MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii AYE plasmid p3ABAYE

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010404	ATTA	2	8	3	10	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010404	TAGA	2	8	52	59	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010404	ATTT	2	8	219	226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010404	GTTT	2	8	283	290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010404	ATTG	2	8	487	494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010404	TATT	2	8	558	565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010404	TATT	2	8	955	962	25 %	75 %	0 %	0 %	169786890
8	NC_010404	ATTT	2	8	1257	1264	25 %	75 %	0 %	0 %	169786890
9	NC_010404	AAGA	2	8	1823	1830	75 %	0 %	25 %	0 %	169786890
10	NC_010404	TGAA	2	8	1887	1894	50 %	25 %	25 %	0 %	169786890
11	NC_010404	TGAT	2	8	3094	3101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010404	ATCA	2	8	3282	3289	50 %	25 %	0 %	25 %	169786891
13	NC_010404	GATG	2	8	3394	3401	25 %	25 %	50 %	0 %	169786891
14	NC_010404	CCAG	2	8	3961	3968	25 %	0 %	25 %	50 %	169786891
15	NC_010404	TAAA	2	8	4250	4257	75 %	25 %	0 %	0 %	169786891
16	NC_010404	TGAC	2	8	4452	4459	25 %	25 %	25 %	25 %	169786891
17	NC_010404	ACGT	2	8	4694	4701	25 %	25 %	25 %	25 %	169786891
18	NC_010404	AAAG	2	8	4855	4862	75 %	0 %	25 %	0 %	169786891
19	NC_010404	TTCC	2	8	4952	4959	0 %	50 %	0 %	50 %	169786891
20	NC_010404	TAAA	2	8	5141	5148	75 %	25 %	0 %	0 %	169786891
21	NC_010404	TAAA	2	8	5965	5972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010404	AGGC	2	8	6389	6396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010404	TGAC	2	8	6438	6445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010404	TAAA	2	8	6526	6533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010404	AAGC	2	8	6849	6856	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010404	TTTG	2	8	7277	7284	0 %	75 %	25 %	0 %	169786892
27	NC_010404	ATCA	2	8	7495	7502	50 %	25 %	0 %	25 %	169786892
28	NC_010404	TCTT	2	8	7909	7916	0 %	75 %	0 %	25 %	169786892
29	NC_010404	AATT	2	8	8189	8196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010404	ATTT	2	8	8220	8227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010404	CATC	2	8	8527	8534	25 %	25 %	0 %	50 %	169786893
32	NC_010404	CAAC	2	8	8784	8791	50 %	0 %	0 %	50 %	169786893
33	NC_010404	AGCA	2	8	8916	8923	50 %	0 %	25 %	25 %	169786893
34	NC_010404	TAAA	2	8	9171	9178	75 %	25 %	0 %	0 %	169786893
35	NC_010404	GATT	2	8	9660	9667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010404	CAAA	2	8	9797	9804	75 %	0 %	0 %	25 %	169786894
37	NC_010404	TCAT	2	8	9805	9812	25 %	50 %	0 %	25 %	169786894
38	NC_010404	CAGC	2	8	10204	10211	25 %	0 %	25 %	50 %	169786895
39	NC_010404	AATT	2	8	10233	10240	50 %	50 %	0 %	0 %	169786895
40	NC_010404	CTTT	2	8	10484	10491	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010404	TCAC	2	8	10563	10570	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010404	TTTA	2	8	11594	11601	25 %	75 %	0 %	0 %	169786896
43	NC_010404	TAAA	2	8	12273	12280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010404	AATT	2	8	12314	12321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010404	ACTT	2	8	12709	12716	25 %	50 %	0 %	25 %	169786897
46	NC_010404	TAAA	2	8	12888	12895	75 %	25 %	0 %	0 %	169786897
47	NC_010404	TTTC	3	12	13057	13068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010404	TAGG	2	8	13679	13686	25 %	25 %	50 %	0 %	169786898
49	NC_010404	GGAT	2	8	13802	13809	25 %	25 %	50 %	0 %	169786898
50	NC_010404	TGAT	2	8	13918	13925	25 %	50 %	25 %	0 %	169786898
51	NC_010404	TGCT	2	8	14212	14219	0 %	50 %	25 %	25 %	169786899
52	NC_010404	GATG	2	8	14618	14625	25 %	25 %	50 %	0 %	169786899
53	NC_010404	AGAA	2	8	14695	14702	75 %	0 %	25 %	0 %	169786899
54	NC_010404	TGAC	2	8	14747	14754	25 %	25 %	25 %	25 %	169786899
55	NC_010404	TTTA	2	8	14999	15006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010404	TAAT	2	8	15119	15126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010404	ATCT	2	8	15485	15492	25 %	50 %	0 %	25 %	169786900
58	NC_010404	TAAT	2	8	15760	15767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010404	TTGA	2	8	15969	15976	25 %	50 %	25 %	0 %	169786901
60	NC_010404	TTTC	2	8	16009	16016	0 %	75 %	0 %	25 %	169786901
61	NC_010404	CATA	2	8	16201	16208	50 %	25 %	0 %	25 %	169786902
62	NC_010404	GCCA	2	8	16234	16241	25 %	0 %	25 %	50 %	169786902
63	NC_010404	ATAA	2	8	16358	16365	75 %	25 %	0 %	0 %	169786902
64	NC_010404	CAAC	2	8	16519	16526	50 %	0 %	0 %	50 %	169786902
65	NC_010404	ACCA	2	8	16595	16602	50 %	0 %	0 %	50 %	169786902
66	NC_010404	ATGT	2	8	16948	16955	25 %	50 %	25 %	0 %	169786902
67	NC_010404	CCTT	2	8	17334	17341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010404	AGGA	2	8	17361	17368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010404	CTAA	2	8	17708	17715	50 %	25 %	0 %	25 %	169786903
70	NC_010404	ATCT	2	8	19145	19152	25 %	50 %	0 %	25 %	169786904
71	NC_010404	TAGA	2	8	19797	19804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010404	TTTA	2	8	19841	19848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010404	TAAA	2	8	19894	19901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010404	TTAT	2	8	20522	20529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010404	CAAA	2	8	20759	20766	75 %	0 %	0 %	25 %	169786906
76	NC_010404	AGAT	2	8	21605	21612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010404	CATG	2	8	21648	21655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010404	TCAT	2	8	21656	21663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010404	CATG	2	8	21670	21677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010404	ATGA	2	8	22033	22040	50 %	25 %	25 %	0 %	169786907
81	NC_010404	CCAG	2	8	22049	22056	25 %	0 %	25 %	50 %	169786907
82	NC_010404	GATT	2	8	22345	22352	25 %	50 %	25 %	0 %	169786907
83	NC_010404	TCAT	2	8	22947	22954	25 %	50 %	0 %	25 %	169786908
84	NC_010404	CAAA	2	8	23314	23321	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010404	TAAA	2	8	23772	23779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010404	GCAA	2	8	24104	24111	50 %	0 %	25 %	25 %	169786909
87	NC_010404	GATT	2	8	24439	24446	25 %	50 %	25 %	0 %	169786909
88	NC_010404	TTTA	2	8	25218	25225	25 %	75 %	0 %	0 %	169786910
89	NC_010404	ACTG	2	8	25347	25354	25 %	25 %	25 %	25 %	169786910
90	NC_010404	GCAT	2	8	25500	25507	25 %	25 %	25 %	25 %	169786910
91	NC_010404	ATTT	2	8	26509	26516	25 %	75 %	0 %	0 %	169786911
92	NC_010404	GTAT	2	8	26615	26622	25 %	50 %	25 %	0 %	169786911
93	NC_010404	TAAA	2	8	27132	27139	75 %	25 %	0 %	0 %	169786911
94	NC_010404	ACTG	2	8	27268	27275	25 %	25 %	25 %	25 %	169786911
95	NC_010404	TACT	2	8	27287	27294	25 %	50 %	0 %	25 %	169786911
96	NC_010404	TGGT	2	8	27795	27802	0 %	50 %	50 %	0 %	169786912
97	NC_010404	ATTA	2	8	27935	27942	50 %	50 %	0 %	0 %	169786912
98	NC_010404	TTTG	2	8	28414	28421	0 %	75 %	25 %	0 %	169786912
99	NC_010404	GAAA	2	8	28515	28522	75 %	0 %	25 %	0 %	169786912
100	NC_010404	GATT	2	8	29075	29082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010404	TTGC	2	8	29386	29393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010404	TCAC	2	8	30144	30151	25 %	25 %	0 %	50 %	169786913
103	NC_010404	CATG	2	8	31835	31842	25 %	25 %	25 %	25 %	169786914
104	NC_010404	GTTA	2	8	31942	31949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010404	TGCT	2	8	32648	32655	0 %	50 %	25 %	25 %	169786915
106	NC_010404	AAAG	2	8	33587	33594	75 %	0 %	25 %	0 %	169786916
107	NC_010404	ACAA	2	8	33618	33625	75 %	0 %	0 %	25 %	169786916
108	NC_010404	AATG	2	8	36562	36569	50 %	25 %	25 %	0 %	169786921
109	NC_010404	ATTT	2	8	37085	37092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010404	ATAA	2	8	37312	37319	75 %	25 %	0 %	0 %	169786922
111	NC_010404	TAAA	2	8	37472	37479	75 %	25 %	0 %	0 %	169786922
112	NC_010404	AATA	2	8	38077	38084	75 %	25 %	0 %	0 %	169786922
113	NC_010404	AGAC	3	12	38097	38108	50 %	0 %	25 %	25 %	169786922
114	NC_010404	ATGA	2	8	38600	38607	50 %	25 %	25 %	0 %	169786923
115	NC_010404	ATTG	2	8	39377	39384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010404	AAAT	2	8	39387	39394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010404	TTAA	2	8	39499	39506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010404	ATTA	2	8	39655	39662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010404	TTCC	2	8	39903	39910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010404	TTGT	2	8	40019	40026	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010404	GATC	2	8	40052	40059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010404	CCTA	2	8	40132	40139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010404	TCAA	2	8	41356	41363	50 %	25 %	0 %	25 %	169786928
124	NC_010404	TATT	2	8	41374	41381	25 %	75 %	0 %	0 %	169786928
125	NC_010404	AATT	2	8	41403	41410	50 %	50 %	0 %	0 %	169786928
126	NC_010404	TAAA	2	8	41826	41833	75 %	25 %	0 %	0 %	169786929
127	NC_010404	ATTA	2	8	42075	42082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010404	TGTT	2	8	42201	42208	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010404	CATT	2	8	42822	42829	25 %	50 %	0 %	25 %	169786931
130	NC_010404	TACT	2	8	43571	43578	25 %	50 %	0 %	25 %	169786933
131	NC_010404	TTAG	2	8	44065	44072	25 %	50 %	25 %	0 %	169786933
132	NC_010404	ATTT	2	8	44143	44150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010404	AGCA	2	8	44469	44476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010404	TAAA	2	8	44836	44843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010404	ATTT	2	8	44922	44929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010404	TACA	2	8	44946	44953	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010404	AAAT	3	12	46248	46259	75 %	25 %	0 %	0 %	169786935
138	NC_010404	GTGA	2	8	46407	46414	25 %	25 %	50 %	0 %	169786935
139	NC_010404	TGCA	2	8	46483	46490	25 %	25 %	25 %	25 %	169786935
140	NC_010404	TTCA	2	8	46864	46871	25 %	50 %	0 %	25 %	169786935
141	NC_010404	TAAA	2	8	46994	47001	75 %	25 %	0 %	0 %	169786935
142	NC_010404	ATTC	3	12	47517	47528	25 %	50 %	0 %	25 %	169786935
143	NC_010404	ATTG	2	8	47561	47568	25 %	50 %	25 %	0 %	169786935
144	NC_010404	GAAT	2	8	48015	48022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010404	GTCA	2	8	48206	48213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010404	CCAG	2	8	48433	48440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010404	AATC	2	8	48450	48457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.