MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 25879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011313	CGA	2	6	259455	259460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809048
5502	NC_011313	TTA	2	6	259554	259559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809048
5503	NC_011313	CAGA	2	8	259596	259603	50 %	0 %	25 %	25 %	209809048
5504	NC_011313	TGA	2	6	259733	259738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809048
5505	NC_011313	AGCG	2	8	259771	259778	25 %	0 %	50 %	25 %	209809048
5506	NC_011313	AAT	2	6	260014	260019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_011313	A	6	6	260032	260037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_011313	T	6	6	260064	260069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_011313	GAA	2	6	260072	260077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_011313	AAT	2	6	260098	260103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809049
5511	NC_011313	TCA	2	6	260107	260112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809049
5512	NC_011313	CAT	2	6	260150	260155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809049
5513	NC_011313	TGT	2	6	260167	260172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809049
5514	NC_011313	ATA	2	6	260224	260229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809049
5515	NC_011313	T	6	6	260320	260325	0 %	100 %	0 %	0 %	209809049
5516	NC_011313	TAA	2	6	260337	260342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809049
5517	NC_011313	TAA	2	6	260373	260378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809049
5518	NC_011313	T	7	7	260395	260401	0 %	100 %	0 %	0 %	209809049
5519	NC_011313	GAA	2	6	260421	260426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809049
5520	NC_011313	A	6	6	260567	260572	100 %	0 %	0 %	0 %	209809049
5521	NC_011313	T	8	8	260663	260670	0 %	100 %	0 %	0 %	209809049
5522	NC_011313	GGTT	2	8	260674	260681	0 %	50 %	50 %	0 %	209809049
5523	NC_011313	TGTA	2	8	260818	260825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_011313	TAT	2	6	260834	260839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011313	AT	3	6	260914	260919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_011313	GTTAA	2	10	260957	260966	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_011313	TATT	2	8	260991	260998	25 %	75 %	0 %	0 %	209809050
5528	NC_011313	ATA	2	6	261013	261018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809050
5529	NC_011313	GAA	2	6	261030	261035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809050
5530	NC_011313	TGG	2	6	261065	261070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809050
5531	NC_011313	TGG	2	6	261128	261133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809050
5532	NC_011313	A	6	6	261240	261245	100 %	0 %	0 %	0 %	209809050
5533	NC_011313	AGAA	2	8	261454	261461	75 %	0 %	25 %	0 %	209809050
5534	NC_011313	GAA	2	6	261558	261563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809050
5535	NC_011313	AGA	2	6	261785	261790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809050
5536	NC_011313	TCT	2	6	261845	261850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809050
5537	NC_011313	A	6	6	261852	261857	100 %	0 %	0 %	0 %	209809050
5538	NC_011313	TC	3	6	261868	261873	0 %	50 %	0 %	50 %	209809050
5539	NC_011313	CA	3	6	261897	261902	50 %	0 %	0 %	50 %	209809050
5540	NC_011313	CCA	2	6	261909	261914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809050
5541	NC_011313	ATC	2	6	261960	261965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809050
5542	NC_011313	TGG	2	6	261980	261985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809050
5543	NC_011313	GT	3	6	262103	262108	0 %	50 %	50 %	0 %	209809050
5544	NC_011313	AAG	2	6	262185	262190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809050
5545	NC_011313	GTT	2	6	262218	262223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809050
5546	NC_011313	CTA	2	6	262247	262252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809050
5547	NC_011313	TGC	2	6	262272	262277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809051
5548	NC_011313	TGA	2	6	262407	262412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809051
5549	NC_011313	TTG	2	6	262423	262428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809051
5550	NC_011313	ATT	2	6	262520	262525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809051
5551	NC_011313	T	7	7	262590	262596	0 %	100 %	0 %	0 %	209809051
5552	NC_011313	CTT	2	6	262687	262692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809051
5553	NC_011313	A	6	6	262693	262698	100 %	0 %	0 %	0 %	209809051
5554	NC_011313	ACG	2	6	262709	262714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809051
5555	NC_011313	GAT	2	6	262783	262788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809051
5556	NC_011313	CAAG	2	8	262966	262973	50 %	0 %	25 %	25 %	209809051
5557	NC_011313	AGTG	2	8	263014	263021	25 %	25 %	50 %	0 %	209809051
5558	NC_011313	AGC	2	6	263103	263108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809051
5559	NC_011313	AAG	3	9	263114	263122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809051
5560	NC_011313	AAG	2	6	263138	263143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809051
5561	NC_011313	CATT	2	8	263187	263194	25 %	50 %	0 %	25 %	209809051
5562	NC_011313	ATTGTT	2	12	263239	263250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	209809051
5563	NC_011313	TGC	2	6	263271	263276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809051
5564	NC_011313	AGCT	2	8	263342	263349	25 %	25 %	25 %	25 %	209809051
5565	NC_011313	TCGT	2	8	263450	263457	0 %	50 %	25 %	25 %	209809051
5566	NC_011313	TGG	2	6	263463	263468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809051
5567	NC_011313	TGAT	2	8	263483	263490	25 %	50 %	25 %	0 %	209809051
5568	NC_011313	GTTTTA	2	12	263519	263530	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	209809051
5569	NC_011313	CGTT	2	8	263569	263576	0 %	50 %	25 %	25 %	209809051
5570	NC_011313	TGAA	2	8	263597	263604	50 %	25 %	25 %	0 %	209809051
5571	NC_011313	ATTA	2	8	263687	263694	50 %	50 %	0 %	0 %	209809051
5572	NC_011313	CAA	2	6	263700	263705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_011313	AAGG	2	8	263717	263724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_011313	CCTTT	2	10	263731	263740	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5575	NC_011313	T	6	6	263738	263743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_011313	ATC	2	6	263755	263760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_011313	T	6	6	263855	263860	0 %	100 %	0 %	0 %	209809052
5578	NC_011313	TTG	2	6	263897	263902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809052
5579	NC_011313	ATTT	2	8	263991	263998	25 %	75 %	0 %	0 %	209809052
5580	NC_011313	TTC	2	6	264025	264030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809052
5581	NC_011313	TTA	2	6	264092	264097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809052
5582	NC_011313	TGC	2	6	264118	264123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809052
5583	NC_011313	GAAG	2	8	264140	264147	50 %	0 %	50 %	0 %	209809052
5584	NC_011313	ATT	2	6	264159	264164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809052
5585	NC_011313	CGG	2	6	264171	264176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209809052
5586	NC_011313	GAC	2	6	264202	264207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809052
5587	NC_011313	GAC	2	6	264229	264234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809052
5588	NC_011313	CAT	2	6	264265	264270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809052
5589	NC_011313	GGT	2	6	264353	264358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809052
5590	NC_011313	TG	3	6	264420	264425	0 %	50 %	50 %	0 %	209809052
5591	NC_011313	TATT	2	8	264452	264459	25 %	75 %	0 %	0 %	209809052
5592	NC_011313	CAT	2	6	264521	264526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_011313	ATA	2	6	264705	264710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809053
5594	NC_011313	ATC	2	6	264803	264808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809053
5595	NC_011313	TTA	2	6	264899	264904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809053
5596	NC_011313	ATCA	2	8	264912	264919	50 %	25 %	0 %	25 %	209809053
5597	NC_011313	CCA	2	6	264941	264946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809054
5598	NC_011313	TTG	2	6	265004	265009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809054
5599	NC_011313	ATAA	2	8	265162	265169	75 %	25 %	0 %	0 %	209809054
5600	NC_011313	AGC	2	6	265190	265195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809054
5601	NC_011313	AAC	2	6	265254	265259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809054
5602	NC_011313	AGG	2	6	265290	265295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_011313	GATT	2	8	265301	265308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_011313	TAT	2	6	265314	265319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_011313	TA	3	6	265323	265328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_011313	ATAAA	2	10	265345	265354	80 %	20 %	0 %	0 %	209809055
5607	NC_011313	AAAT	2	8	265406	265413	75 %	25 %	0 %	0 %	209809055
5608	NC_011313	TCT	2	6	265421	265426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809055
5609	NC_011313	GGCT	2	8	265438	265445	0 %	25 %	50 %	25 %	209809055
5610	NC_011313	GACTC	2	10	265479	265488	20 %	20 %	20 %	40 %	209809055
5611	NC_011313	AGA	3	9	265511	265519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809055
5612	NC_011313	ATC	2	6	265521	265526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809055
5613	NC_011313	ATG	2	6	265534	265539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809055
5614	NC_011313	AC	3	6	265540	265545	50 %	0 %	0 %	50 %	209809055
5615	NC_011313	TTA	2	6	265612	265617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809055
5616	NC_011313	ATGC	2	8	265662	265669	25 %	25 %	25 %	25 %	209809055
5617	NC_011313	A	7	7	265765	265771	100 %	0 %	0 %	0 %	209809055
5618	NC_011313	ATT	2	6	265857	265862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809055
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5621	NC_011313	TAA	2	6	265991	265996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809055
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5623	NC_011313	TGA	2	6	266039	266044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809055
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