MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_011988	TGC	2	6	622503	622508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106626
12002	NC_011988	AGCG	2	8	622547	622554	25 %	0 %	50 %	25 %	222106626
12003	NC_011988	CAG	2	6	622555	622560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106626
12004	NC_011988	TCG	2	6	622638	622643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106626
12005	NC_011988	A	6	6	622689	622694	100 %	0 %	0 %	0 %	222106626
12006	NC_011988	ACG	2	6	622704	622709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106626
12007	NC_011988	GGCT	2	8	622761	622768	0 %	25 %	50 %	25 %	222106626
12008	NC_011988	ATC	2	6	622805	622810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106626
12009	NC_011988	GCG	2	6	622888	622893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106626
12010	NC_011988	ATT	2	6	622953	622958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106626
12011	NC_011988	CAT	2	6	623020	623025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106626
12012	NC_011988	TC	3	6	623191	623196	0 %	50 %	0 %	50 %	222106626
12013	NC_011988	GCG	2	6	623265	623270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106627
12014	NC_011988	CAATT	2	10	623469	623478	40 %	40 %	0 %	20 %	222106627
12015	NC_011988	GCGG	2	8	623526	623533	0 %	0 %	75 %	25 %	222106627
12016	NC_011988	TGA	2	6	623582	623587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106627
12017	NC_011988	CAA	2	6	623683	623688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106627
12018	NC_011988	AT	3	6	623751	623756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_011988	CATT	2	8	623796	623803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12020	NC_011988	CG	3	6	624004	624009	0 %	0 %	50 %	50 %	222106628
12021	NC_011988	ACC	2	6	624165	624170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106628
12022	NC_011988	CCATCG	2	12	624205	624216	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222106628
12023	NC_011988	GGT	2	6	624242	624247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106628
12024	NC_011988	TGG	2	6	624355	624360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106628
12025	NC_011988	GAG	2	6	624402	624407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106628
12026	NC_011988	CCG	2	6	624425	624430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106628
12027	NC_011988	ATA	2	6	624439	624444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106628
12028	NC_011988	CGG	2	6	624469	624474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106628
12029	NC_011988	GGC	2	6	624502	624507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106628
12030	NC_011988	GGC	2	6	624600	624605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106628
12031	NC_011988	GGC	2	6	624624	624629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106628
12032	NC_011988	GCC	2	6	624636	624641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106628
12033	NC_011988	GCT	2	6	624662	624667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106628
12034	NC_011988	GTG	2	6	624744	624749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106629
12035	NC_011988	CAG	2	6	624770	624775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106629
12036	NC_011988	GGC	2	6	624854	624859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106629
12037	NC_011988	ATC	2	6	624915	624920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106629
12038	NC_011988	GGC	2	6	624935	624940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106629
12039	NC_011988	TCG	2	6	624948	624953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106629
12040	NC_011988	CAC	2	6	624970	624975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106629
12041	NC_011988	GCC	2	6	624998	625003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106629
12042	NC_011988	CGCC	2	8	625072	625079	0 %	0 %	25 %	75 %	222106629
12043	NC_011988	GGC	2	6	625112	625117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106629
12044	NC_011988	GCG	2	6	625125	625130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106629
12045	NC_011988	CTG	2	6	625136	625141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106629
12046	NC_011988	CCCG	2	8	625216	625223	0 %	0 %	25 %	75 %	222106629
12047	NC_011988	ATC	2	6	625226	625231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106629
12048	NC_011988	CAT	2	6	625264	625269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106629
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12050	NC_011988	TCA	2	6	625353	625358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106629
12051	NC_011988	GCA	2	6	625360	625365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106629
12052	NC_011988	GCC	2	6	625373	625378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106629
12053	NC_011988	GACA	2	8	625387	625394	50 %	0 %	25 %	25 %	222106629
12054	NC_011988	TCCGG	2	10	625438	625447	0 %	20 %	40 %	40 %	222106629
12055	NC_011988	GAAA	2	8	625451	625458	75 %	0 %	25 %	0 %	222106629
12056	NC_011988	CGCC	2	8	625462	625469	0 %	0 %	25 %	75 %	222106629
12057	NC_011988	CGG	2	6	625562	625567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106630
12058	NC_011988	AC	3	6	625574	625579	50 %	0 %	0 %	50 %	222106630
12059	NC_011988	CGGT	2	8	625762	625769	0 %	25 %	50 %	25 %	222106630
12060	NC_011988	CAGCA	2	10	625803	625812	40 %	0 %	20 %	40 %	222106630
12061	NC_011988	CAT	2	6	625884	625889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106630
12062	NC_011988	CGA	2	6	625925	625930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106630
12063	NC_011988	CGG	2	6	625962	625967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106630
12064	NC_011988	ACG	2	6	625999	626004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106630
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12069	NC_011988	CT	3	6	626192	626197	0 %	50 %	0 %	50 %	222106630
12070	NC_011988	GCT	2	6	626198	626203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106630
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12072	NC_011988	CGGT	2	8	626384	626391	0 %	25 %	50 %	25 %	222106630
12073	NC_011988	CGG	2	6	626400	626405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106630
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12081	NC_011988	CAC	2	6	626770	626775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106631
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12092	NC_011988	CCG	2	6	627228	627233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106631
12093	NC_011988	CAG	2	6	627235	627240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106631
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12100	NC_011988	GAT	2	6	627734	627739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106632
12101	NC_011988	CG	3	6	627775	627780	0 %	0 %	50 %	50 %	222106632
12102	NC_011988	TTG	2	6	627795	627800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106632
12103	NC_011988	TCAGCA	2	12	627823	627834	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222106632
12104	NC_011988	CAGAC	2	10	627855	627864	40 %	0 %	20 %	40 %	222106632
12105	NC_011988	GAT	2	6	627983	627988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106632
12106	NC_011988	CTG	2	6	628041	628046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106632
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12108	NC_011988	CGG	2	6	628108	628113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106632
12109	NC_011988	GAA	3	9	628160	628168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106632
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12111	NC_011988	GAT	2	6	628241	628246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106632
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12115	NC_011988	CCA	2	6	628529	628534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106633
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12117	NC_011988	TTC	2	6	628561	628566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106633
12118	NC_011988	GGC	2	6	628594	628599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106633
12119	NC_011988	TTG	2	6	628604	628609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106633
12120	NC_011988	A	6	6	628620	628625	100 %	0 %	0 %	0 %	222106633
12121	NC_011988	CGC	2	6	628644	628649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106633
12122	NC_011988	GCA	2	6	628692	628697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106633
12123	NC_011988	GAC	2	6	628750	628755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106633
12124	NC_011988	AGC	2	6	628766	628771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106633
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12126	NC_011988	CCG	2	6	628878	628883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106633
12127	NC_011988	CGG	2	6	628940	628945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106633
12128	NC_011988	GCC	2	6	628954	628959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106633
12129	NC_011988	AGA	2	6	629081	629086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106633
12130	NC_011988	GATC	2	8	629121	629128	25 %	25 %	25 %	25 %	222106633
12131	NC_011988	TTC	2	6	629162	629167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106633
12132	NC_011988	CTGC	2	8	629241	629248	0 %	25 %	25 %	50 %	222106633
12133	NC_011988	GTT	2	6	629254	629259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106633
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12139	NC_011988	GCA	2	6	629438	629443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106633
12140	NC_011988	CGG	2	6	629460	629465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106633
12141	NC_011988	TCA	2	6	629511	629516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106633
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12143	NC_011988	ATC	2	6	629684	629689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12144	NC_011988	TGT	3	9	629690	629698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12145	NC_011988	GCC	2	6	629767	629772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12146	NC_011988	GC	3	6	629779	629784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12147	NC_011988	GGC	2	6	629791	629796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106634
12148	NC_011988	CT	3	6	629816	629821	0 %	50 %	0 %	50 %	222106634
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12152	NC_011988	AGG	2	6	629912	629917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106634
12153	NC_011988	TGG	2	6	630041	630046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106634
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12156	NC_011988	GCT	2	6	630280	630285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106634
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12166	NC_011988	TCG	2	6	630636	630641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106635
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12175	NC_011988	TCAT	2	8	630954	630961	25 %	50 %	0 %	25 %	222106635
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12180	NC_011988	AGGGCA	2	12	631147	631158	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222106635
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12185	NC_011988	CTC	3	9	631344	631352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106635
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12187	NC_011988	TGG	2	6	631485	631490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12188	NC_011988	CAAT	2	8	631514	631521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12189	NC_011988	ATA	2	6	631550	631555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12190	NC_011988	CGT	2	6	631575	631580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12191	NC_011988	TCA	2	6	631615	631620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12192	NC_011988	CGG	2	6	631682	631687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12193	NC_011988	TGA	2	6	631767	631772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12194	NC_011988	TCG	2	6	631797	631802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12195	NC_011988	ATGC	2	8	631898	631905	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12196	NC_011988	GCT	2	6	631935	631940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12197	NC_011988	A	7	7	631944	631950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12198	NC_011988	T	6	6	632025	632030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12199	NC_011988	A	7	7	632044	632050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12200	NC_011988	ATT	2	6	632127	632132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12201	NC_011988	GAC	2	6	632247	632252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106636
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12204	NC_011988	GCTGA	2	10	632370	632379	20 %	20 %	40 %	20 %	222106636
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12207	NC_011988	CTG	2	6	632532	632537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106636
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12211	NC_011988	GGC	2	6	632811	632816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106636
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12215	NC_011988	AGC	2	6	632977	632982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106636
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12221	NC_011988	TCG	2	6	633358	633363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106636
12222	NC_011988	GCG	2	6	633376	633381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106636
12223	NC_011988	GGC	2	6	633398	633403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106636
12224	NC_011988	GC	3	6	633402	633407	0 %	0 %	50 %	50 %	222106636
12225	NC_011988	TCGAG	2	10	633457	633466	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12226	NC_011988	GCCTTT	2	12	633467	633478	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12227	NC_011988	T	6	6	633476	633481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12228	NC_011988	AT	3	6	633543	633548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12229	NC_011988	AAT	2	6	633554	633559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12230	NC_011988	GGC	2	6	633561	633566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12231	NC_011988	TAT	2	6	633595	633600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12232	NC_011988	TTC	2	6	633608	633613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12233	NC_011988	TCGC	2	8	633688	633695	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12234	NC_011988	GTTC	2	8	633833	633840	0 %	50 %	25 %	25 %	222106637
12235	NC_011988	CAA	2	6	633853	633858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106637
12236	NC_011988	TTG	2	6	633874	633879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106637
12237	NC_011988	AAT	2	6	633915	633920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106637
12238	NC_011988	AT	3	6	634013	634018	50 %	50 %	0 %	0 %	222106637
12239	NC_011988	CAA	2	6	634305	634310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12240	NC_011988	AAT	2	6	634320	634325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106638
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12242	NC_011988	CTGG	2	8	634368	634375	0 %	25 %	50 %	25 %	222106638
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12362	NC_011988	GAT	2	6	640592	640597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106640
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12461	NC_011988	ACCG	2	8	645898	645905	25 %	0 %	25 %	50 %	222106641
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12465	NC_011988	TGA	2	6	646029	646034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106641
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12474	NC_011988	TGC	2	6	646601	646606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12475	NC_011988	ATC	2	6	646640	646645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106641
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12477	NC_011988	CAC	2	6	646655	646660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106641
12478	NC_011988	ACC	2	6	646681	646686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106641
12479	NC_011988	GATGT	2	10	646744	646753	20 %	40 %	40 %	0 %	222106641
12480	NC_011988	GCGGG	2	10	646867	646876	0 %	0 %	80 %	20 %	222106641
12481	NC_011988	GTG	2	6	646904	646909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106641
12482	NC_011988	CGA	2	6	646911	646916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12483	NC_011988	TCA	2	6	647021	647026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106641
12484	NC_011988	GC	3	6	647052	647057	0 %	0 %	50 %	50 %	222106641
12485	NC_011988	AAACC	2	10	647087	647096	60 %	0 %	0 %	40 %	222106641
12486	NC_011988	TTG	2	6	647197	647202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106641
12487	NC_011988	GAC	3	9	647218	647226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12488	NC_011988	CAGC	2	8	647254	647261	25 %	0 %	25 %	50 %	222106641
12489	NC_011988	CAGCGC	2	12	647392	647403	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222106641
12490	NC_011988	GCG	2	6	647530	647535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106641
12491	NC_011988	TGCGCC	2	12	647577	647588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222106641
12492	NC_011988	GC	3	6	647592	647597	0 %	0 %	50 %	50 %	222106641
12493	NC_011988	TGC	2	6	647624	647629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
12494	NC_011988	GC	3	6	647723	647728	0 %	0 %	50 %	50 %	222106641
12495	NC_011988	GCC	2	6	647775	647780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106641
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12497	NC_011988	CG	3	6	647795	647800	0 %	0 %	50 %	50 %	222106641
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12499	NC_011988	ATG	2	6	647858	647863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106641
12500	NC_011988	GCC	2	6	647901	647906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106641

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