MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011982	TAAA	2	8	201119	201126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011982	GGTT	2	8	201157	201164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011982	TTTA	2	8	201327	201334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011982	TTCC	2	8	201807	201814	0 %	50 %	0 %	50 %	222080274
505	NC_011982	GATA	2	8	202738	202745	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011982	CGTA	2	8	202754	202761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
507	NC_011982	CTGG	2	8	203313	203320	0 %	25 %	50 %	25 %	222080275
508	NC_011982	ACCA	2	8	203353	203360	50 %	0 %	0 %	50 %	222080275
509	NC_011982	AGAC	2	8	204111	204118	50 %	0 %	25 %	25 %	222080276
510	NC_011982	CCCG	2	8	204919	204926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
511	NC_011982	GCCG	2	8	205432	205439	0 %	0 %	50 %	50 %	222080277
512	NC_011982	CCGG	2	8	206012	206019	0 %	0 %	50 %	50 %	222080277
513	NC_011982	TCCA	2	8	206514	206521	25 %	25 %	0 %	50 %	222080278
514	NC_011982	TCCA	2	8	206564	206571	25 %	25 %	0 %	50 %	222080278
515	NC_011982	GTCA	2	8	206771	206778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_011982	ATCA	2	8	206788	206795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_011982	GCAA	2	8	206825	206832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
518	NC_011982	TTGA	2	8	207017	207024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011982	TTAT	2	8	207284	207291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011982	CGAG	2	8	208286	208293	25 %	0 %	50 %	25 %	222080280
521	NC_011982	GCCA	2	8	208873	208880	25 %	0 %	25 %	50 %	222080280
522	NC_011982	GTGC	2	8	208909	208916	0 %	25 %	50 %	25 %	222080280
523	NC_011982	TGCT	2	8	209549	209556	0 %	50 %	25 %	25 %	222080280
524	NC_011982	CAAG	2	8	209860	209867	50 %	0 %	25 %	25 %	222080281
525	NC_011982	TTTC	2	8	210795	210802	0 %	75 %	0 %	25 %	222080282
526	NC_011982	GCAA	2	8	211103	211110	50 %	0 %	25 %	25 %	222080282
527	NC_011982	CGAC	2	8	211446	211453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
528	NC_011982	CGGG	2	8	211985	211992	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
529	NC_011982	CATG	2	8	212226	212233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
530	NC_011982	CGAC	2	8	212252	212259	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
531	NC_011982	CTTC	2	8	212271	212278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_011982	GTCC	2	8	212359	212366	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
533	NC_011982	TTGT	2	8	213352	213359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011982	ATTA	2	8	213406	213413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011982	GATG	2	8	213462	213469	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011982	TTAG	2	8	213486	213493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011982	ATAA	2	8	213560	213567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011982	CGAA	2	8	213802	213809	50 %	0 %	25 %	25 %	222080283
539	NC_011982	TGGT	2	8	214204	214211	0 %	50 %	50 %	0 %	222080283
540	NC_011982	TGAA	2	8	214692	214699	50 %	25 %	25 %	0 %	222080283
541	NC_011982	CAGT	2	8	214879	214886	25 %	25 %	25 %	25 %	222080283
542	NC_011982	TTGC	2	8	215474	215481	0 %	50 %	25 %	25 %	222080284
543	NC_011982	GAGG	2	8	215913	215920	25 %	0 %	75 %	0 %	222080284
544	NC_011982	GCTT	2	8	216159	216166	0 %	50 %	25 %	25 %	222080284
545	NC_011982	CACC	2	8	216501	216508	25 %	0 %	0 %	75 %	222080284
546	NC_011982	GCTA	2	8	216782	216789	25 %	25 %	25 %	25 %	222080284
547	NC_011982	ATGC	2	8	216801	216808	25 %	25 %	25 %	25 %	222080284
548	NC_011982	TGTT	2	8	216946	216953	0 %	75 %	25 %	0 %	222080284
549	NC_011982	TTTC	2	8	217316	217323	0 %	75 %	0 %	25 %	222080284
550	NC_011982	ATGG	2	8	217664	217671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011982	TTGC	2	8	218068	218075	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_011982	CGAG	2	8	218204	218211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
553	NC_011982	GCCT	2	8	218246	218253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
554	NC_011982	GTCG	2	8	218411	218418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_011982	GGCT	2	8	218575	218582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
556	NC_011982	AAAC	2	8	220326	220333	75 %	0 %	0 %	25 %	222080286
557	NC_011982	ATCA	2	8	222039	222046	50 %	25 %	0 %	25 %	222080287
558	NC_011982	TCTG	2	8	222096	222103	0 %	50 %	25 %	25 %	222080287
559	NC_011982	GATG	2	8	222188	222195	25 %	25 %	50 %	0 %	222080287
560	NC_011982	ATGT	2	8	222521	222528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011982	ATTT	2	8	222661	222668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011982	GGCC	2	8	222957	222964	0 %	0 %	50 %	50 %	222080288
563	NC_011982	GCCG	2	8	224597	224604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_011982	AGTT	2	8	224791	224798	25 %	50 %	25 %	0 %	222080290
565	NC_011982	CCAT	2	8	225197	225204	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_011982	ATCA	2	8	225549	225556	50 %	25 %	0 %	25 %	222080291
567	NC_011982	GTCG	2	8	225685	225692	0 %	25 %	50 %	25 %	222080291
568	NC_011982	TCAG	2	8	225934	225941	25 %	25 %	25 %	25 %	222080291
569	NC_011982	TCCC	2	8	226005	226012	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
570	NC_011982	AAAT	2	8	226033	226040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011982	CTTT	2	8	226142	226149	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
572	NC_011982	GGCT	2	8	226509	226516	0 %	25 %	50 %	25 %	222080292
573	NC_011982	ACCG	2	8	226747	226754	25 %	0 %	25 %	50 %	222080292
574	NC_011982	CCGG	2	8	227519	227526	0 %	0 %	50 %	50 %	222080292
575	NC_011982	ATCG	2	8	227667	227674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
576	NC_011982	CTTC	2	8	228171	228178	0 %	50 %	0 %	50 %	222080293
577	NC_011982	TTCG	2	8	228202	228209	0 %	50 %	25 %	25 %	222080293
578	NC_011982	GACG	2	8	228213	228220	25 %	0 %	50 %	25 %	222080293
579	NC_011982	TGAA	2	8	229201	229208	50 %	25 %	25 %	0 %	222080294
580	NC_011982	ATCC	2	8	229320	229327	25 %	25 %	0 %	50 %	222080294
581	NC_011982	GTTG	2	8	229665	229672	0 %	50 %	50 %	0 %	222080294
582	NC_011982	CGAG	2	8	230122	230129	25 %	0 %	50 %	25 %	222080295
583	NC_011982	CATT	2	8	230532	230539	25 %	50 %	0 %	25 %	222080295
584	NC_011982	CGGA	2	8	230870	230877	25 %	0 %	50 %	25 %	222080296
585	NC_011982	CTTC	2	8	232010	232017	0 %	50 %	0 %	50 %	222080297
586	NC_011982	CGGC	2	8	232094	232101	0 %	0 %	50 %	50 %	222080297
587	NC_011982	AACG	2	8	233531	233538	50 %	0 %	25 %	25 %	222080298
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589	NC_011982	GACA	2	8	233868	233875	50 %	0 %	25 %	25 %	222080298
590	NC_011982	CATC	2	8	234027	234034	25 %	25 %	0 %	50 %	222080299
591	NC_011982	GACT	2	8	234610	234617	25 %	25 %	25 %	25 %	222080299
592	NC_011982	CCGA	2	8	234874	234881	25 %	0 %	25 %	50 %	222080299
593	NC_011982	GGAC	2	8	235209	235216	25 %	0 %	50 %	25 %	222080299
594	NC_011982	AAAG	2	8	235247	235254	75 %	0 %	25 %	0 %	222080299
595	NC_011982	AGCA	2	8	235320	235327	50 %	0 %	25 %	25 %	222080299
596	NC_011982	CGAA	2	8	235746	235753	50 %	0 %	25 %	25 %	222080299
597	NC_011982	AGCA	2	8	236340	236347	50 %	0 %	25 %	25 %	222080300
598	NC_011982	GAGC	2	8	236348	236355	25 %	0 %	50 %	25 %	222080300
599	NC_011982	ACAG	2	8	236801	236808	50 %	0 %	25 %	25 %	222080301
600	NC_011982	AGGA	2	8	237125	237132	50 %	0 %	50 %	0 %	222080301
601	NC_011982	AACC	2	8	237192	237199	50 %	0 %	0 %	50 %	222080301
602	NC_011982	CGAT	2	8	237288	237295	25 %	25 %	25 %	25 %	222080301
603	NC_011982	TGGC	2	8	237408	237415	0 %	25 %	50 %	25 %	222080301
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605	NC_011982	GGCC	2	8	237801	237808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_011982	ATGC	2	8	238293	238300	25 %	25 %	25 %	25 %	222080302
607	NC_011982	AACG	2	8	238539	238546	50 %	0 %	25 %	25 %	222080302
608	NC_011982	GGTT	2	8	239234	239241	0 %	50 %	50 %	0 %	222080302
609	NC_011982	ATCC	2	8	239388	239395	25 %	25 %	0 %	50 %	222080302
610	NC_011982	AGGG	2	8	239733	239740	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011982	CTAT	2	8	239836	239843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_011982	GGCA	2	8	240568	240575	25 %	0 %	50 %	25 %	222080304
613	NC_011982	CTGG	2	8	240731	240738	0 %	25 %	50 %	25 %	222080304
614	NC_011982	TATC	2	8	240751	240758	25 %	50 %	0 %	25 %	222080304
615	NC_011982	CCGA	2	8	241006	241013	25 %	0 %	25 %	50 %	222080304
616	NC_011982	GCCG	2	8	241928	241935	0 %	0 %	50 %	50 %	222080305
617	NC_011982	TTTC	2	8	242127	242134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NC_011982	GAGC	2	8	242852	242859	25 %	0 %	50 %	25 %	222080306
619	NC_011982	TCGA	2	8	243215	243222	25 %	25 %	25 %	25 %	222080306
620	NC_011982	GTGC	2	8	243559	243566	0 %	25 %	50 %	25 %	222080306
621	NC_011982	CAGG	2	8	245145	245152	25 %	0 %	50 %	25 %	222080307
622	NC_011982	GCAC	2	8	245167	245174	25 %	0 %	25 %	50 %	222080307
623	NC_011982	GACA	2	8	245181	245188	50 %	0 %	25 %	25 %	222080307
624	NC_011982	CGTG	2	8	245211	245218	0 %	25 %	50 %	25 %	222080307
625	NC_011982	AGGA	2	8	245340	245347	50 %	0 %	50 %	0 %	222080307
626	NC_011982	GCCT	2	8	245470	245477	0 %	25 %	25 %	50 %	222080307
627	NC_011982	CATC	2	8	245568	245575	25 %	25 %	0 %	50 %	222080307
628	NC_011982	TGGA	2	8	245941	245948	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011982	GGGT	2	8	246187	246194	0 %	25 %	75 %	0 %	222080308
630	NC_011982	CTTC	2	8	246356	246363	0 %	50 %	0 %	50 %	222080308
631	NC_011982	CGTT	2	8	246509	246516	0 %	50 %	25 %	25 %	222080308
632	NC_011982	GCGA	2	8	246676	246683	25 %	0 %	50 %	25 %	222080308
633	NC_011982	TCAG	2	8	247270	247277	25 %	25 %	25 %	25 %	222080309
634	NC_011982	GCCG	2	8	247355	247362	0 %	0 %	50 %	50 %	222080309
635	NC_011982	GGCG	2	8	247422	247429	0 %	0 %	75 %	25 %	222080309
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663	NC_011982	TAGG	2	8	258346	258353	25 %	25 %	50 %	0 %	222080321
664	NC_011982	AATT	2	8	258682	258689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
665	NC_011982	CAGC	2	8	258794	258801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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