MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 25879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011313	GTGTT	2	10	166378	166387	0 %	60 %	40 %	0 %	209808967
3502	NC_011313	TTC	2	6	166413	166418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808967
3503	NC_011313	AGA	2	6	166505	166510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808967
3504	NC_011313	GTG	2	6	166528	166533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808967
3505	NC_011313	AAG	2	6	166570	166575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808967
3506	NC_011313	TTA	2	6	166582	166587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808967
3507	NC_011313	ATG	2	6	166690	166695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808967
3508	NC_011313	AAG	2	6	166745	166750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808967
3509	NC_011313	CGT	3	9	166763	166771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808967
3510	NC_011313	TAAAG	2	10	166836	166845	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_011313	TTG	2	6	166852	166857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_011313	TAT	2	6	166865	166870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_011313	T	6	6	166906	166911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_011313	AG	3	6	166919	166924	50 %	0 %	50 %	0 %	209808968
3515	NC_011313	T	6	6	166933	166938	0 %	100 %	0 %	0 %	209808968
3516	NC_011313	ATTA	2	8	166976	166983	50 %	50 %	0 %	0 %	209808968
3517	NC_011313	AAT	2	6	166995	167000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808968
3518	NC_011313	CAG	2	6	167004	167009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808968
3519	NC_011313	ATA	2	6	167011	167016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808968
3520	NC_011313	A	8	8	167176	167183	100 %	0 %	0 %	0 %	209808968
3521	NC_011313	TTA	2	6	167209	167214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808968
3522	NC_011313	AAC	2	6	167238	167243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808968
3523	NC_011313	TCTT	2	8	167285	167292	0 %	75 %	0 %	25 %	209808968
3524	NC_011313	ATTT	2	8	167359	167366	25 %	75 %	0 %	0 %	209808968
3525	NC_011313	GTT	2	6	167376	167381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808968
3526	NC_011313	ATCAG	2	10	167408	167417	40 %	20 %	20 %	20 %	209808968
3527	NC_011313	TGGT	2	8	167428	167435	0 %	50 %	50 %	0 %	209808968
3528	NC_011313	AT	3	6	167482	167487	50 %	50 %	0 %	0 %	209808968
3529	NC_011313	ATC	2	6	167495	167500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808968
3530	NC_011313	GCC	2	6	167569	167574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209808968
3531	NC_011313	T	6	6	167634	167639	0 %	100 %	0 %	0 %	209808968
3532	NC_011313	CAC	2	6	167655	167660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808968
3533	NC_011313	A	7	7	167684	167690	100 %	0 %	0 %	0 %	209808968
3534	NC_011313	TTTTA	2	10	167705	167714	20 %	80 %	0 %	0 %	209808968
3535	NC_011313	TAT	2	6	167762	167767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808968
3536	NC_011313	TTTTA	2	10	167771	167780	20 %	80 %	0 %	0 %	209808968
3537	NC_011313	TGG	2	6	167791	167796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808968
3538	NC_011313	TTA	2	6	167802	167807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808968
3539	NC_011313	TAT	2	6	167824	167829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808968
3540	NC_011313	ATT	2	6	167854	167859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808968
3541	NC_011313	ATG	2	6	167875	167880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808968
3542	NC_011313	TCG	2	6	167900	167905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808968
3543	NC_011313	A	7	7	167914	167920	100 %	0 %	0 %	0 %	209808968
3544	NC_011313	TTTG	2	8	167975	167982	0 %	75 %	25 %	0 %	209808968
3545	NC_011313	ATT	2	6	167989	167994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808968
3546	NC_011313	CA	3	6	168070	168075	50 %	0 %	0 %	50 %	209808968
3547	NC_011313	TCAC	2	8	168076	168083	25 %	25 %	0 %	50 %	209808968
3548	NC_011313	GGT	2	6	168105	168110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808968
3549	NC_011313	ACCAA	2	10	168131	168140	60 %	0 %	0 %	40 %	209808968
3550	NC_011313	CAA	2	6	168147	168152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808968
3551	NC_011313	AGATA	2	10	168179	168188	60 %	20 %	20 %	0 %	209808968
3552	NC_011313	A	6	6	168321	168326	100 %	0 %	0 %	0 %	209808968
3553	NC_011313	TG	3	6	168339	168344	0 %	50 %	50 %	0 %	209808968
3554	NC_011313	T	6	6	168366	168371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_011313	T	7	7	168403	168409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_011313	ATT	2	6	168449	168454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_011313	A	7	7	168482	168488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_011313	TAT	2	6	168538	168543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_011313	ATA	2	6	168564	168569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_011313	TTTA	2	8	168578	168585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_011313	AAT	2	6	168586	168591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_011313	T	6	6	168618	168623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_011313	T	6	6	168638	168643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_011313	TTG	2	6	168706	168711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808969
3565	NC_011313	TATG	2	8	168734	168741	25 %	50 %	25 %	0 %	209808969
3566	NC_011313	AAGT	2	8	168775	168782	50 %	25 %	25 %	0 %	209808969
3567	NC_011313	CAT	2	6	168787	168792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808969
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3569	NC_011313	TTATC	2	10	168883	168892	20 %	60 %	0 %	20 %	209808969
3570	NC_011313	TTG	2	6	168910	168915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808969
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3572	NC_011313	ATT	2	6	168929	168934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808969
3573	NC_011313	TTG	2	6	168958	168963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808969
3574	NC_011313	CTG	2	6	168994	168999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808969
3575	NC_011313	ATG	2	6	169080	169085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808969
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3577	NC_011313	GGT	2	6	169113	169118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808969
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3579	NC_011313	TATT	2	8	169152	169159	25 %	75 %	0 %	0 %	209808969
3580	NC_011313	TGA	2	6	169183	169188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808969
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3583	NC_011313	AAATTA	2	12	169371	169382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808969
3584	NC_011313	AGCTGG	2	12	169433	169444	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209808969
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3586	NC_011313	CACT	2	8	169564	169571	25 %	25 %	0 %	50 %	209808969
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3588	NC_011313	GCTGT	2	10	169584	169593	0 %	40 %	40 %	20 %	209808969
3589	NC_011313	TATTT	2	10	169610	169619	20 %	80 %	0 %	0 %	209808969
3590	NC_011313	CTG	2	6	169621	169626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808969
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3595	NC_011313	GCA	2	6	169725	169730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808969
3596	NC_011313	TTA	2	6	169788	169793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808969
3597	NC_011313	ACC	2	6	169826	169831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808969
3598	NC_011313	TAA	2	6	169882	169887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_011313	A	6	6	169886	169891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_011313	T	6	6	169919	169924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_011313	CTA	2	6	169966	169971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_011313	TTTA	2	8	169972	169979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_011313	TGC	2	6	170055	170060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808970
3604	NC_011313	CTTG	2	8	170123	170130	0 %	50 %	25 %	25 %	209808970
3605	NC_011313	CCG	2	6	170197	170202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209808970
3606	NC_011313	GTT	2	6	170237	170242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808970
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3608	NC_011313	TGTT	2	8	170318	170325	0 %	75 %	25 %	0 %	209808970
3609	NC_011313	TTG	2	6	170332	170337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808970
3610	NC_011313	T	6	6	170358	170363	0 %	100 %	0 %	0 %	209808970
3611	NC_011313	GTGAAC	2	12	170391	170402	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209808970
3612	NC_011313	AG	3	6	170443	170448	50 %	0 %	50 %	0 %	209808970
3613	NC_011313	TTA	2	6	170503	170508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808970
3614	NC_011313	ATCACG	2	12	170529	170540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209808970
3615	NC_011313	TCA	2	6	170593	170598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808970
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3619	NC_011313	TCT	2	6	170749	170754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808970
3620	NC_011313	ATT	2	6	170772	170777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808970
3621	NC_011313	ATG	2	6	170779	170784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808970
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3623	NC_011313	ACC	2	6	171048	171053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808970
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4000	NC_011313	CA	3	6	189044	189049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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