MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_011989	CAGGA	2	10	2525655	2525664	40 %	0 %	40 %	20 %	222149235
50002	NC_011989	GAT	2	6	2525693	2525698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149235
50003	NC_011989	T	6	6	2525717	2525722	0 %	100 %	0 %	0 %	222149235
50004	NC_011989	TCCA	2	8	2525756	2525763	25 %	25 %	0 %	50 %	222149235
50005	NC_011989	GC	3	6	2525791	2525796	0 %	0 %	50 %	50 %	222149235
50006	NC_011989	CGG	2	6	2525889	2525894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149235
50007	NC_011989	TCA	2	6	2525947	2525952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149235
50008	NC_011989	CGA	2	6	2525955	2525960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149235
50009	NC_011989	GCAG	2	8	2525963	2525970	25 %	0 %	50 %	25 %	222149235
50010	NC_011989	GCA	2	6	2526090	2526095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149235
50011	NC_011989	GTC	2	6	2526101	2526106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149235
50012	NC_011989	GTA	2	6	2526140	2526145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149235
50013	NC_011989	CCTCCG	2	12	2526160	2526171	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222149235
50014	NC_011989	GGC	2	6	2526188	2526193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149235
50015	NC_011989	GCC	2	6	2526216	2526221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149235
50016	NC_011989	TTC	2	6	2526338	2526343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149235
50017	NC_011989	CGC	2	6	2526359	2526364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149235
50018	NC_011989	AG	3	6	2526552	2526557	50 %	0 %	50 %	0 %	222149235
50019	NC_011989	ACC	2	6	2526630	2526635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50020	NC_011989	AAC	2	6	2526721	2526726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50021	NC_011989	GC	4	8	2526801	2526808	0 %	0 %	50 %	50 %	222149236
50022	NC_011989	GGC	2	6	2526812	2526817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149236
50023	NC_011989	TGCGCT	2	12	2526833	2526844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149236
50024	NC_011989	TCG	2	6	2526880	2526885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149236
50025	NC_011989	CAAAGC	2	12	2526928	2526939	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222149236
50026	NC_011989	CGT	2	6	2526983	2526988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149236
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50028	NC_011989	CGAT	2	8	2527144	2527151	25 %	25 %	25 %	25 %	222149236
50029	NC_011989	ATC	2	6	2527250	2527255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149237
50030	NC_011989	CAT	2	6	2527256	2527261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149237
50031	NC_011989	ATC	2	6	2527295	2527300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149237
50032	NC_011989	GGC	2	6	2527436	2527441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149237
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50034	NC_011989	T	6	6	2527658	2527663	0 %	100 %	0 %	0 %	222149237
50035	NC_011989	CAC	3	9	2527666	2527674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149237
50036	NC_011989	TCAA	2	8	2527779	2527786	50 %	25 %	0 %	25 %	222149237
50037	NC_011989	GCA	2	6	2527806	2527811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149237
50038	NC_011989	CTG	2	6	2527849	2527854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149237
50039	NC_011989	TTG	2	6	2527902	2527907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149237
50040	NC_011989	TGC	2	6	2527964	2527969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149237
50041	NC_011989	CGGG	2	8	2527997	2528004	0 %	0 %	75 %	25 %	222149237
50042	NC_011989	ATC	2	6	2528110	2528115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50043	NC_011989	GCT	2	6	2528116	2528121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50044	NC_011989	CGG	2	6	2528128	2528133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50045	NC_011989	TCT	2	6	2528182	2528187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50046	NC_011989	CCG	3	9	2528249	2528257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50047	NC_011989	CAT	2	6	2528310	2528315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149238
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50049	NC_011989	GCC	3	9	2528358	2528366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149238
50050	NC_011989	AGT	2	6	2528374	2528379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149238
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50054	NC_011989	GGAC	2	8	2528572	2528579	25 %	0 %	50 %	25 %	222149238
50055	NC_011989	TTG	2	6	2528749	2528754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50056	NC_011989	GT	3	6	2528755	2528760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50057	NC_011989	CTGGA	2	10	2528772	2528781	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50058	NC_011989	ACG	2	6	2528902	2528907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149239
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50061	NC_011989	CG	3	6	2529013	2529018	0 %	0 %	50 %	50 %	222149239
50062	NC_011989	CGCC	2	8	2529021	2529028	0 %	0 %	25 %	75 %	222149239
50063	NC_011989	CGA	2	6	2529111	2529116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149239
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50065	NC_011989	CCT	2	6	2529240	2529245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50066	NC_011989	T	6	6	2529245	2529250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50067	NC_011989	ACG	2	6	2529426	2529431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50068	NC_011989	ATG	2	6	2529614	2529619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50070	NC_011989	CTG	2	6	2529650	2529655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50071	NC_011989	GA	3	6	2529730	2529735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50072	NC_011989	AATG	2	8	2529819	2529826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50073	NC_011989	AGG	2	6	2529914	2529919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50075	NC_011989	TTA	2	6	2530045	2530050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50077	NC_011989	CTGG	2	8	2530145	2530152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50078	NC_011989	CGTA	2	8	2530182	2530189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50079	NC_011989	ATCCG	2	10	2530197	2530206	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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50081	NC_011989	GAAC	2	8	2530258	2530265	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50082	NC_011989	TGG	2	6	2530366	2530371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50084	NC_011989	AG	3	6	2530425	2530430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50085	NC_011989	GGT	2	6	2530451	2530456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50086	NC_011989	CT	4	8	2530530	2530537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50087	NC_011989	GCT	2	6	2530588	2530593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149240
50088	NC_011989	TGG	2	6	2530597	2530602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149240
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50091	NC_011989	CAT	2	6	2531017	2531022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50093	NC_011989	ACA	2	6	2531157	2531162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50094	NC_011989	CGC	2	6	2531165	2531170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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50098	NC_011989	G	8	8	2531415	2531422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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50108	NC_011989	AT	3	6	2532360	2532365	50 %	50 %	0 %	0 %	222149242
50109	NC_011989	TCA	2	6	2532404	2532409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149242
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50113	NC_011989	GCCGC	2	10	2532702	2532711	0 %	0 %	40 %	60 %	222149242
50114	NC_011989	GA	3	6	2532726	2532731	50 %	0 %	50 %	0 %	222149242
50115	NC_011989	GCC	2	6	2532754	2532759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149242
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50120	NC_011989	CAAAA	2	10	2532894	2532903	80 %	0 %	0 %	20 %	222149242
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50239	NC_011989	GAG	2	6	2538432	2538437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149246
50240	NC_011989	CTG	2	6	2538461	2538466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149246
50241	NC_011989	TGG	2	6	2538482	2538487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149246
50242	NC_011989	GCTG	2	8	2538495	2538502	0 %	25 %	50 %	25 %	222149246
50243	NC_011989	GCA	2	6	2538531	2538536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149246
50244	NC_011989	GC	3	6	2538604	2538609	0 %	0 %	50 %	50 %	222149246
50245	NC_011989	GC	3	6	2538648	2538653	0 %	0 %	50 %	50 %	222149246
50246	NC_011989	CG	3	6	2538709	2538714	0 %	0 %	50 %	50 %	222149246
50247	NC_011989	ACA	2	6	2538745	2538750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149246
50248	NC_011989	CAT	2	6	2538856	2538861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149246
50249	NC_011989	GC	3	6	2538891	2538896	0 %	0 %	50 %	50 %	222149246
50250	NC_011989	CCCAGA	2	12	2538943	2538954	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222149246
50251	NC_011989	CGA	2	6	2538991	2538996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149246
50252	NC_011989	GC	3	6	2539143	2539148	0 %	0 %	50 %	50 %	222149246
50253	NC_011989	CG	3	6	2539162	2539167	0 %	0 %	50 %	50 %	222149246
50254	NC_011989	GATA	2	8	2539189	2539196	50 %	25 %	25 %	0 %	222149246
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50259	NC_011989	GCTG	2	8	2539336	2539343	0 %	25 %	50 %	25 %	222149246
50260	NC_011989	GCAG	2	8	2539410	2539417	25 %	0 %	50 %	25 %	222149246
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50268	NC_011989	GC	3	6	2539940	2539945	0 %	0 %	50 %	50 %	222149247
50269	NC_011989	TCG	2	6	2540057	2540062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149247
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50273	NC_011989	CGGC	2	8	2540370	2540377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50274	NC_011989	GC	3	6	2540382	2540387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50275	NC_011989	ATCGAT	2	12	2540463	2540474	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50276	NC_011989	CTG	2	6	2540511	2540516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50277	NC_011989	GATA	2	8	2540537	2540544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50278	NC_011989	TGC	2	6	2540596	2540601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50279	NC_011989	TGC	2	6	2540669	2540674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149248
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50288	NC_011989	GC	3	6	2541286	2541291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50289	NC_011989	GTCCT	2	10	2541311	2541320	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50290	NC_011989	GCTC	2	8	2541345	2541352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50291	NC_011989	GGA	2	6	2541377	2541382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50293	NC_011989	CGGG	2	8	2541441	2541448	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50294	NC_011989	GTTG	2	8	2541457	2541464	0 %	50 %	50 %	0 %	222149250
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50304	NC_011989	TAACG	2	10	2541790	2541799	40 %	20 %	20 %	20 %	222149250
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50326	NC_011989	TGG	2	6	2542949	2542954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50327	NC_011989	TTA	2	6	2542963	2542968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50328	NC_011989	GGC	2	6	2542980	2542985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50332	NC_011989	CCG	2	6	2543122	2543127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50333	NC_011989	TCA	2	6	2543256	2543261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149253
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50339	NC_011989	GCCT	2	8	2543667	2543674	0 %	25 %	25 %	50 %	222149253
50340	NC_011989	GCCGGA	2	12	2543681	2543692	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222149253
50341	NC_011989	GCT	2	6	2543817	2543822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149253
50342	NC_011989	GGC	2	6	2543839	2543844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149253
50343	NC_011989	GGA	2	6	2543848	2543853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149253
50344	NC_011989	GCC	2	6	2543860	2543865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50345	NC_011989	CCA	2	6	2543882	2543887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50346	NC_011989	GCC	2	6	2543896	2543901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50347	NC_011989	TGA	2	6	2543939	2543944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50348	NC_011989	CTG	2	6	2544009	2544014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50349	NC_011989	CAT	2	6	2544087	2544092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50350	NC_011989	GATC	2	8	2544118	2544125	25 %	25 %	25 %	25 %	222149254
50351	NC_011989	GCCA	2	8	2544136	2544143	25 %	0 %	25 %	50 %	222149254
50352	NC_011989	TTG	2	6	2544282	2544287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149254
50353	NC_011989	CCTT	2	8	2544294	2544301	0 %	50 %	0 %	50 %	222149254
50354	NC_011989	GC	3	6	2544315	2544320	0 %	0 %	50 %	50 %	222149254
50355	NC_011989	GGC	2	6	2544343	2544348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149254
50356	NC_011989	CCG	2	6	2544352	2544357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149254
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50358	NC_011989	CAC	2	6	2544437	2544442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149254
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50379	NC_011989	GCCG	2	8	2545175	2545182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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50477	NC_011989	GAT	2	6	2550354	2550359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149259
50478	NC_011989	C	6	6	2550464	2550469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50479	NC_011989	TCA	2	6	2550673	2550678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50480	NC_011989	CAA	2	6	2550684	2550689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50481	NC_011989	GAG	2	6	2550696	2550701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50482	NC_011989	AGA	2	6	2550725	2550730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50483	NC_011989	GGC	2	6	2550781	2550786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50484	NC_011989	CTT	2	6	2550813	2550818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50485	NC_011989	AC	3	6	2550875	2550880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50486	NC_011989	GGC	2	6	2550914	2550919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149260
50487	NC_011989	GAA	2	6	2550947	2550952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149260
50488	NC_011989	AAG	2	6	2550963	2550968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149260
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50490	NC_011989	CTTG	2	8	2550989	2550996	0 %	50 %	25 %	25 %	222149260
50491	NC_011989	CAA	2	6	2551022	2551027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149260
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50493	NC_011989	CAC	2	6	2551292	2551297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50494	NC_011989	GGC	2	6	2551331	2551336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149261
50495	NC_011989	GGGC	2	8	2551350	2551357	0 %	0 %	75 %	25 %	222149261
50496	NC_011989	GGC	2	6	2551372	2551377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149261
50497	NC_011989	GCG	2	6	2551386	2551391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149261
50498	NC_011989	CAA	2	6	2551422	2551427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149261
50499	NC_011989	CTG	2	6	2551482	2551487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149261
50500	NC_011989	CG	3	6	2551508	2551513	0 %	0 %	50 %	50 %	222149261

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