MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_011989	CAG	2	6	2602324	2602329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149299
51502	NC_011989	TGA	2	6	2602332	2602337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149299
51503	NC_011989	CA	3	6	2602346	2602351	50 %	0 %	0 %	50 %	222149299
51504	NC_011989	CAA	2	6	2602357	2602362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149299
51505	NC_011989	GC	3	6	2602420	2602425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51506	NC_011989	GCT	2	6	2602539	2602544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51507	NC_011989	CGGCG	2	10	2602597	2602606	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51508	NC_011989	TGA	2	6	2602626	2602631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51509	NC_011989	GCA	2	6	2602644	2602649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51510	NC_011989	GAC	2	6	2602724	2602729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149300
51511	NC_011989	GAT	2	6	2602819	2602824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149300
51512	NC_011989	CCA	2	6	2602863	2602868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149300
51513	NC_011989	GAT	2	6	2602921	2602926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149300
51514	NC_011989	GCG	2	6	2602976	2602981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149300
51515	NC_011989	CGG	2	6	2603002	2603007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149300
51516	NC_011989	GCG	2	6	2603095	2603100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149300
51517	NC_011989	TCC	2	6	2603291	2603296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149300
51518	NC_011989	CTT	2	6	2603356	2603361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149300
51519	NC_011989	CAAT	2	8	2603501	2603508	50 %	25 %	0 %	25 %	222149300
51520	NC_011989	ACA	2	6	2603528	2603533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149300
51521	NC_011989	T	7	7	2603620	2603626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51522	NC_011989	A	7	7	2603627	2603633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51523	NC_011989	TAC	2	6	2603662	2603667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51524	NC_011989	TCC	2	6	2603685	2603690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51525	NC_011989	TTG	2	6	2603769	2603774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51526	NC_011989	GCA	2	6	2603801	2603806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51527	NC_011989	CAT	2	6	2603824	2603829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51528	NC_011989	G	6	6	2603886	2603891	0 %	0 %	100 %	0 %	222149301
51529	NC_011989	CTTTGT	2	12	2603915	2603926	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	222149301
51530	NC_011989	CCG	2	6	2603941	2603946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149301
51531	NC_011989	GCTTCG	2	12	2604046	2604057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149301
51532	NC_011989	CAG	2	6	2604141	2604146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149301
51533	NC_011989	GCT	2	6	2604176	2604181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149301
51534	NC_011989	ATT	2	6	2604193	2604198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222149301
51535	NC_011989	CCT	2	6	2604234	2604239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149301
51536	NC_011989	CGC	2	6	2604246	2604251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149301
51537	NC_011989	CGGAT	2	10	2604333	2604342	20 %	20 %	40 %	20 %	222149301
51538	NC_011989	GAA	3	9	2604389	2604397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149301
51539	NC_011989	TTG	2	6	2604451	2604456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149301
51540	NC_011989	AGG	2	6	2604469	2604474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149301
51541	NC_011989	ATG	2	6	2604598	2604603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51542	NC_011989	GAG	2	6	2604692	2604697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51543	NC_011989	CG	3	6	2604727	2604732	0 %	0 %	50 %	50 %	222149302
51544	NC_011989	GTC	2	6	2604818	2604823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149302
51545	NC_011989	GC	3	6	2604839	2604844	0 %	0 %	50 %	50 %	222149302
51546	NC_011989	GAG	2	6	2604959	2604964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149302
51547	NC_011989	A	6	6	2605036	2605041	100 %	0 %	0 %	0 %	222149302
51548	NC_011989	GCC	2	6	2605073	2605078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149302
51549	NC_011989	CGC	2	6	2605150	2605155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149302
51550	NC_011989	A	6	6	2605298	2605303	100 %	0 %	0 %	0 %	222149302
51551	NC_011989	CAA	2	6	2605345	2605350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149302
51552	NC_011989	CAT	2	6	2605393	2605398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149302
51553	NC_011989	CT	3	6	2605452	2605457	0 %	50 %	0 %	50 %	222149302
51554	NC_011989	CAA	2	6	2605477	2605482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149302
51555	NC_011989	CGA	2	6	2605495	2605500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149302
51556	NC_011989	ATC	2	6	2605509	2605514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149302
51557	NC_011989	GGAA	2	8	2605564	2605571	50 %	0 %	50 %	0 %	222149302
51558	NC_011989	CGC	2	6	2605608	2605613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149302
51559	NC_011989	GA	3	6	2605688	2605693	50 %	0 %	50 %	0 %	222149302
51560	NC_011989	AAC	2	6	2605695	2605700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149302
51561	NC_011989	GAT	2	6	2605714	2605719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51562	NC_011989	CCA	2	6	2605745	2605750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51563	NC_011989	CCA	2	6	2605762	2605767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149303
51564	NC_011989	GCA	2	6	2605888	2605893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149303
51565	NC_011989	GGC	3	9	2605952	2605960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149303
51566	NC_011989	AAT	2	6	2606066	2606071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149303
51567	NC_011989	CT	3	6	2606174	2606179	0 %	50 %	0 %	50 %	222149303
51568	NC_011989	GC	3	6	2606248	2606253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51569	NC_011989	TGGA	2	8	2606314	2606321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51570	NC_011989	AAATG	2	10	2606376	2606385	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51571	NC_011989	AGGC	2	8	2606397	2606404	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51572	NC_011989	CACAC	2	10	2606418	2606427	40 %	0 %	0 %	60 %	222149304
51573	NC_011989	GGAAA	2	10	2606440	2606449	60 %	0 %	40 %	0 %	222149304
51574	NC_011989	CCGC	2	8	2606458	2606465	0 %	0 %	25 %	75 %	222149304
51575	NC_011989	CCG	2	6	2606497	2606502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149304
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51577	NC_011989	GGC	2	6	2606571	2606576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149304
51578	NC_011989	TGA	2	6	2606581	2606586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149304
51579	NC_011989	CAC	2	6	2606588	2606593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149304
51580	NC_011989	CCGAT	2	10	2606620	2606629	20 %	20 %	20 %	40 %	222149304
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51583	NC_011989	CCG	2	6	2606767	2606772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149304
51584	NC_011989	ATC	2	6	2606781	2606786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149304
51585	NC_011989	GAGC	2	8	2606822	2606829	25 %	0 %	50 %	25 %	222149304
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51589	NC_011989	ACCGTC	2	12	2606964	2606975	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222149304
51590	NC_011989	CGC	2	6	2606982	2606987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149304
51591	NC_011989	GCC	2	6	2607095	2607100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149304
51592	NC_011989	GCC	2	6	2607104	2607109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149304
51593	NC_011989	GAA	2	6	2607131	2607136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149304
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51600	NC_011989	GCC	2	6	2607366	2607371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149304
51601	NC_011989	ATG	2	6	2607433	2607438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149305
51602	NC_011989	GCA	3	9	2607443	2607451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149305
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51605	NC_011989	GC	3	6	2607569	2607574	0 %	0 %	50 %	50 %	222149305
51606	NC_011989	TGC	2	6	2607671	2607676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149305
51607	NC_011989	CTGA	2	8	2607703	2607710	25 %	25 %	25 %	25 %	222149305
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51609	NC_011989	CAC	3	9	2607744	2607752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149305
51610	NC_011989	TGAC	2	8	2607776	2607783	25 %	25 %	25 %	25 %	222149305
51611	NC_011989	GCA	2	6	2607900	2607905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149305
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51739	NC_011989	CTG	2	6	2614655	2614660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149312
51740	NC_011989	TCG	2	6	2614689	2614694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149312
51741	NC_011989	CTG	2	6	2614727	2614732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149312
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51842	NC_011989	T	6	6	2619622	2619627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51852	NC_011989	GAA	2	6	2620229	2620234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149317
51853	NC_011989	CTG	2	6	2620247	2620252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149317
51854	NC_011989	AAT	2	6	2620268	2620273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149317
51855	NC_011989	TTCGGC	2	12	2620485	2620496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51856	NC_011989	CAT	2	6	2620512	2620517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51857	NC_011989	ATC	2	6	2620570	2620575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51858	NC_011989	TGA	2	6	2620656	2620661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51859	NC_011989	T	6	6	2620873	2620878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51860	NC_011989	AGC	2	6	2621022	2621027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51861	NC_011989	CGA	2	6	2621047	2621052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149318
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51863	NC_011989	ATTTC	2	10	2621103	2621112	20 %	60 %	0 %	20 %	222149318
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51883	NC_011989	CGGG	2	8	2622031	2622038	0 %	0 %	75 %	25 %	222149319
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51887	NC_011989	CAG	2	6	2622303	2622308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51888	NC_011989	GCTG	2	8	2622406	2622413	0 %	25 %	50 %	25 %	222149320
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51951	NC_011989	A	6	6	2625812	2625817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51952	NC_011989	TGAT	2	8	2625850	2625857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51953	NC_011989	TCTA	2	8	2625868	2625875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51954	NC_011989	TTC	2	6	2625994	2625999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149324
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51957	NC_011989	CAGC	2	8	2626066	2626073	25 %	0 %	25 %	50 %	222149324
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51960	NC_011989	CCA	2	6	2626210	2626215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51961	NC_011989	AGGC	2	8	2626262	2626269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51962	NC_011989	GAT	2	6	2626293	2626298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51963	NC_011989	T	7	7	2626399	2626405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51964	NC_011989	AGCC	2	8	2626534	2626541	25 %	0 %	25 %	50 %	222149325
51965	NC_011989	TGG	2	6	2626649	2626654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149325
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51967	NC_011989	GAT	2	6	2626666	2626671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149325
51968	NC_011989	GAT	2	6	2626727	2626732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149325
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51974	NC_011989	GGC	2	6	2626865	2626870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149325
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