MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB7

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009932	CCCAA	2	10	163	172	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_009932	GTCAG	2	10	1224	1233	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009932	CTTAA	2	10	1748	1757	40 %	40 %	0 %	20 %	158341332
4	NC_009932	TTCTT	2	10	2647	2656	0 %	80 %	0 %	20 %	158341332
5	NC_009932	GATTT	2	10	2850	2859	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009932	CTAAT	2	10	7523	7532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009932	TTTCC	2	10	7721	7730	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009932	TAGGC	2	10	8981	8990	20 %	20 %	40 %	20 %	158341336
9	NC_009932	TAATC	2	10	10670	10679	40 %	40 %	0 %	20 %	158341336
10	NC_009932	CCCTG	2	10	12060	12069	0 %	20 %	20 %	60 %	158341338
11	NC_009932	CATCA	2	10	12899	12908	40 %	20 %	0 %	40 %	158341338
12	NC_009932	GGCAG	2	10	14452	14461	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009932	CTGGT	2	10	18439	18448	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009932	ATTTA	2	10	18573	18582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009932	GTTAA	2	10	19768	19777	40 %	40 %	20 %	0 %	158341343
16	NC_009932	ATTAG	2	10	20224	20233	40 %	40 %	20 %	0 %	158341344
17	NC_009932	AATTT	2	10	20559	20568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009932	TATTG	2	10	20992	21001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009932	AATTT	2	10	21030	21039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009932	TTCAA	2	10	21815	21824	40 %	40 %	0 %	20 %	158341348
21	NC_009932	TGTTC	2	10	22783	22792	0 %	60 %	20 %	20 %	158341348
22	NC_009932	CAGCC	2	10	24463	24472	20 %	0 %	20 %	60 %	158341350
23	NC_009932	TGAAA	2	10	24749	24758	60 %	20 %	20 %	0 %	158341350
24	NC_009932	ACAGC	2	10	26340	26349	40 %	0 %	20 %	40 %	158341350
25	NC_009932	TCGTG	2	10	28185	28194	0 %	40 %	40 %	20 %	158341351
26	NC_009932	TGAAC	2	10	28642	28651	40 %	20 %	20 %	20 %	158341352
27	NC_009932	TTGTC	2	10	29261	29270	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009932	AAAAT	2	10	29279	29288	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009932	TGTCA	2	10	34121	34130	20 %	40 %	20 %	20 %	158341361
30	NC_009932	ATCTC	2	10	35548	35557	20 %	40 %	0 %	40 %	158341361
31	NC_009932	AAGTC	2	10	36996	37005	40 %	20 %	20 %	20 %	158341363
32	NC_009932	CTTCA	2	10	37149	37158	20 %	40 %	0 %	40 %	158341364
33	NC_009932	TTGCT	2	10	37997	38006	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009932	ACCCA	2	10	41226	41235	40 %	0 %	0 %	60 %	158341369
35	NC_009932	ATCCA	2	10	41543	41552	40 %	20 %	0 %	40 %	158341369
36	NC_009932	GTAGG	2	10	43528	43537	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009932	CAAAG	2	10	43559	43568	60 %	0 %	20 %	20 %	158341371
38	NC_009932	GCAAG	2	10	43679	43688	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009932	GATGC	2	10	44647	44656	20 %	20 %	40 %	20 %	158341372
40	NC_009932	ATGGT	2	10	47762	47771	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009932	GCTTG	2	10	50734	50743	0 %	40 %	40 %	20 %	158341376
42	NC_009932	CCCCA	2	10	51507	51516	20 %	0 %	0 %	80 %	158341377
43	NC_009932	AAGTG	2	10	52132	52141	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009932	AGTCT	2	10	53891	53900	20 %	40 %	20 %	20 %	158341379
45	NC_009932	CTCCC	2	10	54015	54024	0 %	20 %	0 %	80 %	158341380
46	NC_009932	GATTT	2	10	56090	56099	20 %	60 %	20 %	0 %	158341380
47	NC_009932	CGGTC	2	10	59472	59481	0 %	20 %	40 %	40 %	158341383
48	NC_009932	CTGTT	2	10	59818	59827	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009932	AATGC	2	10	60604	60613	40 %	20 %	20 %	20 %	158341385
50	NC_009932	CCCAA	2	10	61224	61233	40 %	0 %	0 %	60 %	158341386
51	NC_009932	ACAGC	2	10	61273	61282	40 %	0 %	20 %	40 %	158341386
52	NC_009932	CCTCG	2	10	66212	66221	0 %	20 %	20 %	60 %	158341390
53	NC_009932	ATTTG	2	10	67650	67659	20 %	60 %	20 %	0 %	158341391
54	NC_009932	CCCAA	2	10	69279	69288	40 %	0 %	0 %	60 %	158341393
55	NC_009932	ATCAG	2	10	71275	71284	40 %	20 %	20 %	20 %	158341396
56	NC_009932	TAAAG	2	10	71423	71432	60 %	20 %	20 %	0 %	158341396
57	NC_009932	TTAAT	2	10	72098	72107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009932	TAAAT	2	10	73253	73262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009932	TATTT	2	10	73703	73712	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009932	TTTCC	2	10	76683	76692	0 %	60 %	0 %	40 %	158341403
61	NC_009932	ACGGT	2	10	76840	76849	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009932	GGTTG	2	10	77418	77427	0 %	40 %	60 %	0 %	158341404
63	NC_009932	AAGGC	2	10	79106	79115	40 %	0 %	40 %	20 %	158341404
64	NC_009932	TTGAG	2	10	79279	79288	20 %	40 %	40 %	0 %	158341404
65	NC_009932	CTAGA	2	10	81077	81086	40 %	20 %	20 %	20 %	158341406
66	NC_009932	TAACG	2	10	82592	82601	40 %	20 %	20 %	20 %	158341409
67	NC_009932	TGCAA	2	10	83297	83306	40 %	20 %	20 %	20 %	158341410
68	NC_009932	CAATG	2	10	84363	84372	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009932	CATAC	2	10	86570	86579	40 %	20 %	0 %	40 %	158341414
70	NC_009932	TCTAG	2	10	87645	87654	20 %	40 %	20 %	20 %	158341418
71	NC_009932	AGACC	2	10	89751	89760	40 %	0 %	20 %	40 %	158341420
72	NC_009932	GATCA	2	10	93052	93061	40 %	20 %	20 %	20 %	158341424
73	NC_009932	TTCTG	2	10	94253	94262	0 %	60 %	20 %	20 %	158341426
74	NC_009932	TTTGC	2	10	95829	95838	0 %	60 %	20 %	20 %	158341426
75	NC_009932	GGTGC	2	10	95971	95980	0 %	20 %	60 %	20 %	158341426
76	NC_009932	TTGTT	2	10	96335	96344	0 %	80 %	20 %	0 %	158341426
77	NC_009932	TGAGC	2	10	96751	96760	20 %	20 %	40 %	20 %	158341426
78	NC_009932	GATCC	2	10	99504	99513	20 %	20 %	20 %	40 %	158341427
79	NC_009932	TGAAG	2	10	100268	100277	40 %	20 %	40 %	0 %	158341427
80	NC_009932	CAGAC	2	10	102606	102615	40 %	0 %	20 %	40 %	158341431
81	NC_009932	CATTT	2	10	104057	104066	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009932	ACCAG	2	10	104349	104358	40 %	0 %	20 %	40 %	158341434
83	NC_009932	AAGGC	2	10	105950	105959	40 %	0 %	40 %	20 %	158341436
84	NC_009932	CAAAT	2	10	107793	107802	60 %	20 %	0 %	20 %	158341440
85	NC_009932	AACAG	2	10	108738	108747	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009932	TCATA	2	10	109085	109094	40 %	40 %	0 %	20 %	158341442
87	NC_009932	GGCTG	2	10	110652	110661	0 %	20 %	60 %	20 %	158341444
88	NC_009932	AATCA	2	10	110928	110937	60 %	20 %	0 %	20 %	158341444
89	NC_009932	CAAAG	2	10	118007	118016	60 %	0 %	20 %	20 %	158341452
90	NC_009932	CCTAT	2	10	119616	119625	20 %	40 %	0 %	40 %	158341458
91	NC_009932	ACCTA	2	10	120773	120782	40 %	20 %	0 %	40 %	158341459
92	NC_009932	CAATC	2	10	121693	121702	40 %	20 %	0 %	40 %	158341459
93	NC_009932	GCAGA	2	10	122675	122684	40 %	0 %	40 %	20 %	158341462
94	NC_009932	CTAAC	2	10	123391	123400	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_009932	CAAAA	2	10	123547	123556	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009932	CCTGA	2	10	124071	124080	20 %	20 %	20 %	40 %	158341464
97	NC_009932	ATTGA	2	10	124675	124684	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009932	TAAAA	2	10	124800	124809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009932	CACTT	2	10	127000	127009	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_009932	AGTTC	2	10	128611	128620	20 %	40 %	20 %	20 %	158341473
101	NC_009932	GACAA	2	10	129103	129112	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009932	GAACT	2	10	129400	129409	40 %	20 %	20 %	20 %	158341475
103	NC_009932	CCAAT	2	10	130310	130319	40 %	20 %	0 %	40 %	158341477
104	NC_009932	TGCTG	2	10	130827	130836	0 %	40 %	40 %	20 %	158341478
105	NC_009932	TGTGA	2	10	130859	130868	20 %	40 %	40 %	0 %	158341478
106	NC_009932	CAGCC	2	10	134727	134736	20 %	0 %	20 %	60 %	158341487
107	NC_009932	CAATA	2	10	135636	135645	60 %	20 %	0 %	20 %	158341488
108	NC_009932	CCCTG	2	10	138142	138151	0 %	20 %	20 %	60 %	158341491
109	NC_009932	AGTCA	2	10	141471	141480	40 %	20 %	20 %	20 %	158341492
110	NC_009932	GACCG	2	10	143159	143168	20 %	0 %	40 %	40 %	158341493
111	NC_009932	TCTGA	2	10	145208	145217	20 %	40 %	20 %	20 %	158341493
112	NC_009932	ATTCC	2	10	145670	145679	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_009932	TTTAT	2	10	147134	147143	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009932	TCAAA	2	10	148203	148212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009932	TAGCC	2	10	150791	150800	20 %	20 %	20 %	40 %	158341502

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.