MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011988	GCT	2	6	366804	366809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106429
7002	NC_011988	AGTC	2	8	366816	366823	25 %	25 %	25 %	25 %	222106429
7003	NC_011988	GC	3	6	366876	366881	0 %	0 %	50 %	50 %	222106429
7004	NC_011988	GC	4	8	366972	366979	0 %	0 %	50 %	50 %	222106429
7005	NC_011988	GCGCA	2	10	367020	367029	20 %	0 %	40 %	40 %	222106429
7006	NC_011988	CTG	2	6	367080	367085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106429
7007	NC_011988	TGC	2	6	367102	367107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106429
7008	NC_011988	GC	3	6	367128	367133	0 %	0 %	50 %	50 %	222106429
7009	NC_011988	GCT	2	6	367181	367186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106429
7010	NC_011988	GCAGT	2	10	367240	367249	20 %	20 %	40 %	20 %	222106429
7011	NC_011988	GGC	2	6	367319	367324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106429
7012	NC_011988	CGG	2	6	367390	367395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106429
7013	NC_011988	TTC	2	6	367444	367449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106429
7014	NC_011988	GA	3	6	367517	367522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_011988	TTAA	2	8	367569	367576	50 %	50 %	0 %	0 %	222106430
7016	NC_011988	CGA	2	6	367695	367700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106430
7017	NC_011988	TCG	3	9	367740	367748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106430
7018	NC_011988	GCA	2	6	367794	367799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106430
7019	NC_011988	ATA	2	6	367820	367825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106430
7020	NC_011988	CAG	2	6	367882	367887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106430
7021	NC_011988	CAG	2	6	367897	367902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106430
7022	NC_011988	TGA	2	6	367977	367982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106430
7023	NC_011988	CAG	2	6	367993	367998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106430
7024	NC_011988	GGC	2	6	368026	368031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106430
7025	NC_011988	CAG	2	6	368059	368064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106430
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7027	NC_011988	CGT	2	6	368146	368151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106430
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7030	NC_011988	GCC	2	6	368236	368241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106430
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7034	NC_011988	GA	3	6	368384	368389	50 %	0 %	50 %	0 %	222106430
7035	NC_011988	CGA	2	6	368427	368432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106430
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7037	NC_011988	GCC	2	6	368446	368451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106430
7038	NC_011988	GGAT	2	8	368519	368526	25 %	25 %	50 %	0 %	222106430
7039	NC_011988	CGG	2	6	368574	368579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106430
7040	NC_011988	TGA	2	6	368604	368609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106430
7041	NC_011988	GCA	2	6	368612	368617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106430
7042	NC_011988	CGG	2	6	368757	368762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106430
7043	NC_011988	CGG	2	6	368781	368786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106430
7044	NC_011988	ATTG	2	8	368848	368855	25 %	50 %	25 %	0 %	222106430
7045	NC_011988	TCG	2	6	368862	368867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106430
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7048	NC_011988	GCG	2	6	368933	368938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_011988	TGA	2	6	368939	368944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_011988	GT	3	6	368956	368961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_011988	GC	3	6	369030	369035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7052	NC_011988	TTC	2	6	369091	369096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106431
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7054	NC_011988	GCT	2	6	369152	369157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106431
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7056	NC_011988	CGA	2	6	369290	369295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106431
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7058	NC_011988	CAA	2	6	369380	369385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106431
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7061	NC_011988	TGA	2	6	369428	369433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106431
7062	NC_011988	CGG	2	6	369443	369448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106431
7063	NC_011988	CAG	2	6	369455	369460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106431
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7065	NC_011988	CAG	2	6	369723	369728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106431
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7072	NC_011988	TCG	2	6	370099	370104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106431
7073	NC_011988	TCGG	2	8	370129	370136	0 %	25 %	50 %	25 %	222106431
7074	NC_011988	GATC	2	8	370151	370158	25 %	25 %	25 %	25 %	222106431
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7081	NC_011988	CTGCA	2	10	370389	370398	20 %	20 %	20 %	40 %	222106431
7082	NC_011988	GAAT	2	8	370502	370509	50 %	25 %	25 %	0 %	222106431
7083	NC_011988	TGC	2	6	370524	370529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106431
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7085	NC_011988	AGC	2	6	370631	370636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7087	NC_011988	T	6	6	370683	370688	0 %	100 %	0 %	0 %	222106432
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7089	NC_011988	TC	3	6	370956	370961	0 %	50 %	0 %	50 %	222106432
7090	NC_011988	CGC	2	6	370977	370982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106432
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7094	NC_011988	CGC	2	6	371182	371187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106432
7095	NC_011988	TCT	2	6	371191	371196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106432
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7102	NC_011988	TGA	2	6	371489	371494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106432
7103	NC_011988	GTC	2	6	371518	371523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106432
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7108	NC_011988	CGC	2	6	371909	371914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106432
7109	NC_011988	AGC	2	6	371923	371928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106432
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7112	NC_011988	CAG	2	6	371991	371996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106432
7113	NC_011988	CG	3	6	371997	372002	0 %	0 %	50 %	50 %	222106432
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7117	NC_011988	TAT	2	6	372105	372110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_011988	TCGGT	2	10	372328	372337	0 %	40 %	40 %	20 %	222106433
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7120	NC_011988	TCCG	2	8	372399	372406	0 %	25 %	25 %	50 %	222106433
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7122	NC_011988	TATC	2	8	372445	372452	25 %	50 %	0 %	25 %	222106433
7123	NC_011988	TGC	2	6	372499	372504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106433
7124	NC_011988	CCG	2	6	372505	372510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106433
7125	NC_011988	TAT	3	9	372593	372601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106433
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7131	NC_011988	GCG	2	6	372909	372914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7132	NC_011988	ATT	2	6	372915	372920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7135	NC_011988	TCG	2	6	373052	373057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106434
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7161	NC_011988	TCG	2	6	374331	374336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106434
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7230	NC_011988	CAA	2	6	377608	377613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106437
7231	NC_011988	CAT	3	9	377635	377643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106437
7232	NC_011988	TCC	2	6	377657	377662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106437
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7234	NC_011988	GGCAC	2	10	377915	377924	20 %	0 %	40 %	40 %	222106437
7235	NC_011988	GCT	2	6	377992	377997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106437
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7241	NC_011988	CAA	2	6	378277	378282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106437
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7243	NC_011988	TTG	2	6	378399	378404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106437
7244	NC_011988	GC	3	6	378551	378556	0 %	0 %	50 %	50 %	222106437
7245	NC_011988	CGG	2	6	378625	378630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106437
7246	NC_011988	AGC	2	6	378636	378641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106437
7247	NC_011988	ATC	2	6	378680	378685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106437
7248	NC_011988	GCT	2	6	378742	378747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106437
7249	NC_011988	GC	3	6	378757	378762	0 %	0 %	50 %	50 %	222106437
7250	NC_011988	TCA	2	6	378834	378839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106437
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7254	NC_011988	GTT	2	6	379026	379031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7255	NC_011988	AC	3	6	379041	379046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7256	NC_011988	GGC	2	6	379071	379076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106438
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7320	NC_011988	GGT	2	6	382483	382488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106440
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7323	NC_011988	TGG	2	6	382685	382690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106440
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7328	NC_011988	TGA	2	6	382938	382943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106441
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7350	NC_011988	GCTGAC	2	12	383914	383925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222106441
7351	NC_011988	CAATC	2	10	383972	383981	40 %	20 %	0 %	40 %	222106441
7352	NC_011988	GGC	2	6	384043	384048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106441
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7354	NC_011988	CGG	2	6	384144	384149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106441
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7359	NC_011988	TGGGC	2	10	384457	384466	0 %	20 %	60 %	20 %	222106442
7360	NC_011988	ATCG	2	8	384557	384564	25 %	25 %	25 %	25 %	222106442
7361	NC_011988	GCG	3	9	384602	384610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106442
7362	NC_011988	TGT	2	6	384617	384622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106442
7363	NC_011988	ATC	2	6	384656	384661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106442
7364	NC_011988	AGA	2	6	384720	384725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106442
7365	NC_011988	ATA	2	6	384735	384740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106442
7366	NC_011988	CG	3	6	384775	384780	0 %	0 %	50 %	50 %	222106442
7367	NC_011988	GGT	2	6	384785	384790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106442
7368	NC_011988	CGC	2	6	384816	384821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106442
7369	NC_011988	TCA	2	6	384858	384863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106442
7370	NC_011988	TCA	2	6	384933	384938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106443
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7373	NC_011988	GGT	2	6	385042	385047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106443
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7375	NC_011988	ACC	2	6	385165	385170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106443
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7379	NC_011988	CCAT	2	8	385409	385416	25 %	25 %	0 %	50 %	222106443
7380	NC_011988	CAAGGC	2	12	385443	385454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106443
7381	NC_011988	TCGG	2	8	385474	385481	0 %	25 %	50 %	25 %	222106443
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7383	NC_011988	A	6	6	385661	385666	100 %	0 %	0 %	0 %	222106443
7384	NC_011988	CGA	2	6	385670	385675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106443
7385	NC_011988	CAA	2	6	385683	385688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106443
7386	NC_011988	TTCGG	2	10	385733	385742	0 %	40 %	40 %	20 %	222106443
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7388	NC_011988	TGGCT	2	10	386013	386022	0 %	40 %	40 %	20 %	222106443
7389	NC_011988	TCA	2	6	386142	386147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106443
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7394	NC_011988	CGA	2	6	386400	386405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106443
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7396	NC_011988	CAG	2	6	386455	386460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106443
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7398	NC_011988	GGC	2	6	386547	386552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106443
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7400	NC_011988	CCG	2	6	386578	386583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106443
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7402	NC_011988	TTG	2	6	386771	386776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106443
7403	NC_011988	CAAT	2	8	386778	386785	50 %	25 %	0 %	25 %	222106443
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7421	NC_011988	TGC	2	6	387774	387779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106444
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7423	NC_011988	GTC	2	6	387879	387884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106444
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7432	NC_011988	GC	3	6	388525	388530	0 %	0 %	50 %	50 %	222106445
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7434	NC_011988	GA	3	6	388546	388551	50 %	0 %	50 %	0 %	222106445
7435	NC_011988	GGC	2	6	388554	388559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106445
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7437	NC_011988	CGA	2	6	388664	388669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106445
7438	NC_011988	TCG	2	6	388690	388695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106445
7439	NC_011988	CTG	2	6	388787	388792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106445
7440	NC_011988	CCG	2	6	388816	388821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106445
7441	NC_011988	CGA	2	6	388898	388903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106445
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7443	NC_011988	TCA	2	6	389007	389012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7444	NC_011988	GA	3	6	389049	389054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7445	NC_011988	CTT	2	6	389129	389134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7447	NC_011988	CCG	2	6	389233	389238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106446
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7450	NC_011988	GAT	2	6	389382	389387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106446
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7452	NC_011988	AAG	2	6	389469	389474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106446
7453	NC_011988	CTATGA	2	12	389594	389605	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222106446
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7456	NC_011988	CGC	2	6	389686	389691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7457	NC_011988	TGC	2	6	389730	389735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106447
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7466	NC_011988	TGT	2	6	390000	390005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106447
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7470	NC_011988	TCT	3	9	390310	390318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106447
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7474	NC_011988	GCC	2	6	390601	390606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106447
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7476	NC_011988	GC	3	6	390644	390649	0 %	0 %	50 %	50 %	222106447
7477	NC_011988	GCG	2	6	390679	390684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106447
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7481	NC_011988	GAA	2	6	390906	390911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106447
7482	NC_011988	AG	3	6	390913	390918	50 %	0 %	50 %	0 %	222106447
7483	NC_011988	GGCT	2	8	390950	390957	0 %	25 %	50 %	25 %	222106447
7484	NC_011988	TGCG	2	8	390960	390967	0 %	25 %	50 %	25 %	222106447
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