MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmid pACHL02

Total Repeats: 405

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011881	CGGC	2	8	662	669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011881	TGGG	2	8	733	740	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011881	CGGG	2	8	1028	1035	0 %	0 %	75 %	25 %	219883260
4	NC_011881	GGCT	2	8	1204	1211	0 %	25 %	50 %	25 %	219883260
5	NC_011881	CCAG	2	8	1429	1436	25 %	0 %	25 %	50 %	219883260
6	NC_011881	TGGG	3	12	1795	1806	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011881	GCCG	2	8	2109	2116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011881	CGGC	2	8	2304	2311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011881	CACC	2	8	2366	2373	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_011881	GTTC	2	8	2684	2691	0 %	50 %	25 %	25 %	219883261
11	NC_011881	TGCC	2	8	2842	2849	0 %	25 %	25 %	50 %	219883262
12	NC_011881	TCCA	2	8	3080	3087	25 %	25 %	0 %	50 %	219883262
13	NC_011881	TGGG	3	12	3216	3227	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011881	GCCG	2	8	3531	3538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011881	CGGA	2	8	3749	3756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011881	TCTT	2	8	3838	3845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011881	GATC	2	8	4031	4038	25 %	25 %	25 %	25 %	219883263
18	NC_011881	CTGG	2	8	4644	4651	0 %	25 %	50 %	25 %	219883264
19	NC_011881	GTCC	2	8	4857	4864	0 %	25 %	25 %	50 %	219883264
20	NC_011881	TCGG	2	8	5087	5094	0 %	25 %	50 %	25 %	219883264
21	NC_011881	CGTT	2	8	5113	5120	0 %	50 %	25 %	25 %	219883264
22	NC_011881	GTGC	2	8	5283	5290	0 %	25 %	50 %	25 %	219883264
23	NC_011881	GGAA	2	8	6195	6202	50 %	0 %	50 %	0 %	219883266
24	NC_011881	ACCA	2	8	6587	6594	50 %	0 %	0 %	50 %	219883266
25	NC_011881	GGCC	2	8	6819	6826	0 %	0 %	50 %	50 %	219883266
26	NC_011881	AAGG	2	8	6834	6841	50 %	0 %	50 %	0 %	219883266
27	NC_011881	GTTT	2	8	7045	7052	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011881	GCAA	3	12	8740	8751	50 %	0 %	25 %	25 %	219883267
29	NC_011881	CAAT	2	8	9137	9144	50 %	25 %	0 %	25 %	219883267
30	NC_011881	GATT	2	8	9737	9744	25 %	50 %	25 %	0 %	219883267
31	NC_011881	GCCG	2	8	9751	9758	0 %	0 %	50 %	50 %	219883267
32	NC_011881	GCGG	2	8	10470	10477	0 %	0 %	75 %	25 %	219883267
33	NC_011881	AGGC	2	8	11049	11056	25 %	0 %	50 %	25 %	219883268
34	NC_011881	CTGG	2	8	11346	11353	0 %	25 %	50 %	25 %	219883268
35	NC_011881	GCCA	2	8	11924	11931	25 %	0 %	25 %	50 %	219883268
36	NC_011881	TGGA	2	8	12162	12169	25 %	25 %	50 %	0 %	219883268
37	NC_011881	TTGC	2	8	12253	12260	0 %	50 %	25 %	25 %	219883268
38	NC_011881	GGCC	2	8	12480	12487	0 %	0 %	50 %	50 %	219883268
39	NC_011881	CCTG	2	8	12578	12585	0 %	25 %	25 %	50 %	219883268
40	NC_011881	GCAG	2	8	14162	14169	25 %	0 %	50 %	25 %	219883269
41	NC_011881	ATCC	2	8	14324	14331	25 %	25 %	0 %	50 %	219883269
42	NC_011881	GCCG	2	8	14613	14620	0 %	0 %	50 %	50 %	219883270
43	NC_011881	GATC	2	8	15001	15008	25 %	25 %	25 %	25 %	219883270
44	NC_011881	CAAC	2	8	15852	15859	50 %	0 %	0 %	50 %	219883271
45	NC_011881	AACG	2	8	15908	15915	50 %	0 %	25 %	25 %	219883271
46	NC_011881	CGCA	2	8	16621	16628	25 %	0 %	25 %	50 %	219883272
47	NC_011881	TGTC	2	8	16885	16892	0 %	50 %	25 %	25 %	219883272
48	NC_011881	GTTC	2	8	16900	16907	0 %	50 %	25 %	25 %	219883272
49	NC_011881	CTTG	2	8	17194	17201	0 %	50 %	25 %	25 %	219883272
50	NC_011881	CTCG	2	8	17683	17690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011881	ACGG	2	8	17803	17810	25 %	0 %	50 %	25 %	219883274
52	NC_011881	GGGT	2	8	17839	17846	0 %	25 %	75 %	0 %	219883274
53	NC_011881	TCGT	2	8	18991	18998	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011881	ACGG	2	8	19577	19584	25 %	0 %	50 %	25 %	219883275
55	NC_011881	GGGC	2	8	19699	19706	0 %	0 %	75 %	25 %	219883275
56	NC_011881	CGGC	2	8	19927	19934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011881	GCGG	2	8	20226	20233	0 %	0 %	75 %	25 %	219883276
58	NC_011881	CCGG	2	8	20624	20631	0 %	0 %	50 %	50 %	219883277
59	NC_011881	CGCC	2	8	21018	21025	0 %	0 %	25 %	75 %	219883277
60	NC_011881	CCGG	2	8	21656	21663	0 %	0 %	50 %	50 %	219883277
61	NC_011881	CGGC	2	8	21710	21717	0 %	0 %	50 %	50 %	219883277
62	NC_011881	ACGA	2	8	21902	21909	50 %	0 %	25 %	25 %	219883278
63	NC_011881	CCCG	2	8	22226	22233	0 %	0 %	25 %	75 %	219883278
64	NC_011881	CGGC	2	8	23030	23037	0 %	0 %	50 %	50 %	219883279
65	NC_011881	CCGG	2	8	23257	23264	0 %	0 %	50 %	50 %	219883279
66	NC_011881	CCGC	2	8	24086	24093	0 %	0 %	25 %	75 %	219883280
67	NC_011881	CGCA	2	8	24190	24197	25 %	0 %	25 %	50 %	219883280
68	NC_011881	ACCG	2	8	24574	24581	25 %	0 %	25 %	50 %	219883280
69	NC_011881	AGGG	2	8	24809	24816	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011881	GCCG	2	8	25590	25597	0 %	0 %	50 %	50 %	219883282
71	NC_011881	GCCC	2	8	25634	25641	0 %	0 %	25 %	75 %	219883282
72	NC_011881	GCCC	3	12	26885	26896	0 %	0 %	25 %	75 %	219883282
73	NC_011881	GGCC	2	8	26978	26985	0 %	0 %	50 %	50 %	219883282
74	NC_011881	AGGC	2	8	27161	27168	25 %	0 %	50 %	25 %	219883282
75	NC_011881	CGAC	2	8	27204	27211	25 %	0 %	25 %	50 %	219883282
76	NC_011881	TGAG	2	8	27329	27336	25 %	25 %	50 %	0 %	219883282
77	NC_011881	GGAC	2	8	27358	27365	25 %	0 %	50 %	25 %	219883283
78	NC_011881	AGCC	2	8	27750	27757	25 %	0 %	25 %	50 %	219883283
79	NC_011881	GATC	2	8	28484	28491	25 %	25 %	25 %	25 %	219883284
80	NC_011881	CGGC	2	8	29177	29184	0 %	0 %	50 %	50 %	219883284
81	NC_011881	GCCG	2	8	29304	29311	0 %	0 %	50 %	50 %	219883284
82	NC_011881	CTGC	2	8	29397	29404	0 %	25 %	25 %	50 %	219883284
83	NC_011881	GTGG	2	8	30397	30404	0 %	25 %	75 %	0 %	219883286
84	NC_011881	CCCG	2	8	31031	31038	0 %	0 %	25 %	75 %	219883286
85	NC_011881	CCGA	2	8	31587	31594	25 %	0 %	25 %	50 %	219883287
86	NC_011881	GGCG	2	8	31850	31857	0 %	0 %	75 %	25 %	219883287
87	NC_011881	CCGG	2	8	31872	31879	0 %	0 %	50 %	50 %	219883287
88	NC_011881	ACGG	2	8	31937	31944	25 %	0 %	50 %	25 %	219883287
89	NC_011881	GCCG	2	8	32533	32540	0 %	0 %	50 %	50 %	219883289
90	NC_011881	ATTC	2	8	32776	32783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011881	GCGG	2	8	33635	33642	0 %	0 %	75 %	25 %	219883290
92	NC_011881	CTTC	2	8	34039	34046	0 %	50 %	0 %	50 %	219883291
93	NC_011881	GGCG	2	8	34500	34507	0 %	0 %	75 %	25 %	219883291
94	NC_011881	CGCC	2	8	34935	34942	0 %	0 %	25 %	75 %	219883292
95	NC_011881	GTCG	3	12	35324	35335	0 %	25 %	50 %	25 %	219883293
96	NC_011881	TCGG	2	8	35415	35422	0 %	25 %	50 %	25 %	219883293
97	NC_011881	TCCG	2	8	36146	36153	0 %	25 %	25 %	50 %	219883293
98	NC_011881	AGGT	2	8	36184	36191	25 %	25 %	50 %	0 %	219883293
99	NC_011881	TTCC	2	8	36673	36680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011881	CGGG	2	8	36826	36833	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011881	GGCC	2	8	37083	37090	0 %	0 %	50 %	50 %	219883294
102	NC_011881	GCGG	2	8	37710	37717	0 %	0 %	75 %	25 %	219883295
103	NC_011881	TGAC	2	8	37875	37882	25 %	25 %	25 %	25 %	219883295
104	NC_011881	GCCG	2	8	38093	38100	0 %	0 %	50 %	50 %	219883296
105	NC_011881	GCGG	2	8	38261	38268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011881	CAAT	2	8	38620	38627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011881	CGGC	2	8	38945	38952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011881	AACC	2	8	39079	39086	50 %	0 %	0 %	50 %	219883297
109	NC_011881	GCCG	2	8	39646	39653	0 %	0 %	50 %	50 %	219883298
110	NC_011881	GCAT	2	8	40296	40303	25 %	25 %	25 %	25 %	219883298
111	NC_011881	TTCC	2	8	42115	42122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011881	GCCC	2	8	42143	42150	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_011881	CAAG	2	8	42231	42238	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011881	CGAA	2	8	42484	42491	50 %	0 %	25 %	25 %	219883301
115	NC_011881	CCGA	2	8	43558	43565	25 %	0 %	25 %	50 %	219883302
116	NC_011881	CGGC	2	8	43672	43679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011881	GCTC	2	8	43707	43714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011881	ACCA	2	8	43866	43873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011881	ACCG	2	8	43952	43959	25 %	0 %	25 %	50 %	219883303
120	NC_011881	GCCA	2	8	45065	45072	25 %	0 %	25 %	50 %	219883304
121	NC_011881	AGCC	2	8	45145	45152	25 %	0 %	25 %	50 %	219883304
122	NC_011881	TGTA	2	8	45566	45573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011881	CATC	2	8	45594	45601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011881	CACC	2	8	45782	45789	25 %	0 %	0 %	75 %	219883305
125	NC_011881	CCAA	2	8	46236	46243	50 %	0 %	0 %	50 %	219883305
126	NC_011881	GATG	2	8	46559	46566	25 %	25 %	50 %	0 %	219883305
127	NC_011881	GTTG	2	8	46619	46626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011881	CGGG	2	8	47138	47145	0 %	0 %	75 %	25 %	219883306
129	NC_011881	TGTT	2	8	47392	47399	0 %	75 %	25 %	0 %	219883306
130	NC_011881	GCCG	2	8	49693	49700	0 %	0 %	50 %	50 %	219883306
131	NC_011881	CCGG	2	8	50281	50288	0 %	0 %	50 %	50 %	219883306
132	NC_011881	TGCG	2	8	50421	50428	0 %	25 %	50 %	25 %	219883306
133	NC_011881	GGCG	2	8	50820	50827	0 %	0 %	75 %	25 %	219883306
134	NC_011881	ACCT	2	8	51873	51880	25 %	25 %	0 %	50 %	219883308
135	NC_011881	GCCT	2	8	52039	52046	0 %	25 %	25 %	50 %	219883308
136	NC_011881	GCGA	2	8	52314	52321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011881	GTCC	2	8	52326	52333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_011881	CACC	2	8	52372	52379	25 %	0 %	0 %	75 %	219883309
139	NC_011881	GCTG	2	8	52857	52864	0 %	25 %	50 %	25 %	219883309
140	NC_011881	TATC	2	8	53608	53615	25 %	50 %	0 %	25 %	219883310
141	NC_011881	GCCA	2	8	53912	53919	25 %	0 %	25 %	50 %	219883310
142	NC_011881	CCCT	2	8	54254	54261	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_011881	ACTA	2	8	54359	54366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011881	CGTT	2	8	54776	54783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011881	TGGC	2	8	54797	54804	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.