MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 386

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009928	AG	3	6	1391	1396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009928	CT	3	6	1538	1543	0 %	50 %	0 %	50 %	158340459
3	NC_009928	CT	3	6	1565	1570	0 %	50 %	0 %	50 %	158340459
4	NC_009928	CT	3	6	1576	1581	0 %	50 %	0 %	50 %	158340459
5	NC_009928	CT	3	6	2773	2778	0 %	50 %	0 %	50 %	158340461
6	NC_009928	AT	3	6	3658	3663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009928	AC	3	6	4029	4034	50 %	0 %	0 %	50 %	158340464
8	NC_009928	GA	3	6	4271	4276	50 %	0 %	50 %	0 %	158340464
9	NC_009928	GA	3	6	5120	5125	50 %	0 %	50 %	0 %	158340465
10	NC_009928	TA	3	6	5825	5830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009928	GA	3	6	6050	6055	50 %	0 %	50 %	0 %	158340467
12	NC_009928	AC	3	6	6246	6251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009928	AG	3	6	7002	7007	50 %	0 %	50 %	0 %	158340468
14	NC_009928	CT	3	6	7197	7202	0 %	50 %	0 %	50 %	158340468
15	NC_009928	AT	3	6	8060	8065	50 %	50 %	0 %	0 %	158340468
16	NC_009928	AC	3	6	8124	8129	50 %	0 %	0 %	50 %	158340468
17	NC_009928	AT	3	6	10345	10350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009928	AT	3	6	10722	10727	50 %	50 %	0 %	0 %	158340469
19	NC_009928	AG	3	6	11232	11237	50 %	0 %	50 %	0 %	158340469
20	NC_009928	AG	3	6	12424	12429	50 %	0 %	50 %	0 %	158340469
21	NC_009928	GT	3	6	12704	12709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009928	TC	3	6	12998	13003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009928	CA	3	6	13676	13681	50 %	0 %	0 %	50 %	158340470
24	NC_009928	TG	3	6	14509	14514	0 %	50 %	50 %	0 %	158340471
25	NC_009928	GT	3	6	14900	14905	0 %	50 %	50 %	0 %	158340471
26	NC_009928	GT	3	6	15390	15395	0 %	50 %	50 %	0 %	158340471
27	NC_009928	TA	3	6	16483	16488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009928	CT	3	6	16668	16673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009928	TC	3	6	19521	19526	0 %	50 %	0 %	50 %	158340474
30	NC_009928	CT	3	6	21060	21065	0 %	50 %	0 %	50 %	158340474
31	NC_009928	TG	3	6	22269	22274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009928	TA	3	6	23195	23200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009928	AT	4	8	23213	23220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009928	GA	3	6	23552	23557	50 %	0 %	50 %	0 %	158340478
35	NC_009928	AC	3	6	25816	25821	50 %	0 %	0 %	50 %	158340478
36	NC_009928	GT	3	6	25879	25884	0 %	50 %	50 %	0 %	158340478
37	NC_009928	AG	3	6	26642	26647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009928	TG	3	6	27297	27302	0 %	50 %	50 %	0 %	158340483
39	NC_009928	CT	3	6	28851	28856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009928	TG	3	6	34271	34276	0 %	50 %	50 %	0 %	158340488
41	NC_009928	CT	3	6	37110	37115	0 %	50 %	0 %	50 %	158340489
42	NC_009928	TC	3	6	37690	37695	0 %	50 %	0 %	50 %	158340489
43	NC_009928	GA	3	6	38561	38566	50 %	0 %	50 %	0 %	158340490
44	NC_009928	GA	3	6	38757	38762	50 %	0 %	50 %	0 %	158340491
45	NC_009928	GA	3	6	38846	38851	50 %	0 %	50 %	0 %	158340491
46	NC_009928	AT	3	6	40319	40324	50 %	50 %	0 %	0 %	158340491
47	NC_009928	AT	3	6	40472	40477	50 %	50 %	0 %	0 %	158340491
48	NC_009928	TA	3	6	42645	42650	50 %	50 %	0 %	0 %	158340494
49	NC_009928	TC	4	8	42700	42707	0 %	50 %	0 %	50 %	158340494
50	NC_009928	CT	3	6	43410	43415	0 %	50 %	0 %	50 %	158340495
51	NC_009928	AG	3	6	44788	44793	50 %	0 %	50 %	0 %	158340495
52	NC_009928	AT	3	6	45590	45595	50 %	50 %	0 %	0 %	158340495
53	NC_009928	TC	3	6	46196	46201	0 %	50 %	0 %	50 %	158340495
54	NC_009928	GA	3	6	46402	46407	50 %	0 %	50 %	0 %	158340495
55	NC_009928	AG	3	6	46453	46458	50 %	0 %	50 %	0 %	158340495
56	NC_009928	CT	3	6	46648	46653	0 %	50 %	0 %	50 %	158340495
57	NC_009928	AT	3	6	47301	47306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009928	GA	3	6	47345	47350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009928	CT	3	6	47881	47886	0 %	50 %	0 %	50 %	158340496
60	NC_009928	AT	3	6	48687	48692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009928	GA	3	6	48733	48738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009928	CT	3	6	48803	48808	0 %	50 %	0 %	50 %	158340497
63	NC_009928	AT	3	6	49643	49648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009928	AG	3	6	50069	50074	50 %	0 %	50 %	0 %	158340498
65	NC_009928	TG	3	6	50690	50695	0 %	50 %	50 %	0 %	158340498
66	NC_009928	AT	3	6	50833	50838	50 %	50 %	0 %	0 %	158340499
67	NC_009928	AT	3	6	50950	50955	50 %	50 %	0 %	0 %	158340499
68	NC_009928	TA	3	6	51264	51269	50 %	50 %	0 %	0 %	158340499
69	NC_009928	TA	3	6	51566	51571	50 %	50 %	0 %	0 %	158340500
70	NC_009928	AT	3	6	51642	51647	50 %	50 %	0 %	0 %	158340500
71	NC_009928	TG	3	6	52390	52395	0 %	50 %	50 %	0 %	158340501
72	NC_009928	TC	3	6	52408	52413	0 %	50 %	0 %	50 %	158340501
73	NC_009928	TC	3	6	52520	52525	0 %	50 %	0 %	50 %	158340501
74	NC_009928	TG	3	6	52589	52594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009928	AG	4	8	52802	52809	50 %	0 %	50 %	0 %	158340502
76	NC_009928	TC	3	6	52859	52864	0 %	50 %	0 %	50 %	158340502
77	NC_009928	CA	3	6	53004	53009	50 %	0 %	0 %	50 %	158340502
78	NC_009928	GT	3	6	53276	53281	0 %	50 %	50 %	0 %	158340502
79	NC_009928	AG	4	8	53423	53430	50 %	0 %	50 %	0 %	158340502
80	NC_009928	TG	3	6	54641	54646	0 %	50 %	50 %	0 %	158340505
81	NC_009928	GA	3	6	54890	54895	50 %	0 %	50 %	0 %	158340505
82	NC_009928	GA	3	6	56075	56080	50 %	0 %	50 %	0 %	158340507
83	NC_009928	TC	3	6	57783	57788	0 %	50 %	0 %	50 %	158340509
84	NC_009928	CT	3	6	58869	58874	0 %	50 %	0 %	50 %	158340510
85	NC_009928	CA	4	8	58999	59006	50 %	0 %	0 %	50 %	158340510
86	NC_009928	GC	3	6	60354	60359	0 %	0 %	50 %	50 %	158340511
87	NC_009928	TC	3	6	62116	62121	0 %	50 %	0 %	50 %	158340513
88	NC_009928	TC	3	6	62570	62575	0 %	50 %	0 %	50 %	158340514
89	NC_009928	GA	3	6	64231	64236	50 %	0 %	50 %	0 %	158340515
90	NC_009928	TA	3	6	64518	64523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009928	TC	3	6	64589	64594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009928	CT	3	6	65068	65073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009928	TA	3	6	65249	65254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009928	TC	3	6	66269	66274	0 %	50 %	0 %	50 %	158340518
95	NC_009928	CG	3	6	66416	66421	0 %	0 %	50 %	50 %	158340519
96	NC_009928	AG	3	6	67015	67020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009928	AT	3	6	67216	67221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009928	AG	3	6	67832	67837	50 %	0 %	50 %	0 %	158340520
99	NC_009928	GC	3	6	68901	68906	0 %	0 %	50 %	50 %	158340521
100	NC_009928	CA	3	6	70028	70033	50 %	0 %	0 %	50 %	158340522
101	NC_009928	CA	3	6	70513	70518	50 %	0 %	0 %	50 %	158340522
102	NC_009928	CA	3	6	70787	70792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009928	TA	3	6	71851	71856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009928	TG	3	6	72701	72706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009928	CA	3	6	72724	72729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009928	TC	3	6	72784	72789	0 %	50 %	0 %	50 %	158340529
107	NC_009928	AG	3	6	73001	73006	50 %	0 %	50 %	0 %	158340529
108	NC_009928	GA	3	6	73144	73149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009928	TC	3	6	73361	73366	0 %	50 %	0 %	50 %	158340530
110	NC_009928	CA	3	6	74816	74821	50 %	0 %	0 %	50 %	158340531
111	NC_009928	AG	4	8	75861	75868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009928	TG	3	6	76622	76627	0 %	50 %	50 %	0 %	158340533
113	NC_009928	TC	3	6	76667	76672	0 %	50 %	0 %	50 %	158340533
114	NC_009928	AC	3	6	77795	77800	50 %	0 %	0 %	50 %	158340534
115	NC_009928	AC	3	6	78190	78195	50 %	0 %	0 %	50 %	158340534
116	NC_009928	CA	3	6	78529	78534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009928	CT	3	6	78674	78679	0 %	50 %	0 %	50 %	158340535
118	NC_009928	CT	4	8	79719	79726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009928	TA	4	8	80056	80063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009928	TC	3	6	80391	80396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009928	AG	3	6	80905	80910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009928	CA	3	6	81246	81251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009928	TA	3	6	81415	81420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009928	AG	3	6	82207	82212	50 %	0 %	50 %	0 %	158340538
125	NC_009928	TC	3	6	82685	82690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009928	CA	3	6	84347	84352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009928	TG	3	6	84622	84627	0 %	50 %	50 %	0 %	158340543
128	NC_009928	AT	3	6	85330	85335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009928	TA	3	6	85417	85422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009928	AT	3	6	85674	85679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009928	TA	3	6	86935	86940	50 %	50 %	0 %	0 %	158340546
132	NC_009928	AT	3	6	87158	87163	50 %	50 %	0 %	0 %	158340546
133	NC_009928	TA	3	6	87831	87836	50 %	50 %	0 %	0 %	158340547
134	NC_009928	AC	3	6	88832	88837	50 %	0 %	0 %	50 %	158340549
135	NC_009928	AT	3	6	89126	89131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009928	CA	3	6	89487	89492	50 %	0 %	0 %	50 %	158340551
137	NC_009928	GA	3	6	89658	89663	50 %	0 %	50 %	0 %	158340551
138	NC_009928	AT	3	6	90398	90403	50 %	50 %	0 %	0 %	158340552
139	NC_009928	CA	3	6	90505	90510	50 %	0 %	0 %	50 %	158340552
140	NC_009928	CA	3	6	90550	90555	50 %	0 %	0 %	50 %	158340552
141	NC_009928	TG	3	6	91438	91443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009928	AC	3	6	91644	91649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009928	CT	3	6	91700	91705	0 %	50 %	0 %	50 %	158340554
144	NC_009928	TA	3	6	93832	93837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009928	AC	3	6	94837	94842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009928	AT	3	6	95088	95093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009928	AT	3	6	95138	95143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009928	AT	3	6	95168	95173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.