MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 25879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011313	ATT	2	6	23425	23430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
502	NC_011313	CGGATG	2	12	23483	23494	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209808861
503	NC_011313	G	6	6	23505	23510	0 %	0 %	100 %	0 %	209808861
504	NC_011313	ATA	2	6	23561	23566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808861
505	NC_011313	GAT	2	6	23662	23667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
506	NC_011313	CCA	2	6	23696	23701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808861
507	NC_011313	GTG	2	6	23707	23712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808861
508	NC_011313	ACTC	2	8	23749	23756	25 %	25 %	0 %	50 %	209808861
509	NC_011313	ATT	2	6	23764	23769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
510	NC_011313	CGGATG	2	12	23822	23833	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209808861
511	NC_011313	ATA	2	6	23900	23905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808861
512	NC_011313	GAT	2	6	24001	24006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
513	NC_011313	CCA	2	6	24035	24040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808861
514	NC_011313	GTG	2	6	24046	24051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808861
515	NC_011313	ACTC	2	8	24088	24095	25 %	25 %	0 %	50 %	209808861
516	NC_011313	ATT	2	6	24103	24108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
517	NC_011313	CGGATG	2	12	24161	24172	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209808861
518	NC_011313	ATA	2	6	24239	24244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808861
519	NC_011313	GAT	2	6	24340	24345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
520	NC_011313	CCA	2	6	24374	24379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808861
521	NC_011313	GTG	2	6	24385	24390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808861
522	NC_011313	ATT	2	6	24442	24447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
523	NC_011313	CGGATG	2	12	24500	24511	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209808861
524	NC_011313	ATA	2	6	24578	24583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808861
525	NC_011313	GCA	2	6	24598	24603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808861
526	NC_011313	ATT	2	6	24622	24627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
527	NC_011313	GCG	2	6	24676	24681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808861
528	NC_011313	GTG	2	6	24724	24729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808861
529	NC_011313	ACTC	2	8	24766	24773	25 %	25 %	0 %	50 %	209808861
530	NC_011313	ATT	2	6	24781	24786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
531	NC_011313	CGGATG	2	12	24839	24850	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209808861
532	NC_011313	GGC	2	6	24865	24870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808861
533	NC_011313	ATA	2	6	24917	24922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808861
534	NC_011313	GCG	2	6	25015	25020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808861
535	NC_011313	CCA	2	6	25052	25057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808861
536	NC_011313	GTG	2	6	25063	25068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808861
537	NC_011313	ATT	2	6	25120	25125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
538	NC_011313	CGGATG	2	12	25178	25189	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209808861
539	NC_011313	GGC	2	6	25204	25209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808861
540	NC_011313	ATA	2	6	25256	25261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808861
541	NC_011313	GAT	2	6	25357	25362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
542	NC_011313	CCA	2	6	25391	25396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808861
543	NC_011313	GTG	2	6	25402	25407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808861
544	NC_011313	ATT	2	6	25459	25464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
545	NC_011313	CGGATG	2	12	25517	25528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209808861
546	NC_011313	GGC	2	6	25543	25548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808861
547	NC_011313	ATA	2	6	25595	25600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808861
548	NC_011313	GAT	2	6	25696	25701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
549	NC_011313	CCA	2	6	25730	25735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808861
550	NC_011313	GTG	2	6	25741	25746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808861
551	NC_011313	ACG	2	6	25774	25779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808861
552	NC_011313	GCG	3	9	25880	25888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808861
553	NC_011313	ATA	2	6	25934	25939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808861
554	NC_011313	GCA	2	6	25954	25959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808861
555	NC_011313	CGG	2	6	26033	26038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808861
556	NC_011313	ATTT	2	8	26051	26058	25 %	75 %	0 %	0 %	209808861
557	NC_011313	CCA	2	6	26069	26074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808861
558	NC_011313	GTG	2	6	26080	26085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808861
559	NC_011313	ACTC	2	8	26122	26129	25 %	25 %	0 %	50 %	209808861
560	NC_011313	ATT	2	6	26137	26142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
561	NC_011313	CGGATG	2	12	26195	26206	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209808861
562	NC_011313	GGC	2	6	26221	26226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808861
563	NC_011313	ATA	2	6	26273	26278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808861
564	NC_011313	GCA	2	6	26293	26298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808861
565	NC_011313	ATT	2	6	26317	26322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
566	NC_011313	CCA	2	6	26408	26413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808861
567	NC_011313	GTG	2	6	26419	26424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808861
568	NC_011313	GAA	2	6	26455	26460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808861
569	NC_011313	TGA	2	6	26541	26546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
570	NC_011313	GAT	2	6	26584	26589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
571	NC_011313	ATT	2	6	26603	26608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
572	NC_011313	TAT	2	6	26649	26654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
573	NC_011313	TGA	2	6	26661	26666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
574	NC_011313	ATG	2	6	26708	26713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
575	NC_011313	AT	3	6	26729	26734	50 %	50 %	0 %	0 %	209808861
576	NC_011313	GGT	2	6	26823	26828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808861
577	NC_011313	ATT	2	6	26831	26836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
578	NC_011313	GAT	2	6	26875	26880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
579	NC_011313	TGA	2	6	26901	26906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
580	NC_011313	TGA	2	6	26925	26930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
581	NC_011313	AAT	2	6	26932	26937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808861
582	NC_011313	ACT	2	6	26939	26944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808861
583	NC_011313	TGG	2	6	26955	26960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808861
584	NC_011313	ATG	3	9	27020	27028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
585	NC_011313	AATG	2	8	27048	27055	50 %	25 %	25 %	0 %	209808861
586	NC_011313	CATT	2	8	27068	27075	25 %	50 %	0 %	25 %	209808861
587	NC_011313	TAA	2	6	27105	27110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808861
588	NC_011313	TGA	2	6	27117	27122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
589	NC_011313	TC	3	6	27128	27133	0 %	50 %	0 %	50 %	209808861
590	NC_011313	ATT	2	6	27166	27171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
591	NC_011313	TAT	2	6	27243	27248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
592	NC_011313	TAATT	2	10	27258	27267	40 %	60 %	0 %	0 %	209808861
593	NC_011313	ATCA	2	8	27284	27291	50 %	25 %	0 %	25 %	209808861
594	NC_011313	TTG	2	6	27329	27334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808861
595	NC_011313	TAATC	2	10	27462	27471	40 %	40 %	0 %	20 %	209808861
596	NC_011313	ATG	2	6	27539	27544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
597	NC_011313	TTG	2	6	27599	27604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808861
598	NC_011313	ATG	2	6	27689	27694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
599	NC_011313	GAT	2	6	27715	27720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
600	NC_011313	TAA	2	6	27735	27740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808861
601	NC_011313	GCTA	2	8	27762	27769	25 %	25 %	25 %	25 %	209808861
602	NC_011313	TGG	2	6	27786	27791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808861
603	NC_011313	TAC	2	6	27816	27821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808861
604	NC_011313	TAC	2	6	27847	27852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808861
605	NC_011313	CAA	2	6	27860	27865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808861
606	NC_011313	ATT	2	6	28013	28018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
607	NC_011313	TTA	2	6	28054	28059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
608	NC_011313	TTG	2	6	28076	28081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808861
609	NC_011313	GAT	2	6	28102	28107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
610	NC_011313	ATG	2	6	28124	28129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
611	NC_011313	GTT	2	6	28252	28257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808861
612	NC_011313	GTGA	2	8	28267	28274	25 %	25 %	50 %	0 %	209808861
613	NC_011313	GACA	2	8	28293	28300	50 %	0 %	25 %	25 %	209808861
614	NC_011313	TTA	2	6	28325	28330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808861
615	NC_011313	AG	3	6	28341	28346	50 %	0 %	50 %	0 %	209808861
616	NC_011313	GAT	2	6	28381	28386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808861
617	NC_011313	TCT	2	6	28388	28393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808861
618	NC_011313	GTGACG	2	12	28460	28471	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209808861
619	NC_011313	TTACT	2	10	28475	28484	20 %	60 %	0 %	20 %	209808861
620	NC_011313	ACT	2	6	28521	28526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808861
621	NC_011313	GTC	2	6	28543	28548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808861
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623	NC_011313	GAA	2	6	28633	28638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808861
624	NC_011313	AATT	2	8	28655	28662	50 %	50 %	0 %	0 %	209808861
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626	NC_011313	CTT	2	6	28764	28769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808861
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