MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 62332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011761	CAT	2	6	202638	202643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218667262
4502	NC_011761	CAATGC	2	12	202688	202699	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218667262
4503	NC_011761	GCGG	2	8	202721	202728	0 %	0 %	75 %	25 %	218667262
4504	NC_011761	GC	3	6	202768	202773	0 %	0 %	50 %	50 %	218667262
4505	NC_011761	TGC	2	6	202783	202788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667262
4506	NC_011761	A	6	6	202831	202836	100 %	0 %	0 %	0 %	218667262
4507	NC_011761	CGC	2	6	202838	202843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667262
4508	NC_011761	GCG	3	9	202896	202904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667262
4509	NC_011761	ACC	2	6	202911	202916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667262
4510	NC_011761	GAT	2	6	203000	203005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667262
4511	NC_011761	GCA	2	6	203072	203077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667262
4512	NC_011761	CCA	2	6	203137	203142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667262
4513	NC_011761	GACGG	2	10	203165	203174	20 %	0 %	60 %	20 %	218667262
4514	NC_011761	GCG	2	6	203175	203180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667262
4515	NC_011761	GA	3	6	203225	203230	50 %	0 %	50 %	0 %	218667262
4516	NC_011761	TGGC	2	8	203253	203260	0 %	25 %	50 %	25 %	218667262
4517	NC_011761	CGGG	2	8	203317	203324	0 %	0 %	75 %	25 %	218667262
4518	NC_011761	ATG	2	6	203326	203331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667262
4519	NC_011761	GGC	2	6	203426	203431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667262
4520	NC_011761	CGA	2	6	203450	203455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667262
4521	NC_011761	GGCG	2	8	203465	203472	0 %	0 %	75 %	25 %	218667262
4522	NC_011761	CTGG	2	8	203480	203487	0 %	25 %	50 %	25 %	218667262
4523	NC_011761	GGC	2	6	203537	203542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667262
4524	NC_011761	AGG	2	6	203563	203568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218667262
4525	NC_011761	G	6	6	203596	203601	0 %	0 %	100 %	0 %	218667262
4526	NC_011761	CCG	2	6	203602	203607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667262
4527	NC_011761	CTG	2	6	203726	203731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667936
4528	NC_011761	TGCGC	2	10	203734	203743	0 %	20 %	40 %	40 %	218667936
4529	NC_011761	CGG	2	6	203782	203787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667936
4530	NC_011761	ACGG	2	8	203905	203912	25 %	0 %	50 %	25 %	218667936
4531	NC_011761	GCC	2	6	204073	204078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667936
4532	NC_011761	GC	3	6	204127	204132	0 %	0 %	50 %	50 %	218667936
4533	NC_011761	GGC	2	6	204139	204144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667936
4534	NC_011761	GCTG	2	8	204162	204169	0 %	25 %	50 %	25 %	218667936
4535	NC_011761	GGC	2	6	204217	204222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667936
4536	NC_011761	G	6	6	204244	204249	0 %	0 %	100 %	0 %	218667936
4537	NC_011761	ATC	2	6	204267	204272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218667936
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4539	NC_011761	GGC	2	6	204394	204399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667936
4540	NC_011761	GC	3	6	204408	204413	0 %	0 %	50 %	50 %	218667936
4541	NC_011761	TC	3	6	204424	204429	0 %	50 %	0 %	50 %	218667936
4542	NC_011761	TCT	2	6	204506	204511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218667936
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4544	NC_011761	CGG	2	6	204540	204545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667936
4545	NC_011761	GGC	2	6	204565	204570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667936
4546	NC_011761	CGT	2	6	204679	204684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665465
4547	NC_011761	TCG	3	9	204771	204779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665465
4548	NC_011761	CGGGA	2	10	204791	204800	20 %	0 %	60 %	20 %	218665465
4549	NC_011761	GCC	2	6	204803	204808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665465
4550	NC_011761	GAGGCG	2	12	204821	204832	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	218665465
4551	NC_011761	CG	3	6	204831	204836	0 %	0 %	50 %	50 %	218665465
4552	NC_011761	GCG	2	6	204884	204889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665465
4553	NC_011761	GCG	2	6	204982	204987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665465
4554	NC_011761	CTG	2	6	204989	204994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665465
4555	NC_011761	GAG	2	6	204995	205000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665465
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4560	NC_011761	CGGG	2	8	205268	205275	0 %	0 %	75 %	25 %	218665465
4561	NC_011761	TGG	2	6	205314	205319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665465
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4565	NC_011761	TGC	2	6	205416	205421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665465
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4592	NC_011761	CGG	2	6	206381	206386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_011761	TGG	2	6	206387	206392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4606	NC_011761	CTTGC	2	10	207123	207132	0 %	40 %	20 %	40 %	218667413
4607	NC_011761	GTCT	2	8	207162	207169	0 %	50 %	25 %	25 %	218667413
4608	NC_011761	G	6	6	207212	207217	0 %	0 %	100 %	0 %	218667413
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4617	NC_011761	GGC	2	6	207443	207448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_011761	GGA	2	6	207469	207474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_011761	TGCA	2	8	207478	207485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_011761	GGT	2	6	207500	207505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_011761	TGTC	2	8	207506	207513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4622	NC_011761	CCG	2	6	207601	207606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_011761	CAG	2	6	207627	207632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_011761	ACT	2	6	207693	207698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665054
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4747	NC_011761	GCCT	2	8	213969	213976	0 %	25 %	25 %	50 %	218665332
4748	NC_011761	TGG	2	6	213988	213993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665332
4749	NC_011761	TGA	2	6	214124	214129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218665332
4750	NC_011761	TGC	2	6	214149	214154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665332
4751	NC_011761	TGC	2	6	214184	214189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665332
4752	NC_011761	CGG	2	6	214217	214222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665332
4753	NC_011761	GCC	2	6	214238	214243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665332
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4761	NC_011761	GGC	2	6	214547	214552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665332
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4766	NC_011761	GATA	2	8	214785	214792	50 %	25 %	25 %	0 %	218665332
4767	NC_011761	GGTGA	2	10	214798	214807	20 %	20 %	60 %	0 %	218665332
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4771	NC_011761	CCGG	2	8	214899	214906	0 %	0 %	50 %	50 %	218665332
4772	NC_011761	GGC	2	6	214959	214964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665332
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4800	NC_011761	TCC	2	6	216063	216068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4801	NC_011761	GTAGG	2	10	216086	216095	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4802	NC_011761	CGT	2	6	216113	216118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4808	NC_011761	ATG	2	6	216322	216327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218666397
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4866	NC_011761	TGT	2	6	218834	218839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218667111
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4868	NC_011761	CACC	2	8	218970	218977	25 %	0 %	0 %	75 %	218667111
4869	NC_011761	CCA	2	6	219032	219037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667111
4870	NC_011761	GACG	2	8	219062	219069	25 %	0 %	50 %	25 %	218667111
4871	NC_011761	GGCC	2	8	219182	219189	0 %	0 %	50 %	50 %	218667111
4872	NC_011761	AGA	2	6	219233	219238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218667111
4873	NC_011761	CGC	2	6	219276	219281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667111
4874	NC_011761	ACC	2	6	219502	219507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218666125
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4876	NC_011761	CCTG	2	8	219606	219613	0 %	25 %	25 %	50 %	218666125
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4878	NC_011761	GGCA	2	8	219637	219644	25 %	0 %	50 %	25 %	218666125
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4906	NC_011761	GAA	2	6	220823	220828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218665576
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4985	NC_011761	GGC	2	6	223936	223941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665942
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4989	NC_011761	TGG	3	9	224070	224078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665942
4990	NC_011761	GCT	2	6	224107	224112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665942
4991	NC_011761	GGGT	2	8	224153	224160	0 %	25 %	75 %	0 %	218665942
4992	NC_011761	GGC	2	6	224221	224226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665942
4993	NC_011761	TGC	2	6	224241	224246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665942
4994	NC_011761	A	6	6	224340	224345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4995	NC_011761	GTC	2	6	224384	224389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4996	NC_011761	GCGT	2	8	224417	224424	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4997	NC_011761	CTG	2	6	224449	224454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667729
4998	NC_011761	TGG	2	6	224456	224461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667729
4999	NC_011761	CTG	2	6	224470	224475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667729
5000	NC_011761	GCT	2	6	224583	224588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667729

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