MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 1010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011981	CT	3	6	617	622	0 %	50 %	0 %	50 %	222102413
2	NC_011981	AT	3	6	681	686	50 %	50 %	0 %	0 %	222102413
3	NC_011981	TC	3	6	2122	2127	0 %	50 %	0 %	50 %	222102414
4	NC_011981	TC	3	6	2367	2372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011981	CG	3	6	2841	2846	0 %	0 %	50 %	50 %	222102415
6	NC_011981	CG	3	6	2904	2909	0 %	0 %	50 %	50 %	222102415
7	NC_011981	GC	3	6	3038	3043	0 %	0 %	50 %	50 %	222102415
8	NC_011981	TC	4	8	3077	3084	0 %	50 %	0 %	50 %	222102415
9	NC_011981	AG	3	6	3155	3160	50 %	0 %	50 %	0 %	222102415
10	NC_011981	GC	3	6	4100	4105	0 %	0 %	50 %	50 %	222102416
11	NC_011981	CT	3	6	4140	4145	0 %	50 %	0 %	50 %	222102416
12	NC_011981	GT	3	6	5282	5287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011981	AG	3	6	5588	5593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011981	GC	3	6	5647	5652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011981	GC	3	6	8094	8099	0 %	0 %	50 %	50 %	222102418
16	NC_011981	GA	3	6	8974	8979	50 %	0 %	50 %	0 %	222102418
17	NC_011981	AT	3	6	9209	9214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011981	CG	3	6	9906	9911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011981	GC	3	6	10170	10175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011981	AG	3	6	11098	11103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011981	TC	3	6	11975	11980	0 %	50 %	0 %	50 %	222102420
22	NC_011981	GA	3	6	12058	12063	50 %	0 %	50 %	0 %	222102420
23	NC_011981	CG	4	8	12382	12389	0 %	0 %	50 %	50 %	222102420
24	NC_011981	GC	3	6	12595	12600	0 %	0 %	50 %	50 %	222102420
25	NC_011981	GC	3	6	12651	12656	0 %	0 %	50 %	50 %	222102420
26	NC_011981	GC	3	6	12829	12834	0 %	0 %	50 %	50 %	222102420
27	NC_011981	CT	3	6	13195	13200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011981	TC	3	6	14089	14094	0 %	50 %	0 %	50 %	222102421
29	NC_011981	CG	3	6	15281	15286	0 %	0 %	50 %	50 %	222102422
30	NC_011981	CT	3	6	17224	17229	0 %	50 %	0 %	50 %	222102423
31	NC_011981	TC	3	6	19277	19282	0 %	50 %	0 %	50 %	222102424
32	NC_011981	CG	3	6	19297	19302	0 %	0 %	50 %	50 %	222102424
33	NC_011981	GC	3	6	19708	19713	0 %	0 %	50 %	50 %	222102425
34	NC_011981	GC	3	6	20211	20216	0 %	0 %	50 %	50 %	222102425
35	NC_011981	GC	3	6	20284	20289	0 %	0 %	50 %	50 %	222102425
36	NC_011981	GC	3	6	20701	20706	0 %	0 %	50 %	50 %	222102426
37	NC_011981	GC	3	6	21988	21993	0 %	0 %	50 %	50 %	222102427
38	NC_011981	CG	3	6	22152	22157	0 %	0 %	50 %	50 %	222102427
39	NC_011981	AG	3	6	22256	22261	50 %	0 %	50 %	0 %	222102427
40	NC_011981	GC	3	6	22549	22554	0 %	0 %	50 %	50 %	222102427
41	NC_011981	CG	3	6	22894	22899	0 %	0 %	50 %	50 %	222102428
42	NC_011981	CG	3	6	23374	23379	0 %	0 %	50 %	50 %	222102428
43	NC_011981	CT	3	6	23561	23566	0 %	50 %	0 %	50 %	222102428
44	NC_011981	GC	3	6	24268	24273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011981	GA	3	6	24417	24422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011981	AC	3	6	24818	24823	50 %	0 %	0 %	50 %	222102429
47	NC_011981	AG	3	6	24918	24923	50 %	0 %	50 %	0 %	222102429
48	NC_011981	GC	3	6	25899	25904	0 %	0 %	50 %	50 %	222102430
49	NC_011981	GC	4	8	26396	26403	0 %	0 %	50 %	50 %	222102430
50	NC_011981	GC	3	6	26486	26491	0 %	0 %	50 %	50 %	222102430
51	NC_011981	AG	3	6	26633	26638	50 %	0 %	50 %	0 %	222102430
52	NC_011981	CT	3	6	26863	26868	0 %	50 %	0 %	50 %	222102431
53	NC_011981	AT	3	6	26989	26994	50 %	50 %	0 %	0 %	222102431
54	NC_011981	AT	3	6	30233	30238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011981	GC	3	6	30659	30664	0 %	0 %	50 %	50 %	222102434
56	NC_011981	AC	3	6	31536	31541	50 %	0 %	0 %	50 %	222102435
57	NC_011981	CG	3	6	31764	31769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011981	GC	3	6	32201	32206	0 %	0 %	50 %	50 %	222102436
59	NC_011981	TC	3	6	32239	32244	0 %	50 %	0 %	50 %	222102436
60	NC_011981	AT	3	6	32546	32551	50 %	50 %	0 %	0 %	222102436
61	NC_011981	CG	3	6	32601	32606	0 %	0 %	50 %	50 %	222102436
62	NC_011981	TC	3	6	32839	32844	0 %	50 %	0 %	50 %	222102436
63	NC_011981	AC	4	8	33496	33503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011981	GC	3	6	34236	34241	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
65	NC_011981	CG	3	6	34664	34669	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
66	NC_011981	CG	3	6	34856	34861	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
67	NC_011981	GC	3	6	35046	35051	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
68	NC_011981	CG	3	6	35108	35113	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
69	NC_011981	CG	3	6	35256	35261	0 %	0 %	50 %	50 %	222102437
70	NC_011981	CT	3	6	35800	35805	0 %	50 %	0 %	50 %	222102438
71	NC_011981	GC	3	6	36692	36697	0 %	0 %	50 %	50 %	222102439
72	NC_011981	GC	3	6	36975	36980	0 %	0 %	50 %	50 %	222102439
73	NC_011981	CG	3	6	37222	37227	0 %	0 %	50 %	50 %	222102439
74	NC_011981	GA	3	6	40573	40578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011981	GC	3	6	42544	42549	0 %	0 %	50 %	50 %	222102446
76	NC_011981	GC	3	6	42729	42734	0 %	0 %	50 %	50 %	222102446
77	NC_011981	GC	3	6	42852	42857	0 %	0 %	50 %	50 %	222102446
78	NC_011981	CG	3	6	43328	43333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011981	CG	3	6	43576	43581	0 %	0 %	50 %	50 %	222102448
80	NC_011981	GC	4	8	43599	43606	0 %	0 %	50 %	50 %	222102448
81	NC_011981	GA	3	6	45246	45251	50 %	0 %	50 %	0 %	222102451
82	NC_011981	TC	3	6	45454	45459	0 %	50 %	0 %	50 %	222102451
83	NC_011981	GA	3	6	46303	46308	50 %	0 %	50 %	0 %	222102452
84	NC_011981	TC	3	6	46511	46516	0 %	50 %	0 %	50 %	222102452
85	NC_011981	GT	3	6	47560	47565	0 %	50 %	50 %	0 %	222102453
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87	NC_011981	GC	3	6	48387	48392	0 %	0 %	50 %	50 %	222102453
88	NC_011981	GC	3	6	48674	48679	0 %	0 %	50 %	50 %	222102454
89	NC_011981	GC	3	6	49349	49354	0 %	0 %	50 %	50 %	222102454
90	NC_011981	AG	3	6	49502	49507	50 %	0 %	50 %	0 %	222102454
91	NC_011981	AG	3	6	50133	50138	50 %	0 %	50 %	0 %	222102455
92	NC_011981	TC	3	6	50728	50733	0 %	50 %	0 %	50 %	222102455
93	NC_011981	GT	3	6	51538	51543	0 %	50 %	50 %	0 %	222102455
94	NC_011981	GC	3	6	52217	52222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011981	GC	3	6	52284	52289	0 %	0 %	50 %	50 %	222102456
96	NC_011981	CG	3	6	52724	52729	0 %	0 %	50 %	50 %	222102457
97	NC_011981	AT	3	6	52990	52995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011981	TC	3	6	53422	53427	0 %	50 %	0 %	50 %	222102458
99	NC_011981	GA	3	6	54228	54233	50 %	0 %	50 %	0 %	222102458
100	NC_011981	GC	3	6	54362	54367	0 %	0 %	50 %	50 %	222102458
101	NC_011981	CG	3	6	55472	55477	0 %	0 %	50 %	50 %	222102459
102	NC_011981	GC	3	6	55488	55493	0 %	0 %	50 %	50 %	222102459
103	NC_011981	GC	3	6	56182	56187	0 %	0 %	50 %	50 %	222102461
104	NC_011981	AC	3	6	56198	56203	50 %	0 %	0 %	50 %	222102461
105	NC_011981	CG	3	6	56355	56360	0 %	0 %	50 %	50 %	222102461
106	NC_011981	GC	3	6	57007	57012	0 %	0 %	50 %	50 %	222102461
107	NC_011981	CG	3	6	59178	59183	0 %	0 %	50 %	50 %	222102461
108	NC_011981	AC	3	6	59207	59212	50 %	0 %	0 %	50 %	222102461
109	NC_011981	TG	3	6	59611	59616	0 %	50 %	50 %	0 %	222102462
110	NC_011981	CG	3	6	60534	60539	0 %	0 %	50 %	50 %	222102463
111	NC_011981	AG	3	6	61578	61583	50 %	0 %	50 %	0 %	222102464
112	NC_011981	CG	3	6	61904	61909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011981	AT	3	6	62223	62228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011981	AT	3	6	62572	62577	50 %	50 %	0 %	0 %	222102465
115	NC_011981	CT	3	6	63371	63376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011981	TG	3	6	63779	63784	0 %	50 %	50 %	0 %	222102466
117	NC_011981	TC	3	6	64327	64332	0 %	50 %	0 %	50 %	222102466
118	NC_011981	GC	3	6	64841	64846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011981	GC	3	6	65538	65543	0 %	0 %	50 %	50 %	222102468
120	NC_011981	TG	3	6	65753	65758	0 %	50 %	50 %	0 %	222102468
121	NC_011981	CG	3	6	66107	66112	0 %	0 %	50 %	50 %	222102468
122	NC_011981	GC	3	6	66374	66379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011981	AG	3	6	66715	66720	50 %	0 %	50 %	0 %	222102469
124	NC_011981	GC	3	6	66772	66777	0 %	0 %	50 %	50 %	222102469
125	NC_011981	CA	3	6	67415	67420	50 %	0 %	0 %	50 %	222102469
126	NC_011981	TC	3	6	68844	68849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011981	AT	3	6	69143	69148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011981	GA	3	6	69267	69272	50 %	0 %	50 %	0 %	222102471
129	NC_011981	GC	3	6	69726	69731	0 %	0 %	50 %	50 %	222102471
130	NC_011981	GC	3	6	69989	69994	0 %	0 %	50 %	50 %	222102472
131	NC_011981	GC	3	6	70019	70024	0 %	0 %	50 %	50 %	222102472
132	NC_011981	CG	3	6	70214	70219	0 %	0 %	50 %	50 %	222102472
133	NC_011981	CG	3	6	70358	70363	0 %	0 %	50 %	50 %	222102472
134	NC_011981	GC	3	6	70621	70626	0 %	0 %	50 %	50 %	222102472
135	NC_011981	GT	3	6	70773	70778	0 %	50 %	50 %	0 %	222102472
136	NC_011981	CG	3	6	71236	71241	0 %	0 %	50 %	50 %	222102473
137	NC_011981	CA	3	6	71458	71463	50 %	0 %	0 %	50 %	222102473
138	NC_011981	CG	3	6	71576	71581	0 %	0 %	50 %	50 %	222102473
139	NC_011981	CG	3	6	71749	71754	0 %	0 %	50 %	50 %	222102473
140	NC_011981	GC	3	6	73205	73210	0 %	0 %	50 %	50 %	222102475
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144	NC_011981	GC	3	6	76303	76308	0 %	0 %	50 %	50 %	222102478
145	NC_011981	AG	3	6	77331	77336	50 %	0 %	50 %	0 %	222102479
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