MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii SDF plasmid p1ABSDF

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010395	ATA	2	6	312	317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010395	GAA	2	6	492	497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302964
3	NC_010395	TTG	2	6	503	508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302964
4	NC_010395	TAA	2	6	524	529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302964
5	NC_010395	AAC	2	6	557	562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302964
6	NC_010395	TAA	2	6	767	772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302964
7	NC_010395	TGA	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302964
8	NC_010395	TGT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302964
9	NC_010395	AGT	2	6	901	906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302964
10	NC_010395	GTA	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302964
11	NC_010395	AGA	2	6	987	992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302964
12	NC_010395	AAC	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302964
13	NC_010395	ATT	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302964
14	NC_010395	ACA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302964
15	NC_010395	CTT	2	6	1218	1223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302964
16	NC_010395	TTA	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302966
17	NC_010395	GTA	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302966
18	NC_010395	CCA	2	6	2067	2072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302966
19	NC_010395	GAT	2	6	2073	2078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302966
20	NC_010395	AGT	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302966
21	NC_010395	ATA	2	6	2097	2102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302966
22	NC_010395	TAT	2	6	2113	2118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302966
23	NC_010395	CAT	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302966
24	NC_010395	CAT	2	6	2434	2439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302966
25	NC_010395	TAC	2	6	2471	2476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302966
26	NC_010395	ATT	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302966
27	NC_010395	CTT	3	9	2521	2529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302966
28	NC_010395	TGG	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169302967
29	NC_010395	CTT	2	6	2886	2891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302967
30	NC_010395	AAC	2	6	2915	2920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302967
31	NC_010395	TTG	2	6	2966	2971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302967
32	NC_010395	CAT	2	6	2997	3002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302967
33	NC_010395	ATG	2	6	3020	3025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302967
34	NC_010395	ATA	2	6	3280	3285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302968
35	NC_010395	TAA	2	6	3369	3374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302968
36	NC_010395	TCA	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302968
37	NC_010395	TAA	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302968
38	NC_010395	GCC	2	6	3612	3617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169302969
39	NC_010395	TCC	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302969
40	NC_010395	CCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302969
41	NC_010395	ACC	2	6	3741	3746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302969
42	NC_010395	TCT	2	6	3787	3792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302969
43	NC_010395	CCA	2	6	3853	3858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302969
44	NC_010395	CCT	2	6	3919	3924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302969
45	NC_010395	CTC	2	6	3935	3940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302969
46	NC_010395	TTC	2	6	3965	3970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302969
47	NC_010395	TTG	2	6	3976	3981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302969
48	NC_010395	CTC	2	6	4113	4118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302969
49	NC_010395	CCT	2	6	4201	4206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302969
50	NC_010395	GAT	2	6	4271	4276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302969
51	NC_010395	ATT	2	6	4278	4283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302969
52	NC_010395	CAT	2	6	4331	4336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302969
53	NC_010395	GAA	2	6	4359	4364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302969
54	NC_010395	CTT	2	6	4386	4391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302969
55	NC_010395	TCT	2	6	4396	4401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302969
56	NC_010395	CTT	2	6	4415	4420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302969
57	NC_010395	CTT	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302969
58	NC_010395	TGT	2	6	4455	4460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302969
59	NC_010395	AAC	3	9	4473	4481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302969
60	NC_010395	CAT	2	6	4643	4648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302969
61	NC_010395	GAA	2	6	4763	4768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302969
62	NC_010395	ATC	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302969
63	NC_010395	TAG	2	6	4880	4885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302969
64	NC_010395	ATT	2	6	4887	4892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302969
65	NC_010395	CAA	2	6	4898	4903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302969
66	NC_010395	TTC	2	6	4983	4988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302970
67	NC_010395	CTT	2	6	5009	5014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302970
68	NC_010395	GTT	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302970
69	NC_010395	TCA	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302970
70	NC_010395	AGA	2	6	5313	5318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302970
71	NC_010395	ACA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302971
72	NC_010395	GAA	2	6	5505	5510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302971
73	NC_010395	ACA	2	6	5681	5686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302971
74	NC_010395	AGA	2	6	5765	5770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302971
75	NC_010395	TCA	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302971
76	NC_010395	ACT	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302971
77	NC_010395	AAC	2	6	6045	6050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302971

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.