MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 1862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011311	A	6	6	23430	23435	100 %	0 %	0 %	0 %	215778371
502	NC_011311	CT	3	6	23449	23454	0 %	50 %	0 %	50 %	215778371
503	NC_011311	CCAT	2	8	23495	23502	25 %	25 %	0 %	50 %	215778371
504	NC_011311	AAACC	2	10	23541	23550	60 %	0 %	0 %	40 %	215778371
505	NC_011311	TCAC	2	8	23561	23568	25 %	25 %	0 %	50 %	215778371
506	NC_011311	TTC	2	6	23585	23590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778371
507	NC_011311	ACTC	2	8	23604	23611	25 %	25 %	0 %	50 %	215778371
508	NC_011311	AAAG	2	8	23620	23627	75 %	0 %	25 %	0 %	215778371
509	NC_011311	CAAA	2	8	23747	23754	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
510	NC_011311	CGC	2	6	23787	23792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215778371
511	NC_011311	CAA	2	6	23887	23892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
512	NC_011311	TCT	2	6	23901	23906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778371
513	NC_011311	CAA	2	6	23928	23933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
514	NC_011311	CTT	2	6	23986	23991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778371
515	NC_011311	AGC	2	6	24049	24054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778371
516	NC_011311	ACA	2	6	24093	24098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
517	NC_011311	CCT	2	6	24108	24113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215778371
518	NC_011311	AGC	2	6	24151	24156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778371
519	NC_011311	AAGC	2	8	24159	24166	50 %	0 %	25 %	25 %	215778371
520	NC_011311	AGC	2	6	24170	24175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778371
521	NC_011311	TCA	2	6	24207	24212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778371
522	NC_011311	GTC	2	6	24214	24219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778371
523	NC_011311	CGT	2	6	24288	24293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778371
524	NC_011311	AAG	2	6	24329	24334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778371
525	NC_011311	TCA	2	6	24341	24346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778371
526	NC_011311	CAA	2	6	24357	24362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
527	NC_011311	CAA	2	6	24403	24408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
528	NC_011311	AC	3	6	24431	24436	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
529	NC_011311	GCA	2	6	24452	24457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778371
530	NC_011311	CCA	2	6	24464	24469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778371
531	NC_011311	AAG	2	6	24470	24475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778371
532	NC_011311	A	6	6	24499	24504	100 %	0 %	0 %	0 %	215778371
533	NC_011311	CCA	2	6	24539	24544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778371
534	NC_011311	AACA	2	8	24559	24566	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
535	NC_011311	AGAGC	2	10	24585	24594	40 %	0 %	40 %	20 %	215778371
536	NC_011311	CAAC	2	8	24677	24684	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
537	NC_011311	ATG	2	6	24694	24699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778371
538	NC_011311	GACAAA	2	12	24709	24720	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	215778371
539	NC_011311	CAA	2	6	24783	24788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
540	NC_011311	A	6	6	24787	24792	100 %	0 %	0 %	0 %	215778371
541	NC_011311	ATT	2	6	24842	24847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778371
542	NC_011311	TCA	2	6	24896	24901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778371
543	NC_011311	TCG	2	6	24936	24941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778371
544	NC_011311	CAA	2	6	25023	25028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
545	NC_011311	GAC	2	6	25033	25038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778371
546	NC_011311	AAAG	2	8	25078	25085	75 %	0 %	25 %	0 %	215778371
547	NC_011311	A	6	6	25171	25176	100 %	0 %	0 %	0 %	215778371
548	NC_011311	CAAA	2	8	25235	25242	75 %	0 %	0 %	25 %	215778371
549	NC_011311	GCT	2	6	25425	25430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778371
550	NC_011311	TCA	2	6	25502	25507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778371
551	NC_011311	CG	4	8	25522	25529	0 %	0 %	50 %	50 %	215778371
552	NC_011311	CAA	2	6	25537	25542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
553	NC_011311	ATT	3	9	25597	25605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778371
554	NC_011311	GAC	2	6	25606	25611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778371
555	NC_011311	TCA	2	6	25645	25650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778371
556	NC_011311	CCG	2	6	25751	25756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215778371
557	NC_011311	CGT	2	6	25803	25808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778371
558	NC_011311	ATT	2	6	25840	25845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778371
559	NC_011311	ATTA	2	8	25869	25876	50 %	50 %	0 %	0 %	215778371
560	NC_011311	CAACA	2	10	25879	25888	60 %	0 %	0 %	40 %	215778371
561	NC_011311	TAA	3	9	25914	25922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778371
562	NC_011311	AAT	2	6	25935	25940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778371
563	NC_011311	ACA	2	6	25961	25966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
564	NC_011311	TCA	2	6	25967	25972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778371
565	NC_011311	ACCA	2	8	26038	26045	50 %	0 %	0 %	50 %	215778371
566	NC_011311	A	6	6	26130	26135	100 %	0 %	0 %	0 %	215778371
567	NC_011311	CAA	2	6	26145	26150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
568	NC_011311	AAG	2	6	26186	26191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778371
569	NC_011311	AAGA	2	8	26234	26241	75 %	0 %	25 %	0 %	215778371
570	NC_011311	AGA	2	6	26244	26249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778371
571	NC_011311	GAAC	2	8	26250	26257	50 %	0 %	25 %	25 %	215778371
572	NC_011311	AAC	2	6	26354	26359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778371
573	NC_011311	A	6	6	26378	26383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011311	TC	3	6	26454	26459	0 %	50 %	0 %	50 %	215778372
575	NC_011311	CAT	2	6	26476	26481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778372
576	NC_011311	TTC	2	6	26492	26497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778372
577	NC_011311	GAGT	2	8	26514	26521	25 %	25 %	50 %	0 %	215778372
578	NC_011311	AAC	2	6	26556	26561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778372
579	NC_011311	CTT	2	6	26563	26568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778372
580	NC_011311	TCAC	2	8	26583	26590	25 %	25 %	0 %	50 %	215778372
581	NC_011311	TCT	2	6	26610	26615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778372
582	NC_011311	CT	3	6	26759	26764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_011311	A	6	6	26851	26856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011311	ACAA	2	8	26891	26898	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
585	NC_011311	GAT	2	6	27033	27038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011311	TCA	2	6	27148	27153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011311	GT	3	6	27164	27169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011311	AAG	2	6	27181	27186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011311	ATT	2	6	27210	27215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011311	A	6	6	27254	27259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011311	AAGG	2	8	27332	27339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011311	A	6	6	27353	27358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011311	A	7	7	27378	27384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011311	CGC	2	6	27405	27410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215778373
595	NC_011311	TTC	2	6	27448	27453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778373
596	NC_011311	GA	3	6	27602	27607	50 %	0 %	50 %	0 %	215778373
597	NC_011311	CAC	2	6	27648	27653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778373
598	NC_011311	TTCA	2	8	27675	27682	25 %	50 %	0 %	25 %	215778373
599	NC_011311	TAA	2	6	27748	27753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778373
600	NC_011311	ATA	2	6	27900	27905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778374
601	NC_011311	TAT	2	6	27963	27968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778374
602	NC_011311	T	6	6	28013	28018	0 %	100 %	0 %	0 %	215778374
603	NC_011311	TAT	2	6	28029	28034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778374
604	NC_011311	AGG	2	6	28046	28051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215778374
605	NC_011311	ACA	2	6	28062	28067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778374
606	NC_011311	T	6	6	28117	28122	0 %	100 %	0 %	0 %	215778374
607	NC_011311	TTG	2	6	28140	28145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778374
608	NC_011311	ACA	2	6	28166	28171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778374
609	NC_011311	TGA	2	6	28213	28218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778374
610	NC_011311	GTT	2	6	28229	28234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778374
611	NC_011311	TAT	2	6	28235	28240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778374
612	NC_011311	CAT	2	6	28251	28256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778374
613	NC_011311	GGC	2	6	28353	28358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215778375
614	NC_011311	AAT	2	6	28365	28370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778375
615	NC_011311	CAAC	2	8	28395	28402	50 %	0 %	0 %	50 %	215778375
616	NC_011311	GGT	2	6	28578	28583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215778375
617	NC_011311	GGC	2	6	28621	28626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215778375
618	NC_011311	AT	3	6	28629	28634	50 %	50 %	0 %	0 %	215778375
619	NC_011311	TTA	2	6	28663	28668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778375
620	NC_011311	CCA	2	6	28765	28770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778375
621	NC_011311	TCA	2	6	28820	28825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778375
622	NC_011311	CT	3	6	28834	28839	0 %	50 %	0 %	50 %	215778375
623	NC_011311	TCA	2	6	28840	28845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778375
624	NC_011311	TCT	2	6	28858	28863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778375
625	NC_011311	TCG	2	6	28889	28894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778375
626	NC_011311	GCTT	2	8	28936	28943	0 %	50 %	25 %	25 %	215778375
627	NC_011311	CAG	2	6	28982	28987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778375
628	NC_011311	CAA	2	6	28995	29000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778375
629	NC_011311	GC	3	6	29024	29029	0 %	0 %	50 %	50 %	215778375
630	NC_011311	AGA	2	6	29052	29057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778375
631	NC_011311	AAT	2	6	29115	29120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778375
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