MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 25879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011313	GCA	2	6	118046	118051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_011313	AGT	2	6	118058	118063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_011313	GGT	2	6	118134	118139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_011313	AAG	2	6	118192	118197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_011313	ATT	2	6	118211	118216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_011313	TGC	2	6	118265	118270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_011313	ATT	2	6	118296	118301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_011313	ATC	2	6	118317	118322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_011313	ATTA	2	8	118340	118347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_011313	GTT	2	6	118348	118353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_011313	TAT	2	6	118354	118359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_011313	TTG	2	6	118372	118377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_011313	AAG	2	6	118385	118390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_011313	ATA	2	6	118597	118602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808924
2515	NC_011313	ATC	2	6	118695	118700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808924
2516	NC_011313	TTA	2	6	118791	118796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808924
2517	NC_011313	ATCA	2	8	118804	118811	50 %	25 %	0 %	25 %	209808924
2518	NC_011313	CCA	2	6	118833	118838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808925
2519	NC_011313	TTG	2	6	118896	118901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808925
2520	NC_011313	ATAA	2	8	119054	119061	75 %	25 %	0 %	0 %	209808925
2521	NC_011313	AGC	2	6	119082	119087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808925
2522	NC_011313	AAC	2	6	119146	119151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808925
2523	NC_011313	AGG	2	6	119182	119187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_011313	GATT	2	8	119193	119200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_011313	TAT	2	6	119206	119211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_011313	TA	3	6	119215	119220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_011313	ATT	2	6	119283	119288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_011313	AT	3	6	119331	119336	50 %	50 %	0 %	0 %	209808926
2529	NC_011313	GAT	2	6	119348	119353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808926
2530	NC_011313	TTG	2	6	119391	119396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808926
2531	NC_011313	GA	3	6	119405	119410	50 %	0 %	50 %	0 %	209808926
2532	NC_011313	GTCA	2	8	119421	119428	25 %	25 %	25 %	25 %	209808926
2533	NC_011313	CTA	2	6	119436	119441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808926
2534	NC_011313	TCA	2	6	119470	119475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808926
2535	NC_011313	TCA	2	6	119518	119523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808926
2536	NC_011313	GCCTA	2	10	119581	119590	20 %	20 %	20 %	40 %	209808926
2537	NC_011313	TG	3	6	119601	119606	0 %	50 %	50 %	0 %	209808926
2538	NC_011313	TTG	2	6	119649	119654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808926
2539	NC_011313	ATT	2	6	119795	119800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808926
2540	NC_011313	TGAG	2	8	119910	119917	25 %	25 %	50 %	0 %	209808926
2541	NC_011313	A	6	6	119959	119964	100 %	0 %	0 %	0 %	209808926
2542	NC_011313	GAA	2	6	120046	120051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808926
2543	NC_011313	TC	3	6	120054	120059	0 %	50 %	0 %	50 %	209808926
2544	NC_011313	A	7	7	120136	120142	100 %	0 %	0 %	0 %	209808926
2545	NC_011313	TA	3	6	120222	120227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_011313	ATAAA	2	10	120244	120253	80 %	20 %	0 %	0 %	209808927
2547	NC_011313	AAAT	2	8	120305	120312	75 %	25 %	0 %	0 %	209808927
2548	NC_011313	TCT	2	6	120320	120325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808927
2549	NC_011313	GGCT	2	8	120337	120344	0 %	25 %	50 %	25 %	209808927
2550	NC_011313	GACTC	2	10	120378	120387	20 %	20 %	20 %	40 %	209808927
2551	NC_011313	AGA	3	9	120410	120418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808927
2552	NC_011313	ATC	2	6	120420	120425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808927
2553	NC_011313	ATG	2	6	120433	120438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808927
2554	NC_011313	AC	3	6	120439	120444	50 %	0 %	0 %	50 %	209808927
2555	NC_011313	TTA	2	6	120511	120516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808927
2556	NC_011313	ATGC	2	8	120561	120568	25 %	25 %	25 %	25 %	209808927
2557	NC_011313	A	7	7	120664	120670	100 %	0 %	0 %	0 %	209808927
2558	NC_011313	ATT	2	6	120756	120761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808927
2559	NC_011313	ATT	2	6	120828	120833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808927
2560	NC_011313	TAA	2	6	120859	120864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808927
2561	NC_011313	TAA	2	6	120890	120895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808927
2562	NC_011313	AAC	2	6	120919	120924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808927
2563	NC_011313	TGA	2	6	120938	120943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808927
2564	NC_011313	AAC	2	6	120944	120949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808927
2565	NC_011313	CACG	2	8	121179	121186	25 %	0 %	25 %	50 %	209808927
2566	NC_011313	CGA	2	6	121188	121193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808927
2567	NC_011313	TTA	2	6	121287	121292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808927
2568	NC_011313	CAGA	2	8	121329	121336	50 %	0 %	25 %	25 %	209808927
2569	NC_011313	TGA	2	6	121466	121471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808927
2570	NC_011313	AGCG	2	8	121504	121511	25 %	0 %	50 %	25 %	209808927
2571	NC_011313	GTAA	2	8	121839	121846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_011313	TAA	2	6	121850	121855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_011313	GAA	2	6	121856	121861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_011313	TGT	2	6	121885	121890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_011313	A	8	8	121929	121936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_011313	GAAT	2	8	121964	121971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_011313	TTA	2	6	121979	121984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_011313	TGA	2	6	122015	122020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_011313	ATT	2	6	122096	122101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_011313	TCA	2	6	122109	122114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_011313	AAT	2	6	122119	122124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_011313	ATAA	2	8	122250	122257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_011313	GC	3	6	122378	122383	0 %	0 %	50 %	50 %	209808928
2584	NC_011313	CTT	2	6	122395	122400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808928
2585	NC_011313	CA	3	6	122424	122429	50 %	0 %	0 %	50 %	209808928
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2587	NC_011313	TCTG	2	8	122463	122470	0 %	50 %	25 %	25 %	209808928
2588	NC_011313	T	6	6	122498	122503	0 %	100 %	0 %	0 %	209808928
2589	NC_011313	ATT	2	6	122516	122521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808928
2590	NC_011313	ATA	2	6	122530	122535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808928
2591	NC_011313	ATT	2	6	122556	122561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808928
2592	NC_011313	ATA	2	6	122783	122788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808928
2593	NC_011313	CCG	2	6	122791	122796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209808928
2594	NC_011313	GAGT	2	8	122810	122817	25 %	25 %	50 %	0 %	209808928
2595	NC_011313	A	6	6	122862	122867	100 %	0 %	0 %	0 %	209808928
2596	NC_011313	GAT	2	6	122898	122903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808928
2597	NC_011313	ATC	2	6	122945	122950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808928
2598	NC_011313	ACC	2	6	122996	123001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808928
2599	NC_011313	TGA	2	6	123045	123050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808928
2600	NC_011313	TCT	2	6	123066	123071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808928
2601	NC_011313	AC	3	6	123295	123300	50 %	0 %	0 %	50 %	209808928
2602	NC_011313	TTG	2	6	123338	123343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808928
2603	NC_011313	GTG	2	6	123399	123404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808928
2604	NC_011313	ATA	2	6	123495	123500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_011313	ATA	2	6	123514	123519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_011313	AG	3	6	123521	123526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_011313	AAT	2	6	123568	123573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_011313	ATA	2	6	123679	123684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808929
2609	NC_011313	TAATA	2	10	123727	123736	60 %	40 %	0 %	0 %	209808929
2610	NC_011313	GTTT	2	8	123788	123795	0 %	75 %	25 %	0 %	209808929
2611	NC_011313	GTT	2	6	123852	123857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808929
2612	NC_011313	A	6	6	123860	123865	100 %	0 %	0 %	0 %	209808929
2613	NC_011313	TTA	2	6	123900	123905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_011313	TTTTA	2	10	123910	123919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_011313	TAGAT	2	10	124032	124041	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_011313	AAC	2	6	124054	124059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_011313	ACT	2	6	124068	124073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_011313	T	6	6	124079	124084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_011313	TC	3	6	124095	124100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2620	NC_011313	T	6	6	124112	124117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_011313	T	8	8	124139	124146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_011313	TAAA	2	8	124153	124160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_011313	CTTT	2	8	124186	124193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2624	NC_011313	ATT	2	6	124200	124205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_011313	AGT	2	6	124218	124223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_011313	AT	3	6	124508	124513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_011313	TAAT	2	8	124527	124534	50 %	50 %	0 %	0 %	209808930
2628	NC_011313	TAA	2	6	124586	124591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808930
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2659	NC_011313	TAA	2	6	125838	125843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2740	NC_011313	T	7	7	129432	129438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2752	NC_011313	CTGT	2	8	129857	129864	0 %	50 %	25 %	25 %	209808934
2753	NC_011313	AAT	2	6	129885	129890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808934
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2999	NC_011313	TTA	2	6	141934	141939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808942
3000	NC_011313	TCA	3	9	141973	141981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808942

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