	0 %	25 %	50 %	222147051
618	NC_011989	CGG	2	6	32125	32130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147051
619	NC_011989	ATG	3	9	32159	32167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147051
620	NC_011989	TGG	3	9	32322	32330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147051
621	NC_011989	CCG	2	6	32352	32357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147051
622	NC_011989	AGC	2	6	32379	32384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147051
623	NC_011989	TGCCGG	2	12	32475	32486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222147051
624	NC_011989	GAA	2	6	32494	32499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147051
625	NC_011989	GCA	2	6	32565	32570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147051
626	NC_011989	CTT	2	6	32596	32601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147051
627	NC_011989	TAG	2	6	32615	32620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147051
628	NC_011989	TTG	2	6	32642	32647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147051
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998	NC_011989	AGG	2	6	51749	51754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
999	NC_011989	CTT	2	6	51858	51863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147063
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