MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_011988	CTGC	2	8	1155267	1155274	0 %	25 %	25 %	50 %	222107059
22502	NC_011988	ACC	2	6	1155413	1155418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107060
22503	NC_011988	ATC	2	6	1155419	1155424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107060
22504	NC_011988	TGG	2	6	1155480	1155485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107060
22505	NC_011988	GT	3	6	1155489	1155494	0 %	50 %	50 %	0 %	222107060
22506	NC_011988	GCG	3	9	1155569	1155577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107060
22507	NC_011988	TGC	2	6	1155583	1155588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107060
22508	NC_011988	TTG	2	6	1155597	1155602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107060
22509	NC_011988	GGC	2	6	1155643	1155648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107060
22510	NC_011988	CCA	2	6	1155693	1155698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107060
22511	NC_011988	CCAGCG	2	12	1155789	1155800	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222107060
22512	NC_011988	ACG	3	9	1155803	1155811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107060
22513	NC_011988	AG	3	6	1155818	1155823	50 %	0 %	50 %	0 %	222107060
22514	NC_011988	ATA	2	6	1155829	1155834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222107060
22515	NC_011988	CAG	2	6	1155847	1155852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107060
22516	NC_011988	GC	3	6	1155872	1155877	0 %	0 %	50 %	50 %	222107060
22517	NC_011988	AGCCA	2	10	1155884	1155893	40 %	0 %	20 %	40 %	222107060
22518	NC_011988	GCC	2	6	1155922	1155927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107060
22519	NC_011988	CGA	2	6	1155951	1155956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107060
22520	NC_011988	GCA	2	6	1156014	1156019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107060
22521	NC_011988	AGC	4	12	1156061	1156072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107060
22522	NC_011988	GCC	2	6	1156090	1156095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107060
22523	NC_011988	AGC	2	6	1156184	1156189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107060
22524	NC_011988	AGC	2	6	1156191	1156196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107060
22525	NC_011988	CGC	2	6	1156209	1156214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107060
22526	NC_011988	GGC	2	6	1156225	1156230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107060
22527	NC_011988	CGA	2	6	1156260	1156265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107060
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22532	NC_011988	CGAG	2	8	1156413	1156420	25 %	0 %	50 %	25 %	222107060
22533	NC_011988	GCT	2	6	1156421	1156426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107060
22534	NC_011988	AG	3	6	1156457	1156462	50 %	0 %	50 %	0 %	222107060
22535	NC_011988	GCG	2	6	1156463	1156468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107060
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22540	NC_011988	CAA	2	6	1156933	1156938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22541	NC_011988	TCT	2	6	1156949	1156954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22542	NC_011988	A	6	6	1157005	1157010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22543	NC_011988	ACCG	2	8	1157090	1157097	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22544	NC_011988	GCC	2	6	1157157	1157162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107061
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22547	NC_011988	CCTT	2	8	1157313	1157320	0 %	50 %	0 %	50 %	222107061
22548	NC_011988	TGA	2	6	1157326	1157331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107061
22549	NC_011988	AAG	2	6	1157337	1157342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107061
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22551	NC_011988	GCC	3	9	1157381	1157389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107061
22552	NC_011988	AAT	2	6	1157428	1157433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222107061
22553	NC_011988	TAA	2	6	1157487	1157492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222107061
22554	NC_011988	CAG	2	6	1157624	1157629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107061
22555	NC_011988	GCC	2	6	1157670	1157675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107061
22556	NC_011988	GCGG	2	8	1157771	1157778	0 %	0 %	75 %	25 %	222107061
22557	NC_011988	TGGC	2	8	1157884	1157891	0 %	25 %	50 %	25 %	222107061
22558	NC_011988	GCCGTC	2	12	1158065	1158076	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222107061
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22561	NC_011988	AGTC	2	8	1158166	1158173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22562	NC_011988	GAAG	2	8	1158190	1158197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22563	NC_011988	GT	3	6	1158261	1158266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22564	NC_011988	GGC	2	6	1158477	1158482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107062
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22574	NC_011988	AT	3	6	1158967	1158972	50 %	50 %	0 %	0 %	222107062
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22588	NC_011988	CAGC	2	8	1159791	1159798	25 %	0 %	25 %	50 %	222107062
22589	NC_011988	GCT	2	6	1159845	1159850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107062
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22591	NC_011988	TGAA	2	8	1159999	1160006	50 %	25 %	25 %	0 %	222107062
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22599	NC_011988	CAT	3	9	1160382	1160390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107062
22600	NC_011988	TGG	2	6	1160402	1160407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107062
22601	NC_011988	TGTTC	2	10	1160501	1160510	0 %	60 %	20 %	20 %	222107062
22602	NC_011988	GAG	2	6	1160586	1160591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107062
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22604	NC_011988	C	6	6	1160648	1160653	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22605	NC_011988	GCTAT	2	10	1160670	1160679	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22606	NC_011988	TTA	2	6	1160790	1160795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22607	NC_011988	GGC	2	6	1160821	1160826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107063
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22613	NC_011988	CTGTG	2	10	1161143	1161152	0 %	40 %	40 %	20 %	222107063
22614	NC_011988	GCG	2	6	1161201	1161206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107063
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22617	NC_011988	T	7	7	1161268	1161274	0 %	100 %	0 %	0 %	222107063
22618	NC_011988	GCGT	2	8	1161418	1161425	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22619	NC_011988	GCCA	2	8	1161538	1161545	25 %	0 %	25 %	50 %	222107064
22620	NC_011988	CGC	2	6	1161555	1161560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107064
22621	NC_011988	TGC	2	6	1161585	1161590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107064
22622	NC_011988	TGA	2	6	1161600	1161605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107064
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22624	NC_011988	GC	3	6	1161802	1161807	0 %	0 %	50 %	50 %	222107064
22625	NC_011988	CGA	2	6	1161808	1161813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107064
22626	NC_011988	CCG	4	12	1161814	1161825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107064
22627	NC_011988	TGA	2	6	1161846	1161851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107064
22628	NC_011988	TGG	2	6	1161901	1161906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22629	NC_011988	GC	3	6	1161926	1161931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22630	NC_011988	TCG	2	6	1162016	1162021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22632	NC_011988	CTA	2	6	1162056	1162061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22633	NC_011988	ATC	2	6	1162073	1162078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22634	NC_011988	TCTTT	2	10	1162135	1162144	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22635	NC_011988	AT	3	6	1162182	1162187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22636	NC_011988	ATC	2	6	1162242	1162247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22637	NC_011988	GGC	2	6	1162281	1162286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22638	NC_011988	CAGT	2	8	1162303	1162310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22639	NC_011988	GC	3	6	1162567	1162572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22640	NC_011988	CAG	2	6	1162698	1162703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107065
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22644	NC_011988	CTG	2	6	1162887	1162892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107065
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22649	NC_011988	CTG	2	6	1163058	1163063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107065
22650	NC_011988	TGA	2	6	1163125	1163130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107065
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22655	NC_011988	TGG	2	6	1163312	1163317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107065
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22661	NC_011988	GTCA	2	8	1163582	1163589	25 %	25 %	25 %	25 %	222107065
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22672	NC_011988	CCTT	2	8	1164136	1164143	0 %	50 %	0 %	50 %	222107065
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22723	NC_011988	GT	3	6	1167076	1167081	0 %	50 %	50 %	0 %	222107068
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22732	NC_011988	GCG	2	6	1167417	1167422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107068
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22970	NC_011988	TGATC	2	10	1178530	1178539	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22971	NC_011988	ATAA	2	8	1178615	1178622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22972	NC_011988	GCC	2	6	1178735	1178740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22973	NC_011988	TGA	2	6	1178805	1178810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22974	NC_011988	GC	3	6	1178846	1178851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22975	NC_011988	GCAAAG	2	12	1178928	1178939	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22976	NC_011988	CTT	2	6	1179087	1179092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107083
22977	NC_011988	GCT	2	6	1179100	1179105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107083
22978	NC_011988	TGC	2	6	1179127	1179132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107083
22979	NC_011988	T	6	6	1179196	1179201	0 %	100 %	0 %	0 %	222107083
22980	NC_011988	GCT	2	6	1179290	1179295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107083
22981	NC_011988	GCG	2	6	1179317	1179322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107083
22982	NC_011988	TTA	2	6	1179384	1179389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22983	NC_011988	CGGG	2	8	1179690	1179697	0 %	0 %	75 %	25 %	222107085
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22987	NC_011988	GC	3	6	1180099	1180104	0 %	0 %	50 %	50 %	222107086
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22989	NC_011988	CGAT	2	8	1180263	1180270	25 %	25 %	25 %	25 %	222107086
22990	NC_011988	TAT	2	6	1180306	1180311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107086
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22993	NC_011988	GTG	2	6	1180436	1180441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107086
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22996	NC_011988	ATCC	2	8	1180588	1180595	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22997	NC_011988	GCG	2	6	1180622	1180627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22998	NC_011988	GCG	2	6	1180671	1180676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22999	NC_011988	GCATT	2	10	1180708	1180717	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23000	NC_011988	CGG	2	6	1180820	1180825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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