MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB7

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009932	AT	3	6	2047	2052	50 %	50 %	0 %	0 %	158341332
2	NC_009932	TA	4	8	2323	2330	50 %	50 %	0 %	0 %	158341332
3	NC_009932	AT	3	6	2712	2717	50 %	50 %	0 %	0 %	158341332
4	NC_009932	AT	3	6	2723	2728	50 %	50 %	0 %	0 %	158341332
5	NC_009932	AG	3	6	2911	2916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009932	AC	3	6	7665	7670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009932	AG	3	6	8969	8974	50 %	0 %	50 %	0 %	158341336
8	NC_009932	GA	3	6	9494	9499	50 %	0 %	50 %	0 %	158341336
9	NC_009932	TC	3	6	9618	9623	0 %	50 %	0 %	50 %	158341336
10	NC_009932	CA	3	6	14122	14127	50 %	0 %	0 %	50 %	158341339
11	NC_009932	GA	3	6	14528	14533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009932	TC	4	8	17769	17776	0 %	50 %	0 %	50 %	158341340
13	NC_009932	TG	3	6	19371	19376	0 %	50 %	50 %	0 %	158341342
14	NC_009932	GT	3	6	19499	19504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009932	AT	3	6	19650	19655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009932	AT	3	6	20210	20215	50 %	50 %	0 %	0 %	158341344
17	NC_009932	TA	3	6	20297	20302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009932	CA	3	6	20982	20987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009932	GA	3	6	21177	21182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009932	AT	3	6	22227	22232	50 %	50 %	0 %	0 %	158341348
21	NC_009932	AG	3	6	24090	24095	50 %	0 %	50 %	0 %	158341349
22	NC_009932	CT	3	6	24502	24507	0 %	50 %	0 %	50 %	158341350
23	NC_009932	TC	3	6	24815	24820	0 %	50 %	0 %	50 %	158341350
24	NC_009932	CT	3	6	26850	26855	0 %	50 %	0 %	50 %	158341350
25	NC_009932	GT	3	6	27294	27299	0 %	50 %	50 %	0 %	158341350
26	NC_009932	AT	3	6	28057	28062	50 %	50 %	0 %	0 %	158341351
27	NC_009932	CT	3	6	29194	29199	0 %	50 %	0 %	50 %	158341352
28	NC_009932	CT	3	6	29389	29394	0 %	50 %	0 %	50 %	158341353
29	NC_009932	CT	3	6	30226	30231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009932	TC	3	6	30711	30716	0 %	50 %	0 %	50 %	158341356
31	NC_009932	CT	3	6	30911	30916	0 %	50 %	0 %	50 %	158341356
32	NC_009932	AT	3	6	31124	31129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009932	CA	3	6	31144	31149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009932	AT	3	6	32555	32560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009932	TC	3	6	32877	32882	0 %	50 %	0 %	50 %	158341360
36	NC_009932	TA	3	6	32887	32892	50 %	50 %	0 %	0 %	158341360
37	NC_009932	TG	3	6	35731	35736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009932	GT	3	6	35869	35874	0 %	50 %	50 %	0 %	158341362
39	NC_009932	TC	3	6	35962	35967	0 %	50 %	0 %	50 %	158341362
40	NC_009932	TC	3	6	36166	36171	0 %	50 %	0 %	50 %	158341362
41	NC_009932	TC	3	6	36951	36956	0 %	50 %	0 %	50 %	158341363
42	NC_009932	CA	3	6	37125	37130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009932	TA	3	6	37519	37524	50 %	50 %	0 %	0 %	158341364
44	NC_009932	GA	3	6	37641	37646	50 %	0 %	50 %	0 %	158341364
45	NC_009932	AG	3	6	38092	38097	50 %	0 %	50 %	0 %	158341365
46	NC_009932	GA	3	6	39318	39323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009932	TG	4	8	41631	41638	0 %	50 %	50 %	0 %	158341370
48	NC_009932	CT	4	8	45075	45082	0 %	50 %	0 %	50 %	158341372
49	NC_009932	GT	3	6	45230	45235	0 %	50 %	50 %	0 %	158341372
50	NC_009932	AC	3	6	45679	45684	50 %	0 %	0 %	50 %	158341373
51	NC_009932	CA	3	6	46553	46558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009932	CT	3	6	47877	47882	0 %	50 %	0 %	50 %	158341375
53	NC_009932	GT	3	6	48158	48163	0 %	50 %	50 %	0 %	158341375
54	NC_009932	GA	3	6	48197	48202	50 %	0 %	50 %	0 %	158341375
55	NC_009932	AT	3	6	48213	48218	50 %	50 %	0 %	0 %	158341375
56	NC_009932	TC	3	6	49813	49818	0 %	50 %	0 %	50 %	158341376
57	NC_009932	TA	3	6	50081	50086	50 %	50 %	0 %	0 %	158341376
58	NC_009932	AT	3	6	50376	50381	50 %	50 %	0 %	0 %	158341376
59	NC_009932	AC	3	6	51136	51141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009932	TC	3	6	51275	51280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009932	AT	3	6	52269	52274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009932	TC	4	8	52351	52358	0 %	50 %	0 %	50 %	158341378
63	NC_009932	GA	3	6	53307	53312	50 %	0 %	50 %	0 %	158341378
64	NC_009932	TA	3	6	53632	53637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009932	CT	3	6	53899	53904	0 %	50 %	0 %	50 %	158341379
66	NC_009932	AT	3	6	53953	53958	50 %	50 %	0 %	0 %	158341379
67	NC_009932	CA	3	6	54956	54961	50 %	0 %	0 %	50 %	158341380
68	NC_009932	TC	3	6	55191	55196	0 %	50 %	0 %	50 %	158341380
69	NC_009932	TC	3	6	55227	55232	0 %	50 %	0 %	50 %	158341380
70	NC_009932	CT	3	6	55250	55255	0 %	50 %	0 %	50 %	158341380
71	NC_009932	TC	3	6	55877	55882	0 %	50 %	0 %	50 %	158341380
72	NC_009932	CA	3	6	56446	56451	50 %	0 %	0 %	50 %	158341380
73	NC_009932	GA	3	6	56920	56925	50 %	0 %	50 %	0 %	158341380
74	NC_009932	AG	3	6	57139	57144	50 %	0 %	50 %	0 %	158341380
75	NC_009932	TG	3	6	57467	57472	0 %	50 %	50 %	0 %	158341381
76	NC_009932	AG	3	6	57839	57844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009932	AC	3	6	57909	57914	50 %	0 %	0 %	50 %	158341382
78	NC_009932	TC	3	6	58461	58466	0 %	50 %	0 %	50 %	158341383
79	NC_009932	TC	3	6	58864	58869	0 %	50 %	0 %	50 %	158341383
80	NC_009932	CT	3	6	60188	60193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009932	TA	3	6	60305	60310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009932	TA	3	6	60327	60332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009932	CA	3	6	60756	60761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009932	AC	3	6	61455	61460	50 %	0 %	0 %	50 %	158341386
85	NC_009932	AT	3	6	63332	63337	50 %	50 %	0 %	0 %	158341388
86	NC_009932	CT	3	6	63480	63485	0 %	50 %	0 %	50 %	158341388
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88	NC_009932	CT	3	6	63666	63671	0 %	50 %	0 %	50 %	158341388
89	NC_009932	CT	3	6	64567	64572	0 %	50 %	0 %	50 %	158341388
90	NC_009932	AG	3	6	64916	64921	50 %	0 %	50 %	0 %	158341388
91	NC_009932	CT	3	6	65407	65412	0 %	50 %	0 %	50 %	158341388
92	NC_009932	GA	3	6	67157	67162	50 %	0 %	50 %	0 %	158341391
93	NC_009932	TG	3	6	67363	67368	0 %	50 %	50 %	0 %	158341391
94	NC_009932	AG	3	6	68929	68934	50 %	0 %	50 %	0 %	158341393
95	NC_009932	AG	3	6	70580	70585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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97	NC_009932	AG	3	6	71922	71927	50 %	0 %	50 %	0 %	158341396
98	NC_009932	AT	4	8	72030	72037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009932	AT	3	6	72997	73002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009932	AG	3	6	73065	73070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009932	AT	3	6	73287	73292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009932	AT	3	6	73773	73778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009932	CT	3	6	74723	74728	0 %	50 %	0 %	50 %	158341400
104	NC_009932	TC	3	6	75024	75029	0 %	50 %	0 %	50 %	158341400
105	NC_009932	GA	3	6	75058	75063	50 %	0 %	50 %	0 %	158341400
106	NC_009932	AT	3	6	77064	77069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009932	CT	3	6	78584	78589	0 %	50 %	0 %	50 %	158341404
108	NC_009932	TC	3	6	80880	80885	0 %	50 %	0 %	50 %	158341406
109	NC_009932	TA	3	6	80993	80998	50 %	50 %	0 %	0 %	158341406
110	NC_009932	CA	3	6	81309	81314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009932	GA	3	6	81404	81409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009932	GC	3	6	81705	81710	0 %	0 %	50 %	50 %	158341408
113	NC_009932	AG	3	6	81909	81914	50 %	0 %	50 %	0 %	158341408
114	NC_009932	CT	3	6	82003	82008	0 %	50 %	0 %	50 %	158341408
115	NC_009932	CA	3	6	82331	82336	50 %	0 %	0 %	50 %	158341409
116	NC_009932	GC	3	6	83712	83717	0 %	0 %	50 %	50 %	158341410
117	NC_009932	GA	3	6	85047	85052	50 %	0 %	50 %	0 %	158341412
118	NC_009932	TA	3	6	85151	85156	50 %	50 %	0 %	0 %	158341412
119	NC_009932	AC	3	6	85394	85399	50 %	0 %	0 %	50 %	158341412
120	NC_009932	TC	3	6	86661	86666	0 %	50 %	0 %	50 %	158341414
121	NC_009932	AG	3	6	86739	86744	50 %	0 %	50 %	0 %	158341414
122	NC_009932	CT	3	6	87376	87381	0 %	50 %	0 %	50 %	158341417
123	NC_009932	TA	4	8	87731	87738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009932	GA	3	6	89575	89580	50 %	0 %	50 %	0 %	158341419
125	NC_009932	GA	3	6	90083	90088	50 %	0 %	50 %	0 %	158341420
126	NC_009932	TC	3	6	90743	90748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009932	TC	3	6	90782	90787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009932	GT	3	6	93690	93695	0 %	50 %	50 %	0 %	158341425
129	NC_009932	GA	3	6	93724	93729	50 %	0 %	50 %	0 %	158341425
130	NC_009932	TG	3	6	96065	96070	0 %	50 %	50 %	0 %	158341426
131	NC_009932	TC	4	8	96137	96144	0 %	50 %	0 %	50 %	158341426
132	NC_009932	AG	3	6	97473	97478	50 %	0 %	50 %	0 %	158341426
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136	NC_009932	TC	3	6	100134	100139	0 %	50 %	0 %	50 %	158341427
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139	NC_009932	AG	3	6	103335	103340	50 %	0 %	50 %	0 %	158341432
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141	NC_009932	AT	3	6	105236	105241	50 %	50 %	0 %	0 %	158341435
142	NC_009932	AT	3	6	105965	105970	50 %	50 %	0 %	0 %	158341436
143	NC_009932	TC	3	6	106084	106089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_009932	TG	3	6	107730	107735	0 %	50 %	50 %	0 %	158341440
146	NC_009932	AG	3	6	107810	107815	50 %	0 %	50 %	0 %	158341440
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.