MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_011206	ATG	2	6	312578	312583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282469
6503	NC_011206	GCG	2	6	312603	312608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282469
6504	NC_011206	GAT	2	6	312649	312654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282469
6505	NC_011206	GCG	2	6	312660	312665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282469
6506	NC_011206	CGG	2	6	312673	312678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282469
6507	NC_011206	GC	3	6	312681	312686	0 %	0 %	50 %	50 %	198282469
6508	NC_011206	TCG	2	6	312736	312741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282469
6509	NC_011206	CCCTGC	2	12	312762	312773	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	198282469
6510	NC_011206	GTG	2	6	312846	312851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282469
6511	NC_011206	GGA	2	6	312913	312918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282469
6512	NC_011206	ACCGG	2	10	312976	312985	20 %	0 %	40 %	40 %	198282469
6513	NC_011206	GCC	2	6	313065	313070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282469
6514	NC_011206	GAT	2	6	313082	313087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282469
6515	NC_011206	G	6	6	313120	313125	0 %	0 %	100 %	0 %	198282469
6516	NC_011206	GTG	2	6	313161	313166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_011206	TCAG	2	8	313205	313212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6518	NC_011206	GCG	2	6	313298	313303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282470
6519	NC_011206	AGC	2	6	313306	313311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282470
6520	NC_011206	GCA	2	6	313330	313335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282470
6521	NC_011206	CAG	2	6	313359	313364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282470
6522	NC_011206	CGG	2	6	313392	313397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282470
6523	NC_011206	AG	3	6	313424	313429	50 %	0 %	50 %	0 %	198282470
6524	NC_011206	GCC	2	6	313448	313453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282470
6525	NC_011206	CAG	2	6	313551	313556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282470
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6529	NC_011206	TTC	2	6	313752	313757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282470
6530	NC_011206	TTC	2	6	313887	313892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_011206	CAA	2	6	313986	313991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282471
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6533	NC_011206	AGCC	2	8	314110	314117	25 %	0 %	25 %	50 %	198282471
6534	NC_011206	CCA	2	6	314156	314161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282471
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6536	NC_011206	TCA	2	6	314225	314230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282471
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6538	NC_011206	GGC	2	6	314401	314406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_011206	CTC	2	6	314432	314437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6540	NC_011206	ACG	2	6	314541	314546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282472
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6542	NC_011206	CCT	2	6	314626	314631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282472
6543	NC_011206	GCG	2	6	314687	314692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282472
6544	NC_011206	GGC	2	6	314716	314721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282472
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6546	NC_011206	A	7	7	314796	314802	100 %	0 %	0 %	0 %	198282472
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6550	NC_011206	ATG	2	6	314922	314927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282472
6551	NC_011206	GGC	3	9	314947	314955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282472
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6553	NC_011206	CGC	2	6	315025	315030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282472
6554	NC_011206	TAC	2	6	315051	315056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282472
6555	NC_011206	TCC	2	6	315078	315083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282472
6556	NC_011206	CGGG	2	8	315113	315120	0 %	0 %	75 %	25 %	198282472
6557	NC_011206	TCT	2	6	315156	315161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282472
6558	NC_011206	TC	3	6	315169	315174	0 %	50 %	0 %	50 %	198282472
6559	NC_011206	CCA	2	6	315183	315188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282472
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6561	NC_011206	CATC	2	8	315319	315326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6562	NC_011206	AT	3	6	315345	315350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_011206	ATC	2	6	315364	315369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_011206	ATT	2	6	315392	315397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_011206	GGC	2	6	315501	315506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282473
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6571	NC_011206	GCT	2	6	315919	315924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282473
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6573	NC_011206	GGGC	2	8	316074	316081	0 %	0 %	75 %	25 %	198282473
6574	NC_011206	GTA	2	6	316160	316165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6588	NC_011206	TGG	2	6	316928	316933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_011206	GCA	2	6	316943	316948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282475
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6607	NC_011206	TGG	2	6	317796	317801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_011206	AAAAG	2	10	317835	317844	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_011206	AG	3	6	317898	317903	50 %	0 %	50 %	0 %	198282476
6610	NC_011206	CAT	2	6	317938	317943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282476
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6619	NC_011206	AAG	2	6	318324	318329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_011206	AG	3	6	318600	318605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_011206	TATC	2	8	318714	318721	25 %	50 %	0 %	25 %	198282477
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6745	NC_011206	GCG	2	6	324274	324279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282485
6746	NC_011206	GCC	2	6	324286	324291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282485
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6748	NC_011206	CTT	2	6	324357	324362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282485
6749	NC_011206	GAC	2	6	324384	324389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282485
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6753	NC_011206	CG	3	6	324505	324510	0 %	0 %	50 %	50 %	198282486
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6755	NC_011206	GGC	2	6	324569	324574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282486
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6759	NC_011206	CTG	2	6	324642	324647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282486
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6761	NC_011206	TGC	2	6	324889	324894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282486
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6774	NC_011206	T	6	6	325404	325409	0 %	100 %	0 %	0 %	198282487
6775	NC_011206	TGGCGG	2	12	325488	325499	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	198282487
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6988	NC_011206	GCC	2	6	334334	334339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282496
6989	NC_011206	GACG	2	8	334360	334367	25 %	0 %	50 %	25 %	198282496
6990	NC_011206	GAC	2	6	334483	334488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282496
6991	NC_011206	TGCGCC	2	12	334503	334514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	198282496
6992	NC_011206	C	6	6	334533	334538	0 %	0 %	0 %	100 %	198282496
6993	NC_011206	AGC	2	6	334622	334627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282497
6994	NC_011206	GGC	2	6	334795	334800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282497
6995	NC_011206	GCC	2	6	334822	334827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282497
6996	NC_011206	CGT	2	6	334845	334850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282497
6997	NC_011206	CTG	3	9	334966	334974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282497
6998	NC_011206	ACG	2	6	335015	335020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282497
6999	NC_011206	G	6	6	335030	335035	0 %	0 %	100 %	0 %	198282497
7000	NC_011206	GCGG	2	8	335061	335068	0 %	0 %	75 %	25 %	198282497

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