MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii AYE plasmid p2ABAYE

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010402	ATT	2	6	452	457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010402	ATA	2	6	620	625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010402	AAC	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302981
4	NC_010402	TTG	2	6	750	755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302981
5	NC_010402	CTG	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302981
6	NC_010402	GAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302981
7	NC_010402	TAG	2	6	1075	1080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302981
8	NC_010402	TAG	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302981
9	NC_010402	AGA	3	9	1341	1349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302981
10	NC_010402	ATC	2	6	1775	1780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302982
11	NC_010402	AAG	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302982
12	NC_010402	TGA	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302982
13	NC_010402	GAA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302982
14	NC_010402	CAA	2	6	1872	1877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302982
15	NC_010402	CAG	2	6	1927	1932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302982
16	NC_010402	CAC	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302982
17	NC_010402	ACA	2	6	1983	1988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302982
18	NC_010402	CAA	2	6	1989	1994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302982
19	NC_010402	AAT	2	6	2013	2018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302982
20	NC_010402	ATT	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302983
21	NC_010402	GCT	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302983
22	NC_010402	GAA	2	6	2295	2300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302983
23	NC_010402	ATT	2	6	2343	2348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302983
24	NC_010402	TGA	2	6	2378	2383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010402	AAT	2	6	2384	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010402	TAT	2	6	2503	2508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010402	GTG	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010402	GAA	3	9	2635	2643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010402	ATC	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010402	ATT	2	6	2818	2823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302984
31	NC_010402	AAT	2	6	2831	2836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302984
32	NC_010402	TGC	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302984
33	NC_010402	CAT	2	6	2875	2880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302984
34	NC_010402	ATG	2	6	2909	2914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302984
35	NC_010402	AAC	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302984
36	NC_010402	GTA	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302984
37	NC_010402	AGT	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302984
38	NC_010402	CTT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302984
39	NC_010402	TCT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302984
40	NC_010402	CAA	2	6	3340	3345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302984
41	NC_010402	ACC	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302984
42	NC_010402	TGA	2	6	3647	3652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302984
43	NC_010402	CAA	2	6	3664	3669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302984
44	NC_010402	TAA	2	6	3802	3807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302984
45	NC_010402	ATA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302984
46	NC_010402	ATA	2	6	3903	3908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302984
47	NC_010402	TGG	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010402	CAA	2	6	3988	3993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010402	AGC	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010402	ACT	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010402	TAA	2	6	4177	4182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010402	CTT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010402	AAT	2	6	4265	4270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010402	ATT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010402	GAA	2	6	4487	4492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302985
56	NC_010402	TGG	2	6	4536	4541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169302985
57	NC_010402	TGA	2	6	4555	4560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302985
58	NC_010402	ATC	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302985
59	NC_010402	TGA	2	6	4724	4729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302986
60	NC_010402	CAA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302986
61	NC_010402	TCA	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302986
62	NC_010402	TAG	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010402	GTT	2	6	5060	5065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010402	TAC	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302987
65	NC_010402	TGA	2	6	5184	5189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
66	NC_010402	TAT	2	6	5343	5348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302987
67	NC_010402	AAT	2	6	5386	5391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
68	NC_010402	GTG	2	6	5477	5482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169302987
69	NC_010402	TAC	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302987
70	NC_010402	CAG	2	6	5627	5632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302987
71	NC_010402	CTC	2	6	5708	5713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302987
72	NC_010402	AGA	2	6	5742	5747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302987
73	NC_010402	ATA	2	6	5846	5851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
74	NC_010402	ATG	2	6	5882	5887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
75	NC_010402	TAT	2	6	5986	5991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302987
76	NC_010402	TCA	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302987
77	NC_010402	ATG	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
78	NC_010402	ATT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302987
79	NC_010402	ATA	2	6	6329	6334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
80	NC_010402	AAG	2	6	6359	6364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302987
81	NC_010402	ACC	2	6	6370	6375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302987
82	NC_010402	CAG	2	6	6388	6393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302987
83	NC_010402	TAA	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
84	NC_010402	TAA	2	6	6585	6590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
85	NC_010402	CTA	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302987
86	NC_010402	AAT	2	6	6823	6828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
87	NC_010402	GAT	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
88	NC_010402	CTG	2	6	6992	6997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302987
89	NC_010402	CCT	2	6	7180	7185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302987
90	NC_010402	TGA	2	6	7218	7223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
91	NC_010402	ATA	2	6	7268	7273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
92	NC_010402	AAT	2	6	7378	7383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
93	NC_010402	GAA	2	6	7442	7447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302987
94	NC_010402	TCT	2	6	7494	7499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010402	AGA	2	6	7513	7518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010402	CAG	2	6	7603	7608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010402	CAA	2	6	7820	7825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302988
98	NC_010402	AAC	2	6	7845	7850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302988
99	NC_010402	ACT	2	6	7909	7914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302988
100	NC_010402	ATG	2	6	7995	8000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302988
101	NC_010402	TGA	2	6	8032	8037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302988
102	NC_010402	GCA	2	6	8066	8071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302988
103	NC_010402	TCA	2	6	8144	8149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302988
104	NC_010402	TGA	2	6	8164	8169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302988
105	NC_010402	TCA	2	6	8593	8598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302989
106	NC_010402	AAT	2	6	8724	8729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302989
107	NC_010402	ACT	2	6	8740	8745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302989
108	NC_010402	ATC	2	6	8762	8767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302990
109	NC_010402	CAT	2	6	8843	8848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302990
110	NC_010402	ATC	2	6	8909	8914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302990
111	NC_010402	AAT	2	6	9009	9014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302990
112	NC_010402	TTA	2	6	9125	9130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010402	TAA	2	6	9186	9191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010402	GTT	2	6	9330	9335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010402	GTG	2	6	9487	9492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169302991

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.