MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL320

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011314	AT	3	6	158	163	50 %	50 %	0 %	0 %	209967945
2	NC_011314	CT	3	6	386	391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011314	AT	3	6	944	949	50 %	50 %	0 %	0 %	209967946
4	NC_011314	AT	3	6	1129	1134	50 %	50 %	0 %	0 %	209967946
5	NC_011314	CA	3	6	1713	1718	50 %	0 %	0 %	50 %	209967947
6	NC_011314	CT	3	6	2289	2294	0 %	50 %	0 %	50 %	209967948
7	NC_011314	AG	3	6	2510	2515	50 %	0 %	50 %	0 %	209967949
8	NC_011314	CT	3	6	2787	2792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011314	CT	3	6	2890	2895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011314	TC	3	6	3074	3079	0 %	50 %	0 %	50 %	209967950
11	NC_011314	CA	3	6	6404	6409	50 %	0 %	0 %	50 %	209967955
12	NC_011314	TA	4	8	6654	6661	50 %	50 %	0 %	0 %	209967955
13	NC_011314	AG	3	6	6851	6856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011314	TA	3	6	7226	7231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011314	GC	3	6	7809	7814	0 %	0 %	50 %	50 %	209967956
16	NC_011314	AG	3	6	8297	8302	50 %	0 %	50 %	0 %	209967956
17	NC_011314	AC	3	6	8615	8620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011314	GC	3	6	9643	9648	0 %	0 %	50 %	50 %	209967958
19	NC_011314	GT	3	6	10388	10393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011314	TA	3	6	10436	10441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011314	AT	3	6	10738	10743	50 %	50 %	0 %	0 %	209967960
22	NC_011314	CA	3	6	10831	10836	50 %	0 %	0 %	50 %	209967960
23	NC_011314	AT	3	6	11629	11634	50 %	50 %	0 %	0 %	209967961
24	NC_011314	TA	4	8	12917	12924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011314	TC	3	6	13575	13580	0 %	50 %	0 %	50 %	209967962
26	NC_011314	TA	3	6	14228	14233	50 %	50 %	0 %	0 %	209967963
27	NC_011314	TA	3	6	14698	14703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011314	TG	3	6	14986	14991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011314	TA	3	6	15558	15563	50 %	50 %	0 %	0 %	209967965
30	NC_011314	TA	3	6	15670	15675	50 %	50 %	0 %	0 %	209967965
31	NC_011314	AT	3	6	16566	16571	50 %	50 %	0 %	0 %	209967966
32	NC_011314	AC	3	6	16640	16645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011314	CT	3	6	18169	18174	0 %	50 %	0 %	50 %	209967967
34	NC_011314	AC	3	6	18629	18634	50 %	0 %	0 %	50 %	209967967
35	NC_011314	CA	3	6	18711	18716	50 %	0 %	0 %	50 %	209967967
36	NC_011314	CT	3	6	19478	19483	0 %	50 %	0 %	50 %	209967967
37	NC_011314	AT	3	6	19946	19951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011314	TA	3	6	19960	19965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011314	AT	3	6	22116	22121	50 %	50 %	0 %	0 %	209967968
40	NC_011314	TA	3	6	22708	22713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011314	AT	3	6	22724	22729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011314	TA	3	6	23556	23561	50 %	50 %	0 %	0 %	209967969
43	NC_011314	AT	3	6	23743	23748	50 %	50 %	0 %	0 %	209967969
44	NC_011314	CT	3	6	24302	24307	0 %	50 %	0 %	50 %	209967970
45	NC_011314	TA	3	6	25483	25488	50 %	50 %	0 %	0 %	209967971
46	NC_011314	GA	3	6	26038	26043	50 %	0 %	50 %	0 %	209967972
47	NC_011314	CA	3	6	26220	26225	50 %	0 %	0 %	50 %	209967972
48	NC_011314	AT	3	6	26454	26459	50 %	50 %	0 %	0 %	209967972
49	NC_011314	AT	3	6	26928	26933	50 %	50 %	0 %	0 %	209967972
50	NC_011314	CG	3	6	27542	27547	0 %	0 %	50 %	50 %	209967973
51	NC_011314	AT	3	6	27914	27919	50 %	50 %	0 %	0 %	209967973
52	NC_011314	CT	3	6	28625	28630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011314	AT	3	6	29197	29202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.