MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 chromosome 1

Total Repeats: 2846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011985	GCCGT	2	10	2075	2084	0 %	20 %	40 %	40 %	222084203
2	NC_011985	GGCGC	2	10	3492	3501	0 %	0 %	60 %	40 %	222084205
3	NC_011985	TGGCG	2	10	4437	4446	0 %	20 %	60 %	20 %	222084206
4	NC_011985	GCCGC	2	10	6132	6141	0 %	0 %	40 %	60 %	222084209
5	NC_011985	CGTGC	2	10	8234	8243	0 %	20 %	40 %	40 %	222084211
6	NC_011985	AATGA	2	10	9329	9338	60 %	20 %	20 %	0 %	222084213
7	NC_011985	CATCG	2	10	17529	17538	20 %	20 %	20 %	40 %	222084220
8	NC_011985	CCTGC	2	10	19159	19168	0 %	20 %	20 %	60 %	222084222
9	NC_011985	GAGCC	2	10	19826	19835	20 %	0 %	40 %	40 %	222084222
10	NC_011985	GCCGC	2	10	21802	21811	0 %	0 %	40 %	60 %	222084224
11	NC_011985	GCTGC	2	10	22533	22542	0 %	20 %	40 %	40 %	222084225
12	NC_011985	GCCGG	2	10	22644	22653	0 %	0 %	60 %	40 %	222084225
13	NC_011985	GGCCG	2	10	22754	22763	0 %	0 %	60 %	40 %	222084225
14	NC_011985	GGCGC	2	10	23324	23333	0 %	0 %	60 %	40 %	222084226
15	NC_011985	GCGCC	2	10	25495	25504	0 %	0 %	40 %	60 %	222084227
16	NC_011985	TCGAA	2	10	25533	25542	40 %	20 %	20 %	20 %	222084227
17	NC_011985	CGGTG	2	10	25681	25690	0 %	20 %	60 %	20 %	222084227
18	NC_011985	GCCCG	2	10	28728	28737	0 %	0 %	40 %	60 %	222084228
19	NC_011985	GCCGG	2	10	29827	29836	0 %	0 %	60 %	40 %	222084228
20	NC_011985	TCTCG	2	10	31166	31175	0 %	40 %	20 %	40 %	222084229
21	NC_011985	TGCGC	2	10	31410	31419	0 %	20 %	40 %	40 %	222084230
22	NC_011985	GCCAG	2	10	35155	35164	20 %	0 %	40 %	40 %	222084231
23	NC_011985	GATCG	2	10	36097	36106	20 %	20 %	40 %	20 %	222084232
24	NC_011985	ACCGC	2	10	39521	39530	20 %	0 %	20 %	60 %	222084236
25	NC_011985	GCCAA	2	10	40226	40235	40 %	0 %	20 %	40 %	222084236
26	NC_011985	ACTCG	2	10	41540	41549	20 %	20 %	20 %	40 %	222084238
27	NC_011985	AGCCG	2	10	42353	42362	20 %	0 %	40 %	40 %	222084238
28	NC_011985	TTTGG	2	10	43689	43698	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011985	GTCCG	2	10	48959	48968	0 %	20 %	40 %	40 %	222084246
30	NC_011985	TCGTC	2	10	50212	50221	0 %	40 %	20 %	40 %	222084248
31	NC_011985	TGGCC	2	10	50284	50293	0 %	20 %	40 %	40 %	222084248
32	NC_011985	TGCGC	2	10	51405	51414	0 %	20 %	40 %	40 %	222084250
33	NC_011985	TCGCC	2	10	51522	51531	0 %	20 %	20 %	60 %	222084250
34	NC_011985	CGATC	2	10	53053	53062	20 %	20 %	20 %	40 %	222084251
35	NC_011985	GATCC	2	10	55598	55607	20 %	20 %	20 %	40 %	222084253
36	NC_011985	TCCGG	2	10	56023	56032	0 %	20 %	40 %	40 %	222084253
37	NC_011985	GCCGC	2	10	56277	56286	0 %	0 %	40 %	60 %	222084253
38	NC_011985	CGTGC	2	10	59782	59791	0 %	20 %	40 %	40 %	222084255
39	NC_011985	CTTTG	2	10	60407	60416	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011985	CAGGG	2	10	62522	62531	20 %	0 %	60 %	20 %	222084258
41	NC_011985	AGGCA	2	10	62787	62796	40 %	0 %	40 %	20 %	222084258
42	NC_011985	CGGCC	2	10	63803	63812	0 %	0 %	40 %	60 %	222084259
43	NC_011985	TCGCT	2	10	66286	66295	0 %	40 %	20 %	40 %	222084260
44	NC_011985	GGCCA	2	10	66384	66393	20 %	0 %	40 %	40 %	222084260
45	NC_011985	GTTTG	2	10	67081	67090	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011985	TCGTG	2	10	68158	68167	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011985	GGGCT	2	10	68303	68312	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011985	GAAGA	2	10	69321	69330	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011985	GCGAA	2	10	70422	70431	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011985	ATGGA	2	10	72404	72413	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011985	ACTGG	2	10	76244	76253	20 %	20 %	40 %	20 %	222084263
52	NC_011985	TCGAT	2	10	77296	77305	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011985	GGTGC	2	10	78331	78340	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011985	TCATC	2	10	78559	78568	20 %	40 %	0 %	40 %	222084265
55	NC_011985	GATCA	2	10	79795	79804	40 %	20 %	20 %	20 %	222084266
56	NC_011985	TCTGG	2	10	80682	80691	0 %	40 %	40 %	20 %	222084266
57	NC_011985	CGGTG	2	10	80939	80948	0 %	20 %	60 %	20 %	222084266
58	NC_011985	GCGGT	2	10	83397	83406	0 %	20 %	60 %	20 %	222084267
59	NC_011985	GCCTT	2	10	86166	86175	0 %	40 %	20 %	40 %	222084267
60	NC_011985	GCTCA	2	10	86625	86634	20 %	20 %	20 %	40 %	222084267
61	NC_011985	ACAGC	2	10	88059	88068	40 %	0 %	20 %	40 %	222084267
62	NC_011985	GCGAG	2	10	89202	89211	20 %	0 %	60 %	20 %	222084267
63	NC_011985	AATCA	2	10	90881	90890	60 %	20 %	0 %	20 %	222084267
64	NC_011985	GTTTG	2	10	96044	96053	0 %	60 %	40 %	0 %	222087939
65	NC_011985	AGACG	2	10	96256	96265	40 %	0 %	40 %	20 %	222087939
66	NC_011985	CTGTT	2	10	102760	102769	0 %	60 %	20 %	20 %	222084276
67	NC_011985	GATCG	2	10	104227	104236	20 %	20 %	40 %	20 %	222084277
68	NC_011985	CGGCC	2	10	104304	104313	0 %	0 %	40 %	60 %	222084277
69	NC_011985	TTGGC	2	10	104318	104327	0 %	40 %	40 %	20 %	222084277
70	NC_011985	TCGGC	2	10	106952	106961	0 %	20 %	40 %	40 %	222084279
71	NC_011985	ATCAT	2	10	108305	108314	40 %	40 %	0 %	20 %	222084280
72	NC_011985	ATCTC	2	10	108604	108613	20 %	40 %	0 %	40 %	222084281
73	NC_011985	TTTCG	2	10	110481	110490	0 %	60 %	20 %	20 %	222084282
74	NC_011985	TGCCG	2	10	111131	111140	0 %	20 %	40 %	40 %	222084283
75	NC_011985	CGGTC	2	10	116301	116310	0 %	20 %	40 %	40 %	222084287
76	NC_011985	GGCGC	2	10	117400	117409	0 %	0 %	60 %	40 %	222084289
77	NC_011985	CCCGG	2	10	117853	117862	0 %	0 %	40 %	60 %	222084289
78	NC_011985	GCCAT	2	10	119199	119208	20 %	20 %	20 %	40 %	222084290
79	NC_011985	GATCG	2	10	119794	119803	20 %	20 %	40 %	20 %	222084291
80	NC_011985	GCGAC	2	10	124898	124907	20 %	0 %	40 %	40 %	222084295
81	NC_011985	GGAGA	2	10	126752	126761	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011985	GCCGA	2	10	126953	126962	20 %	0 %	40 %	40 %	222084297
83	NC_011985	AGGTC	2	10	128646	128655	20 %	20 %	40 %	20 %	222084298
84	NC_011985	ATACG	2	10	129054	129063	40 %	20 %	20 %	20 %	222084299
85	NC_011985	CGGCC	2	10	129259	129268	0 %	0 %	40 %	60 %	222084299
86	NC_011985	CGACG	2	10	129409	129418	20 %	0 %	40 %	40 %	222084299
87	NC_011985	CGGCC	2	10	131847	131856	0 %	0 %	40 %	60 %	222084301
88	NC_011985	TGCGC	2	10	134270	134279	0 %	20 %	40 %	40 %	222084303
89	NC_011985	TTGCC	2	10	134548	134557	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_011985	CATGT	2	10	134650	134659	20 %	40 %	20 %	20 %	222084304
91	NC_011985	CGAAC	2	10	136503	136512	40 %	0 %	20 %	40 %	222084305
92	NC_011985	CGGCG	2	10	136667	136676	0 %	0 %	60 %	40 %	222084305
93	NC_011985	GCCAT	2	10	137447	137456	20 %	20 %	20 %	40 %	222084305
94	NC_011985	CGGCC	2	10	138439	138448	0 %	0 %	40 %	60 %	222084306
95	NC_011985	GCACG	2	10	138739	138748	20 %	0 %	40 %	40 %	222084306
96	NC_011985	CGGGT	2	10	139505	139514	0 %	20 %	60 %	20 %	222084307
97	NC_011985	GAGGC	2	10	140201	140210	20 %	0 %	60 %	20 %	222084307
98	NC_011985	GCATG	2	10	141161	141170	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011985	TCGGC	2	10	141226	141235	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_011985	TGTGA	2	10	145139	145148	20 %	40 %	40 %	0 %	222084313
101	NC_011985	GTCGG	2	10	145516	145525	0 %	20 %	60 %	20 %	222084314
102	NC_011985	TCCTG	2	10	145915	145924	0 %	40 %	20 %	40 %	222084315
103	NC_011985	GAAGT	2	10	146208	146217	40 %	20 %	40 %	0 %	222084315
104	NC_011985	GCGAG	2	10	150638	150647	20 %	0 %	60 %	20 %	222084320
105	NC_011985	AGCGT	2	10	152617	152626	20 %	20 %	40 %	20 %	222084321
106	NC_011985	GAACG	2	10	152983	152992	40 %	0 %	40 %	20 %	222084321
107	NC_011985	ATCGC	2	10	155117	155126	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_011985	GCGGT	2	10	157593	157602	0 %	20 %	60 %	20 %	222084326
109	NC_011985	CGGCG	2	10	158800	158809	0 %	0 %	60 %	40 %	222084326
110	NC_011985	CGTCC	2	10	159988	159997	0 %	20 %	20 %	60 %	222084327
111	NC_011985	TTTCG	2	10	160281	160290	0 %	60 %	20 %	20 %	222084328
112	NC_011985	TCCCG	2	10	161759	161768	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_011985	CTTGT	2	10	162641	162650	0 %	60 %	20 %	20 %	222084330
114	NC_011985	CGGGC	2	10	163408	163417	0 %	0 %	60 %	40 %	222084330
115	NC_011985	GCGAT	2	10	164823	164832	20 %	20 %	40 %	20 %	222084332
116	NC_011985	TGGCG	2	10	165587	165596	0 %	20 %	60 %	20 %	222084333
117	NC_011985	TGCCT	2	10	166751	166760	0 %	40 %	20 %	40 %	222084335
118	NC_011985	ATTGA	2	10	167395	167404	40 %	40 %	20 %	0 %	222084336
119	NC_011985	CCGGC	2	10	169194	169203	0 %	0 %	40 %	60 %	222084337
120	NC_011985	TGGAA	2	10	170422	170431	40 %	20 %	40 %	0 %	222084338
121	NC_011985	GCGCG	2	10	173093	173102	0 %	0 %	60 %	40 %	222084342
122	NC_011985	CCGGA	2	10	175148	175157	20 %	0 %	40 %	40 %	222084344
123	NC_011985	TCGCC	2	10	176620	176629	0 %	20 %	20 %	60 %	222084345
124	NC_011985	ACGAG	2	10	177430	177439	40 %	0 %	40 %	20 %	222084346
125	NC_011985	GCCGC	2	10	178848	178857	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_011985	TGCCG	2	10	179983	179992	0 %	20 %	40 %	40 %	222084349
127	NC_011985	CGGCG	2	10	180312	180321	0 %	0 %	60 %	40 %	222084349
128	NC_011985	TGACG	2	10	181181	181190	20 %	20 %	40 %	20 %	222084350
129	NC_011985	CGAGG	2	10	181403	181412	20 %	0 %	60 %	20 %	222084350
130	NC_011985	GCGCG	2	10	184849	184858	0 %	0 %	60 %	40 %	222084354
131	NC_011985	ATTGC	2	10	185302	185311	20 %	40 %	20 %	20 %	222084354
132	NC_011985	ACTTC	2	10	186756	186765	20 %	40 %	0 %	40 %	222084355
133	NC_011985	ATCAG	2	10	187639	187648	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_011985	TCACG	2	10	189272	189281	20 %	20 %	20 %	40 %	222084356
135	NC_011985	GATCG	2	10	189549	189558	20 %	20 %	40 %	20 %	222084356
136	NC_011985	TCCCG	2	10	189940	189949	0 %	20 %	20 %	60 %	222084356
137	NC_011985	TGCCG	2	10	191225	191234	0 %	20 %	40 %	40 %	222084358
138	NC_011985	ATTTT	2	10	193069	193078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011985	CAATT	2	10	194634	194643	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011985	GCGGG	2	10	195190	195199	0 %	0 %	80 %	20 %	222084361
141	NC_011985	TCGGG	2	10	195674	195683	0 %	20 %	60 %	20 %	222084361
142	NC_011985	CTGTC	2	10	196057	196066	0 %	40 %	20 %	40 %	222084362
143	NC_011985	GATCG	2	10	197085	197094	20 %	20 %	40 %	20 %	222084363
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146	NC_011985	TGCGC	2	10	199653	199662	0 %	20 %	40 %	40 %	222084365
147	NC_011985	GTTTG	2	10	200927	200936	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011985	TCGTG	2	10	202004	202013	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_011985	GGGCT	2	10	202149	202158	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
150	NC_011985	GAAGA	2	10	203167	203176	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011985	GCGAA	2	10	204268	204277	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_011985	ATGGA	2	10	206250	206259	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011985	TCCGC	2	10	207130	207139	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
154	NC_011985	CAAAT	2	10	207262	207271	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_011985	GGCAT	2	10	207601	207610	20 %	20 %	40 %	20 %	222084367
156	NC_011985	CGCAG	2	10	208129	208138	20 %	0 %	40 %	40 %	222084367
157	NC_011985	GATCA	2	10	208753	208762	40 %	20 %	20 %	20 %	222084367
158	NC_011985	CGGTC	2	10	210853	210862	0 %	20 %	40 %	40 %	222084369
159	NC_011985	GCCGA	2	10	211397	211406	20 %	0 %	40 %	40 %	222084369
160	NC_011985	GCCCG	2	10	212053	212062	0 %	0 %	40 %	60 %	222084370
161	NC_011985	GGCCG	2	10	213013	213022	0 %	0 %	60 %	40 %	222084371
162	NC_011985	GGGTG	2	10	213425	213434	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011985	TCGCC	2	10	215733	215742	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
164	NC_011985	GCTGG	2	10	216167	216176	0 %	20 %	60 %	20 %	222084373
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174	NC_011985	ACGGT	2	10	233506	233515	20 %	20 %	40 %	20 %	222084390
175	NC_011985	TCCTC	2	10	235434	235443	0 %	40 %	0 %	60 %	222084392
176	NC_011985	GCCAG	2	10	237222	237231	20 %	0 %	40 %	40 %	222084393
177	NC_011985	ATGCG	2	10	237843	237852	20 %	20 %	40 %	20 %	222084394
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180	NC_011985	TGGAT	2	10	240055	240064	20 %	40 %	40 %	0 %	222084395
181	NC_011985	ATTTA	2	10	240276	240285	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011985	TCGTG	2	10	242361	242370	0 %	40 %	40 %	20 %	222084396
183	NC_011985	CGAGC	2	10	242634	242643	20 %	0 %	40 %	40 %	222084396
184	NC_011985	AGCCG	2	10	243015	243024	20 %	0 %	40 %	40 %	222084397
185	NC_011985	CCTGC	2	10	243869	243878	0 %	20 %	20 %	60 %	222084398
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191	NC_011985	GCGTG	2	10	248829	248838	0 %	20 %	60 %	20 %	222084401
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193	NC_011985	TCGTC	2	10	252700	252709	0 %	40 %	20 %	40 %	222084405
194	NC_011985	GTCGG	2	10	253299	253308	0 %	20 %	60 %	20 %	222084405
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197	NC_011985	GGCCG	2	10	260076	260085	0 %	0 %	60 %	40 %	222084414
198	NC_011985	GCGTA	2	10	260620	260629	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
199	NC_011985	CATCG	2	10	262143	262152	20 %	20 %	20 %	40 %	222084416
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202	NC_011985	AGGCT	2	10	264513	264522	20 %	20 %	40 %	20 %	222084418
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204	NC_011985	CCACC	2	10	266593	266602	20 %	0 %	0 %	80 %	222084420
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214	NC_011985	GAATT	2	10	281423	281432	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
215	NC_011985	GCGCC	2	10	282453	282462	0 %	0 %	40 %	60 %	222084433
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232	NC_011985	CGGGG	2	10	303999	304008	0 %	0 %	80 %	20 %	222084457
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234	NC_011985	GGTCG	2	10	307192	307201	0 %	20 %	60 %	20 %	222084461
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236	NC_011985	GGCGG	2	10	311444	311453	0 %	0 %	80 %	20 %	222084467
237	NC_011985	TATTG	2	10	311680	311689	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
238	NC_011985	TGGCC	2	10	312006	312015	0 %	20 %	40 %	40 %	222084468
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252	NC_011985	CCGCG	2	10	325854	325863	0 %	0 %	40 %	60 %	222084481
253	NC_011985	GCCGA	2	10	331199	331208	20 %	0 %	40 %	40 %	222084486
254	NC_011985	AGCGA	2	10	331952	331961	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
255	NC_011985	CCGGC	3	15	335147	335161	0 %	0 %	40 %	60 %	222084488
256	NC_011985	GAGGC	2	10	335391	335400	20 %	0 %	60 %	20 %	222084488
257	NC_011985	TTCAA	2	10	335675	335684	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
258	NC_011985	CCGGC	2	10	336175	336184	0 %	0 %	40 %	60 %	222084489
259	NC_011985	TGTCC	2	10	336358	336367	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
260	NC_011985	TCTCT	2	10	337357	337366	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
261	NC_011985	AAATC	2	10	337409	337418	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
262	NC_011985	GCCAT	2	10	339583	339592	20 %	20 %	20 %	40 %	222084492
263	NC_011985	AGGGC	2	10	340201	340210	20 %	0 %	60 %	20 %	222084493
264	NC_011985	TGTCG	2	10	340864	340873	0 %	40 %	40 %	20 %	222084493
265	NC_011985	AAGGC	2	10	340950	340959	40 %	0 %	40 %	20 %	222084493
266	NC_011985	AGCCG	2	10	341644	341653	20 %	0 %	40 %	40 %	222084493
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282	NC_011985	GTGCT	2	10	361355	361364	0 %	40 %	40 %	20 %	222084512
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381	NC_011985	AGGGG	2	10	496423	496432	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
382	NC_011985	CGCGT	2	10	497954	497963	0 %	20 %	40 %	40 %	222084650
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384	NC_011985	GGCCA	2	10	502999	503008	20 %	0 %	40 %	40 %	222084655
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386	NC_011985	TCCTG	2	10	503413	503422	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
387	NC_011985	CCGGC	2	10	506216	506225	0 %	0 %	40 %	60 %	222084659
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401	NC_011985	CCGAT	2	10	520485	520494	20 %	20 %	20 %	40 %	222084676
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403	NC_011985	CCGGC	2	10	521483	521492	0 %	0 %	40 %	60 %	222084676
404	NC_011985	GCATG	2	10	523421	523430	20 %	20 %	40 %	20 %	222084677
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439	NC_011985	AGGGC	2	10	571924	571933	20 %	0 %	60 %	20 %	222084721
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