MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 25879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011313	GAT	2	6	142028	142033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808942
3002	NC_011313	TAAGG	2	10	142201	142210	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_011313	A	6	6	142246	142251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_011313	T	7	7	142271	142277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_011313	TTA	2	6	142365	142370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808943
3006	NC_011313	TGC	2	6	142371	142376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808943
3007	NC_011313	CTGA	2	8	142385	142392	25 %	25 %	25 %	25 %	209808943
3008	NC_011313	GAC	2	6	142454	142459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808943
3009	NC_011313	ACG	3	9	142590	142598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808943
3010	NC_011313	A	6	6	142606	142611	100 %	0 %	0 %	0 %	209808943
3011	NC_011313	GTA	2	6	142614	142619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808943
3012	NC_011313	ATC	2	6	142624	142629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808943
3013	NC_011313	CTA	2	6	142655	142660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808943
3014	NC_011313	ATC	2	6	142669	142674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808943
3015	NC_011313	TCT	2	6	142675	142680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808943
3016	NC_011313	CTGT	2	8	142696	142703	0 %	50 %	25 %	25 %	209808943
3017	NC_011313	AAT	2	6	142724	142729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808943
3018	NC_011313	TCG	2	6	142817	142822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808943
3019	NC_011313	ATT	2	6	142830	142835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808943
3020	NC_011313	ACG	2	6	142863	142868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808943
3021	NC_011313	TTA	2	6	142906	142911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808943
3022	NC_011313	TTC	2	6	142926	142931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808943
3023	NC_011313	ATA	2	6	142950	142955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808943
3024	NC_011313	CAA	2	6	142990	142995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808943
3025	NC_011313	CAG	2	6	143166	143171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808943
3026	NC_011313	GCA	2	6	143179	143184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808943
3027	NC_011313	AAT	2	6	143191	143196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808943
3028	NC_011313	TGT	2	6	143290	143295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808943
3029	NC_011313	AT	3	6	143368	143373	50 %	50 %	0 %	0 %	209808943
3030	NC_011313	CAA	2	6	143398	143403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808943
3031	NC_011313	TTA	2	6	143491	143496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808943
3032	NC_011313	GAA	2	6	143498	143503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808943
3033	NC_011313	AAT	2	6	143530	143535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808943
3034	NC_011313	CAA	2	6	143587	143592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_011313	ATG	2	6	143655	143660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_011313	ATTAC	2	10	143748	143757	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3037	NC_011313	ATT	2	6	143763	143768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_011313	ACAA	2	8	143804	143811	75 %	0 %	0 %	25 %	209808944
3039	NC_011313	CAG	2	6	143922	143927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808944
3040	NC_011313	ATG	2	6	143966	143971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808944
3041	NC_011313	T	6	6	143975	143980	0 %	100 %	0 %	0 %	209808944
3042	NC_011313	GTT	2	6	144223	144228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808944
3043	NC_011313	TTA	2	6	144232	144237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808944
3044	NC_011313	CATT	2	8	144281	144288	25 %	50 %	0 %	25 %	209808944
3045	NC_011313	T	6	6	144313	144318	0 %	100 %	0 %	0 %	209808944
3046	NC_011313	GT	3	6	144329	144334	0 %	50 %	50 %	0 %	209808944
3047	NC_011313	A	7	7	144349	144355	100 %	0 %	0 %	0 %	209808944
3048	NC_011313	TGA	2	6	144362	144367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808944
3049	NC_011313	CT	3	6	144478	144483	0 %	50 %	0 %	50 %	209808945
3050	NC_011313	TGC	2	6	144504	144509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808945
3051	NC_011313	CGA	2	6	144590	144595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808945
3052	NC_011313	ACC	2	6	144601	144606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808945
3053	NC_011313	CG	3	6	144612	144617	0 %	0 %	50 %	50 %	209808945
3054	NC_011313	GGTA	2	8	144681	144688	25 %	25 %	50 %	0 %	209808945
3055	NC_011313	AAG	2	6	144711	144716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808945
3056	NC_011313	TGG	2	6	144718	144723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808945
3057	NC_011313	GTCG	2	8	144730	144737	0 %	25 %	50 %	25 %	209808945
3058	NC_011313	CAG	2	6	144782	144787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808945
3059	NC_011313	GAC	2	6	144817	144822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808945
3060	NC_011313	TGG	2	6	144882	144887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808945
3061	NC_011313	ATT	2	6	144893	144898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808945
3062	NC_011313	A	6	6	144905	144910	100 %	0 %	0 %	0 %	209808945
3063	NC_011313	AAT	2	6	145040	145045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808946
3064	NC_011313	TAAAG	2	10	145052	145061	60 %	20 %	20 %	0 %	209808946
3065	NC_011313	GCA	2	6	145086	145091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808946
3066	NC_011313	GGT	2	6	145167	145172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808946
3067	NC_011313	GGCA	2	8	145229	145236	25 %	0 %	50 %	25 %	209808946
3068	NC_011313	AGT	2	6	145250	145255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808946
3069	NC_011313	CGT	2	6	145305	145310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808946
3070	NC_011313	GAA	3	9	145332	145340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808946
3071	NC_011313	TAA	2	6	145361	145366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808946
3072	NC_011313	ACA	2	6	145533	145538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808946
3073	NC_011313	ATA	2	6	145555	145560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808946
3074	NC_011313	AC	3	6	145584	145589	50 %	0 %	0 %	50 %	209808946
3075	NC_011313	TTC	2	6	145629	145634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808946
3076	NC_011313	CGG	2	6	145663	145668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808946
3077	NC_011313	ATC	2	6	145699	145704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808946
3078	NC_011313	AGTG	2	8	145721	145728	25 %	25 %	50 %	0 %	209808946
3079	NC_011313	TGA	2	6	145777	145782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808946
3080	NC_011313	ACC	2	6	145810	145815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808946
3081	NC_011313	CAAG	2	8	145827	145834	50 %	0 %	25 %	25 %	209808946
3082	NC_011313	ACT	2	6	145862	145867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808946
3083	NC_011313	AAT	2	6	145870	145875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808946
3084	NC_011313	CAC	2	6	145884	145889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_011313	GGTG	2	8	145900	145907	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_011313	T	6	6	145912	145917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_011313	TCT	2	6	145965	145970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808947
3088	NC_011313	CTT	2	6	145971	145976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808947
3089	NC_011313	T	6	6	145975	145980	0 %	100 %	0 %	0 %	209808947
3090	NC_011313	GAATC	2	10	146025	146034	40 %	20 %	20 %	20 %	209808947
3091	NC_011313	GCA	2	6	146065	146070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808947
3092	NC_011313	ATG	2	6	146083	146088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808947
3093	NC_011313	TACGAT	2	12	146097	146108	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209808947
3094	NC_011313	CAC	2	6	146129	146134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808947
3095	NC_011313	TGT	2	6	146225	146230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808947
3096	NC_011313	ATT	2	6	146249	146254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808947
3097	NC_011313	ATT	2	6	146306	146311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808948
3098	NC_011313	GGT	2	6	146332	146337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808948
3099	NC_011313	ATC	2	6	146349	146354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808948
3100	NC_011313	GAA	2	6	146456	146461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808948
3101	NC_011313	AGA	2	6	146488	146493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808948
3102	NC_011313	GCA	2	6	146587	146592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808948
3103	NC_011313	A	6	6	146627	146632	100 %	0 %	0 %	0 %	209808948
3104	NC_011313	TCAT	2	8	146645	146652	25 %	50 %	0 %	25 %	209808948
3105	NC_011313	GAT	2	6	146669	146674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808948
3106	NC_011313	ATAA	2	8	146822	146829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_011313	ATG	2	6	146832	146837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808949
3108	NC_011313	TACG	2	8	146850	146857	25 %	25 %	25 %	25 %	209808949
3109	NC_011313	GCTTA	2	10	146870	146879	20 %	40 %	20 %	20 %	209808949
3110	NC_011313	CT	3	6	146880	146885	0 %	50 %	0 %	50 %	209808949
3111	NC_011313	TTA	2	6	146948	146953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808949
3112	NC_011313	AGT	2	6	146969	146974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808949
3113	NC_011313	TTC	2	6	146992	146997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808949
3114	NC_011313	ATT	2	6	147028	147033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808949
3115	NC_011313	CCAA	2	8	147038	147045	50 %	0 %	0 %	50 %	209808949
3116	NC_011313	TAAA	2	8	147061	147068	75 %	25 %	0 %	0 %	209808949
3117	NC_011313	TTG	2	6	147079	147084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808949
3118	NC_011313	ATG	2	6	147100	147105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808949
3119	NC_011313	GCG	2	6	147126	147131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808949
3120	NC_011313	ACA	2	6	147136	147141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808949
3121	NC_011313	GTT	2	6	147179	147184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808949
3122	NC_011313	CA	4	8	147226	147233	50 %	0 %	0 %	50 %	209808949
3123	NC_011313	TCTA	2	8	147242	147249	25 %	50 %	0 %	25 %	209808949
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