MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c

Total Repeats: 7760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011987	GTA	2	6	50	55	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011987	TAT	2	6	85	90	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011987	TGCG	2	8	146	153	0 %	25 %	50 %	25 %	222101963
4	NC_011987	TGA	2	6	374	379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222101963
5	NC_011987	GAT	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222101963
6	NC_011987	TCA	2	6	428	433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101963
7	NC_011987	CTGG	2	8	560	567	0 %	25 %	50 %	25 %	222101963
8	NC_011987	AAT	2	6	662	667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222101963
9	NC_011987	A	6	6	787	792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011987	GGT	2	6	887	892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222101964
11	NC_011987	GGC	2	6	1004	1009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101964
12	NC_011987	GAA	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222101964
13	NC_011987	GAGC	2	8	1140	1147	25 %	0 %	50 %	25 %	222101964
14	NC_011987	GCA	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101964
15	NC_011987	TCG	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222101964
16	NC_011987	CAC	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222101964
17	NC_011987	GCA	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101964
18	NC_011987	GCC	2	6	1365	1370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101964
19	NC_011987	CACTC	2	10	1526	1535	20 %	20 %	0 %	60 %	222101964
20	NC_011987	CGT	2	6	1543	1548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222101964
21	NC_011987	CGA	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101964
22	NC_011987	ATC	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101964
23	NC_011987	CGA	2	6	1693	1698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101964
24	NC_011987	TCA	2	6	1746	1751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101964
25	NC_011987	GAT	2	6	1777	1782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222101964
26	NC_011987	GGC	2	6	1819	1824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101964
27	NC_011987	TCG	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222101964
28	NC_011987	GC	3	6	1960	1965	0 %	0 %	50 %	50 %	222101964
29	NC_011987	CCG	2	6	1969	1974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101964
30	NC_011987	TGG	2	6	2010	2015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222101965
31	NC_011987	CTGG	2	8	2019	2026	0 %	25 %	50 %	25 %	222101965
32	NC_011987	TG	3	6	2077	2082	0 %	50 %	50 %	0 %	222101965
33	NC_011987	TCA	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101965
34	NC_011987	TCA	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101965
35	NC_011987	TC	3	6	2207	2212	0 %	50 %	0 %	50 %	222101965
36	NC_011987	CTC	3	9	2210	2218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222101965
37	NC_011987	GCG	2	6	2223	2228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101965
38	NC_011987	GTC	2	6	2243	2248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222101965
39	NC_011987	CGG	2	6	2275	2280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101965
40	NC_011987	GCC	2	6	2318	2323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101965
41	NC_011987	CGC	2	6	2350	2355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101965
42	NC_011987	GAC	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101965
43	NC_011987	GA	3	6	2514	2519	50 %	0 %	50 %	0 %	222101965
44	NC_011987	CCGA	2	8	2555	2562	25 %	0 %	25 %	50 %	222101965
45	NC_011987	TTC	2	6	2588	2593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222101965
46	NC_011987	CG	3	6	2609	2614	0 %	0 %	50 %	50 %	222101965
47	NC_011987	CGA	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101965
48	NC_011987	CAT	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101965
49	NC_011987	ATG	2	6	2927	2932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222101965
50	NC_011987	CAACG	2	10	2961	2970	40 %	0 %	20 %	40 %	222101965
51	NC_011987	CGG	2	6	2983	2988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101965
52	NC_011987	GC	3	6	3010	3015	0 %	0 %	50 %	50 %	222101965
53	NC_011987	CAT	2	6	3016	3021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101965
54	NC_011987	GAT	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222101965
55	NC_011987	CGG	2	6	3138	3143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101965
56	NC_011987	TC	3	6	3231	3236	0 %	50 %	0 %	50 %	222101966
57	NC_011987	TCA	2	6	3297	3302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101966
58	NC_011987	GCA	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101966
59	NC_011987	GAG	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222101966
60	NC_011987	CGCA	2	8	3470	3477	25 %	0 %	25 %	50 %	222101966
61	NC_011987	TGG	2	6	3503	3508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222101966
62	NC_011987	GC	3	6	3536	3541	0 %	0 %	50 %	50 %	222101966
63	NC_011987	GTT	2	6	3587	3592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222101966
64	NC_011987	GC	3	6	3614	3619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011987	GCG	2	6	3676	3681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011987	CAG	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011987	CCG	3	9	3919	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101967
68	NC_011987	CTT	2	6	3951	3956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222101967
69	NC_011987	CGG	2	6	4012	4017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101967
70	NC_011987	TTG	2	6	4035	4040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222101967
71	NC_011987	CCGC	2	8	4157	4164	0 %	0 %	25 %	75 %	222101967
72	NC_011987	GCA	2	6	4192	4197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101967
73	NC_011987	CAAGA	2	10	4251	4260	60 %	0 %	20 %	20 %	222101967
74	NC_011987	AGC	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101967
75	NC_011987	AT	3	6	4322	4327	50 %	50 %	0 %	0 %	222101967
76	NC_011987	GTC	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222101967
77	NC_011987	GCA	2	6	4477	4482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101967
78	NC_011987	GAG	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222101967
79	NC_011987	TCT	2	6	4495	4500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222101967
80	NC_011987	ACA	2	6	4556	4561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222101967
81	NC_011987	CGT	2	6	4661	4666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222101967
82	NC_011987	A	6	6	4675	4680	100 %	0 %	0 %	0 %	222101967
83	NC_011987	GA	3	6	4703	4708	50 %	0 %	50 %	0 %	222101967
84	NC_011987	CTCG	2	8	4725	4732	0 %	25 %	25 %	50 %	222101967
85	NC_011987	GC	3	6	4816	4821	0 %	0 %	50 %	50 %	222101967
86	NC_011987	TTG	2	6	4846	4851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222101967
87	NC_011987	ATC	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101968
88	NC_011987	CAGG	2	8	4936	4943	25 %	0 %	50 %	25 %	222101968
89	NC_011987	TCG	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222101968
90	NC_011987	CAT	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101968
91	NC_011987	CAG	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101968
92	NC_011987	CA	3	6	5198	5203	50 %	0 %	0 %	50 %	222101968
93	NC_011987	ACG	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101968
94	NC_011987	TGA	2	6	5254	5259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222101968
95	NC_011987	CGAG	2	8	5260	5267	25 %	0 %	50 %	25 %	222101968
96	NC_011987	ATC	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101968
97	NC_011987	TCG	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222101968
98	NC_011987	GAC	2	6	5486	5491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101968
99	NC_011987	A	6	6	5552	5557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011987	CTCC	2	8	5576	5583	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_011987	CTAA	2	8	5619	5626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011987	TCT	2	6	5638	5643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011987	CGA	2	6	5644	5649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011987	CCTCCC	2	12	5696	5707	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	222101969
105	NC_011987	CCG	2	6	5741	5746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101969
106	NC_011987	CGC	2	6	5747	5752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101969
107	NC_011987	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101969
108	NC_011987	CCA	2	6	5779	5784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222101969
109	NC_011987	CGTC	2	8	5846	5853	0 %	25 %	25 %	50 %	222101969
110	NC_011987	GC	3	6	5882	5887	0 %	0 %	50 %	50 %	222101969
111	NC_011987	GCCG	2	8	5924	5931	0 %	0 %	50 %	50 %	222101969
112	NC_011987	A	6	6	5934	5939	100 %	0 %	0 %	0 %	222101969
113	NC_011987	AGC	2	6	5955	5960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101969
114	NC_011987	CGG	2	6	6022	6027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101969
115	NC_011987	CAG	2	6	6077	6082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101969
116	NC_011987	GTTC	2	8	6118	6125	0 %	50 %	25 %	25 %	222101969
117	NC_011987	CGA	2	6	6139	6144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101969
118	NC_011987	GCA	2	6	6151	6156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101969
119	NC_011987	CCG	2	6	6157	6162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101969
120	NC_011987	CGC	2	6	6187	6192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101969
121	NC_011987	TCC	2	6	6198	6203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222101969
122	NC_011987	GC	3	6	6264	6269	0 %	0 %	50 %	50 %	222101969
123	NC_011987	CGC	2	6	6293	6298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101969
124	NC_011987	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	222101969
125	NC_011987	GGC	2	6	6326	6331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101969
126	NC_011987	CAGA	2	8	6343	6350	50 %	0 %	25 %	25 %	222101969
127	NC_011987	TCC	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222101969
128	NC_011987	CGC	2	6	6415	6420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101969
129	NC_011987	CGG	2	6	6487	6492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101969
130	NC_011987	GCG	2	6	6516	6521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101969
131	NC_011987	CGG	2	6	6528	6533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101969
132	NC_011987	GCA	2	6	6601	6606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101969
133	NC_011987	TCA	2	6	6760	6765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101969
134	NC_011987	GATT	2	8	6918	6925	25 %	50 %	25 %	0 %	222101970
135	NC_011987	CGC	2	6	6929	6934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101970
136	NC_011987	GCC	2	6	6972	6977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101970
137	NC_011987	CCCA	2	8	7005	7012	25 %	0 %	0 %	75 %	222101970
138	NC_011987	A	7	7	7012	7018	100 %	0 %	0 %	0 %	222101970
139	NC_011987	CCG	2	6	7026	7031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101970
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141	NC_011987	GCC	2	6	7064	7069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222101970
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150	NC_011987	CGA	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101970
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152	NC_011987	CGG	2	6	7459	7464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101970
153	NC_011987	GC	3	6	7507	7512	0 %	0 %	50 %	50 %	222101970
154	NC_011987	GACGC	2	10	7522	7531	20 %	0 %	40 %	40 %	222101970
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165	NC_011987	TGG	2	6	7842	7847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222101970
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173	NC_011987	GAT	2	6	8264	8269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_011987	ATG	2	6	8300	8305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_011987	GAG	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
179	NC_011987	GTC	2	6	8446	8451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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246	NC_011987	GCG	2	6	12143	12148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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250	NC_011987	TCCCC	2	10	12363	12372	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
251	NC_011987	CGCC	2	8	12384	12391	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
252	NC_011987	GGC	2	6	12429	12434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_011987	TGG	2	6	12524	12529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_011987	CGC	2	6	12546	12551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
255	NC_011987	GCC	2	6	12641	12646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
256	NC_011987	CCA	2	6	12673	12678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
257	NC_011987	CGG	2	6	12810	12815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_011987	CAGC	2	8	12822	12829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
259	NC_011987	GAT	2	6	12843	12848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_011987	CG	3	6	12901	12906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
261	NC_011987	GCG	2	6	12922	12927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_011987	GTGCA	2	10	12972	12981	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
263	NC_011987	CCG	2	6	12990	12995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_011987	CAAA	2	8	13018	13025	75 %	0 %	0 %	25 %	222101977
265	NC_011987	GAA	2	6	13223	13228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222101977
266	NC_011987	CAGAAC	2	12	13230	13241	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222101977
267	NC_011987	GGC	2	6	13242	13247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101977
268	NC_011987	ACT	2	6	13249	13254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101977
269	NC_011987	TCACCG	2	12	13255	13266	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222101977
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272	NC_011987	CCGG	2	8	13378	13385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
273	NC_011987	GTT	2	6	13395	13400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_011987	AAT	2	6	13453	13458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_011987	TCG	2	6	13620	13625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_011987	AGT	2	6	13631	13636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_011987	ACT	2	6	13643	13648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_011987	AGT	2	6	13810	13815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_011987	AGT	2	6	13826	13831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011987	AGT	2	6	13967	13972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_011987	AG	3	6	14017	14022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_011987	CGA	2	6	20927	20932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222101984
400	NC_011987	ACT	2	6	20953	20958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222101984
401	NC_011987	GCG	2	6	21091	21096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222101984
402	NC_011987	TG	3	6	21116	21121	0 %	50 %	50 %	0 %	222101984
403	NC_011987	TGA	2	6	21184	21189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222101984
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405	NC_011987	AAG	2	6	21217	21222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222101984
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407	NC_011987	AGA	2	6	21278	21283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222101984
408	NC_011987	A	6	6	21313	21318	100 %	0 %	0 %	0 %	222101984
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421	NC_011987	GAC	2	6	22431	22436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_011987	CGC	2	6	22440	22445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_011987	CGA	2	6	22454	22459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_011987	CGTA	2	8	22491	22498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
425	NC_011987	CCCG	2	8	22501	22508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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454	NC_011987	GCTTG	2	10	23782	23791	0 %	40 %	40 %	20 %	222101987
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458	NC_011987	AT	3	6	24151	24156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_011987	CGA	2	6	24239	24244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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