MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_011206	CTA	2	6	1914854	1914859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40002	NC_011206	CA	3	6	1914895	1914900	50 %	0 %	0 %	50 %	198284031
40003	NC_011206	GAT	2	6	1914916	1914921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284031
40004	NC_011206	CAA	2	6	1914930	1914935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284031
40005	NC_011206	ACA	2	6	1914936	1914941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284031
40006	NC_011206	CCG	2	6	1914942	1914947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284031
40007	NC_011206	CAT	2	6	1914999	1915004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284031
40008	NC_011206	CGG	2	6	1915046	1915051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284031
40009	NC_011206	TGG	2	6	1915098	1915103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284031
40010	NC_011206	TGG	2	6	1915106	1915111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284031
40011	NC_011206	GCA	2	6	1915165	1915170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284031
40012	NC_011206	T	6	6	1915171	1915176	0 %	100 %	0 %	0 %	198284031
40013	NC_011206	GGC	2	6	1915179	1915184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284031
40014	NC_011206	TCC	2	6	1915213	1915218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284031
40015	NC_011206	CTT	2	6	1915233	1915238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284031
40016	NC_011206	AG	3	6	1915310	1915315	50 %	0 %	50 %	0 %	198284031
40017	NC_011206	CT	3	6	1915324	1915329	0 %	50 %	0 %	50 %	198284031
40018	NC_011206	GAT	2	6	1915347	1915352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284031
40019	NC_011206	GTTGG	2	10	1915375	1915384	0 %	40 %	60 %	0 %	198284031
40020	NC_011206	TGC	2	6	1915385	1915390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284031
40021	NC_011206	GCG	2	6	1915430	1915435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284031
40022	NC_011206	GCG	2	6	1915464	1915469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284031
40023	NC_011206	ACCG	2	8	1915508	1915515	25 %	0 %	25 %	50 %	198284031
40024	NC_011206	AGGC	2	8	1915588	1915595	25 %	0 %	50 %	25 %	198284031
40025	NC_011206	TTTG	2	8	1915629	1915636	0 %	75 %	25 %	0 %	198284031
40026	NC_011206	GAT	2	6	1915680	1915685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284031
40027	NC_011206	T	6	6	1915885	1915890	0 %	100 %	0 %	0 %	198284031
40028	NC_011206	GCT	2	6	1915938	1915943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284031
40029	NC_011206	TTC	2	6	1915969	1915974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284031
40030	NC_011206	GCCA	2	8	1915986	1915993	25 %	0 %	25 %	50 %	198284031
40031	NC_011206	GGC	2	6	1916079	1916084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284031
40032	NC_011206	GAC	2	6	1916085	1916090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284031
40033	NC_011206	CTG	2	6	1916101	1916106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284031
40034	NC_011206	TGCA	2	8	1916114	1916121	25 %	25 %	25 %	25 %	198284031
40035	NC_011206	GGTA	2	8	1916124	1916131	25 %	25 %	50 %	0 %	198284031
40036	NC_011206	GCTGAT	2	12	1916139	1916150	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	198284031
40037	NC_011206	TGG	2	6	1916168	1916173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284031
40038	NC_011206	TGC	2	6	1916189	1916194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284031
40039	NC_011206	AGA	2	6	1916304	1916309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40040	NC_011206	GC	3	6	1916436	1916441	0 %	0 %	50 %	50 %	198284032
40041	NC_011206	GCG	2	6	1916494	1916499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284032
40042	NC_011206	CCTTT	2	10	1916591	1916600	0 %	60 %	0 %	40 %	198284032
40043	NC_011206	CGC	2	6	1916697	1916702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284032
40044	NC_011206	ATC	2	6	1916758	1916763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284032
40045	NC_011206	TTC	2	6	1916836	1916841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284032
40046	NC_011206	ATG	2	6	1916862	1916867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284032
40047	NC_011206	CTG	2	6	1916947	1916952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284033
40048	NC_011206	CTG	2	6	1916997	1917002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284033
40049	NC_011206	TCCC	2	8	1917085	1917092	0 %	25 %	0 %	75 %	198284033
40050	NC_011206	GGA	2	6	1917131	1917136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284033
40051	NC_011206	GAG	2	6	1917159	1917164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284033
40052	NC_011206	ATC	2	6	1917189	1917194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284033
40053	NC_011206	GCGA	2	8	1917257	1917264	25 %	0 %	50 %	25 %	198284033
40054	NC_011206	CTGC	2	8	1917368	1917375	0 %	25 %	25 %	50 %	198284033
40055	NC_011206	AGG	2	6	1917394	1917399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284033
40056	NC_011206	AGG	2	6	1917428	1917433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284034
40057	NC_011206	GCC	2	6	1917450	1917455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284034
40058	NC_011206	TC	3	6	1917567	1917572	0 %	50 %	0 %	50 %	198284034
40059	NC_011206	ACG	2	6	1917574	1917579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284034
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40062	NC_011206	GCG	2	6	1917716	1917721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284034
40063	NC_011206	CGG	2	6	1917749	1917754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284034
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40077	NC_011206	CGG	2	6	1918645	1918650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284035
40078	NC_011206	GCC	2	6	1918664	1918669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284035
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40083	NC_011206	ACC	2	6	1918778	1918783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284035
40084	NC_011206	GATCA	2	10	1918970	1918979	40 %	20 %	20 %	20 %	198284035
40085	NC_011206	CGT	3	9	1919043	1919051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284035
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40087	NC_011206	C	6	6	1919143	1919148	0 %	0 %	0 %	100 %	198284035
40088	NC_011206	GC	3	6	1919217	1919222	0 %	0 %	50 %	50 %	198284035
40089	NC_011206	GCG	2	6	1919226	1919231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284035
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40098	NC_011206	CGGG	2	8	1919786	1919793	0 %	0 %	75 %	25 %	198284036
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40106	NC_011206	TCG	2	6	1920368	1920373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284037
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40109	NC_011206	GCGT	2	8	1920463	1920470	0 %	25 %	50 %	25 %	198284037
40110	NC_011206	CCTT	2	8	1920518	1920525	0 %	50 %	0 %	50 %	198284037
40111	NC_011206	G	6	6	1920560	1920565	0 %	0 %	100 %	0 %	198284037
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40116	NC_011206	AGG	2	6	1920685	1920690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284037
40117	NC_011206	CGGG	2	8	1920696	1920703	0 %	0 %	75 %	25 %	198284037
40118	NC_011206	CTT	2	6	1920775	1920780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284037
40119	NC_011206	GGA	2	6	1920832	1920837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284038
40120	NC_011206	TGT	2	6	1920838	1920843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198284038
40121	NC_011206	GGTGC	2	10	1920851	1920860	0 %	20 %	60 %	20 %	198284038
40122	NC_011206	TCT	2	6	1920943	1920948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284038
40123	NC_011206	GCG	2	6	1921058	1921063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284038
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40125	NC_011206	GGT	2	6	1921147	1921152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284038
40126	NC_011206	TCG	2	6	1921392	1921397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284038
40127	NC_011206	CTG	2	6	1921445	1921450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284038
40128	NC_011206	CT	3	6	1921468	1921473	0 %	50 %	0 %	50 %	198284038
40129	NC_011206	GGC	2	6	1921567	1921572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284038
40130	NC_011206	GCG	2	6	1921577	1921582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284038
40131	NC_011206	GT	3	6	1921681	1921686	0 %	50 %	50 %	0 %	198284038
40132	NC_011206	TG	3	6	1921722	1921727	0 %	50 %	50 %	0 %	198284038
40133	NC_011206	TGG	2	6	1921743	1921748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284038
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40136	NC_011206	GAT	2	6	1921783	1921788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284038
40137	NC_011206	GC	3	6	1921802	1921807	0 %	0 %	50 %	50 %	198284038
40138	NC_011206	ATGG	2	8	1921877	1921884	25 %	25 %	50 %	0 %	198284038
40139	NC_011206	GAG	2	6	1921932	1921937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284038
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40141	NC_011206	CGG	2	6	1921990	1921995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284039
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40144	NC_011206	GCCCAT	2	12	1922117	1922128	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198284039
40145	NC_011206	ACC	2	6	1922198	1922203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284039
40146	NC_011206	GGA	2	6	1922219	1922224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284039
40147	NC_011206	GT	3	6	1922285	1922290	0 %	50 %	50 %	0 %	198284039
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40150	NC_011206	T	7	7	1922486	1922492	0 %	100 %	0 %	0 %	198284039
40151	NC_011206	AG	3	6	1922495	1922500	50 %	0 %	50 %	0 %	198284039
40152	NC_011206	CAG	2	6	1922556	1922561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284039
40153	NC_011206	ATTTT	2	10	1922563	1922572	20 %	80 %	0 %	0 %	198284039
40154	NC_011206	TGG	2	6	1922594	1922599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284039
40155	NC_011206	GGT	2	6	1922601	1922606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284039
40156	NC_011206	GTC	2	6	1922678	1922683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284040
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40158	NC_011206	CGCC	2	8	1922715	1922722	0 %	0 %	25 %	75 %	198284040
40159	NC_011206	GAA	2	6	1922854	1922859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284040
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40177	NC_011206	T	6	6	1923624	1923629	0 %	100 %	0 %	0 %	198284041
40178	NC_011206	TGG	2	6	1923649	1923654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284041
40179	NC_011206	A	7	7	1923693	1923699	100 %	0 %	0 %	0 %	198284041
40180	NC_011206	TCC	2	6	1923729	1923734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284041
40181	NC_011206	CAA	2	6	1923909	1923914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40182	NC_011206	GCC	2	6	1923960	1923965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40183	NC_011206	TCG	2	6	1924209	1924214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284042
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40187	NC_011206	TAGG	2	8	1924394	1924401	25 %	25 %	50 %	0 %	198284042
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40191	NC_011206	GTC	2	6	1925041	1925046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284042
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40206	NC_011206	TAC	2	6	1925842	1925847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284042
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40218	NC_011206	TCA	2	6	1926257	1926262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284042
40219	NC_011206	CCA	2	6	1926307	1926312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284042
40220	NC_011206	AGC	2	6	1926320	1926325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284042
40221	NC_011206	TAA	2	6	1926376	1926381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40222	NC_011206	AAT	2	6	1926390	1926395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40223	NC_011206	TCG	2	6	1926455	1926460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40224	NC_011206	CAT	2	6	1926506	1926511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40225	NC_011206	TGG	2	6	1926532	1926537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40226	NC_011206	CTC	2	6	1926561	1926566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40227	NC_011206	CGA	2	6	1926620	1926625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40228	NC_011206	GAT	2	6	1926686	1926691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40229	NC_011206	CA	3	6	1926728	1926733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40230	NC_011206	C	6	6	1926765	1926770	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40231	NC_011206	CG	3	6	1926878	1926883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40232	NC_011206	TGCA	2	8	1926987	1926994	25 %	25 %	25 %	25 %	198284043
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40234	NC_011206	CAA	2	6	1927098	1927103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284043
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40356	NC_011206	TCA	2	6	1932701	1932706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284046
40357	NC_011206	TCA	2	6	1932725	1932730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284046
40358	NC_011206	TCG	2	6	1932779	1932784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284046
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40376	NC_011206	CAAT	2	8	1933470	1933477	50 %	25 %	0 %	25 %	198284046
40377	NC_011206	CTA	4	12	1933479	1933490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284046
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40380	NC_011206	CCG	2	6	1933570	1933575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284046
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40382	NC_011206	GGT	2	6	1933761	1933766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198284046
40383	NC_011206	CGA	2	6	1933869	1933874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284046
40384	NC_011206	GC	3	6	1934114	1934119	0 %	0 %	50 %	50 %	198284046
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40389	NC_011206	CAT	2	6	1934347	1934352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284046
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40391	NC_011206	GCA	2	6	1934396	1934401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284046
40392	NC_011206	TAT	2	6	1934428	1934433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198284046
40393	NC_011206	GCG	2	6	1934441	1934446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284046
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40399	NC_011206	GGC	2	6	1934872	1934877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284047
40400	NC_011206	CCTTCC	2	12	1934943	1934954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284047
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40402	NC_011206	TCC	2	6	1935018	1935023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284047
40403	NC_011206	CTG	2	6	1935101	1935106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284047
40404	NC_011206	CTG	2	6	1935110	1935115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284047
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40411	NC_011206	CGT	2	6	1935286	1935291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284047
40412	NC_011206	TCA	2	6	1935321	1935326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284047
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40414	NC_011206	ATC	2	6	1935448	1935453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284048
40415	NC_011206	CAT	2	6	1935465	1935470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284048
40416	NC_011206	CTG	2	6	1935478	1935483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284048
40417	NC_011206	TCT	2	6	1935485	1935490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284048
40418	NC_011206	TCA	2	6	1935491	1935496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284048
40419	NC_011206	CCCA	2	8	1935517	1935524	25 %	0 %	0 %	75 %	198284048
40420	NC_011206	CCGC	2	8	1935557	1935564	0 %	0 %	25 %	75 %	198284048
40421	NC_011206	GCCCAA	2	12	1935570	1935581	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	198284048
40422	NC_011206	GTC	2	6	1935583	1935588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284048
40423	NC_011206	GACG	2	8	1935618	1935625	25 %	0 %	50 %	25 %	198284048
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40425	NC_011206	CGC	2	6	1935699	1935704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284048
40426	NC_011206	GCC	2	6	1935752	1935757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284048
40427	NC_011206	GGC	2	6	1935783	1935788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284048
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40431	NC_011206	GAA	2	6	1935846	1935851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284049
40432	NC_011206	CTG	2	6	1935858	1935863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284049
40433	NC_011206	CGG	2	6	1935864	1935869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284049
40434	NC_011206	GCC	2	6	1935879	1935884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284049
40435	NC_011206	CTG	2	6	1935897	1935902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284049
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40438	NC_011206	CAG	2	6	1936024	1936029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284049
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40444	NC_011206	GGCG	2	8	1936268	1936275	0 %	0 %	75 %	25 %	198284049
40445	NC_011206	CGT	2	6	1936334	1936339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284049
40446	NC_011206	CGTC	2	8	1936381	1936388	0 %	25 %	25 %	50 %	198284049
40447	NC_011206	GCT	2	6	1936409	1936414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284049
40448	NC_011206	CGA	2	6	1936415	1936420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284049
40449	NC_011206	GCC	2	6	1936422	1936427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284049
40450	NC_011206	GC	3	6	1936439	1936444	0 %	0 %	50 %	50 %	198284049
40451	NC_011206	CCG	2	6	1936465	1936470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284049
40452	NC_011206	CAC	3	9	1936502	1936510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284049
40453	NC_011206	GAC	2	6	1936527	1936532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284049
40454	NC_011206	ACC	2	6	1936537	1936542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40455	NC_011206	CAA	2	6	1936551	1936556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284050
40456	NC_011206	GCC	2	6	1936601	1936606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284050
40457	NC_011206	GAT	2	6	1936637	1936642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284050
40458	NC_011206	CGA	2	6	1936654	1936659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284050
40459	NC_011206	CCG	2	6	1936730	1936735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284050
40460	NC_011206	TCA	2	6	1936787	1936792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284050
40461	NC_011206	AACCAG	2	12	1936844	1936855	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	198284050
40462	NC_011206	TGGA	2	8	1936869	1936876	25 %	25 %	50 %	0 %	198284050
40463	NC_011206	CAA	3	9	1936903	1936911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198284050
40464	NC_011206	GC	3	6	1936927	1936932	0 %	0 %	50 %	50 %	198284050
40465	NC_011206	CGGCA	2	10	1936987	1936996	20 %	0 %	40 %	40 %	198284050
40466	NC_011206	CCA	2	6	1936998	1937003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284050
40467	NC_011206	GGC	2	6	1937012	1937017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284050
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