MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011206	GTC	2	6	162824	162829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3502	NC_011206	GCA	2	6	162861	162866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3503	NC_011206	GCT	2	6	162886	162891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3504	NC_011206	GAA	2	6	162893	162898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282317
3505	NC_011206	CTG	2	6	162932	162937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3506	NC_011206	CG	4	8	162938	162945	0 %	0 %	50 %	50 %	198282317
3507	NC_011206	TGG	2	6	162954	162959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282317
3508	NC_011206	TCG	2	6	162963	162968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3509	NC_011206	GCC	2	6	162989	162994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282317
3510	NC_011206	TCA	2	6	162999	163004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282317
3511	NC_011206	CAT	2	6	163030	163035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282317
3512	NC_011206	GGC	2	6	163043	163048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282317
3513	NC_011206	TGA	2	6	163068	163073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282317
3514	NC_011206	GCG	3	9	163145	163153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282317
3515	NC_011206	GGC	3	9	163156	163164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282317
3516	NC_011206	GGA	2	6	163165	163170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282317
3517	NC_011206	GGTC	2	8	163171	163178	0 %	25 %	50 %	25 %	198282317
3518	NC_011206	TTC	2	6	163187	163192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282317
3519	NC_011206	ATC	2	6	163202	163207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282317
3520	NC_011206	TCCT	2	8	163214	163221	0 %	50 %	0 %	50 %	198282317
3521	NC_011206	GAG	2	6	163244	163249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282317
3522	NC_011206	GCC	4	12	163295	163306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282317
3523	NC_011206	GTG	2	6	163322	163327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282317
3524	NC_011206	GC	3	6	163435	163440	0 %	0 %	50 %	50 %	198282317
3525	NC_011206	CTG	2	6	163466	163471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3526	NC_011206	TAC	2	6	163487	163492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282317
3527	NC_011206	C	7	7	163523	163529	0 %	0 %	0 %	100 %	198282317
3528	NC_011206	GCT	2	6	163543	163548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3529	NC_011206	CGG	2	6	163572	163577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282317
3530	NC_011206	GCA	2	6	163606	163611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3531	NC_011206	GACC	2	8	163612	163619	25 %	0 %	25 %	50 %	198282317
3532	NC_011206	GGT	2	6	163717	163722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282317
3533	NC_011206	CGG	2	6	163996	164001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282317
3534	NC_011206	GCC	2	6	164036	164041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282317
3535	NC_011206	ACC	2	6	164108	164113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282317
3536	NC_011206	CGC	2	6	164203	164208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282317
3537	NC_011206	GGGC	2	8	164260	164267	0 %	0 %	75 %	25 %	198282317
3538	NC_011206	ACA	2	6	164286	164291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282317
3539	NC_011206	AGG	2	6	164395	164400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282317
3540	NC_011206	GCC	2	6	164444	164449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282317
3541	NC_011206	CTG	2	6	164483	164488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3542	NC_011206	CTC	2	6	164498	164503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282317
3543	NC_011206	CAT	2	6	164536	164541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282317
3544	NC_011206	TGG	2	6	164565	164570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282317
3545	NC_011206	GGCG	2	8	164641	164648	0 %	0 %	75 %	25 %	198282317
3546	NC_011206	GGC	2	6	164650	164655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282317
3547	NC_011206	GTG	2	6	164666	164671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282317
3548	NC_011206	CTC	2	6	164675	164680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282317
3549	NC_011206	CGG	2	6	164702	164707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282317
3550	NC_011206	TGC	2	6	164769	164774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3551	NC_011206	TGG	3	9	164805	164813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282317
3552	NC_011206	CAT	2	6	164827	164832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282317
3553	NC_011206	TGA	2	6	164859	164864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282317
3554	NC_011206	GCC	2	6	164873	164878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282317
3555	NC_011206	TGG	2	6	164883	164888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282317
3556	NC_011206	GCT	2	6	164917	164922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282317
3557	NC_011206	GCG	2	6	164956	164961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282317
3558	NC_011206	GAT	2	6	164973	164978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282317
3559	NC_011206	GAG	2	6	164991	164996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_011206	ATG	2	6	165003	165008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282318
3561	NC_011206	GCT	2	6	165053	165058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282318
3562	NC_011206	TGG	2	6	165072	165077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282318
3563	NC_011206	ATG	2	6	165090	165095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282318
3564	NC_011206	CCT	2	6	165119	165124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282318
3565	NC_011206	CAT	2	6	165170	165175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282318
3566	NC_011206	CGG	2	6	165185	165190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282318
3567	NC_011206	CGC	3	9	165200	165208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282318
3568	NC_011206	TGG	2	6	165211	165216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282318
3569	NC_011206	CCG	2	6	165243	165248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282318
3570	NC_011206	GC	3	6	165252	165257	0 %	0 %	50 %	50 %	198282318
3571	NC_011206	CCT	2	6	165266	165271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282318
3572	NC_011206	CCG	2	6	165335	165340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282318
3573	NC_011206	CCGGC	2	10	165376	165385	0 %	0 %	40 %	60 %	198282318
3574	NC_011206	TTCT	2	8	165501	165508	0 %	75 %	0 %	25 %	198282318
3575	NC_011206	GCT	2	6	165509	165514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282318
3576	NC_011206	GCC	2	6	165565	165570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282318
3577	NC_011206	GCG	2	6	165679	165684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282318
3578	NC_011206	GTG	2	6	165761	165766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_011206	AGG	2	6	165795	165800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_011206	CAA	2	6	165856	165861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_011206	CGG	3	9	165915	165923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282319
3582	NC_011206	GGGCA	2	10	166019	166028	20 %	0 %	60 %	20 %	198282319
3583	NC_011206	TGGC	2	8	166093	166100	0 %	25 %	50 %	25 %	198282319
3584	NC_011206	GA	3	6	166161	166166	50 %	0 %	50 %	0 %	198282319
3585	NC_011206	CCG	2	6	166194	166199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282319
3586	NC_011206	G	6	6	166199	166204	0 %	0 %	100 %	0 %	198282319
3587	NC_011206	TCA	2	6	166209	166214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282319
3588	NC_011206	ATC	2	6	166301	166306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_011206	CTA	2	6	166317	166322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_011206	AGG	2	6	166342	166347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_011206	CCA	2	6	166372	166377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282320
3592	NC_011206	TGC	2	6	166423	166428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282320
3593	NC_011206	ATG	3	9	166442	166450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282320
3594	NC_011206	CCAA	2	8	166499	166506	50 %	0 %	0 %	50 %	198282320
3595	NC_011206	GACA	2	8	166531	166538	50 %	0 %	25 %	25 %	198282320
3596	NC_011206	GGAA	2	8	166590	166597	50 %	0 %	50 %	0 %	198282320
3597	NC_011206	GGAT	2	8	166718	166725	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_011206	AC	3	6	166774	166779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_011206	ACT	2	6	166793	166798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_011206	TAC	2	6	166804	166809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282321
3601	NC_011206	TCA	2	6	166831	166836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282321
3602	NC_011206	GCT	2	6	166844	166849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282321
3603	NC_011206	TTG	2	6	166878	166883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282321
3604	NC_011206	CTT	2	6	166899	166904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282321
3605	NC_011206	CAC	2	6	166932	166937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282321
3606	NC_011206	ACA	2	6	167145	167150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_011206	CTT	2	6	167172	167177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_011206	GAG	2	6	167178	167183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_011206	GAAC	2	8	167198	167205	50 %	0 %	25 %	25 %	198282322
3610	NC_011206	T	6	6	167211	167216	0 %	100 %	0 %	0 %	198282322
3611	NC_011206	GAT	2	6	167271	167276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282322
3612	NC_011206	GCGT	2	8	167349	167356	0 %	25 %	50 %	25 %	198282322
3613	NC_011206	GGC	2	6	167421	167426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282322
3614	NC_011206	CTG	2	6	167490	167495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282322
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3617	NC_011206	CTGG	2	8	167597	167604	0 %	25 %	50 %	25 %	198282322
3618	NC_011206	AGG	2	6	167765	167770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282322
3619	NC_011206	GGGCC	2	10	167868	167877	0 %	0 %	60 %	40 %	198282322
3620	NC_011206	CGG	2	6	167900	167905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282322
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3622	NC_011206	CCT	2	6	167926	167931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282322
3623	NC_011206	GAA	2	6	167946	167951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282322
3624	NC_011206	GCC	2	6	168072	168077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_011206	CCGTAT	2	12	168139	168150	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_011206	CAT	2	6	168363	168368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_011206	GAT	2	6	168372	168377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_011206	TCG	2	6	168573	168578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282323
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3743	NC_011206	TGGA	2	8	174536	174543	25 %	25 %	50 %	0 %	198282328
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3885	NC_011206	CT	3	6	180049	180054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3886	NC_011206	GCA	2	6	180115	180120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3989	NC_011206	CGCC	2	8	183984	183991	0 %	0 %	25 %	75 %	198282338
3990	NC_011206	GAA	2	6	183997	184002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282338
3991	NC_011206	GC	3	6	184065	184070	0 %	0 %	50 %	50 %	198282338
3992	NC_011206	CGT	2	6	184071	184076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282338
3993	NC_011206	AGG	2	6	184222	184227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3994	NC_011206	GGC	2	6	184299	184304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282339
3995	NC_011206	CATGGG	2	12	184313	184324	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198282339
3996	NC_011206	ATG	2	6	184326	184331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282339
3997	NC_011206	A	7	7	184332	184338	100 %	0 %	0 %	0 %	198282339
3998	NC_011206	GCG	2	6	184360	184365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282339
3999	NC_011206	GAT	2	6	184379	184384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282339
4000	NC_011206	AGA	2	6	184387	184392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282339

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