MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_011988	GGA	2	6	441487	441492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_011988	AAG	2	6	441677	441682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106489
8503	NC_011988	CTTG	2	8	441698	441705	0 %	50 %	25 %	25 %	222106489
8504	NC_011988	GACG	2	8	441821	441828	25 %	0 %	50 %	25 %	222106489
8505	NC_011988	AGCCA	2	10	441847	441856	40 %	0 %	20 %	40 %	222106489
8506	NC_011988	GCA	2	6	441892	441897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106489
8507	NC_011988	TGC	2	6	441978	441983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106489
8508	NC_011988	ATC	2	6	442128	442133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106489
8509	NC_011988	CAGCT	2	10	442151	442160	20 %	20 %	20 %	40 %	222106489
8510	NC_011988	CAA	2	6	442186	442191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106489
8511	NC_011988	TCA	2	6	442203	442208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106489
8512	NC_011988	GCA	2	6	442285	442290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106489
8513	NC_011988	TTC	2	6	442323	442328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106489
8514	NC_011988	CGC	2	6	442471	442476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106490
8515	NC_011988	GTC	2	6	442481	442486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106490
8516	NC_011988	GCG	2	6	442546	442551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106490
8517	NC_011988	CGA	2	6	442677	442682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106490
8518	NC_011988	GCCA	2	8	442719	442726	25 %	0 %	25 %	50 %	222106490
8519	NC_011988	ATC	2	6	442749	442754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106490
8520	NC_011988	GTC	2	6	442778	442783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106490
8521	NC_011988	CGG	2	6	442792	442797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106490
8522	NC_011988	TGGC	2	8	442833	442840	0 %	25 %	50 %	25 %	222106490
8523	NC_011988	GATCT	2	10	443033	443042	20 %	40 %	20 %	20 %	222106490
8524	NC_011988	GGT	2	6	443123	443128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106490
8525	NC_011988	GCC	2	6	443146	443151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106490
8526	NC_011988	AGC	2	6	443251	443256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_011988	GCGGG	2	10	443270	443279	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8528	NC_011988	GAG	2	6	443417	443422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_011988	TGA	2	6	443427	443432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106491
8530	NC_011988	GTC	2	6	443462	443467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106491
8531	NC_011988	TCT	2	6	443506	443511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106491
8532	NC_011988	GGC	2	6	443513	443518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106491
8533	NC_011988	GT	3	6	443523	443528	0 %	50 %	50 %	0 %	222106491
8534	NC_011988	CGA	3	9	443587	443595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106491
8535	NC_011988	GGA	2	6	443626	443631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106491
8536	NC_011988	GTG	2	6	443648	443653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106491
8537	NC_011988	CG	3	6	443718	443723	0 %	0 %	50 %	50 %	222106491
8538	NC_011988	TTC	2	6	443816	443821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106491
8539	NC_011988	GCG	2	6	443882	443887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106491
8540	NC_011988	GC	3	6	443909	443914	0 %	0 %	50 %	50 %	222106491
8541	NC_011988	GGA	2	6	443933	443938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106491
8542	NC_011988	CGGA	2	8	444020	444027	25 %	0 %	50 %	25 %	222106491
8543	NC_011988	CGT	2	6	444104	444109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106491
8544	NC_011988	TGC	2	6	444120	444125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106491
8545	NC_011988	GAG	2	6	444155	444160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106491
8546	NC_011988	CGC	2	6	444215	444220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106491
8547	NC_011988	GAAT	2	8	444327	444334	50 %	25 %	25 %	0 %	222106491
8548	NC_011988	GCG	2	6	444430	444435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106491
8549	NC_011988	TGA	2	6	444483	444488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106491
8550	NC_011988	ATT	2	6	444564	444569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106491
8551	NC_011988	AAGCCA	2	12	444587	444598	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222106491
8552	NC_011988	TGG	2	6	444651	444656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106491
8553	NC_011988	GTG	2	6	444677	444682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106491
8554	NC_011988	TGA	2	6	444751	444756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106491
8555	NC_011988	TCA	2	6	444786	444791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106491
8556	NC_011988	GGC	2	6	444885	444890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106491
8557	NC_011988	TGC	2	6	444936	444941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106491
8558	NC_011988	AT	3	6	444952	444957	50 %	50 %	0 %	0 %	222106491
8559	NC_011988	TGG	2	6	444993	444998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106491
8560	NC_011988	T	6	6	445114	445119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_011988	TGT	2	6	445221	445226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_011988	TTA	2	6	445362	445367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_011988	ATA	2	6	445377	445382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_011988	ATA	2	6	445406	445411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_011988	GTC	2	6	445421	445426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8566	NC_011988	GTC	2	6	445453	445458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8567	NC_011988	AGA	2	6	445468	445473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_011988	GAC	2	6	445494	445499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8569	NC_011988	CAT	2	6	445554	445559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_011988	CGT	2	6	445616	445621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_011988	TGG	2	6	445682	445687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_011988	ATG	2	6	445697	445702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106492
8573	NC_011988	GCTG	2	8	445741	445748	0 %	25 %	50 %	25 %	222106492
8574	NC_011988	GCC	2	6	445784	445789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106492
8575	NC_011988	AGCC	2	8	445790	445797	25 %	0 %	25 %	50 %	222106492
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8577	NC_011988	CGA	2	6	445936	445941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106492
8578	NC_011988	CGG	2	6	445942	445947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106492
8579	NC_011988	GGC	2	6	446015	446020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106492
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8582	NC_011988	ACC	2	6	446111	446116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106492
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8584	NC_011988	CTG	2	6	446219	446224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106492
8585	NC_011988	AGA	2	6	446254	446259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106492
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8587	NC_011988	CGA	2	6	446494	446499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106492
8588	NC_011988	GCA	3	9	446519	446527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106492
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8590	NC_011988	ATG	2	6	446658	446663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106492
8591	NC_011988	GCAT	2	8	446664	446671	25 %	25 %	25 %	25 %	222106492
8592	NC_011988	GCC	2	6	446714	446719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106492
8593	NC_011988	CG	3	6	446793	446798	0 %	0 %	50 %	50 %	222106492
8594	NC_011988	GAA	2	6	446836	446841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106492
8595	NC_011988	CT	3	6	446910	446915	0 %	50 %	0 %	50 %	222106492
8596	NC_011988	TG	3	6	447012	447017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_011988	GAG	2	6	447076	447081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_011988	TGG	2	6	447096	447101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106493
8599	NC_011988	TA	3	6	447227	447232	50 %	50 %	0 %	0 %	222106493
8600	NC_011988	C	6	6	447288	447293	0 %	0 %	0 %	100 %	222106493
8601	NC_011988	GGC	2	6	447310	447315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106493
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8603	NC_011988	CGGT	2	8	447349	447356	0 %	25 %	50 %	25 %	222106493
8604	NC_011988	TCT	2	6	447375	447380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106493
8605	NC_011988	TCG	2	6	447399	447404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106493
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8609	NC_011988	CATT	2	8	447546	447553	25 %	50 %	0 %	25 %	222106493
8610	NC_011988	CAT	2	6	447586	447591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106493
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8612	NC_011988	TCG	2	6	447768	447773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106493
8613	NC_011988	TAT	2	6	447854	447859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106493
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8616	NC_011988	CG	3	6	447921	447926	0 %	0 %	50 %	50 %	222106493
8617	NC_011988	CGCTC	2	10	447965	447974	0 %	20 %	20 %	60 %	222106494
8618	NC_011988	CTT	2	6	448003	448008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106494
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8620	NC_011988	GAT	2	6	448082	448087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106494
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8622	NC_011988	GGT	2	6	448297	448302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106494
8623	NC_011988	GCACG	2	10	448320	448329	20 %	0 %	40 %	40 %	222106494
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8626	NC_011988	CGC	2	6	448594	448599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106494
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8991	NC_011988	GCC	2	6	467911	467916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106511
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