MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii AYE plasmid p3ABAYE

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010404	TTAAT	2	10	652	661	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010404	TATTG	2	10	788	797	20 %	60 %	20 %	0 %	169786890
3	NC_010404	ATGCA	2	10	2176	2185	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010404	TGTAC	2	10	2491	2500	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010404	TTTAA	2	10	3112	3121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010404	TTTTC	2	10	4670	4679	0 %	80 %	0 %	20 %	169786891
7	NC_010404	ACTAC	2	10	8562	8571	40 %	20 %	0 %	40 %	169786893
8	NC_010404	TGCAT	2	10	9084	9093	20 %	40 %	20 %	20 %	169786893
9	NC_010404	TGAAA	2	10	9466	9475	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010404	AATTA	2	10	10113	10122	60 %	40 %	0 %	0 %	169786895
11	NC_010404	TTTAA	2	10	13217	13226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010404	ACCAC	2	10	14240	14249	40 %	0 %	0 %	60 %	169786899
13	NC_010404	GAAGC	2	10	15154	15163	40 %	0 %	40 %	20 %	169786900
14	NC_010404	TCCAA	2	10	15281	15290	40 %	20 %	0 %	40 %	169786900
15	NC_010404	GCGAT	2	10	16245	16254	20 %	20 %	40 %	20 %	169786902
16	NC_010404	CAATA	2	10	17213	17222	60 %	20 %	0 %	20 %	169786902
17	NC_010404	TTTCA	2	10	17276	17285	20 %	60 %	0 %	20 %	169786902
18	NC_010404	TTGCA	2	10	17929	17938	20 %	40 %	20 %	20 %	169786903
19	NC_010404	TAAGT	2	10	18795	18804	40 %	40 %	20 %	0 %	169786904
20	NC_010404	CATGA	2	10	18812	18821	40 %	20 %	20 %	20 %	169786904
21	NC_010404	TGATC	2	10	21763	21772	20 %	40 %	20 %	20 %	169786907
22	NC_010404	ATTAC	2	10	24992	25001	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010404	AACAT	2	10	26239	26248	60 %	20 %	0 %	20 %	169786910
24	NC_010404	GATTT	2	10	28068	28077	20 %	60 %	20 %	0 %	169786912
25	NC_010404	CTGAT	2	10	30237	30246	20 %	40 %	20 %	20 %	169786913
26	NC_010404	AATCA	2	10	31861	31870	60 %	20 %	0 %	20 %	169786914
27	NC_010404	AAGCA	2	10	32615	32624	60 %	0 %	20 %	20 %	169786915
28	NC_010404	AACCA	2	10	33184	33193	60 %	0 %	0 %	40 %	169786916
29	NC_010404	AAAAC	2	10	33382	33391	80 %	0 %	0 %	20 %	169786916
30	NC_010404	CGTAT	2	10	33815	33824	20 %	40 %	20 %	20 %	169786917
31	NC_010404	CTGAT	2	10	35556	35565	20 %	40 %	20 %	20 %	169786919
32	NC_010404	TTTAA	2	10	35808	35817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010404	CCTTT	2	10	36614	36623	0 %	60 %	0 %	40 %	169786921
34	NC_010404	AAATT	2	10	38797	38806	60 %	40 %	0 %	0 %	169786924
35	NC_010404	TTTTC	2	10	41271	41280	0 %	80 %	0 %	20 %	169786928
36	NC_010404	GCACA	2	10	42611	42620	40 %	0 %	20 %	40 %	169786931
37	NC_010404	TAAGT	2	10	45522	45531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010404	ACCTA	2	10	47317	47326	40 %	20 %	0 %	40 %	169786935
39	NC_010404	GTCAT	2	10	49283	49292	20 %	40 %	20 %	20 %	169786937
40	NC_010404	TCGAT	2	10	49376	49385	20 %	40 %	20 %	20 %	169786937
41	NC_010404	GATCG	2	10	49641	49650	20 %	20 %	40 %	20 %	169786937
42	NC_010404	TAAAT	2	10	51007	51016	60 %	40 %	0 %	0 %	169786937
43	NC_010404	AGTTT	2	10	52604	52613	20 %	60 %	20 %	0 %	169786937
44	NC_010404	AATCA	2	10	53215	53224	60 %	20 %	0 %	20 %	169786937
45	NC_010404	TCAAC	2	10	53834	53843	40 %	20 %	0 %	40 %	169786938
46	NC_010404	TGGCT	2	10	54382	54391	0 %	40 %	40 %	20 %	169786938
47	NC_010404	ATCAC	2	10	54641	54650	40 %	20 %	0 %	40 %	169786938
48	NC_010404	TTACG	2	10	55686	55695	20 %	40 %	20 %	20 %	169786938
49	NC_010404	ATCAA	2	10	56185	56194	60 %	20 %	0 %	20 %	169786939
50	NC_010404	CTGTA	2	10	57293	57302	20 %	40 %	20 %	20 %	169786939
51	NC_010404	TTGAA	2	10	58595	58604	40 %	40 %	20 %	0 %	169786940
52	NC_010404	TTGCT	2	10	61987	61996	0 %	60 %	20 %	20 %	169786941
53	NC_010404	AATAT	2	10	62605	62614	60 %	40 %	0 %	0 %	169786941
54	NC_010404	CTCAG	2	10	63918	63927	20 %	20 %	20 %	40 %	169786942
55	NC_010404	GTTCA	2	10	64865	64874	20 %	40 %	20 %	20 %	169786942
56	NC_010404	CTGCC	2	10	65723	65732	0 %	20 %	20 %	60 %	169786942
57	NC_010404	GCTCT	2	10	67863	67872	0 %	40 %	20 %	40 %	169786944
58	NC_010404	GTGTT	2	10	69796	69805	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010404	GCTAT	2	10	70263	70272	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010404	AAATC	2	10	71080	71089	60 %	20 %	0 %	20 %	169786947
61	NC_010404	TAACT	2	10	71914	71923	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010404	CTTTT	2	10	73229	73238	0 %	80 %	0 %	20 %	169786950
63	NC_010404	TAACT	2	10	73781	73790	40 %	40 %	0 %	20 %	169786952
64	NC_010404	ACCAA	2	10	74836	74845	60 %	0 %	0 %	40 %	169786955
65	NC_010404	TGAAC	2	10	76682	76691	40 %	20 %	20 %	20 %	169786958
66	NC_010404	TCTGA	2	10	77944	77953	20 %	40 %	20 %	20 %	169786959
67	NC_010404	TTTAC	2	10	78702	78711	20 %	60 %	0 %	20 %	169786961
68	NC_010404	AAATT	2	10	78753	78762	60 %	40 %	0 %	0 %	169786961
69	NC_010404	ATTAA	2	10	80940	80949	60 %	40 %	0 %	0 %	169786965
70	NC_010404	TTAAA	2	10	81361	81370	60 %	40 %	0 %	0 %	169786965
71	NC_010404	TTAAC	2	10	84413	84422	40 %	40 %	0 %	20 %	169786967
72	NC_010404	CTTGC	2	10	84634	84643	0 %	40 %	20 %	40 %	169786967
73	NC_010404	AATTG	2	10	88288	88297	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010404	AATCC	2	10	88326	88335	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_010404	TTGAT	2	10	88407	88416	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010404	CTCAC	2	10	88585	88594	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_010404	AATTA	2	10	89454	89463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010404	TTTTC	2	10	90716	90725	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010404	GAGTT	2	10	91623	91632	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010404	ATTAT	2	10	93463	93472	40 %	60 %	0 %	0 %	169786971

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.