MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 25879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011313	TCT	2	6	235173	235178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809026
5002	NC_011313	GCC	2	6	235197	235202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209809026
5003	NC_011313	ATG	2	6	235258	235263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809026
5004	NC_011313	ATG	2	6	235288	235293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809026
5005	NC_011313	TCG	2	6	235314	235319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809026
5006	NC_011313	GAC	2	6	235411	235416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809026
5007	NC_011313	CTT	2	6	235434	235439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809026
5008	NC_011313	CAT	2	6	235488	235493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809026
5009	NC_011313	GTT	2	6	235546	235551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809026
5010	NC_011313	TGGT	2	8	235616	235623	0 %	50 %	50 %	0 %	209809026
5011	NC_011313	CTA	2	6	235643	235648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809026
5012	NC_011313	TGG	2	6	235677	235682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809026
5013	NC_011313	TCC	2	6	235755	235760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209809026
5014	NC_011313	ATG	2	6	235825	235830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809026
5015	NC_011313	GCG	2	6	235834	235839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209809026
5016	NC_011313	TGTT	2	8	235883	235890	0 %	75 %	25 %	0 %	209809026
5017	NC_011313	TCT	2	6	236011	236016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809026
5018	NC_011313	ATC	2	6	236044	236049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809026
5019	NC_011313	G	6	6	236077	236082	0 %	0 %	100 %	0 %	209809026
5020	NC_011313	TGAT	2	8	236087	236094	25 %	50 %	25 %	0 %	209809026
5021	NC_011313	A	7	7	236150	236156	100 %	0 %	0 %	0 %	209809026
5022	NC_011313	ATTA	2	8	236176	236183	50 %	50 %	0 %	0 %	209809026
5023	NC_011313	TTTA	2	8	236194	236201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_011313	TAT	2	6	236208	236213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011313	A	6	6	236214	236219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_011313	TTTA	2	8	236249	236256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_011313	TTAT	2	8	236279	236286	25 %	75 %	0 %	0 %	209809027
5028	NC_011313	GCA	2	6	236292	236297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809027
5029	NC_011313	TTC	2	6	236360	236365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809027
5030	NC_011313	ATA	2	6	236415	236420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809027
5031	NC_011313	TTG	2	6	236572	236577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809027
5032	NC_011313	TCA	2	6	236583	236588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809027
5033	NC_011313	AAC	2	6	236591	236596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809027
5034	NC_011313	GA	3	6	236653	236658	50 %	0 %	50 %	0 %	209809027
5035	NC_011313	TTAA	2	8	236853	236860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_011313	AGC	2	6	236890	236895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_011313	ATTT	2	8	236918	236925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_011313	ATT	2	6	236936	236941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_011313	T	6	6	236975	236980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011313	TAT	2	6	237011	237016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_011313	TAA	2	6	237027	237032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_011313	TGT	2	6	237120	237125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_011313	ATG	2	6	237131	237136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011313	T	6	6	237143	237148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_011313	AT	3	6	237171	237176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_011313	T	6	6	237179	237184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_011313	AAAT	2	8	237195	237202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_011313	ATT	3	9	237234	237242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011313	T	6	6	237247	237252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_011313	TAG	2	6	237291	237296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_011313	TTAA	2	8	237301	237308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_011313	T	8	8	237315	237322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_011313	A	8	8	237323	237330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_011313	ATT	2	6	237469	237474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_011313	TAG	2	6	237504	237509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809028
5056	NC_011313	GCG	2	6	237543	237548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209809028
5057	NC_011313	TTA	2	6	237623	237628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809028
5058	NC_011313	T	6	6	237695	237700	0 %	100 %	0 %	0 %	209809028
5059	NC_011313	GAG	2	6	237720	237725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209809028
5060	NC_011313	TTG	2	6	237732	237737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809028
5061	NC_011313	TGA	2	6	237754	237759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809028
5062	NC_011313	GTTT	2	8	237792	237799	0 %	75 %	25 %	0 %	209809028
5063	NC_011313	TCT	2	6	237800	237805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809028
5064	NC_011313	TGC	2	6	237817	237822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809028
5065	NC_011313	A	7	7	237865	237871	100 %	0 %	0 %	0 %	209809028
5066	NC_011313	TGG	2	6	237943	237948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809028
5067	NC_011313	TGG	2	6	237961	237966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809028
5068	NC_011313	AAG	2	6	237990	237995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809028
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5070	NC_011313	ATGAA	2	10	238050	238059	60 %	20 %	20 %	0 %	209809028
5071	NC_011313	TTA	2	6	238091	238096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809028
5072	NC_011313	AATC	2	8	238148	238155	50 %	25 %	0 %	25 %	209809028
5073	NC_011313	ACG	2	6	238187	238192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809028
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5076	NC_011313	CAT	2	6	238295	238300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809028
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5078	NC_011313	TTA	2	6	238369	238374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_011313	TAA	2	6	238397	238402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_011313	CAG	3	9	238438	238446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809029
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5084	NC_011313	GAA	2	6	238767	238772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809029
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5088	NC_011313	TC	3	6	239062	239067	0 %	50 %	0 %	50 %	209809029
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5091	NC_011313	GCG	2	6	239346	239351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209809029
5092	NC_011313	TC	3	6	239386	239391	0 %	50 %	0 %	50 %	209809029
5093	NC_011313	GTTT	2	8	239413	239420	0 %	75 %	25 %	0 %	209809029
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5099	NC_011313	TGAAGA	2	12	239654	239665	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209809029
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5103	NC_011313	TAA	2	6	239885	239890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_011313	T	6	6	239932	239937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_011313	ATT	2	6	240014	240019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_011313	A	6	6	240072	240077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_011313	AT	3	6	240098	240103	50 %	50 %	0 %	0 %	209809030
5108	NC_011313	AGA	2	6	240134	240139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809030
5109	NC_011313	ATCAG	2	10	240184	240193	40 %	20 %	20 %	20 %	209809030
5110	NC_011313	AGA	2	6	240281	240286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809030
5111	NC_011313	AATC	2	8	240316	240323	50 %	25 %	0 %	25 %	209809030
5112	NC_011313	A	6	6	240363	240368	100 %	0 %	0 %	0 %	209809030
5113	NC_011313	TGG	2	6	240412	240417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809030
5114	NC_011313	A	6	6	240600	240605	100 %	0 %	0 %	0 %	209809030
5115	NC_011313	G	7	7	240623	240629	0 %	0 %	100 %	0 %	209809030
5116	NC_011313	TGA	2	6	240674	240679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809030
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5122	NC_011313	TGG	2	6	240989	240994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809030
5123	NC_011313	ATTG	2	8	241007	241014	25 %	50 %	25 %	0 %	209809030
5124	NC_011313	AAGAA	2	10	241027	241036	80 %	0 %	20 %	0 %	209809030
5125	NC_011313	AGA	2	6	241039	241044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809030
5126	NC_011313	AGC	2	6	241045	241050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809030
5127	NC_011313	ATC	2	6	241058	241063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809030
5128	NC_011313	TAAG	2	8	241064	241071	50 %	25 %	25 %	0 %	209809030
5129	NC_011313	AATG	2	8	241093	241100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_011313	ATAA	2	8	241107	241114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_011313	ATA	2	6	241134	241139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_011313	ATT	2	6	241156	241161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_011313	TCA	2	6	241226	241231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_011313	TTG	2	6	241346	241351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809031
5135	NC_011313	TGG	2	6	241431	241436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809031
5136	NC_011313	TGA	2	6	241482	241487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809031
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5139	NC_011313	C	6	6	241706	241711	0 %	0 %	0 %	100 %	209809031
5140	NC_011313	CTT	2	6	241718	241723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809031
5141	NC_011313	GTC	2	6	241792	241797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809031
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5144	NC_011313	CAG	2	6	241859	241864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809031
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5155	NC_011313	ATT	2	6	242532	242537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5156	NC_011313	T	7	7	242545	242551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_011313	TC	3	6	242573	242578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5158	NC_011313	TCAT	2	8	242623	242630	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5159	NC_011313	AAT	2	6	242671	242676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5160	NC_011313	ACA	2	6	242721	242726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5161	NC_011313	GGCAAC	2	12	242780	242791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809032
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5167	NC_011313	GT	3	6	243195	243200	0 %	50 %	50 %	0 %	209809032
5168	NC_011313	TGA	2	6	243244	243249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809032
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5189	NC_011313	TGA	2	6	244347	244352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5191	NC_011313	TTA	2	6	244384	244389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5192	NC_011313	CGCT	2	8	244645	244652	0 %	25 %	25 %	50 %	209809033
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5217	NC_011313	ATA	2	6	245938	245943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5246	NC_011313	T	6	6	247645	247650	0 %	100 %	0 %	0 %	209809037
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5249	NC_011313	T	6	6	247796	247801	0 %	100 %	0 %	0 %	209809037
5250	NC_011313	T	6	6	247838	247843	0 %	100 %	0 %	0 %	209809037
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5252	NC_011313	ATG	2	6	247895	247900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_011313	TAT	2	6	247990	247995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_011313	T	6	6	248012	248017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_011313	TTA	2	6	248027	248032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809038
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5261	NC_011313	ATT	2	6	248305	248310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809038
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5268	NC_011313	AG	3	6	248612	248617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5269	NC_011313	ACGTT	2	10	248620	248629	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5270	NC_011313	A	6	6	248676	248681	100 %	0 %	0 %	0 %	209809039
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5280	NC_011313	GAT	2	6	249159	249164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5281	NC_011313	AAT	2	6	249301	249306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5282	NC_011313	AAT	3	9	249404	249412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5283	NC_011313	TTAGT	2	10	249527	249536	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5284	NC_011313	TGT	2	6	249566	249571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5285	NC_011313	ATG	2	6	249575	249580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5286	NC_011313	ATG	2	6	249628	249633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5287	NC_011313	AAGT	2	8	249722	249729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5293	NC_011313	GAT	2	6	249904	249909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809040
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5298	NC_011313	T	8	8	250076	250083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5299	NC_011313	TTAT	2	8	250087	250094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5300	NC_011313	ATA	2	6	250296	250301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5301	NC_011313	ATC	2	6	250394	250399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5340	NC_011313	GTTT	2	8	252514	252521	0 %	75 %	25 %	0 %	209809043
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5366	NC_011313	ATT	2	6	253816	253821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5367	NC_011313	T	7	7	253827	253833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5368	NC_011313	ATA	2	6	253868	253873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5369	NC_011313	TA	5	10	253872	253881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5370	NC_011313	ATTAT	2	10	253905	253914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5371	NC_011313	TTA	2	6	253924	253929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_011313	CAT	3	9	254109	254117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809044
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5374	NC_011313	GTG	2	6	254170	254175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809044
5375	NC_011313	ACA	2	6	254286	254291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809044
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