MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011989	GAG	2	6	283212	283217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147263
5502	NC_011989	CGAG	2	8	283264	283271	25 %	0 %	50 %	25 %	222147263
5503	NC_011989	ACG	2	6	283272	283277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147263
5504	NC_011989	CTG	2	6	283294	283299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147263
5505	NC_011989	TGG	3	9	283321	283329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147263
5506	NC_011989	TCA	2	6	283360	283365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147263
5507	NC_011989	GCGCAG	2	12	283376	283387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222147263
5508	NC_011989	TGC	2	6	283435	283440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147263
5509	NC_011989	CAAT	2	8	283518	283525	50 %	25 %	0 %	25 %	222147264
5510	NC_011989	CGA	2	6	283566	283571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147264
5511	NC_011989	TGG	2	6	283575	283580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147264
5512	NC_011989	CGC	2	6	283599	283604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147264
5513	NC_011989	CGC	2	6	283620	283625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147264
5514	NC_011989	CAT	2	6	283636	283641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147264
5515	NC_011989	CAG	2	6	283663	283668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147264
5516	NC_011989	GGC	2	6	283696	283701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147264
5517	NC_011989	GCG	2	6	283724	283729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147264
5518	NC_011989	TGCA	2	8	283741	283748	25 %	25 %	25 %	25 %	222147264
5519	NC_011989	TGT	2	6	283757	283762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147264
5520	NC_011989	CCA	2	6	283797	283802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147264
5521	NC_011989	GCT	2	6	283878	283883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147264
5522	NC_011989	GCC	2	6	283906	283911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_011989	CTGC	2	8	283926	283933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_011989	TGA	2	6	283969	283974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011989	TGC	2	6	284012	284017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_011989	CAG	2	6	284029	284034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147265
5527	NC_011989	GAA	2	6	284200	284205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147265
5528	NC_011989	CAG	2	6	284227	284232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147265
5529	NC_011989	GC	3	6	284258	284263	0 %	0 %	50 %	50 %	222147265
5530	NC_011989	CGG	2	6	284362	284367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147265
5531	NC_011989	GAA	2	6	284371	284376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147265
5532	NC_011989	CGG	2	6	284448	284453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147265
5533	NC_011989	TGGA	2	8	284515	284522	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_011989	CAT	2	6	284534	284539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147266
5535	NC_011989	GAT	2	6	284548	284553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147266
5536	NC_011989	CAT	2	6	284598	284603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147266
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5538	NC_011989	GA	3	6	284705	284710	50 %	0 %	50 %	0 %	222147266
5539	NC_011989	GGC	2	6	284801	284806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147266
5540	NC_011989	GGC	2	6	284855	284860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147266
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5542	NC_011989	GAT	2	6	285082	285087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147266
5543	NC_011989	CAG	2	6	285088	285093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147266
5544	NC_011989	CAT	2	6	285099	285104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147266
5545	NC_011989	TCATG	2	10	285114	285123	20 %	40 %	20 %	20 %	222147266
5546	NC_011989	TCTG	2	8	285166	285173	0 %	50 %	25 %	25 %	222147266
5547	NC_011989	TTG	2	6	285203	285208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147266
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5551	NC_011989	GAC	2	6	285295	285300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147266
5552	NC_011989	CTG	2	6	285313	285318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147266
5553	NC_011989	GCC	2	6	285351	285356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147266
5554	NC_011989	CG	3	6	285420	285425	0 %	0 %	50 %	50 %	222147266
5555	NC_011989	GCG	2	6	285455	285460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147266
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5557	NC_011989	GCT	2	6	285524	285529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147266
5558	NC_011989	CGCGC	2	10	285598	285607	0 %	0 %	40 %	60 %	222147266
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5560	NC_011989	TGC	2	6	285692	285697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147267
5561	NC_011989	CAG	2	6	285708	285713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147267
5562	NC_011989	GCC	2	6	285751	285756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147267
5563	NC_011989	GGT	2	6	285780	285785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147267
5564	NC_011989	CCGC	2	8	285960	285967	0 %	0 %	25 %	75 %	222147267
5565	NC_011989	GAA	2	6	285978	285983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147267
5566	NC_011989	TCG	2	6	285997	286002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147267
5567	NC_011989	CAT	2	6	286073	286078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147267
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5570	NC_011989	GTC	2	6	286317	286322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147267
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5593	NC_011989	TCCGG	2	10	287841	287850	0 %	20 %	40 %	40 %	222147268
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5602	NC_011989	TCG	2	6	288253	288258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147268
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5607	NC_011989	TTG	2	6	288491	288496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147269
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5617	NC_011989	GC	3	6	288968	288973	0 %	0 %	50 %	50 %	222147269
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5621	NC_011989	TGG	2	6	289164	289169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147269
5622	NC_011989	TTGATC	2	12	289187	289198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222147269
5623	NC_011989	TCA	2	6	289322	289327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147269
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5625	NC_011989	CTG	2	6	289360	289365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147269
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5662	NC_011989	ATCC	2	8	291176	291183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5663	NC_011989	TTG	2	6	291198	291203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5664	NC_011989	CAA	2	6	291325	291330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5679	NC_011989	GA	3	6	292079	292084	50 %	0 %	50 %	0 %	222147272
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5694	NC_011989	CGT	2	6	292826	292831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147272
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5702	NC_011989	CTGCG	2	10	293272	293281	0 %	20 %	40 %	40 %	222147273
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5735	NC_011989	ATCG	2	8	294973	294980	25 %	25 %	25 %	25 %	222147275
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5865	NC_011989	CTT	2	6	301557	301562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147282
5866	NC_011989	GTT	2	6	301675	301680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147282
5867	NC_011989	CGA	2	6	301738	301743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147282
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5869	NC_011989	ATG	2	6	301979	301984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147282
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5871	NC_011989	TAA	2	6	302117	302122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147282
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5873	NC_011989	CGAT	2	8	302156	302163	25 %	25 %	25 %	25 %	222147282
5874	NC_011989	GGCA	2	8	302243	302250	25 %	0 %	50 %	25 %	222147282
5875	NC_011989	CGAC	2	8	302266	302273	25 %	0 %	25 %	50 %	222147282
5876	NC_011989	AGC	2	6	302315	302320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147282
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5879	NC_011989	AGC	2	6	302477	302482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147282
5880	NC_011989	ACC	2	6	302519	302524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147282
5881	NC_011989	AGA	2	6	302549	302554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147282
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5883	NC_011989	GCA	2	6	302677	302682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147282
5884	NC_011989	CCA	2	6	302739	302744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5885	NC_011989	GCCT	2	8	302786	302793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5886	NC_011989	CGGCC	2	10	302956	302965	0 %	0 %	40 %	60 %	222147283
5887	NC_011989	TGG	2	6	302986	302991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147283
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5899	NC_011989	ATG	2	6	303589	303594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147283
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5907	NC_011989	A	7	7	303810	303816	100 %	0 %	0 %	0 %	222147284
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5918	NC_011989	GGC	2	6	304351	304356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147285
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5921	NC_011989	TGG	2	6	304409	304414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147285
5922	NC_011989	TCA	2	6	304443	304448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147285
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5929	NC_011989	TCG	2	6	304731	304736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147285
5930	NC_011989	TCG	2	6	304751	304756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147285
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5949	NC_011989	GATCT	2	10	305644	305653	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5950	NC_011989	GTTCA	2	10	305714	305723	20 %	40 %	20 %	20 %	222147286
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5953	NC_011989	GTC	2	6	305812	305817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147286
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5963	NC_011989	CTG	2	6	306350	306355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147286
5964	NC_011989	CCG	2	6	306423	306428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147286
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5972	NC_011989	TGC	2	6	306814	306819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147287
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5975	NC_011989	ATC	2	6	306933	306938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147287
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5977	NC_011989	GCT	2	6	306947	306952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147287
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5981	NC_011989	TGAT	2	8	307150	307157	25 %	50 %	25 %	0 %	222147287
5982	NC_011989	GAT	2	6	307181	307186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147287
5983	NC_011989	GCG	2	6	307188	307193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147287
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5987	NC_011989	TGGG	2	8	307308	307315	0 %	25 %	75 %	0 %	222147287
5988	NC_011989	TCA	2	6	307378	307383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147287
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5990	NC_011989	TCA	2	6	307408	307413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147287
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