MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmid pACHL01

Total Repeats: 342

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011879	AATGA	2	10	1485	1494	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011879	GCTGA	2	10	3710	3719	20 %	20 %	40 %	20 %	219882548
3	NC_011879	ACACC	2	10	4719	4728	40 %	0 %	0 %	60 %	219882550
4	NC_011879	GCCAG	2	10	5499	5508	20 %	0 %	40 %	40 %	219882551
5	NC_011879	CGGGC	2	10	7759	7768	0 %	0 %	60 %	40 %	219882552
6	NC_011879	AGTAG	2	10	8310	8319	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011879	CCGCA	2	10	8489	8498	20 %	0 %	20 %	60 %	219882553
8	NC_011879	GACCG	2	10	9856	9865	20 %	0 %	40 %	40 %	219882554
9	NC_011879	CAGGA	2	10	15408	15417	40 %	0 %	40 %	20 %	219882564
10	NC_011879	CCGAG	2	10	18252	18261	20 %	0 %	40 %	40 %	219882568
11	NC_011879	GACCG	2	10	18389	18398	20 %	0 %	40 %	40 %	219882568
12	NC_011879	GGAAC	2	10	19956	19965	40 %	0 %	40 %	20 %	219882571
13	NC_011879	CCGCA	2	10	20669	20678	20 %	0 %	20 %	60 %	219882573
14	NC_011879	CGCGC	2	10	20889	20898	0 %	0 %	40 %	60 %	219882573
15	NC_011879	ACTGG	2	10	21945	21954	20 %	20 %	40 %	20 %	219882575
16	NC_011879	TCCGG	2	10	22309	22318	0 %	20 %	40 %	40 %	219882575
17	NC_011879	CCGGG	2	10	22366	22375	0 %	0 %	60 %	40 %	219882575
18	NC_011879	CCAGC	2	10	22690	22699	20 %	0 %	20 %	60 %	219882576
19	NC_011879	GAACG	2	10	24651	24660	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011879	AGGAC	2	10	25136	25145	40 %	0 %	40 %	20 %	219882579
21	NC_011879	CAGGG	2	10	27303	27312	20 %	0 %	60 %	20 %	219882582
22	NC_011879	GCATG	2	10	29260	29269	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011879	AGCGC	2	10	29375	29384	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_011879	CGCGG	2	10	29938	29947	0 %	0 %	60 %	40 %	219882585
25	NC_011879	CCGGG	2	10	32498	32507	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011879	CCGGT	2	10	33201	33210	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011879	CACTT	2	10	35865	35874	20 %	40 %	0 %	40 %	219882592
28	NC_011879	TCCGG	2	10	35911	35920	0 %	20 %	40 %	40 %	219882592
29	NC_011879	CGGAC	2	10	36057	36066	20 %	0 %	40 %	40 %	219882592
30	NC_011879	AAGGC	2	10	37285	37294	40 %	0 %	40 %	20 %	219882593
31	NC_011879	CTCGG	2	10	39472	39481	0 %	20 %	40 %	40 %	219882596
32	NC_011879	GGCGC	2	10	40460	40469	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_011879	CGGTT	2	10	40729	40738	0 %	40 %	40 %	20 %	219882598
34	NC_011879	CCCGC	2	10	41356	41365	0 %	0 %	20 %	80 %	219882599
35	NC_011879	CCCAG	2	10	41620	41629	20 %	0 %	20 %	60 %	219882599
36	NC_011879	GGCGC	2	10	42500	42509	0 %	0 %	60 %	40 %	219882600
37	NC_011879	TCGGA	2	10	43100	43109	20 %	20 %	40 %	20 %	219882601
38	NC_011879	GCGGA	2	10	45523	45532	20 %	0 %	60 %	20 %	219882603
39	NC_011879	CAGCA	2	10	46275	46284	40 %	0 %	20 %	40 %	219882604
40	NC_011879	GGAAC	2	10	47999	48008	40 %	0 %	40 %	20 %	219882607
41	NC_011879	CGGCA	2	10	48054	48063	20 %	0 %	40 %	40 %	219882607
42	NC_011879	GGCTG	2	10	53710	53719	0 %	20 %	60 %	20 %	219882616
43	NC_011879	TCCGC	2	10	53798	53807	0 %	20 %	20 %	60 %	219882616
44	NC_011879	AAAGA	2	10	54789	54798	80 %	0 %	20 %	0 %	219882618
45	NC_011879	AACGC	2	10	54817	54826	40 %	0 %	20 %	40 %	219882618
46	NC_011879	ACTCG	2	10	59593	59602	20 %	20 %	20 %	40 %	219882626
47	NC_011879	GACCT	2	10	60293	60302	20 %	20 %	20 %	40 %	219882626
48	NC_011879	GCTCA	2	10	62070	62079	20 %	20 %	20 %	40 %	219882629
49	NC_011879	TCTGG	2	10	63082	63091	0 %	40 %	40 %	20 %	219882631
50	NC_011879	GACCA	2	10	63201	63210	40 %	0 %	20 %	40 %	219882632
51	NC_011879	CGATG	2	10	63638	63647	20 %	20 %	40 %	20 %	219882632
52	NC_011879	TTCCT	2	10	64982	64991	0 %	60 %	0 %	40 %	219882635
53	NC_011879	GCCGG	2	10	65290	65299	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_011879	GGCTT	2	10	66537	66546	0 %	40 %	40 %	20 %	219882638
55	NC_011879	CGGAC	2	10	67138	67147	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_011879	GCGCA	2	10	69502	69511	20 %	0 %	40 %	40 %	219882641
57	NC_011879	GAAAA	2	10	69724	69733	80 %	0 %	20 %	0 %	219882642
58	NC_011879	CCTGA	2	10	72070	72079	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_011879	TCCGC	2	10	72173	72182	0 %	20 %	20 %	60 %	219882643
60	NC_011879	TTCTC	2	10	72491	72500	0 %	60 %	0 %	40 %	219882643
61	NC_011879	CTGGC	2	10	72604	72613	0 %	20 %	40 %	40 %	219882643
62	NC_011879	CCATG	2	10	73786	73795	20 %	20 %	20 %	40 %	219882645
63	NC_011879	GACCA	2	10	75416	75425	40 %	0 %	20 %	40 %	219882646
64	NC_011879	GCTGT	2	10	76063	76072	0 %	40 %	40 %	20 %	219882646
65	NC_011879	CAGTC	2	10	79052	79061	20 %	20 %	20 %	40 %	219882648
66	NC_011879	CTGGG	2	10	82144	82153	0 %	20 %	60 %	20 %	219882651
67	NC_011879	TGCCG	2	10	82295	82304	0 %	20 %	40 %	40 %	219882652
68	NC_011879	ATCGA	2	10	82734	82743	40 %	20 %	20 %	20 %	219882652
69	NC_011879	CTACG	2	10	82821	82830	20 %	20 %	20 %	40 %	219882652
70	NC_011879	CCGGT	2	10	86841	86850	0 %	20 %	40 %	40 %	219882657
71	NC_011879	TCAGT	2	10	87689	87698	20 %	40 %	20 %	20 %	219882658
72	NC_011879	CGTCC	2	10	90628	90637	0 %	20 %	20 %	60 %	219882662
73	NC_011879	CGCGC	2	10	91629	91638	0 %	0 %	40 %	60 %	219882663
74	NC_011879	CTCTC	2	10	94046	94055	0 %	40 %	0 %	60 %	219882667
75	NC_011879	CCGGT	2	10	94130	94139	0 %	20 %	40 %	40 %	219882667
76	NC_011879	CGGCC	2	10	96201	96210	0 %	0 %	40 %	60 %	219882670
77	NC_011879	GCCTC	2	10	96335	96344	0 %	20 %	20 %	60 %	219882670
78	NC_011879	CGGGC	2	10	97294	97303	0 %	0 %	60 %	40 %	219882671
79	NC_011879	CCGAG	2	10	100372	100381	20 %	0 %	40 %	40 %	219882676
80	NC_011879	CCTGG	2	10	103876	103885	0 %	20 %	40 %	40 %	219882679
81	NC_011879	CCGAC	2	10	108899	108908	20 %	0 %	20 %	60 %	219882687
82	NC_011879	ACGCT	2	10	110037	110046	20 %	20 %	20 %	40 %	219882691
83	NC_011879	CGAGC	2	10	111096	111105	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_011879	CAGCC	2	10	112438	112447	20 %	0 %	20 %	60 %	219882695
85	NC_011879	ACCGT	2	10	112843	112852	20 %	20 %	20 %	40 %	219882696
86	NC_011879	TCGGT	2	10	114222	114231	0 %	40 %	40 %	20 %	219882699
87	NC_011879	ACAGC	2	10	116288	116297	40 %	0 %	20 %	40 %	219882702
88	NC_011879	GCCCG	2	10	118399	118408	0 %	0 %	40 %	60 %	219882706
89	NC_011879	GCCAG	2	10	118708	118717	20 %	0 %	40 %	40 %	219882706
90	NC_011879	AGCGC	2	10	119008	119017	20 %	0 %	40 %	40 %	219882706
91	NC_011879	CGCAG	2	10	119078	119087	20 %	0 %	40 %	40 %	219882706
92	NC_011879	GTGAT	2	10	119250	119259	20 %	40 %	40 %	0 %	219882706
93	NC_011879	GTCCG	2	10	120147	120156	0 %	20 %	40 %	40 %	219882706
94	NC_011879	GTGCC	2	10	121104	121113	0 %	20 %	40 %	40 %	219882708
95	NC_011879	CGGCG	2	10	123637	123646	0 %	0 %	60 %	40 %	219882710
96	NC_011879	GCACG	2	10	124357	124366	20 %	0 %	40 %	40 %	219882710
97	NC_011879	GGTCC	2	10	125069	125078	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_011879	ACTGA	2	10	125583	125592	40 %	20 %	20 %	20 %	219882712
99	NC_011879	CGCCT	2	10	125643	125652	0 %	20 %	20 %	60 %	219882712
100	NC_011879	TGACA	2	10	126791	126800	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011879	TCACT	2	10	127973	127982	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_011879	CCTTC	2	10	130442	130451	0 %	40 %	0 %	60 %	219882721
103	NC_011879	CGGAG	2	10	131282	131291	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011879	AGTAG	2	10	131703	131712	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011879	CCCAG	2	10	132765	132774	20 %	0 %	20 %	60 %	219882722
106	NC_011879	GCGTG	2	10	133395	133404	0 %	20 %	60 %	20 %	219882724
107	NC_011879	GCCCC	2	10	135138	135147	0 %	0 %	20 %	80 %	219882725
108	NC_011879	CCGCG	2	10	135285	135294	0 %	0 %	40 %	60 %	219882725
109	NC_011879	TCCAG	2	10	135431	135440	20 %	20 %	20 %	40 %	219882725
110	NC_011879	CTGAC	2	10	135814	135823	20 %	20 %	20 %	40 %	219882726
111	NC_011879	CCGGG	2	10	136025	136034	0 %	0 %	60 %	40 %	219882726
112	NC_011879	GAGAC	2	10	139053	139062	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011879	GGGCA	2	10	141451	141460	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011879	CGCGG	2	10	142748	142757	0 %	0 %	60 %	40 %	219882737
115	NC_011879	CCTTC	2	10	143925	143934	0 %	40 %	0 %	60 %	219882738
116	NC_011879	GACAG	2	10	144924	144933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011879	GTTCA	2	10	145609	145618	20 %	40 %	20 %	20 %	219882741
118	NC_011879	GGCCA	2	10	146044	146053	20 %	0 %	40 %	40 %	219882742
119	NC_011879	GGCCG	2	10	146980	146989	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_011879	TCGGC	2	10	150050	150059	0 %	20 %	40 %	40 %	219882746
121	NC_011879	GATTC	2	10	151649	151658	20 %	40 %	20 %	20 %	219882747
122	NC_011879	AGCGC	2	10	156208	156217	20 %	0 %	40 %	40 %	219882752
123	NC_011879	GGGCT	2	10	159689	159698	0 %	20 %	60 %	20 %	219882755
124	NC_011879	GCAGG	2	10	159799	159808	20 %	0 %	60 %	20 %	219882755
125	NC_011879	GCGGG	2	10	160378	160387	0 %	0 %	80 %	20 %	219882756
126	NC_011879	TCGTG	2	10	161645	161654	0 %	40 %	40 %	20 %	219882757
127	NC_011879	CCCTG	2	10	161908	161917	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_011879	CGTTC	2	10	162357	162366	0 %	40 %	20 %	40 %	219882758
129	NC_011879	CAGAC	2	10	163729	163738	40 %	0 %	20 %	40 %	219882761
130	NC_011879	TGCCG	2	10	163756	163765	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011879	GTTGA	2	10	163808	163817	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011879	AAGAG	2	10	164691	164700	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011879	GTTGG	2	10	167371	167380	0 %	40 %	60 %	0 %	219882765
134	NC_011879	TCGCC	2	10	167472	167481	0 %	20 %	20 %	60 %	219882765
135	NC_011879	CAGGC	2	10	172076	172085	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_011879	GTCCT	2	10	173390	173399	0 %	40 %	20 %	40 %	219882771
137	NC_011879	ACCAC	2	10	173955	173964	40 %	0 %	0 %	60 %	219882771
138	NC_011879	CTGGT	2	10	175393	175402	0 %	40 %	40 %	20 %	219882773
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151	NC_011879	GCCGT	2	10	201369	201378	0 %	20 %	40 %	40 %	219882798
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265	NC_011879	CAAAC	2	10	331760	331769	60 %	0 %	0 %	40 %	219883000
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.