MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 62332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_011761	CGC	2	6	179269	179274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665251
4003	NC_011761	CTG	2	6	179348	179353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665251
4004	NC_011761	TCG	2	6	179397	179402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665251
4005	NC_011761	CGG	2	6	179456	179461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665251
4006	NC_011761	CCG	2	6	179572	179577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665251
4007	NC_011761	GCC	2	6	179579	179584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665251
4008	NC_011761	GCA	2	6	179683	179688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665251
4009	NC_011761	CGG	2	6	179713	179718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665251
4010	NC_011761	GCT	2	6	179728	179733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665251
4011	NC_011761	CAGG	2	8	179807	179814	25 %	0 %	50 %	25 %	218665251
4012	NC_011761	TGC	2	6	179889	179894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665251
4013	NC_011761	GGA	2	6	179896	179901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665251
4014	NC_011761	GA	4	8	179978	179985	50 %	0 %	50 %	0 %	218665251
4015	NC_011761	TTG	2	6	180108	180113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218666607
4016	NC_011761	CCA	2	6	180122	180127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218666607
4017	NC_011761	GCGG	2	8	180147	180154	0 %	0 %	75 %	25 %	218666607
4018	NC_011761	TGA	3	9	180164	180172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218666607
4019	NC_011761	CCG	2	6	180227	180232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666607
4020	NC_011761	GGC	2	6	180246	180251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666607
4021	NC_011761	GGC	2	6	180312	180317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666607
4022	NC_011761	GCG	2	6	180318	180323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666607
4023	NC_011761	CCA	2	6	180500	180505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218666607
4024	NC_011761	CGT	2	6	180521	180526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666607
4025	NC_011761	GCC	2	6	180552	180557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666607
4026	NC_011761	CGGCGC	3	18	180632	180649	0 %	0 %	50 %	50 %	218666607
4027	NC_011761	GCC	2	6	180726	180731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666607
4028	NC_011761	CGGC	2	8	180842	180849	0 %	0 %	50 %	50 %	218666607
4029	NC_011761	CCG	2	6	180850	180855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666607
4030	NC_011761	CCA	2	6	180904	180909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218666607
4031	NC_011761	GCAT	2	8	180913	180920	25 %	25 %	25 %	25 %	218666607
4032	NC_011761	TCC	2	6	180930	180935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218667206
4033	NC_011761	GCC	2	6	180957	180962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667206
4034	NC_011761	TGC	2	6	180973	180978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667206
4035	NC_011761	AGT	2	6	180993	180998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667206
4036	NC_011761	CGG	2	6	181006	181011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667206
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4038	NC_011761	CAGG	2	8	181051	181058	25 %	0 %	50 %	25 %	218667206
4039	NC_011761	GGC	2	6	181079	181084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667206
4040	NC_011761	GCC	2	6	181173	181178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667206
4041	NC_011761	GCT	2	6	181181	181186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667206
4042	NC_011761	CCA	3	9	181240	181248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667206
4043	NC_011761	GCG	2	6	181278	181283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667206
4044	NC_011761	TGG	2	6	181285	181290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667206
4045	NC_011761	ATC	2	6	181319	181324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218667206
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4051	NC_011761	CCAG	2	8	181498	181505	25 %	0 %	25 %	50 %	218667206
4052	NC_011761	GCA	2	6	181612	181617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667206
4053	NC_011761	CCG	2	6	181743	181748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667206
4054	NC_011761	GAC	2	6	181781	181786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667206
4055	NC_011761	GA	3	6	181800	181805	50 %	0 %	50 %	0 %	218667206
4056	NC_011761	AGGA	2	8	181809	181816	50 %	0 %	50 %	0 %	218667206
4057	NC_011761	CCA	2	6	181840	181845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667206
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4060	NC_011761	CCGC	2	8	181923	181930	0 %	0 %	25 %	75 %	218667206
4061	NC_011761	CCA	2	6	181945	181950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667206
4062	NC_011761	TGG	4	12	181954	181965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667206
4063	NC_011761	GGCGAT	2	12	181982	181993	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218667206
4064	NC_011761	CGGCG	2	10	182029	182038	0 %	0 %	60 %	40 %	218667206
4065	NC_011761	GGC	2	6	182063	182068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667206
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4068	NC_011761	CAG	2	6	182237	182242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667206
4069	NC_011761	TGCCGC	2	12	182263	182274	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218667206
4070	NC_011761	TGC	2	6	182340	182345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665844
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4072	NC_011761	GCC	2	6	182386	182391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665844
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4077	NC_011761	GAAGGG	2	12	182544	182555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665844
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4080	NC_011761	GCCCA	2	10	182632	182641	20 %	0 %	20 %	60 %	218665844
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4084	NC_011761	ACTG	2	8	182793	182800	25 %	25 %	25 %	25 %	218665844
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4087	NC_011761	GGCG	2	8	182942	182949	0 %	0 %	75 %	25 %	218665844
4088	NC_011761	CAGA	2	8	183030	183037	50 %	0 %	25 %	25 %	218665844
4089	NC_011761	GGC	2	6	183057	183062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665844
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4091	NC_011761	GC	4	8	183170	183177	0 %	0 %	50 %	50 %	218665844
4092	NC_011761	GC	3	6	183255	183260	0 %	0 %	50 %	50 %	218665844
4093	NC_011761	GC	3	6	183307	183312	0 %	0 %	50 %	50 %	218665844
4094	NC_011761	TCC	2	6	183398	183403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218665584
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4099	NC_011761	GGGCA	2	10	183514	183523	20 %	0 %	60 %	20 %	218665584
4100	NC_011761	GAA	2	6	183616	183621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218665584
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4102	NC_011761	GCCG	2	8	183645	183652	0 %	0 %	50 %	50 %	218665584
4103	NC_011761	TCC	2	6	183663	183668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218665584
4104	NC_011761	CCA	2	6	183815	183820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218665584
4105	NC_011761	GA	3	6	183835	183840	50 %	0 %	50 %	0 %	218665584
4106	NC_011761	AGG	2	6	183968	183973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665584
4107	NC_011761	CAC	2	6	184024	184029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218665584
4108	NC_011761	CAG	2	6	184075	184080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665584
4109	NC_011761	CCTT	2	8	184109	184116	0 %	50 %	0 %	50 %	218665584
4110	NC_011761	AGC	2	6	184166	184171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665584
4111	NC_011761	CAA	2	6	184183	184188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218665584
4112	NC_011761	CGA	2	6	184254	184259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665584
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4114	NC_011761	CGG	3	9	184362	184370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665584
4115	NC_011761	GAA	3	9	184402	184410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218665584
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4120	NC_011761	ACC	2	6	184533	184538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218665584
4121	NC_011761	TCC	2	6	184561	184566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218666253
4122	NC_011761	GGCG	2	8	184641	184648	0 %	0 %	75 %	25 %	218666253
4123	NC_011761	AGC	2	6	184651	184656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666253
4124	NC_011761	CCG	2	6	184682	184687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666253
4125	NC_011761	GAC	2	6	184779	184784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666253
4126	NC_011761	ATC	2	6	184855	184860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218666253
4127	NC_011761	TCG	2	6	184924	184929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666253
4128	NC_011761	ACTC	2	8	184935	184942	25 %	25 %	0 %	50 %	218666253
4129	NC_011761	CG	3	6	185031	185036	0 %	0 %	50 %	50 %	218666253
4130	NC_011761	CAG	2	6	185040	185045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666253
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4132	NC_011761	GC	3	6	185075	185080	0 %	0 %	50 %	50 %	218666253
4133	NC_011761	CAG	2	6	185106	185111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666253
4134	NC_011761	GCAG	2	8	185126	185133	25 %	0 %	50 %	25 %	218666253
4135	NC_011761	CGT	2	6	185156	185161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666253
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4140	NC_011761	GGC	3	9	185358	185366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666253
4141	NC_011761	TCGGGC	2	12	185428	185439	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218666253
4142	NC_011761	GCC	2	6	185481	185486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666253
4143	NC_011761	CGG	2	6	185489	185494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666253
4144	NC_011761	GTG	2	6	185533	185538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218666253
4145	NC_011761	TGC	2	6	185555	185560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666253
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4148	NC_011761	CTG	2	6	185744	185749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666253
4149	NC_011761	CGG	2	6	185768	185773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666253
4150	NC_011761	CATGTC	2	12	185889	185900	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218666253
4151	NC_011761	TGA	2	6	185946	185951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667704
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4153	NC_011761	ATG	3	9	186001	186009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667704
4154	NC_011761	ACC	2	6	186056	186061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667704
4155	NC_011761	ATG	2	6	186065	186070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667704
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4158	NC_011761	CGA	2	6	186132	186137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667704
4159	NC_011761	CGA	2	6	186141	186146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667704
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4162	NC_011761	C	8	8	186543	186550	0 %	0 %	0 %	100 %	218667704
4163	NC_011761	CCA	2	6	186561	186566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667704
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4165	NC_011761	GTC	2	6	186634	186639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667704
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4171	NC_011761	GAA	2	6	186850	186855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218667704
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4231	NC_011761	GC	3	6	190167	190172	0 %	0 %	50 %	50 %	218666604
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4236	NC_011761	CG	3	6	190332	190337	0 %	0 %	50 %	50 %	218666604
4237	NC_011761	CAGG	2	8	190388	190395	25 %	0 %	50 %	25 %	218666604
4238	NC_011761	GCA	2	6	190430	190435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666604
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4240	NC_011761	CAT	2	6	190616	190621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218666604
4241	NC_011761	GCA	2	6	190627	190632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666604
4242	NC_011761	TCA	2	6	190649	190654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218666604
4243	NC_011761	GTT	2	6	190689	190694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218666604
4244	NC_011761	GGCTG	2	10	190700	190709	0 %	20 %	60 %	20 %	218666604
4245	NC_011761	TGGCCA	2	12	190748	190759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218666604
4246	NC_011761	CCG	2	6	190790	190795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666604
4247	NC_011761	TTC	2	6	190959	190964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218666604
4248	NC_011761	CGGCG	2	10	191049	191058	0 %	0 %	60 %	40 %	218666604
4249	NC_011761	TGC	2	6	191060	191065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666604
4250	NC_011761	CGGA	2	8	191066	191073	25 %	0 %	50 %	25 %	218666604
4251	NC_011761	TA	3	6	191099	191104	50 %	50 %	0 %	0 %	218666604
4252	NC_011761	GCC	2	6	191181	191186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666604
4253	NC_011761	CTG	2	6	191256	191261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666604
4254	NC_011761	AAC	2	6	191269	191274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218666604
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4256	NC_011761	TGCC	2	8	191427	191434	0 %	25 %	25 %	50 %	218666604
4257	NC_011761	CTT	2	6	191438	191443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218666604
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4260	NC_011761	ATG	2	6	191565	191570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218665286
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4262	NC_011761	CCT	2	6	191707	191712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218665286
4263	NC_011761	TGCCG	2	10	191742	191751	0 %	20 %	40 %	40 %	218665286
4264	NC_011761	CGA	2	6	191752	191757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665286
4265	NC_011761	CAG	2	6	191780	191785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665286
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4268	NC_011761	GCCG	2	8	191901	191908	0 %	0 %	50 %	50 %	218665162
4269	NC_011761	GC	3	6	191938	191943	0 %	0 %	50 %	50 %	218665162
4270	NC_011761	CG	3	6	191976	191981	0 %	0 %	50 %	50 %	218665162
4271	NC_011761	A	6	6	191983	191988	100 %	0 %	0 %	0 %	218665162
4272	NC_011761	TGA	2	6	192023	192028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218665162
4273	NC_011761	AGGA	2	8	192069	192076	50 %	0 %	50 %	0 %	218665162
4274	NC_011761	TTC	2	6	192087	192092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218665162
4275	NC_011761	TGA	2	6	192104	192109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218665162
4276	NC_011761	TTC	2	6	192267	192272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218665162
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4279	NC_011761	GCA	2	6	192475	192480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665162
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4281	NC_011761	GC	5	10	192543	192552	0 %	0 %	50 %	50 %	218665162
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4284	NC_011761	CAG	2	6	192618	192623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665162
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4292	NC_011761	TTC	2	6	192959	192964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218666931
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4304	NC_011761	CGG	2	6	193866	193871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4322	NC_011761	GTG	2	6	194787	194792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667162
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4327	NC_011761	GCA	2	6	194874	194879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667162
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4341	NC_011761	GGGCA	2	10	195368	195377	20 %	0 %	60 %	20 %	218667162
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4353	NC_011761	GCA	2	6	195738	195743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666535
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4360	NC_011761	GACG	2	8	196132	196139	25 %	0 %	50 %	25 %	218666535
4361	NC_011761	GGC	2	6	196237	196242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666535
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4484	NC_011761	GAT	2	6	201687	201692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218665025
4485	NC_011761	CGA	2	6	201719	201724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665025
4486	NC_011761	GCC	2	6	201744	201749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665025
4487	NC_011761	CTCA	2	8	201867	201874	25 %	25 %	0 %	50 %	218665025
4488	NC_011761	TC	3	6	201933	201938	0 %	50 %	0 %	50 %	218665025
4489	NC_011761	CTG	2	6	201978	201983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665025
4490	NC_011761	ATC	2	6	202027	202032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665025
4491	NC_011761	AGA	2	6	202066	202071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218665025
4492	NC_011761	GAA	2	6	202137	202142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218665025
4493	NC_011761	TCCGGC	2	12	202175	202186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218665025
4494	NC_011761	GCC	2	6	202218	202223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665025
4495	NC_011761	GCG	3	9	202263	202271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665025
4496	NC_011761	AGG	2	6	202330	202335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665025
4497	NC_011761	GAC	2	6	202359	202364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665025
4498	NC_011761	TCC	2	6	202466	202471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218667262
4499	NC_011761	GGC	2	6	202583	202588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667262
4500	NC_011761	TGG	2	6	202627	202632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667262

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