MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011206	CGC	2	6	45007	45012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282188
1002	NC_011206	TTG	2	6	45024	45029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282188
1003	NC_011206	GCC	2	6	45084	45089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282188
1004	NC_011206	GCC	3	9	45114	45122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282188
1005	NC_011206	GCC	2	6	45141	45146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282188
1006	NC_011206	CCA	2	6	45242	45247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282188
1007	NC_011206	GC	3	6	45361	45366	0 %	0 %	50 %	50 %	198282188
1008	NC_011206	GCC	2	6	45368	45373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282188
1009	NC_011206	ACG	2	6	45381	45386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282188
1010	NC_011206	GCG	2	6	45402	45407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282188
1011	NC_011206	TCC	2	6	45436	45441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282189
1012	NC_011206	CTG	2	6	45483	45488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1013	NC_011206	CCTGC	3	15	45509	45523	0 %	20 %	20 %	60 %	198282189
1014	NC_011206	CAGAGC	2	12	45583	45594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1015	NC_011206	GGT	2	6	45624	45629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282189
1016	NC_011206	TGGA	2	8	45637	45644	25 %	25 %	50 %	0 %	198282189
1017	NC_011206	GCC	2	6	45789	45794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282189
1018	NC_011206	GCC	2	6	45823	45828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282189
1019	NC_011206	GGC	2	6	45836	45841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282189
1020	NC_011206	GTG	2	6	45961	45966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282189
1021	NC_011206	CGA	2	6	45980	45985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1022	NC_011206	GCCA	2	8	46003	46010	25 %	0 %	25 %	50 %	198282189
1023	NC_011206	CGC	2	6	46061	46066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282189
1024	NC_011206	GCA	2	6	46079	46084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1025	NC_011206	CGCC	2	8	46091	46098	0 %	0 %	25 %	75 %	198282189
1026	NC_011206	TGA	2	6	46124	46129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282189
1027	NC_011206	CAG	3	9	46158	46166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1028	NC_011206	CGC	2	6	46213	46218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282189
1029	NC_011206	AGG	2	6	46219	46224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282189
1030	NC_011206	CAGG	2	8	46233	46240	25 %	0 %	50 %	25 %	198282189
1031	NC_011206	GAA	2	6	46266	46271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282189
1032	NC_011206	GAG	2	6	46278	46283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282189
1033	NC_011206	CAGC	2	8	46302	46309	25 %	0 %	25 %	50 %	198282189
1034	NC_011206	CCA	2	6	46326	46331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282189
1035	NC_011206	CGC	2	6	46343	46348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282189
1036	NC_011206	GCG	2	6	46381	46386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282189
1037	NC_011206	AGC	2	6	46387	46392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1038	NC_011206	CCG	2	6	46499	46504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282189
1039	NC_011206	GCAA	2	8	46555	46562	50 %	0 %	25 %	25 %	198282189
1040	NC_011206	GCA	2	6	46565	46570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1041	NC_011206	CAG	2	6	46632	46637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1042	NC_011206	CGC	2	6	46665	46670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282189
1043	NC_011206	GCC	2	6	46689	46694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282189
1044	NC_011206	CCA	2	6	46739	46744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282189
1045	NC_011206	CAG	2	6	46746	46751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1046	NC_011206	ACC	2	6	46813	46818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282189
1047	NC_011206	CAG	2	6	46833	46838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1048	NC_011206	GCA	2	6	46901	46906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1049	NC_011206	CAG	3	9	46938	46946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1050	NC_011206	GCT	2	6	46950	46955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1051	NC_011206	CAG	2	6	46968	46973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282189
1052	NC_011206	GCG	2	6	47053	47058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282189
1053	NC_011206	GGC	2	6	47154	47159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_011206	CCG	2	6	47172	47177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_011206	GAT	2	6	47247	47252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011206	GCA	2	6	47272	47277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_011206	GAT	2	6	47310	47315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011206	GAAT	2	8	47316	47323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011206	TAT	2	6	47330	47335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011206	T	6	6	47400	47405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011206	ACA	2	6	47537	47542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_011206	CAG	2	6	47575	47580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282190
1063	NC_011206	GTG	2	6	47604	47609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282190
1064	NC_011206	T	8	8	47739	47746	0 %	100 %	0 %	0 %	198282190
1065	NC_011206	GC	3	6	47774	47779	0 %	0 %	50 %	50 %	198282190
1066	NC_011206	T	6	6	47782	47787	0 %	100 %	0 %	0 %	198282190
1067	NC_011206	GCC	2	6	47793	47798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282190
1068	NC_011206	TCG	2	6	47801	47806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282190
1069	NC_011206	CTG	2	6	47886	47891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282190
1070	NC_011206	ACC	2	6	47910	47915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282190
1071	NC_011206	TGG	2	6	47934	47939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282190
1072	NC_011206	T	6	6	47959	47964	0 %	100 %	0 %	0 %	198282190
1073	NC_011206	TTA	2	6	47981	47986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282190
1074	NC_011206	CCATG	2	10	48005	48014	20 %	20 %	20 %	40 %	198282190
1075	NC_011206	GCT	2	6	48035	48040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282190
1076	NC_011206	GGT	2	6	48044	48049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282190
1077	NC_011206	CCG	2	6	48051	48056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282190
1078	NC_011206	GGC	3	9	48062	48070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282190
1079	NC_011206	GCG	2	6	48073	48078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282190
1080	NC_011206	CGGC	2	8	48109	48116	0 %	0 %	50 %	50 %	198282190
1081	NC_011206	TCC	2	6	48190	48195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282190
1082	NC_011206	TGCTGG	2	12	48283	48294	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	198282190
1083	NC_011206	GGC	2	6	48332	48337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282190
1084	NC_011206	ATC	2	6	48366	48371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282190
1085	NC_011206	TGG	2	6	48402	48407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282190
1086	NC_011206	TGG	2	6	48471	48476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282190
1087	NC_011206	GTG	3	9	48597	48605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282190
1088	NC_011206	GGC	2	6	48621	48626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282190
1089	NC_011206	CCCT	2	8	48654	48661	0 %	25 %	0 %	75 %	198282190
1090	NC_011206	GAA	2	6	48666	48671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282190
1091	NC_011206	AGA	2	6	48695	48700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282190
1092	NC_011206	GTG	2	6	48753	48758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011206	GCC	2	6	48900	48905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282191
1094	NC_011206	CGG	2	6	48990	48995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282191
1095	NC_011206	ATG	2	6	49017	49022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282191
1096	NC_011206	CGG	2	6	49079	49084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282191
1097	NC_011206	CGCCAC	2	12	49259	49270	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	198282191
1098	NC_011206	C	6	6	49363	49368	0 %	0 %	0 %	100 %	198282191
1099	NC_011206	ACA	2	6	49372	49377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282191
1100	NC_011206	CAT	2	6	49379	49384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282191
1101	NC_011206	TGC	2	6	49387	49392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282191
1102	NC_011206	GTG	2	6	49399	49404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282191
1103	NC_011206	ATC	2	6	49477	49482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282191
1104	NC_011206	GAA	2	6	49491	49496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282191
1105	NC_011206	ACCA	2	8	49512	49519	50 %	0 %	0 %	50 %	198282191
1106	NC_011206	A	7	7	49632	49638	100 %	0 %	0 %	0 %	198282192
1107	NC_011206	GCC	2	6	49698	49703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282192
1108	NC_011206	GAT	2	6	49836	49841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282192
1109	NC_011206	GGC	2	6	49893	49898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282192
1110	NC_011206	TAC	2	6	49902	49907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282192
1111	NC_011206	CTA	2	6	49970	49975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282192
1112	NC_011206	GCC	2	6	49985	49990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282192
1113	NC_011206	CACCAT	2	12	50024	50035	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	198282192
1114	NC_011206	TGC	2	6	50072	50077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282192
1115	NC_011206	GAA	2	6	50084	50089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282192
1116	NC_011206	TCA	2	6	50101	50106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282192
1117	NC_011206	TTG	2	6	50115	50120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282192
1118	NC_011206	CAT	2	6	50159	50164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282192
1119	NC_011206	CAGA	2	8	50264	50271	50 %	0 %	25 %	25 %	198282192
1120	NC_011206	GGC	2	6	50295	50300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282192
1121	NC_011206	CAT	2	6	50367	50372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282192
1122	NC_011206	CGC	2	6	50380	50385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282192
1123	NC_011206	ACA	2	6	50494	50499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282192
1124	NC_011206	CCG	2	6	50518	50523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282192
1125	NC_011206	GCG	2	6	50535	50540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282192
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1129	NC_011206	TCCC	2	8	50657	50664	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1130	NC_011206	TCAG	2	8	50669	50676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1163	NC_011206	CCG	2	6	52558	52563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1500	NC_011206	GCCT	2	8	66864	66871	0 %	25 %	25 %	50 %	198282211

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