MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 44292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_010278	ATT	2	6	2225217	2225222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165977477
44003	NC_010278	TAAA	2	8	2225300	2225307	75 %	25 %	0 %	0 %	165977477
44004	NC_010278	CTA	2	6	2225395	2225400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44005	NC_010278	A	6	6	2225407	2225412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44006	NC_010278	T	6	6	2225433	2225438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44007	NC_010278	TCA	2	6	2225541	2225546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977478
44008	NC_010278	T	6	6	2225647	2225652	0 %	100 %	0 %	0 %	165977478
44009	NC_010278	TTG	2	6	2225669	2225674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165977478
44010	NC_010278	CA	3	6	2225786	2225791	50 %	0 %	0 %	50 %	165977478
44011	NC_010278	CCAG	2	8	2225818	2225825	25 %	0 %	25 %	50 %	165977478
44012	NC_010278	TTC	2	6	2225855	2225860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165977478
44013	NC_010278	AAT	2	6	2226001	2226006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165977479
44014	NC_010278	ATT	2	6	2226025	2226030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165977479
44015	NC_010278	ATG	2	6	2226139	2226144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165977479
44016	NC_010278	TCA	2	6	2226177	2226182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977479
44017	NC_010278	GCGAAA	2	12	2226411	2226422	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	165977479
44018	NC_010278	CCA	2	6	2226477	2226482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165977479
44019	NC_010278	GTC	2	6	2226502	2226507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165977479
44020	NC_010278	T	7	7	2226579	2226585	0 %	100 %	0 %	0 %	165977479
44021	NC_010278	ATA	2	6	2226586	2226591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165977479
44022	NC_010278	CAAG	2	8	2226642	2226649	50 %	0 %	25 %	25 %	165977479
44023	NC_010278	TTG	2	6	2226670	2226675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165977479
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44026	NC_010278	CGT	2	6	2226937	2226942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165977479
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44028	NC_010278	T	6	6	2226988	2226993	0 %	100 %	0 %	0 %	165977479
44029	NC_010278	TTGC	2	8	2227060	2227067	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44030	NC_010278	TTA	2	6	2227076	2227081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165977480
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44032	NC_010278	GATT	2	8	2227150	2227157	25 %	50 %	25 %	0 %	165977480
44033	NC_010278	TCA	2	6	2227183	2227188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977480
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44040	NC_010278	ATTTAT	2	12	2227570	2227581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165977480
44041	NC_010278	ATACG	2	10	2227621	2227630	40 %	20 %	20 %	20 %	165977480
44042	NC_010278	ATAG	2	8	2227733	2227740	50 %	25 %	25 %	0 %	165977480
44043	NC_010278	ATT	2	6	2227748	2227753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165977480
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44045	NC_010278	TAA	2	6	2227996	2228001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165977480
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44051	NC_010278	CAT	2	6	2228308	2228313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977480
44052	NC_010278	GATAT	2	10	2228333	2228342	40 %	40 %	20 %	0 %	165977480
44053	NC_010278	TAAA	2	8	2228377	2228384	75 %	25 %	0 %	0 %	165977480
44054	NC_010278	A	6	6	2228534	2228539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44055	NC_010278	TTG	2	6	2228558	2228563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44056	NC_010278	ATT	2	6	2228566	2228571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165977481
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44086	NC_010278	TAAA	2	8	2230721	2230728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44088	NC_010278	T	6	6	2230750	2230755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44089	NC_010278	TGG	2	6	2230864	2230869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165977483
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44115	NC_010278	TTTTG	2	10	2232357	2232366	0 %	80 %	20 %	0 %	165977484
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44119	NC_010278	TCA	2	6	2232665	2232670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977484
44120	NC_010278	GTA	2	6	2232696	2232701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165977484
44121	NC_010278	ATT	2	6	2232811	2232816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165977485
44122	NC_010278	TGC	2	6	2232848	2232853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165977485
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44224	NC_010278	AATT	2	8	2238413	2238420	50 %	50 %	0 %	0 %	165977491
44225	NC_010278	TCA	2	6	2238436	2238441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977491
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.