MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 70999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011312	CCT	2	6	194363	194368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_011312	GTT	2	6	194399	194404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_011312	TGC	2	6	194462	194467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_011312	TTAT	2	8	194489	194496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011312	CAATA	2	10	194564	194573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4006	NC_011312	CAA	2	6	194649	194654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_011312	TGG	2	6	194711	194716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_011312	TGAT	2	8	194738	194745	25 %	50 %	25 %	0 %	209693774
4009	NC_011312	TAA	2	6	194753	194758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693774
4010	NC_011312	GAT	2	6	194849	194854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693774
4011	NC_011312	GTAT	2	8	195141	195148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011312	TC	3	6	195208	195213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_011312	TAAAG	2	10	195298	195307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011312	CAAA	2	8	195324	195331	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4015	NC_011312	TG	3	6	195408	195413	0 %	50 %	50 %	0 %	209693775
4016	NC_011312	GCT	2	6	195500	195505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693775
4017	NC_011312	AT	4	8	195511	195518	50 %	50 %	0 %	0 %	209693775
4018	NC_011312	TGT	2	6	195570	195575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693775
4019	NC_011312	TC	3	6	195587	195592	0 %	50 %	0 %	50 %	209693775
4020	NC_011312	AT	3	6	195685	195690	50 %	50 %	0 %	0 %	209693775
4021	NC_011312	T	6	6	195707	195712	0 %	100 %	0 %	0 %	209693775
4022	NC_011312	TGA	2	6	195743	195748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693775
4023	NC_011312	ATC	2	6	195756	195761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693775
4024	NC_011312	GTG	2	6	195830	195835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693775
4025	NC_011312	ATA	2	6	195850	195855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693775
4026	NC_011312	CTT	3	9	195908	195916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693775
4027	NC_011312	TTCT	2	8	195929	195936	0 %	75 %	0 %	25 %	209693775
4028	NC_011312	CGCT	2	8	195943	195950	0 %	25 %	25 %	50 %	209693775
4029	NC_011312	CAT	2	6	195968	195973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693775
4030	NC_011312	CTT	2	6	196043	196048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693775
4031	NC_011312	CAC	2	6	196100	196105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693775
4032	NC_011312	AAT	2	6	196181	196186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693775
4033	NC_011312	TAA	2	6	196220	196225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693775
4034	NC_011312	TGC	2	6	196260	196265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693775
4035	NC_011312	GCT	2	6	196267	196272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693775
4036	NC_011312	GAA	2	6	196294	196299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693775
4037	NC_011312	TCG	2	6	196307	196312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693775
4038	NC_011312	AAAAC	2	10	196384	196393	80 %	0 %	0 %	20 %	209693775
4039	NC_011312	TAA	2	6	196422	196427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693775
4040	NC_011312	CAA	2	6	196451	196456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693775
4041	NC_011312	TTCC	2	8	196472	196479	0 %	50 %	0 %	50 %	209693775
4042	NC_011312	CGT	2	6	196533	196538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693775
4043	NC_011312	CAA	2	6	196559	196564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693775
4044	NC_011312	TTTA	2	8	196593	196600	25 %	75 %	0 %	0 %	209693775
4045	NC_011312	T	6	6	196620	196625	0 %	100 %	0 %	0 %	209693775
4046	NC_011312	AGA	2	6	196751	196756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693775
4047	NC_011312	ATC	2	6	196768	196773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693775
4048	NC_011312	AAT	2	6	196791	196796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693775
4049	NC_011312	TGT	2	6	196804	196809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693775
4050	NC_011312	TGC	2	6	196825	196830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693775
4051	NC_011312	AGA	2	6	196865	196870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693775
4052	NC_011312	TAA	2	6	196889	196894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693775
4053	NC_011312	ATC	2	6	196947	196952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693775
4054	NC_011312	AGGTA	2	10	196994	197003	40 %	20 %	40 %	0 %	209693775
4055	NC_011312	A	6	6	197040	197045	100 %	0 %	0 %	0 %	209693775
4056	NC_011312	ATT	2	6	197068	197073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693775
4057	NC_011312	CGC	2	6	197204	197209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693775
4058	NC_011312	AAGA	2	8	197244	197251	75 %	0 %	25 %	0 %	209693775
4059	NC_011312	ATG	2	6	197269	197274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693775
4060	NC_011312	GTT	2	6	197315	197320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693775
4061	NC_011312	TTG	2	6	197328	197333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693775
4062	NC_011312	TGAC	2	8	197451	197458	25 %	25 %	25 %	25 %	209693776
4063	NC_011312	GGT	2	6	197550	197555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693776
4064	NC_011312	T	6	6	197586	197591	0 %	100 %	0 %	0 %	209693776
4065	NC_011312	ATAA	2	8	197665	197672	75 %	25 %	0 %	0 %	209693776
4066	NC_011312	CCCCAC	2	12	197694	197705	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	209693776
4067	NC_011312	GTT	2	6	197715	197720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693776
4068	NC_011312	ATA	2	6	197722	197727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693776
4069	NC_011312	ACG	2	6	197737	197742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693776
4070	NC_011312	T	7	7	197744	197750	0 %	100 %	0 %	0 %	209693776
4071	NC_011312	ATGA	2	8	197985	197992	50 %	25 %	25 %	0 %	209693776
4072	NC_011312	CGG	2	6	198037	198042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693776
4073	NC_011312	TTCTG	2	10	198105	198114	0 %	60 %	20 %	20 %	209693776
4074	NC_011312	GGTGT	2	10	198146	198155	0 %	40 %	60 %	0 %	209693776
4075	NC_011312	AAAT	2	8	198213	198220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_011312	GAT	2	6	198235	198240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_011312	GAC	2	6	198390	198395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_011312	CACT	2	8	198396	198403	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_011312	CTTT	2	8	198440	198447	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_011312	TAAA	2	8	198469	198476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_011312	GGC	2	6	198505	198510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693777
4082	NC_011312	GCA	2	6	198524	198529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693777
4083	NC_011312	ATT	2	6	198532	198537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693777
4084	NC_011312	A	6	6	198598	198603	100 %	0 %	0 %	0 %	209693777
4085	NC_011312	AGA	2	6	198648	198653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693777
4086	NC_011312	TGA	2	6	198678	198683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693777
4087	NC_011312	GTGC	2	8	198716	198723	0 %	25 %	50 %	25 %	209693777
4088	NC_011312	ATG	3	9	198754	198762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693777
4089	NC_011312	AAC	2	6	198763	198768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693777
4090	NC_011312	AAG	2	6	198782	198787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693777
4091	NC_011312	CAT	2	6	198830	198835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693777
4092	NC_011312	CTG	2	6	198836	198841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693777
4093	NC_011312	ACA	2	6	198918	198923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693777
4094	NC_011312	CGC	2	6	198940	198945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693777
4095	NC_011312	AATG	2	8	199077	199084	50 %	25 %	25 %	0 %	209693777
4096	NC_011312	TGA	2	6	199116	199121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693777
4097	NC_011312	CAC	2	6	199261	199266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693777
4098	NC_011312	TAA	2	6	199422	199427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693777
4099	NC_011312	TCGCT	2	10	199478	199487	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4100	NC_011312	A	7	7	199596	199602	100 %	0 %	0 %	0 %	209693778
4101	NC_011312	A	7	7	199605	199611	100 %	0 %	0 %	0 %	209693778
4102	NC_011312	TTC	2	6	199650	199655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693778
4103	NC_011312	TAT	2	6	199664	199669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693778
4104	NC_011312	GTTT	2	8	199717	199724	0 %	75 %	25 %	0 %	209693778
4105	NC_011312	CAT	2	6	199808	199813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693778
4106	NC_011312	AGG	2	6	199829	199834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209693778
4107	NC_011312	T	6	6	199892	199897	0 %	100 %	0 %	0 %	209693778
4108	NC_011312	CAC	2	6	199921	199926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693778
4109	NC_011312	GCG	2	6	199950	199955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693778
4110	NC_011312	TCA	2	6	199966	199971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693778
4111	NC_011312	TAT	2	6	200048	200053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693778
4112	NC_011312	T	7	7	200085	200091	0 %	100 %	0 %	0 %	209693778
4113	NC_011312	ACAGA	2	10	200103	200112	60 %	0 %	20 %	20 %	209693778
4114	NC_011312	TTA	2	6	200166	200171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693778
4115	NC_011312	TAAA	2	8	200230	200237	75 %	25 %	0 %	0 %	209693778
4116	NC_011312	TAA	2	6	200242	200247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693778
4117	NC_011312	A	7	7	200250	200256	100 %	0 %	0 %	0 %	209693778
4118	NC_011312	TGC	2	6	200276	200281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693778
4119	NC_011312	TTC	2	6	200378	200383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693778
4120	NC_011312	TA	3	6	200416	200421	50 %	50 %	0 %	0 %	209693778
4121	NC_011312	ATT	2	6	200438	200443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693778
4122	NC_011312	AGC	2	6	200468	200473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693778
4123	NC_011312	AGA	2	6	200549	200554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693778
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4125	NC_011312	T	6	6	200618	200623	0 %	100 %	0 %	0 %	209693778
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4248	NC_011312	T	7	7	207338	207344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_011312	ATC	2	6	207401	207406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693784
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4252	NC_011312	AC	3	6	207660	207665	50 %	0 %	0 %	50 %	209693784
4253	NC_011312	TCA	2	6	207742	207747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693784
4254	NC_011312	ATC	2	6	207773	207778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693784
4255	NC_011312	CCA	2	6	207798	207803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693784
4256	NC_011312	TGC	2	6	207870	207875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693784
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4258	NC_011312	AT	3	6	207904	207909	50 %	50 %	0 %	0 %	209693784
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4262	NC_011312	TAAC	2	8	208162	208169	50 %	25 %	0 %	25 %	209693784
4263	NC_011312	ACA	2	6	208224	208229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693784
4264	NC_011312	GCT	2	6	208297	208302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693784
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4269	NC_011312	TAAT	2	8	208384	208391	50 %	50 %	0 %	0 %	209693784
4270	NC_011312	T	6	6	208394	208399	0 %	100 %	0 %	0 %	209693784
4271	NC_011312	TTA	2	6	208423	208428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_011312	AGA	2	6	208469	208474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693785
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4326	NC_011312	ATCA	2	8	211135	211142	50 %	25 %	0 %	25 %	209693787
4327	NC_011312	ATGC	2	8	211195	211202	25 %	25 %	25 %	25 %	209693787
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4343	NC_011312	CATC	2	8	212122	212129	25 %	25 %	0 %	50 %	209693788
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4364	NC_011312	ATCA	2	8	213322	213329	50 %	25 %	0 %	25 %	209693789
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4371	NC_011312	TA	3	6	213852	213857	50 %	50 %	0 %	0 %	209693790
4372	NC_011312	TTGAA	2	10	213871	213880	40 %	40 %	20 %	0 %	209693790
4373	NC_011312	TTCT	2	8	213900	213907	0 %	75 %	0 %	25 %	209693790
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