MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011988	TGC	2	6	647939	647944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12502	NC_011988	GCT	2	6	647952	647957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12503	NC_011988	GCA	2	6	648044	648049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12504	NC_011988	CTG	2	6	648100	648105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12505	NC_011988	TTC	3	9	648106	648114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106641
12506	NC_011988	TTC	2	6	648175	648180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106641
12507	NC_011988	TGG	3	9	648201	648209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106641
12508	NC_011988	TCA	2	6	648215	648220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106641
12509	NC_011988	AGC	2	6	648221	648226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12510	NC_011988	GCA	2	6	648232	648237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12511	NC_011988	TGG	2	6	648299	648304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106641
12512	NC_011988	GCA	2	6	648348	648353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12513	NC_011988	GCC	2	6	648381	648386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106641
12514	NC_011988	TGC	2	6	648392	648397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12515	NC_011988	TGA	2	6	648398	648403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106641
12516	NC_011988	TAT	2	6	648487	648492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106641
12517	NC_011988	TGA	2	6	648507	648512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106641
12518	NC_011988	GCT	2	6	648555	648560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12519	NC_011988	GCAT	2	8	648584	648591	25 %	25 %	25 %	25 %	222106641
12520	NC_011988	CA	3	6	648624	648629	50 %	0 %	0 %	50 %	222106641
12521	NC_011988	CGTG	2	8	648648	648655	0 %	25 %	50 %	25 %	222106641
12522	NC_011988	TTCA	2	8	648697	648704	25 %	50 %	0 %	25 %	222106641
12523	NC_011988	CTG	2	6	648715	648720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12524	NC_011988	AATGA	2	10	648901	648910	60 %	20 %	20 %	0 %	222106641
12525	NC_011988	CAC	2	6	648916	648921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106641
12526	NC_011988	GCC	2	6	648922	648927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106641
12527	NC_011988	GC	3	6	648984	648989	0 %	0 %	50 %	50 %	222106641
12528	NC_011988	GATG	2	8	649077	649084	25 %	25 %	50 %	0 %	222106641
12529	NC_011988	ATG	2	6	649091	649096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106641
12530	NC_011988	GTG	2	6	649153	649158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106641
12531	NC_011988	GGC	2	6	649176	649181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106641
12532	NC_011988	CGG	2	6	649259	649264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106641
12533	NC_011988	ACG	2	6	649294	649299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12534	NC_011988	CTTC	2	8	649409	649416	0 %	50 %	0 %	50 %	222106641
12535	NC_011988	GGA	2	6	649488	649493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106641
12536	NC_011988	GAG	2	6	649510	649515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106641
12537	NC_011988	GGC	2	6	649577	649582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106641
12538	NC_011988	GCC	2	6	649584	649589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106641
12539	NC_011988	TGC	2	6	649607	649612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12540	NC_011988	GGT	2	6	649636	649641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106641
12541	NC_011988	ACCA	2	8	649702	649709	50 %	0 %	0 %	50 %	222106641
12542	NC_011988	GCT	2	6	649869	649874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12543	NC_011988	CCG	2	6	649920	649925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106641
12544	NC_011988	TGG	2	6	649940	649945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106641
12545	NC_011988	AGG	2	6	650033	650038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_011988	CAAT	2	8	650048	650055	50 %	25 %	0 %	25 %	222106642
12547	NC_011988	TCGCC	2	10	650324	650333	0 %	20 %	20 %	60 %	222106642
12548	NC_011988	CAG	2	6	650356	650361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106642
12549	NC_011988	GC	3	6	650447	650452	0 %	0 %	50 %	50 %	222106642
12550	NC_011988	CTG	2	6	650518	650523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106642
12551	NC_011988	CGC	3	9	650605	650613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106642
12552	NC_011988	GCA	2	6	650621	650626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106642
12553	NC_011988	GCT	2	6	650718	650723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106642
12554	NC_011988	GAG	2	6	650743	650748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106642
12555	NC_011988	CGA	2	6	650781	650786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106642
12556	NC_011988	ACCG	2	8	650818	650825	25 %	0 %	25 %	50 %	222106642
12557	NC_011988	TGC	3	9	650840	650848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106642
12558	NC_011988	CTG	2	6	650854	650859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106642
12559	NC_011988	TCGGTG	2	12	650912	650923	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222106642
12560	NC_011988	GCC	3	9	650950	650958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106642
12561	NC_011988	GCC	2	6	650971	650976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106642
12562	NC_011988	GGTC	2	8	650990	650997	0 %	25 %	50 %	25 %	222106642
12563	NC_011988	TCG	2	6	651022	651027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106642
12564	NC_011988	GC	3	6	651036	651041	0 %	0 %	50 %	50 %	222106642
12565	NC_011988	GCT	2	6	651085	651090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106642
12566	NC_011988	GTT	2	6	651138	651143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106642
12567	NC_011988	CGC	2	6	651178	651183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106642
12568	NC_011988	GGT	2	6	651213	651218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106642
12569	NC_011988	CGG	2	6	651275	651280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106642
12570	NC_011988	GAA	2	6	651400	651405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106642
12571	NC_011988	GCC	2	6	651407	651412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106642
12572	NC_011988	CGC	2	6	651499	651504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106642
12573	NC_011988	GTG	2	6	651505	651510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106642
12574	NC_011988	TGGC	2	8	651562	651569	0 %	25 %	50 %	25 %	222106642
12575	NC_011988	ACA	2	6	651624	651629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106642
12576	NC_011988	GAC	3	9	651678	651686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106643
12577	NC_011988	CGGG	2	8	651808	651815	0 %	0 %	75 %	25 %	222106643
12578	NC_011988	TGG	2	6	651820	651825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106643
12579	NC_011988	GC	3	6	651849	651854	0 %	0 %	50 %	50 %	222106643
12580	NC_011988	CTGG	2	8	651927	651934	0 %	25 %	50 %	25 %	222106643
12581	NC_011988	GCGCA	2	10	651942	651951	20 %	0 %	40 %	40 %	222106643
12582	NC_011988	GCT	2	6	651968	651973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
12583	NC_011988	CAA	2	6	652031	652036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106643
12584	NC_011988	GGTC	2	8	652094	652101	0 %	25 %	50 %	25 %	222106643
12585	NC_011988	CGG	2	6	652156	652161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106643
12586	NC_011988	GGGT	2	8	652300	652307	0 %	25 %	75 %	0 %	222106643
12587	NC_011988	GGCGAA	2	12	652308	652319	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222106643
12588	NC_011988	TCA	2	6	652351	652356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106643
12589	NC_011988	GGC	2	6	652440	652445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106643
12590	NC_011988	CTG	2	6	652464	652469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
12591	NC_011988	TCCG	2	8	652537	652544	0 %	25 %	25 %	50 %	222106643
12592	NC_011988	GGC	3	9	652559	652567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106643
12593	NC_011988	CAG	2	6	652595	652600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106643
12594	NC_011988	AT	3	6	652709	652714	50 %	50 %	0 %	0 %	222106643
12595	NC_011988	CAAT	2	8	652751	652758	50 %	25 %	0 %	25 %	222106643
12596	NC_011988	TCG	2	6	652845	652850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
12597	NC_011988	TTG	2	6	652917	652922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106643
12598	NC_011988	GGC	2	6	652949	652954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106643
12599	NC_011988	GGT	2	6	652973	652978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106643
12600	NC_011988	GAGGCA	2	12	652992	653003	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222106643
12601	NC_011988	CTG	2	6	653037	653042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
12602	NC_011988	CTG	2	6	653114	653119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
12603	NC_011988	TGC	2	6	653167	653172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
12604	NC_011988	CTG	2	6	653178	653183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
12605	NC_011988	CGG	2	6	653204	653209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106643
12606	NC_011988	AGA	2	6	653210	653215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106643
12607	NC_011988	GGC	2	6	653228	653233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106643
12608	NC_011988	TGA	2	6	653282	653287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106643
12609	NC_011988	AGC	2	6	653308	653313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106643
12610	NC_011988	GAT	2	6	653318	653323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_011988	T	6	6	653332	653337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_011988	GAA	2	6	653404	653409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106644
12613	NC_011988	A	6	6	653408	653413	100 %	0 %	0 %	0 %	222106644
12614	NC_011988	GCA	2	6	653480	653485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106644
12615	NC_011988	CCT	2	6	653490	653495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106644
12616	NC_011988	CCCG	2	8	653534	653541	0 %	0 %	25 %	75 %	222106644
12617	NC_011988	ATG	2	6	653547	653552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106644
12618	NC_011988	CGG	2	6	653599	653604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106644
12619	NC_011988	ATG	2	6	653606	653611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106644
12620	NC_011988	CGC	2	6	653654	653659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106644
12621	NC_011988	TGG	2	6	653767	653772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106644
12622	NC_011988	GCC	2	6	653799	653804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106644
12623	NC_011988	TCT	2	6	653815	653820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106644
12624	NC_011988	GAT	2	6	653911	653916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106644
12625	NC_011988	CGA	2	6	653932	653937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106644
12626	NC_011988	TC	3	6	653952	653957	0 %	50 %	0 %	50 %	222106644
12627	NC_011988	GCC	2	6	654164	654169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106644
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12630	NC_011988	TGCC	2	8	654350	654357	0 %	25 %	25 %	50 %	222106644
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12632	NC_011988	GCT	2	6	654496	654501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106644
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12634	NC_011988	GCTG	2	8	654595	654602	0 %	25 %	50 %	25 %	222106644
12635	NC_011988	GC	3	6	654626	654631	0 %	0 %	50 %	50 %	222106644
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12643	NC_011988	GTC	2	6	654815	654820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106644
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12646	NC_011988	TGC	2	6	654932	654937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106644
12647	NC_011988	TGG	2	6	654961	654966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106644
12648	NC_011988	CGGA	2	8	654984	654991	25 %	0 %	50 %	25 %	222106644
12649	NC_011988	TTGGC	2	10	654997	655006	0 %	40 %	40 %	20 %	222106644
12650	NC_011988	GCCGGA	2	12	655054	655065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222106644
12651	NC_011988	GCT	2	6	655180	655185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106644
12652	NC_011988	TGA	2	6	655212	655217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12653	NC_011988	GCT	2	6	655220	655225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12654	NC_011988	CAC	2	6	655280	655285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106645
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12656	NC_011988	TCG	2	6	655374	655379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106645
12657	NC_011988	AGA	2	6	655383	655388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106645
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12661	NC_011988	CCGA	2	8	655620	655627	25 %	0 %	25 %	50 %	222106645
12662	NC_011988	TCGACC	2	12	655641	655652	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222106645
12663	NC_011988	CGCC	2	8	655669	655676	0 %	0 %	25 %	75 %	222106645
12664	NC_011988	GA	3	6	655677	655682	50 %	0 %	50 %	0 %	222106645
12665	NC_011988	GCC	2	6	655700	655705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106645
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12684	NC_011988	TGC	2	6	657300	657305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106647
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12699	NC_011988	GAC	2	6	658256	658261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106648
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12732	NC_011988	GGC	2	6	659521	659526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106649
12733	NC_011988	CCCG	2	8	659559	659566	0 %	0 %	25 %	75 %	222106649
12734	NC_011988	GCA	3	9	659619	659627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106649
12735	NC_011988	GCT	2	6	659629	659634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106649
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12859	NC_011988	GCT	2	6	666738	666743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106655
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12977	NC_011988	GCC	2	6	672373	672378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106660
12978	NC_011988	GAT	2	6	672384	672389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106660
12979	NC_011988	GCCC	2	8	672397	672404	0 %	0 %	25 %	75 %	222106660
12980	NC_011988	CTGG	2	8	672447	672454	0 %	25 %	50 %	25 %	222106660
12981	NC_011988	GATATC	2	12	672460	672471	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222106660
12982	NC_011988	GCTG	2	8	672502	672509	0 %	25 %	50 %	25 %	222106660
12983	NC_011988	ATT	2	6	672544	672549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106660
12984	NC_011988	GGC	2	6	672570	672575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106660
12985	NC_011988	TGA	2	6	672605	672610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106660
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12987	NC_011988	GAT	2	6	672696	672701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106660
12988	NC_011988	GCG	2	6	672800	672805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106660
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12992	NC_011988	CAGC	2	8	672946	672953	25 %	0 %	25 %	50 %	222106660
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