MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76 plasmid ABB7_B

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010941	AGA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010941	TAG	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190151406
3	NC_010941	GAC	2	6	572	577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151406
4	NC_010941	TAA	2	6	640	645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190151406
5	NC_010941	GAA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190151406
6	NC_010941	ACA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190151406
7	NC_010941	TAC	2	6	860	865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151406
8	NC_010941	AAC	2	6	938	943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190151406
9	NC_010941	CAG	2	6	1209	1214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151406
10	NC_010941	CAG	2	6	1290	1295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151406
11	NC_010941	TAA	2	6	1446	1451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190151406
12	NC_010941	GTT	2	6	1452	1457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151406
13	NC_010941	TCT	2	6	1492	1497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151406
14	NC_010941	TAT	2	6	1515	1520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151406
15	NC_010941	ATA	2	6	1634	1639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010941	TAT	2	6	1703	1708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151407
17	NC_010941	TAC	2	6	1726	1731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151407
18	NC_010941	TAT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151407
19	NC_010941	TCA	2	6	1796	1801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151407
20	NC_010941	CGC	2	6	1947	1952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190151407
21	NC_010941	GTG	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190151407
22	NC_010941	ATC	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151407
23	NC_010941	TCG	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151407
24	NC_010941	CAT	2	6	2217	2222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151407
25	NC_010941	GCG	2	6	2233	2238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190151407
26	NC_010941	GCT	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151407
27	NC_010941	GCC	3	9	2491	2499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190151407
28	NC_010941	GGC	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190151407
29	NC_010941	GTG	2	6	2709	2714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190151408
30	NC_010941	CGC	2	6	2750	2755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190151408
31	NC_010941	AGG	2	6	2835	2840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190151408
32	NC_010941	AGG	2	6	2844	2849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190151408
33	NC_010941	CGG	2	6	2886	2891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190151408
34	NC_010941	GCA	2	6	2938	2943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151408
35	NC_010941	CTT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151408
36	NC_010941	CGC	2	6	3081	3086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190151408
37	NC_010941	GTT	2	6	3155	3160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151408
38	NC_010941	TGG	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190151408
39	NC_010941	GGC	2	6	3237	3242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190151408
40	NC_010941	CAG	2	6	3249	3254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151408
41	NC_010941	GCC	2	6	3432	3437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010941	CTA	2	6	3681	3686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010941	ACG	2	6	3702	3707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010941	GAA	2	6	3759	3764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010941	ACG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010941	TTG	2	6	3950	3955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010941	TAA	3	9	4171	4179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010941	TAA	2	6	4225	4230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.