MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Anoxybacillus flavithermus WK1 chromosome

Total Repeats: 1194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011567	AAATTA	2	12	2937	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212637851
2	NC_011567	GCAAGC	2	12	7772	7783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212637855
3	NC_011567	ATTTTT	2	12	8348	8359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212637855
4	NC_011567	TTAATG	2	12	8799	8810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	212637855
5	NC_011567	GCGCAG	2	12	15653	15664	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011567	TTTCTC	2	12	16294	16305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212637857
7	NC_011567	AACTGG	2	12	18974	18985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212637859
8	NC_011567	ATACTT	2	12	25167	25178	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011567	ATGTTG	2	12	36206	36217	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212637874
10	NC_011567	ATTTTT	2	12	40150	40161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212637879
11	NC_011567	TTCCTG	2	12	42053	42064	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212637881
12	NC_011567	CTTCCG	2	12	42250	42261	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	212637881
13	NC_011567	TCGAAA	2	12	42310	42321	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212637881
14	NC_011567	ACGTGC	2	12	43547	43558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212637882
15	NC_011567	GCCAAA	2	12	46858	46869	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	212637885
16	NC_011567	AAAAGA	2	12	47303	47314	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212637886
17	NC_011567	AATTGA	2	12	50795	50806	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212637890
18	NC_011567	TGCGTA	2	12	58196	58207	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212637897
19	NC_011567	TACAAT	2	12	61266	61277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	212637900
20	NC_011567	TGCGGA	2	12	72896	72907	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212637911
21	NC_011567	CAGGAG	2	12	75865	75876	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212637914
22	NC_011567	AGGAAA	2	12	76157	76168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212637914
23	NC_011567	AGCAGG	2	12	77633	77644	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212637915
24	NC_011567	GGGAAA	2	12	82216	82227	50 %	0 %	50 %	0 %	212637922
25	NC_011567	CAAATT	2	12	82261	82272	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	212637922
26	NC_011567	AGTCAA	2	12	88905	88916	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011567	GGTGGC	2	12	89122	89133	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	212637923
28	NC_011567	GAGAAG	2	12	91384	91395	50 %	0 %	50 %	0 %	212637926
29	NC_011567	TACGTT	2	12	92248	92259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212637926
30	NC_011567	AAACAG	2	12	92521	92532	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212637926
31	NC_011567	GAAGAG	2	12	95478	95489	50 %	0 %	50 %	0 %	212637928
32	NC_011567	CATACG	2	12	103757	103768	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212637938
33	NC_011567	GATTTT	2	12	104483	104494	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	212637940
34	NC_011567	CATTTA	2	12	105001	105012	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	212637941
35	NC_011567	TCTGGT	2	12	105066	105077	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212637941
36	NC_011567	AGAAGC	2	12	105591	105602	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	212637942
37	NC_011567	GTTGCT	2	12	106021	106032	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212637942
38	NC_011567	TAAAAT	2	12	106794	106805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011567	CGTGAA	2	12	113492	113503	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212637947
40	NC_011567	GAAGTT	2	12	114429	114440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212637947
41	NC_011567	AATTAC	2	12	117022	117033	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	212637951
42	NC_011567	AAACAG	2	12	117186	117197	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212637951
43	NC_011567	AAGCTG	2	12	119856	119867	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212637952
44	NC_011567	CTTAAT	2	12	121393	121404	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	212637954
45	NC_011567	CAGCTA	2	12	121783	121794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212637955
46	NC_011567	GAAAAG	2	12	125960	125971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011567	ATCGTT	2	12	126795	126806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212637966
48	NC_011567	GTTACA	2	12	127599	127610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212637969
49	NC_011567	TGTCGG	2	12	127823	127834	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	212637969
50	NC_011567	TGGTGA	2	12	129564	129575	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	212637973
51	NC_011567	GAAATT	2	12	131695	131706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212637976
52	NC_011567	AAAAAG	2	12	134580	134591	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212637981
53	NC_011567	CCTTTT	2	12	142248	142259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212637992
54	NC_011567	ATTTTC	2	12	152838	152849	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	212637997
55	NC_011567	GAAGAG	2	12	153493	153504	50 %	0 %	50 %	0 %	212637998
56	NC_011567	GATACA	2	12	157339	157350	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212638001
57	NC_011567	GCTTTT	2	12	157422	157433	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	212638001
58	NC_011567	ATTTTT	2	12	164328	164339	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212638007
59	NC_011567	TTTTTC	2	12	171831	171842	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	212638012
60	NC_011567	ATATGC	2	12	179140	179151	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638018
61	NC_011567	AAAAGC	2	12	179701	179712	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011567	AATCGA	2	12	192556	192567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212638031
63	NC_011567	CGCTTC	2	12	200640	200651	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	212638039
64	NC_011567	TTACGA	2	12	202916	202927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638041
65	NC_011567	TTGGTA	2	12	206242	206253	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212638044
66	NC_011567	CATTGA	2	12	210489	210500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638049
67	NC_011567	GCGCAG	2	12	218980	218991	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011567	TTTTAG	2	12	221882	221893	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	212638055
69	NC_011567	AGCGAG	2	12	223094	223105	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212638056
70	NC_011567	AACAGA	2	12	227960	227971	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212638061
71	NC_011567	ATGAAC	2	12	228524	228535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011567	ACTTGT	2	12	232311	232322	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212638065
73	NC_011567	TAAAAA	2	12	234507	234518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011567	CTGGTA	2	12	235373	235384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638067
75	NC_011567	GTCAAA	2	12	236993	237004	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212638068
76	NC_011567	GCATTT	2	12	240346	240357	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212638071
77	NC_011567	GCCTCT	2	12	241902	241913	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	212638073
78	NC_011567	CCAGGA	2	12	243536	243547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212638074
79	NC_011567	ACAGCG	2	12	244382	244393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212638075
80	NC_011567	TTGCGC	2	12	244446	244457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212638075
81	NC_011567	GCTTTT	2	12	259373	259384	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	212638084
82	NC_011567	AACAGA	2	12	259393	259404	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212638084
83	NC_011567	GAAAAA	2	12	260748	260759	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212638085
84	NC_011567	ACGATG	2	12	262479	262490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212638087
85	NC_011567	AGAATA	2	12	264734	264745	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	212638089
86	NC_011567	CTTTCT	2	12	264855	264866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212638090
87	NC_011567	TTCGAT	2	12	266416	266427	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212638091
88	NC_011567	TGCGGT	2	12	267149	267160	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	212638092
89	NC_011567	GAAACA	2	12	268168	268179	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212638093
90	NC_011567	TTTAAA	2	12	274138	274149	50 %	50 %	0 %	0 %	212638097
91	NC_011567	GCAGAT	2	12	274903	274914	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212638098
92	NC_011567	CATGGT	2	12	277359	277370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638100
93	NC_011567	ACAAAC	2	12	277576	277587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212638101
94	NC_011567	TCTGCT	2	12	279439	279450	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212638103
95	NC_011567	ACCAAC	2	12	281349	281360	50 %	0 %	0 %	50 %	212638106
96	NC_011567	GCGTAT	2	12	285486	285497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638109
97	NC_011567	CGGATT	2	12	289061	289072	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638112
98	NC_011567	TTATGA	2	12	291140	291151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011567	TTTTGT	2	12	293037	293048	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011567	CGAGTG	2	12	294045	294056	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212638115
101	NC_011567	TATCGG	2	12	294544	294555	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638116
102	NC_011567	GAAAGT	2	12	295869	295880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212638116
103	NC_011567	ACGCGA	2	12	296080	296091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212638117
104	NC_011567	GCGATG	2	12	300927	300938	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212638118
105	NC_011567	TGATGG	2	12	308227	308238	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	212638125
106	NC_011567	AAAATA	2	12	308712	308723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	212638125
107	NC_011567	TGGACG	2	12	308826	308837	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212638125
108	NC_011567	TGCTTC	2	12	310534	310545	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212638127
109	NC_011567	CCCATT	2	12	311433	311444	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	212638128
110	NC_011567	GTCGAT	2	12	314677	314688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638131
111	NC_011567	TGAAGA	2	12	316270	316281	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212638133
112	NC_011567	TCATTT	2	12	317738	317749	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	212638134
113	NC_011567	CCAAAA	2	12	319098	319109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212638136
114	NC_011567	GGCTAC	2	12	320756	320767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212638138
115	NC_011567	AAACAT	2	12	320888	320899	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	212638138
116	NC_011567	AAGCGA	2	12	331472	331483	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	212638148
117	NC_011567	CATTGA	2	12	334625	334636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638152
118	NC_011567	GACAAT	2	12	336935	336946	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212638152
119	NC_011567	ATACGT	2	12	337173	337184	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638153
120	NC_011567	AAAGGA	2	12	339698	339709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212638155
121	NC_011567	CGATGA	2	12	352200	352211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212638173
122	NC_011567	CATTTG	2	12	353654	353665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212638174
123	NC_011567	TAATGT	2	12	354146	354157	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	212638175
124	NC_011567	AGCGAG	2	12	361569	361580	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212638182
125	NC_011567	GTATGT	2	12	363270	363281	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212638182
126	NC_011567	TTTTAT	2	12	368794	368805	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011567	TTTTTC	2	12	375680	375691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	212638196
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129	NC_011567	AAAGTA	2	12	381328	381339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	212638204
130	NC_011567	GCGATG	2	12	382031	382042	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212638205
131	NC_011567	ATTGCG	2	12	386706	386717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638209
132	NC_011567	TTGCGA	2	12	386884	386895	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638209
133	NC_011567	ATTGTG	2	12	387367	387378	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212638210
134	NC_011567	ACGAAG	2	12	387941	387952	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	212638210
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137	NC_011567	GGTGTT	2	12	394111	394122	0 %	50 %	50 %	0 %	212638212
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139	NC_011567	GCTTAA	2	12	408436	408447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638221
140	NC_011567	ATTTAA	2	12	408639	408650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011567	TTTGAT	2	12	410337	410348	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	212638222
142	NC_011567	ATGATC	2	12	410422	410433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638222
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149	NC_011567	GTACGA	2	12	429278	429289	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212638239
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152	NC_011567	TGCTCA	2	12	437222	437233	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212638245
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159	NC_011567	GAAAAA	2	12	463973	463984	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_011567	ACATTT	2	12	477042	477053	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	212638291
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212	NC_011567	CTAGGA	2	12	596853	596864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212638398
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214	NC_011567	AGATGA	2	12	599557	599568	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212638402
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219	NC_011567	CGAAAA	2	12	612909	612920	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212638413
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224	NC_011567	ATGGAA	2	12	625523	625534	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
225	NC_011567	ATTAAC	2	12	627718	627729	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	212638427
226	NC_011567	TGAAAG	2	12	635468	635479	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212638437
227	NC_011567	ATTGTC	2	12	636874	636885	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212638437
228	NC_011567	ATTTTT	2	12	644491	644502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_011567	AGTAGA	2	12	644570	644581	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212638445
230	NC_011567	GCTTGA	2	12	647001	647012	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638446
231	NC_011567	GGAAAA	2	12	650994	651005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212638448
232	NC_011567	TTGACG	2	12	651006	651017	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638448
233	NC_011567	ATATTC	2	12	651124	651135	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	212638448
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239	NC_011567	GCTTGG	2	12	661721	661732	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	212638460
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345	NC_011567	AAATCG	2	12	906430	906441	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212638731
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447	NC_011567	AACAGA	2	12	1116705	1116716	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212638970
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454	NC_011567	TAGAAG	2	12	1123678	1123689	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212638977
455	NC_011567	CTTTTT	2	12	1129922	1129933	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
456	NC_011567	CGCCAT	2	12	1129943	1129954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
457	NC_011567	TGCGCT	2	12	1131440	1131451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212638988
458	NC_011567	TTTTCA	2	12	1134927	1134938	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	212638992
459	NC_011567	TTGCTC	2	12	1136114	1136125	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212638994
460	NC_011567	ATCGCA	2	12	1137162	1137173	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212638995
461	NC_011567	CGGGAG	2	12	1140079	1140090	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	212638998
462	NC_011567	ACAGAA	2	12	1144622	1144633	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212639001
463	NC_011567	CATCGT	2	12	1145525	1145536	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212639002
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480	NC_011567	TTGTGG	2	12	1184948	1184959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
481	NC_011567	TGTAAA	2	12	1186541	1186552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_011567	GAGAAA	2	12	1209801	1209812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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