MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 12100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011981	CCA	2	6	75975	75980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102477
1502	NC_011981	ATT	2	6	76034	76039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102477
1503	NC_011981	CGAAA	2	10	76125	76134	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1504	NC_011981	GC	3	6	76303	76308	0 %	0 %	50 %	50 %	222102478
1505	NC_011981	TGA	2	6	76517	76522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102478
1506	NC_011981	CGGT	2	8	76523	76530	0 %	25 %	50 %	25 %	222102478
1507	NC_011981	CGC	2	6	76578	76583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102478
1508	NC_011981	AATC	2	8	76613	76620	50 %	25 %	0 %	25 %	222102478
1509	NC_011981	CGT	2	6	76748	76753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102478
1510	NC_011981	GCG	2	6	76798	76803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102478
1511	NC_011981	GTT	2	6	76847	76852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102479
1512	NC_011981	TTG	2	6	76997	77002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102479
1513	NC_011981	ATG	2	6	77066	77071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102479
1514	NC_011981	CTT	2	6	77142	77147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102479
1515	NC_011981	GAA	2	6	77185	77190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102479
1516	NC_011981	AG	3	6	77331	77336	50 %	0 %	50 %	0 %	222102479
1517	NC_011981	CAGT	2	8	77433	77440	25 %	25 %	25 %	25 %	222102479
1518	NC_011981	GAT	2	6	77481	77486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102479
1519	NC_011981	CCG	2	6	77496	77501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102479
1520	NC_011981	CGG	2	6	77505	77510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102479
1521	NC_011981	TCGC	2	8	77542	77549	0 %	25 %	25 %	50 %	222102479
1522	NC_011981	T	6	6	77598	77603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011981	TCGC	2	8	77608	77615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_011981	CTA	2	6	77624	77629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_011981	CG	3	6	77630	77635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_011981	CA	3	6	77638	77643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_011981	AC	3	6	77644	77649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_011981	TTTG	2	8	77704	77711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011981	ATA	2	6	77738	77743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011981	A	6	6	77750	77755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011981	TGTC	2	8	77931	77938	0 %	50 %	25 %	25 %	222102480
1532	NC_011981	TGG	2	6	77998	78003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102480
1533	NC_011981	CGG	2	6	78020	78025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102480
1534	NC_011981	TCAG	2	8	78062	78069	25 %	25 %	25 %	25 %	222102480
1535	NC_011981	CTTGTG	2	12	78126	78137	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222102480
1536	NC_011981	GATGGT	2	12	78141	78152	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	222102480
1537	NC_011981	CCA	2	6	78202	78207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102480
1538	NC_011981	CTT	2	6	78278	78283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102480
1539	NC_011981	CATC	2	8	78295	78302	25 %	25 %	0 %	50 %	222102480
1540	NC_011981	ATCT	2	8	78360	78367	25 %	50 %	0 %	25 %	222102480
1541	NC_011981	GCCC	2	8	78413	78420	0 %	0 %	25 %	75 %	222102480
1542	NC_011981	GCC	2	6	78450	78455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102480
1543	NC_011981	AAC	2	6	78473	78478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102480
1544	NC_011981	TGC	2	6	78614	78619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102480
1545	NC_011981	TCT	2	6	78685	78690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102480
1546	NC_011981	CAAT	2	8	78749	78756	50 %	25 %	0 %	25 %	222102480
1547	NC_011981	GGC	2	6	78965	78970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102480
1548	NC_011981	GTC	2	6	79089	79094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102481
1549	NC_011981	ATTTG	2	10	79176	79185	20 %	60 %	20 %	0 %	222102481
1550	NC_011981	CTG	2	6	79240	79245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102481
1551	NC_011981	CTG	2	6	79384	79389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102481
1552	NC_011981	GCG	2	6	79411	79416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102481
1553	NC_011981	GCGCG	2	10	79498	79507	0 %	0 %	60 %	40 %	222102481
1554	NC_011981	CG	3	6	79574	79579	0 %	0 %	50 %	50 %	222102481
1555	NC_011981	TGT	2	6	79580	79585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102481
1556	NC_011981	GATG	2	8	79731	79738	25 %	25 %	50 %	0 %	222102481
1557	NC_011981	GCT	2	6	79749	79754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102481
1558	NC_011981	CAC	2	6	79824	79829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102481
1559	NC_011981	TTG	2	6	79977	79982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102482
1560	NC_011981	CAC	2	6	80044	80049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102482
1561	NC_011981	GCC	2	6	80079	80084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102482
1562	NC_011981	TGT	2	6	80085	80090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102482
1563	NC_011981	CT	3	6	80095	80100	0 %	50 %	0 %	50 %	222102482
1564	NC_011981	GCC	2	6	80136	80141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102482
1565	NC_011981	CGG	2	6	80198	80203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102482
1566	NC_011981	CAG	2	6	80234	80239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102482
1567	NC_011981	TGG	2	6	80241	80246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102482
1568	NC_011981	TTG	2	6	80375	80380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102482
1569	NC_011981	GC	3	6	80399	80404	0 %	0 %	50 %	50 %	222102482
1570	NC_011981	GT	3	6	80405	80410	0 %	50 %	50 %	0 %	222102482
1571	NC_011981	GGT	2	6	80425	80430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102482
1572	NC_011981	GA	3	6	80494	80499	50 %	0 %	50 %	0 %	222102482
1573	NC_011981	GGT	2	6	80569	80574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102483
1574	NC_011981	GCCTT	2	10	80597	80606	0 %	40 %	20 %	40 %	222102483
1575	NC_011981	GGT	2	6	80625	80630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102483
1576	NC_011981	TGG	2	6	80661	80666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102483
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1578	NC_011981	TGG	2	6	80750	80755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102483
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1580	NC_011981	TTG	2	6	80774	80779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102483
1581	NC_011981	CG	3	6	80798	80803	0 %	0 %	50 %	50 %	222102483
1582	NC_011981	TTG	2	6	80843	80848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102483
1583	NC_011981	TGA	2	6	80960	80965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102483
1584	NC_011981	GGC	2	6	80982	80987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102483
1585	NC_011981	CG	3	6	81031	81036	0 %	0 %	50 %	50 %	222102483
1586	NC_011981	GC	3	6	81039	81044	0 %	0 %	50 %	50 %	222102483
1587	NC_011981	ATCGG	2	10	81048	81057	20 %	20 %	40 %	20 %	222102483
1588	NC_011981	GCC	2	6	81121	81126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102483
1589	NC_011981	GGT	3	9	81216	81224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102483
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1591	NC_011981	GTT	2	6	81289	81294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102483
1592	NC_011981	TCGGT	2	10	81427	81436	0 %	40 %	40 %	20 %	222102484
1593	NC_011981	T	6	6	81440	81445	0 %	100 %	0 %	0 %	222102484
1594	NC_011981	AT	3	6	81455	81460	50 %	50 %	0 %	0 %	222102484
1595	NC_011981	CT	3	6	81483	81488	0 %	50 %	0 %	50 %	222102484
1596	NC_011981	CCT	2	6	81527	81532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102484
1597	NC_011981	GGC	2	6	81543	81548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102484
1598	NC_011981	TCA	2	6	81563	81568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102484
1599	NC_011981	GCC	2	6	81651	81656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102484
1600	NC_011981	CTG	2	6	81690	81695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102484
1601	NC_011981	G	6	6	81794	81799	0 %	0 %	100 %	0 %	222102484
1602	NC_011981	CGG	3	9	82018	82026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102484
1603	NC_011981	GGGC	2	8	82036	82043	0 %	0 %	75 %	25 %	222102484
1604	NC_011981	TAC	2	6	82050	82055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102484
1605	NC_011981	ATG	2	6	82113	82118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102484
1606	NC_011981	CGG	2	6	82133	82138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102484
1607	NC_011981	GCA	2	6	82222	82227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102484
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1609	NC_011981	CT	4	8	82304	82311	0 %	50 %	0 %	50 %	222102484
1610	NC_011981	CTTGCC	2	12	82391	82402	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222102485
1611	NC_011981	GCA	2	6	82519	82524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102485
1612	NC_011981	GTG	2	6	82604	82609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102485
1613	NC_011981	CGG	2	6	82623	82628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102485
1614	NC_011981	ACCG	2	8	82650	82657	25 %	0 %	25 %	50 %	222102485
1615	NC_011981	CGC	2	6	82725	82730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102485
1616	NC_011981	TC	3	6	82792	82797	0 %	50 %	0 %	50 %	222102485
1617	NC_011981	CTC	2	6	82813	82818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102485
1618	NC_011981	GGC	2	6	82820	82825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102485
1619	NC_011981	GGC	2	6	82840	82845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102485
1620	NC_011981	GGC	2	6	82880	82885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102485
1621	NC_011981	ATT	2	6	82905	82910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102485
1622	NC_011981	GCG	2	6	82911	82916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102485
1623	NC_011981	CCA	2	6	82967	82972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102485
1624	NC_011981	GC	3	6	83021	83026	0 %	0 %	50 %	50 %	222102485
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1626	NC_011981	CGG	2	6	83230	83235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102485
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1628	NC_011981	AC	3	6	83328	83333	50 %	0 %	0 %	50 %	222102485
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1705	NC_011981	CAT	2	6	87189	87194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1885	NC_011981	GCA	2	6	97937	97942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102503
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1999	NC_011981	CTT	2	6	103366	103371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2000	NC_011981	GGTG	2	8	103372	103379	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

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