MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 62332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011761	CGC	2	6	23461	23466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666805
502	NC_011761	GC	3	6	23489	23494	0 %	0 %	50 %	50 %	218666805
503	NC_011761	ATGG	2	8	23543	23550	25 %	25 %	50 %	0 %	218666805
504	NC_011761	AGC	2	6	23590	23595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666805
505	NC_011761	GTCG	2	8	23607	23614	0 %	25 %	50 %	25 %	218667699
506	NC_011761	GCAG	2	8	23621	23628	25 %	0 %	50 %	25 %	218667699
507	NC_011761	GTC	2	6	23638	23643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667699
508	NC_011761	T	6	6	23666	23671	0 %	100 %	0 %	0 %	218667699
509	NC_011761	GGC	2	6	23682	23687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667699
510	NC_011761	GCA	2	6	23790	23795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667699
511	NC_011761	TTA	2	6	23919	23924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218667699
512	NC_011761	CAG	2	6	23956	23961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667699
513	NC_011761	GTC	2	6	23995	24000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667699
514	NC_011761	CG	3	6	24051	24056	0 %	0 %	50 %	50 %	218667699
515	NC_011761	CGT	2	6	24159	24164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667699
516	NC_011761	AGC	2	6	24220	24225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_011761	CTGCTC	2	12	24255	24266	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218668036
518	NC_011761	G	6	6	24309	24314	0 %	0 %	100 %	0 %	218668036
519	NC_011761	ATT	2	6	24325	24330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218668036
520	NC_011761	CGG	2	6	24352	24357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668036
521	NC_011761	GGT	2	6	24395	24400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218668036
522	NC_011761	GCT	2	6	24404	24409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218668036
523	NC_011761	GCG	2	6	24419	24424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668036
524	NC_011761	TGG	2	6	24457	24462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218668036
525	NC_011761	TCA	3	9	24463	24471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218668036
526	NC_011761	T	6	6	24482	24487	0 %	100 %	0 %	0 %	218668036
527	NC_011761	CGT	2	6	24497	24502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218668036
528	NC_011761	CAG	2	6	24551	24556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218668036
529	NC_011761	GGCG	2	8	24599	24606	0 %	0 %	75 %	25 %	218668036
530	NC_011761	GGC	2	6	24635	24640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668036
531	NC_011761	TGG	2	6	24661	24666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218668036
532	NC_011761	CAG	2	6	24677	24682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218668036
533	NC_011761	AGC	2	6	24726	24731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218668036
534	NC_011761	ATC	2	6	24759	24764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218668036
535	NC_011761	CCA	2	6	24766	24771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218668036
536	NC_011761	CCA	2	6	24847	24852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218668036
537	NC_011761	CTG	2	6	24876	24881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218668036
538	NC_011761	TGATGC	2	12	25018	25029	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218668036
539	NC_011761	TCAGC	2	10	25052	25061	20 %	20 %	20 %	40 %	218668036
540	NC_011761	TGC	2	6	25075	25080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218668036
541	NC_011761	GCTGT	2	10	25083	25092	0 %	40 %	40 %	20 %	218668036
542	NC_011761	CGG	2	6	25093	25098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668036
543	NC_011761	CGA	2	6	25122	25127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218668036
544	NC_011761	CG	3	6	25142	25147	0 %	0 %	50 %	50 %	218668036
545	NC_011761	GGC	2	6	25151	25156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668036
546	NC_011761	ACG	2	6	25213	25218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218668036
547	NC_011761	CAA	2	6	25244	25249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218668036
548	NC_011761	AGC	2	6	25276	25281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218668036
549	NC_011761	GGC	4	12	25283	25294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668036
550	NC_011761	AGC	2	6	25309	25314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218668036
551	NC_011761	GCG	2	6	25404	25409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668036
552	NC_011761	AGG	2	6	25423	25428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218668036
553	NC_011761	TGG	2	6	25495	25500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218668036
554	NC_011761	GC	3	6	25588	25593	0 %	0 %	50 %	50 %	218668036
555	NC_011761	CGC	2	6	25658	25663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218668036
556	NC_011761	GCC	2	6	25674	25679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218668036
557	NC_011761	GCG	2	6	25694	25699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668036
558	NC_011761	CCG	2	6	25744	25749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218668036
559	NC_011761	GCG	2	6	25757	25762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668036
560	NC_011761	CGA	2	6	25784	25789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218668036
561	NC_011761	CAT	2	6	25820	25825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218668036
562	NC_011761	TGG	2	6	25852	25857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218668036
563	NC_011761	AG	3	6	25955	25960	50 %	0 %	50 %	0 %	218668036
564	NC_011761	C	7	7	25998	26004	0 %	0 %	0 %	100 %	218668036
565	NC_011761	AAT	2	6	26040	26045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218668036
566	NC_011761	GACG	2	8	26126	26133	25 %	0 %	50 %	25 %	218668036
567	NC_011761	GT	3	6	26161	26166	0 %	50 %	50 %	0 %	218668036
568	NC_011761	GAG	2	6	26280	26285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218668036
569	NC_011761	CGG	2	6	26288	26293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668036
570	NC_011761	AGG	2	6	26375	26380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011761	TGG	2	6	26410	26415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665148
572	NC_011761	GGA	2	6	26459	26464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665148
573	NC_011761	CCG	2	6	26485	26490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665148
574	NC_011761	TGG	2	6	26530	26535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665148
575	NC_011761	CTC	2	6	26544	26549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218665148
576	NC_011761	GGT	2	6	26621	26626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665148
577	NC_011761	GAT	2	6	26627	26632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218665148
578	NC_011761	CCA	2	6	26644	26649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218665148
579	NC_011761	CGG	2	6	26656	26661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665148
580	NC_011761	TGCG	2	8	26782	26789	0 %	25 %	50 %	25 %	218665148
581	NC_011761	GGC	2	6	26864	26869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665148
582	NC_011761	TGC	2	6	26887	26892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665148
583	NC_011761	CG	3	6	26924	26929	0 %	0 %	50 %	50 %	218665148
584	NC_011761	CGA	2	6	26940	26945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665148
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588	NC_011761	GAG	2	6	27030	27035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665148
589	NC_011761	GGC	2	6	27075	27080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665148
590	NC_011761	CGA	2	6	27092	27097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665148
591	NC_011761	GC	3	6	27126	27131	0 %	0 %	50 %	50 %	218665148
592	NC_011761	GCG	2	6	27152	27157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665148
593	NC_011761	CAT	2	6	27158	27163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665148
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596	NC_011761	CTA	2	6	27269	27274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665148
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598	NC_011761	AGA	2	6	27344	27349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218665148
599	NC_011761	GCGCC	2	10	27384	27393	0 %	0 %	40 %	60 %	218665148
600	NC_011761	TGC	2	6	27418	27423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665148
601	NC_011761	TGG	2	6	27466	27471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665148
602	NC_011761	CTG	2	6	27477	27482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665148
603	NC_011761	TCGTC	2	10	27545	27554	0 %	40 %	20 %	40 %	218665148
604	NC_011761	CGG	2	6	27587	27592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665148
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606	NC_011761	GC	3	6	27623	27628	0 %	0 %	50 %	50 %	218665148
607	NC_011761	CG	3	6	27668	27673	0 %	0 %	50 %	50 %	218665148
608	NC_011761	CGG	2	6	27676	27681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665148
609	NC_011761	CA	3	6	27701	27706	50 %	0 %	0 %	50 %	218665148
610	NC_011761	GAA	2	6	27722	27727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218665148
611	NC_011761	GCG	2	6	27752	27757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665148
612	NC_011761	GGCG	3	12	27754	27765	0 %	0 %	75 %	25 %	218665148
613	NC_011761	GAGGGG	2	12	27777	27788	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	218665148
614	NC_011761	AT	3	6	27862	27867	50 %	50 %	0 %	0 %	218665805
615	NC_011761	GTCTG	2	10	27917	27926	0 %	40 %	40 %	20 %	218665805
616	NC_011761	GTG	2	6	27933	27938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665805
617	NC_011761	AAC	2	6	27985	27990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218665805
618	NC_011761	GCC	2	6	28029	28034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_011761	CGT	2	6	28068	28073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_011761	GA	3	6	28098	28103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011761	TG	3	6	28149	28154	0 %	50 %	50 %	0 %	218666690
622	NC_011761	TCCA	2	8	28158	28165	25 %	25 %	0 %	50 %	218666690
623	NC_011761	TCAG	2	8	28290	28297	25 %	25 %	25 %	25 %	218666690
624	NC_011761	GCGT	2	8	28329	28336	0 %	25 %	50 %	25 %	218666690
625	NC_011761	TGCTCA	2	12	28356	28367	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218666690
626	NC_011761	CGAA	2	8	28414	28421	50 %	0 %	25 %	25 %	218666690
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757	NC_011761	AT	3	6	34111	34116	50 %	50 %	0 %	0 %	218665938
758	NC_011761	CGG	2	6	34240	34245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665938
759	NC_011761	T	6	6	34247	34252	0 %	100 %	0 %	0 %	218665938
760	NC_011761	GA	3	6	34322	34327	50 %	0 %	50 %	0 %	218665938
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773	NC_011761	CGA	2	6	35124	35129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667012
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871	NC_011761	TGGT	2	8	39451	39458	0 %	50 %	50 %	0 %	218665463
872	NC_011761	TCG	2	6	39463	39468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665463
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877	NC_011761	GCG	2	6	39583	39588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665463
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880	NC_011761	CGG	2	6	39623	39628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665463
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882	NC_011761	GGC	2	6	39696	39701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665463
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