MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB8

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009933	GAGTT	2	10	3987	3996	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009933	TTCTG	2	10	4440	4449	0 %	60 %	20 %	20 %	158341507
3	NC_009933	GGTGC	2	10	6158	6167	0 %	20 %	60 %	20 %	158341507
4	NC_009933	GGTTC	2	10	6730	6739	0 %	40 %	40 %	20 %	158341507
5	NC_009933	TGAGC	2	10	6938	6947	20 %	20 %	40 %	20 %	158341507
6	NC_009933	AGCAA	2	10	8709	8718	60 %	0 %	20 %	20 %	158341508
7	NC_009933	CCAAA	2	10	13753	13762	60 %	0 %	0 %	40 %	158341516
8	NC_009933	CCCAG	2	10	14484	14493	20 %	0 %	20 %	60 %	158341518
9	NC_009933	TTTCT	2	10	14670	14679	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009933	GAGCA	2	10	15043	15052	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009933	GAGTG	2	10	15842	15851	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009933	TCCCT	2	10	16256	16265	0 %	40 %	0 %	60 %	158341521
13	NC_009933	TTGCA	2	10	20205	20214	20 %	40 %	20 %	20 %	158341524
14	NC_009933	CAACT	2	10	20483	20492	40 %	20 %	0 %	40 %	158341524
15	NC_009933	GTACA	2	10	22042	22051	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009933	ATTTG	2	10	22533	22542	20 %	60 %	20 %	0 %	158341527
17	NC_009933	AGCTG	2	10	25564	25573	20 %	20 %	40 %	20 %	158341530
18	NC_009933	GCGGA	2	10	27128	27137	20 %	0 %	60 %	20 %	158341529
19	NC_009933	CACAC	2	10	30004	30013	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_009933	ATTTG	2	10	32115	32124	20 %	60 %	20 %	0 %	158341542
21	NC_009933	GACAA	2	10	32405	32414	60 %	0 %	20 %	20 %	158341543
22	NC_009933	GAACT	2	10	32702	32711	40 %	20 %	20 %	20 %	158341543
23	NC_009933	CCAAT	2	10	33612	33621	40 %	20 %	0 %	40 %	158341545
24	NC_009933	TGCTG	2	10	34129	34138	0 %	40 %	40 %	20 %	158341546
25	NC_009933	TGTGA	2	10	34161	34170	20 %	40 %	40 %	0 %	158341546
26	NC_009933	CTTAC	2	10	38187	38196	20 %	40 %	0 %	40 %	158341553
27	NC_009933	AAGTT	2	10	38443	38452	40 %	40 %	20 %	0 %	158341553
28	NC_009933	CCTAG	2	10	38509	38518	20 %	20 %	20 %	40 %	158341553
29	NC_009933	ATTTG	2	10	40202	40211	20 %	60 %	20 %	0 %	158341556
30	NC_009933	AAGGA	2	10	40609	40618	60 %	0 %	40 %	0 %	158341557
31	NC_009933	GGATA	2	10	41202	41211	40 %	20 %	40 %	0 %	158341557
32	NC_009933	GTCCA	2	10	44712	44721	20 %	20 %	20 %	40 %	158341559
33	NC_009933	AATTA	2	10	45328	45337	60 %	40 %	0 %	0 %	158341560
34	NC_009933	TAGAA	2	10	47060	47069	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009933	GGGCT	2	10	56088	56097	0 %	20 %	60 %	20 %	158341565
36	NC_009933	ATTTA	2	10	56919	56928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009933	TGACT	2	10	58447	58456	20 %	40 %	20 %	20 %	158341568
38	NC_009933	CTTAG	2	10	62636	62645	20 %	40 %	20 %	20 %	158341570
39	NC_009933	CATTG	2	10	65715	65724	20 %	40 %	20 %	20 %	158341572
40	NC_009933	TTGGA	2	10	73804	73813	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009933	TTTGT	2	10	80337	80346	0 %	80 %	20 %	0 %	158341585
42	NC_009933	CTCAA	2	10	82945	82954	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009933	CTTTT	2	10	83516	83525	0 %	80 %	0 %	20 %	158341588
44	NC_009933	AGATC	2	10	83619	83628	40 %	20 %	20 %	20 %	158341588
45	NC_009933	TTTGT	2	10	90803	90812	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009933	CTGGT	2	10	92526	92535	0 %	40 %	40 %	20 %	158341594
47	NC_009933	ATCGC	2	10	95304	95313	20 %	20 %	20 %	40 %	158341595
48	NC_009933	GAAGG	2	10	95719	95728	40 %	0 %	60 %	0 %	158341595
49	NC_009933	TTTGA	2	10	98310	98319	20 %	60 %	20 %	0 %	158341597
50	NC_009933	ACTAA	2	10	98614	98623	60 %	20 %	0 %	20 %	158341597
51	NC_009933	GAAAT	2	10	101781	101790	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009933	AATTT	2	10	101860	101869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009933	TAACT	2	10	103377	103386	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009933	TTGAA	2	10	103503	103512	40 %	40 %	20 %	0 %	158341603
55	NC_009933	GGTTG	2	10	105502	105511	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009933	AGGAA	2	10	106563	106572	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009933	CCCCA	2	10	106961	106970	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
58	NC_009933	CCAAT	2	10	107286	107295	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009933	AATGG	2	10	108113	108122	40 %	20 %	40 %	0 %	158341606
60	NC_009933	AGACC	2	10	110703	110712	40 %	0 %	20 %	40 %	158341609
61	NC_009933	CTCTT	2	10	114061	114070	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_009933	TCAAA	2	10	114968	114977	60 %	20 %	0 %	20 %	158341614
63	NC_009933	GCTAG	2	10	115566	115575	20 %	20 %	40 %	20 %	158341614
64	NC_009933	CTTTT	2	10	115922	115931	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009933	ATTTG	2	10	118311	118320	20 %	60 %	20 %	0 %	158341618
66	NC_009933	GTTTC	2	10	119481	119490	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009933	TTGGA	2	10	119785	119794	20 %	40 %	40 %	0 %	158341620
68	NC_009933	CATGT	2	10	119931	119940	20 %	40 %	20 %	20 %	158341620

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.