MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76 plasmid APP7_A

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010942	TTC	2	6	115	120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010942	TTA	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010942	GTC	2	6	217	222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010942	ACT	2	6	259	264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010942	TTC	2	6	620	625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010942	TTA	2	6	800	805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010942	TAT	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010942	CAA	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010942	TTC	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010942	CGT	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010942	GTA	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010942	TTA	2	6	1524	1529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010942	GTT	2	6	1618	1623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010942	TTC	2	6	2038	2043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151411
15	NC_010942	ATG	2	6	2208	2213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190151411
16	NC_010942	AAC	2	6	2281	2286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190151411
17	NC_010942	GCT	2	6	2423	2428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151411
18	NC_010942	TCA	2	6	2648	2653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151411
19	NC_010942	TGA	2	6	2696	2701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010942	CTT	2	6	2705	2710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010942	TCT	2	6	2816	2821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151412
22	NC_010942	TTG	2	6	2831	2836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151412
23	NC_010942	CTT	2	6	2844	2849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151412
24	NC_010942	ACC	2	6	2906	2911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190151412
25	NC_010942	AGC	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151412
26	NC_010942	AGC	2	6	3236	3241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151412
27	NC_010942	TGT	2	6	3255	3260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151412
28	NC_010942	GCT	2	6	3275	3280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151412
29	NC_010942	CAA	2	6	3418	3423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190151412
30	NC_010942	CTG	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151412
31	NC_010942	TTG	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151412
32	NC_010942	AAT	3	9	3659	3667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190151412
33	NC_010942	GGC	3	9	3893	3901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010942	ATT	2	6	3981	3986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010942	ATC	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010942	ATC	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010942	AAT	2	6	4175	4180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010942	TCA	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010942	TTC	2	6	4407	4412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010942	TCT	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010942	TAA	2	6	4464	4469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010942	ACC	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010942	TTA	2	6	4535	4540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010942	TTA	2	6	4643	4648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151413
45	NC_010942	AGT	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190151413
46	NC_010942	TTC	2	6	5023	5028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151414
47	NC_010942	CTG	2	6	5184	5189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151414
48	NC_010942	CTG	2	6	5265	5270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151414
49	NC_010942	GTT	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010942	GTA	2	6	5614	5619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.