MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011988	ATT	2	6	826503	826508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_011988	CGG	2	6	826603	826608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106789
16003	NC_011988	CTTT	2	8	826627	826634	0 %	75 %	0 %	25 %	222106789
16004	NC_011988	TGA	2	6	826671	826676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106789
16005	NC_011988	GGT	2	6	826696	826701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106789
16006	NC_011988	AGC	2	6	826724	826729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106789
16007	NC_011988	TCG	3	9	826764	826772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106789
16008	NC_011988	CAT	2	6	826844	826849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106789
16009	NC_011988	TC	3	6	827001	827006	0 %	50 %	0 %	50 %	222106789
16010	NC_011988	CAG	2	6	827074	827079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106789
16011	NC_011988	TCCA	2	8	827119	827126	25 %	25 %	0 %	50 %	222106789
16012	NC_011988	GGAGC	2	10	827144	827153	20 %	0 %	60 %	20 %	222106789
16013	NC_011988	TCT	2	6	827160	827165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106789
16014	NC_011988	GC	3	6	827228	827233	0 %	0 %	50 %	50 %	222106789
16015	NC_011988	G	6	6	827241	827246	0 %	0 %	100 %	0 %	222106789
16016	NC_011988	TAT	2	6	827252	827257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106789
16017	NC_011988	GCTG	2	8	827278	827285	0 %	25 %	50 %	25 %	222106789
16018	NC_011988	GA	3	6	827293	827298	50 %	0 %	50 %	0 %	222106789
16019	NC_011988	ACA	2	6	827387	827392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106789
16020	NC_011988	GCT	2	6	827500	827505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106789
16021	NC_011988	CGGCTG	2	12	827523	827534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222106789
16022	NC_011988	CGGCG	2	10	827535	827544	0 %	0 %	60 %	40 %	222106789
16023	NC_011988	CGGA	2	8	827552	827559	25 %	0 %	50 %	25 %	222106789
16024	NC_011988	GC	3	6	827585	827590	0 %	0 %	50 %	50 %	222106789
16025	NC_011988	GCA	2	6	827596	827601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106789
16026	NC_011988	CAT	2	6	827685	827690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_011988	TTC	2	6	827699	827704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_011988	GTT	2	6	827716	827721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_011988	TGC	2	6	827736	827741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_011988	AC	3	6	827809	827814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16031	NC_011988	GCA	2	6	827854	827859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_011988	TGG	2	6	827987	827992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_011988	CTC	2	6	828017	828022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16034	NC_011988	GCT	2	6	828024	828029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_011988	GCC	3	9	828054	828062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16036	NC_011988	GATG	2	8	828071	828078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_011988	GACT	2	8	828114	828121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16038	NC_011988	TCA	3	9	828124	828132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_011988	CGC	2	6	828166	828171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106790
16040	NC_011988	TTGC	2	8	828179	828186	0 %	50 %	25 %	25 %	222106790
16041	NC_011988	ACG	2	6	828248	828253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106790
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16044	NC_011988	ATC	2	6	828449	828454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106790
16045	NC_011988	GCA	2	6	828460	828465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106790
16046	NC_011988	ATG	2	6	828479	828484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106790
16047	NC_011988	GGA	2	6	828575	828580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_011988	ACC	2	6	828600	828605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106791
16049	NC_011988	CGA	2	6	828620	828625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106791
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16051	NC_011988	GAT	2	6	828788	828793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106791
16052	NC_011988	TCT	2	6	828869	828874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106791
16053	NC_011988	TGA	2	6	828946	828951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106791
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16055	NC_011988	CGG	2	6	829059	829064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106791
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16057	NC_011988	CG	3	6	829095	829100	0 %	0 %	50 %	50 %	222106791
16058	NC_011988	ATG	2	6	829101	829106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106791
16059	NC_011988	GT	3	6	829162	829167	0 %	50 %	50 %	0 %	222106791
16060	NC_011988	TTG	2	6	829267	829272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106791
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16062	NC_011988	GC	3	6	829477	829482	0 %	0 %	50 %	50 %	222106792
16063	NC_011988	TTC	2	6	829512	829517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106792
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16065	NC_011988	CTGC	2	8	829565	829572	0 %	25 %	25 %	50 %	222106792
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16072	NC_011988	GGT	2	6	829799	829804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106792
16073	NC_011988	GGC	2	6	829817	829822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106792
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16075	NC_011988	CAAT	2	8	829901	829908	50 %	25 %	0 %	25 %	222106792
16076	NC_011988	T	6	6	829942	829947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_011988	T	6	6	829967	829972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_011988	TGAA	2	8	830021	830028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_011988	GCG	2	6	830051	830056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16080	NC_011988	A	6	6	830099	830104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16086	NC_011988	CAGA	2	8	830443	830450	50 %	0 %	25 %	25 %	222106793
16087	NC_011988	ACCAG	2	10	830493	830502	40 %	0 %	20 %	40 %	222106793
16088	NC_011988	AAT	2	6	830534	830539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106793
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16093	NC_011988	CCG	2	6	830666	830671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106793
16094	NC_011988	CG	4	8	830683	830690	0 %	0 %	50 %	50 %	222106793
16095	NC_011988	GCT	2	6	830928	830933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16096	NC_011988	T	6	6	830958	830963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16099	NC_011988	GCA	3	9	831120	831128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106794
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16101	NC_011988	CGC	2	6	831175	831180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106794
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16106	NC_011988	TCG	2	6	831292	831297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106794
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16111	NC_011988	TGCGTG	2	12	831418	831429	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222106794
16112	NC_011988	TCC	2	6	831448	831453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106794
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16115	NC_011988	GC	4	8	831492	831499	0 %	0 %	50 %	50 %	222106794
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16117	NC_011988	GGTC	2	8	831662	831669	0 %	25 %	50 %	25 %	222106794
16118	NC_011988	CGG	2	6	831734	831739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106794
16119	NC_011988	AGA	2	6	831819	831824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_011988	CTT	2	6	831841	831846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16122	NC_011988	ACG	2	6	831862	831867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16368	NC_011988	CACC	2	8	843611	843618	25 %	0 %	0 %	75 %	222106802
16369	NC_011988	CCAC	2	8	843670	843677	25 %	0 %	0 %	75 %	222106802
16370	NC_011988	GCCC	2	8	843710	843717	0 %	0 %	25 %	75 %	222106802
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16373	NC_011988	TCA	2	6	843842	843847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106802
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16377	NC_011988	GGC	2	6	844171	844176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106804
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16422	NC_011988	GC	3	6	846203	846208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16423	NC_011988	AAT	2	6	846249	846254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16425	NC_011988	CGCC	2	8	846327	846334	0 %	0 %	25 %	75 %	222106807
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16475	NC_011988	CCAG	2	8	848920	848927	25 %	0 %	25 %	50 %	222106809
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16483	NC_011988	ATC	2	6	849264	849269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106809
16484	NC_011988	GCA	2	6	849283	849288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106809
16485	NC_011988	CAG	2	6	849293	849298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106809
16486	NC_011988	GCCC	2	8	849310	849317	0 %	0 %	25 %	75 %	222106809
16487	NC_011988	CAGC	2	8	849332	849339	25 %	0 %	25 %	50 %	222106809
16488	NC_011988	GCA	3	9	849376	849384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106809
16489	NC_011988	AAT	2	6	849388	849393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106809
16490	NC_011988	GCAT	2	8	849399	849406	25 %	25 %	25 %	25 %	222106809
16491	NC_011988	TCA	2	6	849435	849440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106809
16492	NC_011988	AAG	2	6	849491	849496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106809
16493	NC_011988	GC	3	6	849587	849592	0 %	0 %	50 %	50 %	222106809
16494	NC_011988	GTC	2	6	849593	849598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106809
16495	NC_011988	AT	3	6	849609	849614	50 %	50 %	0 %	0 %	222106809
16496	NC_011988	T	6	6	849614	849619	0 %	100 %	0 %	0 %	222106809
16497	NC_011988	ACTG	2	8	849678	849685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16498	NC_011988	TCCG	2	8	849768	849775	0 %	25 %	25 %	50 %	222106810
16499	NC_011988	GTT	2	6	849791	849796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106810
16500	NC_011988	GAA	2	6	849812	849817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106810

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